Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000487886
• Subject: NM_008960.2
• Aligned Length: 1209
• Identities: 1163
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGACAGCCATCATCAAAGAGATCGTTAGCAGAAACAAAAGGAGATATCAAGAGGATGGATTCGACTTAGACTT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGACAGCCATCATCAAAGAGATCGTTAGCAGAAACAAAAGGAGATATCAAGAGGATGGATTCGACTTAGACTT  74

Query   75  GACCTATATTTATCCAAACATTATTGCTATGGGATTTCCTGCAGAAAGACTTGAAGGCGTATACAGGAACAATA  148
            ||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct   75  GACCTATATTTATCCAAATATTATTGCTATGGGATTTCCTGCAGAAAGACTTGAAGGTGTATACAGGAACAATA  148

Query  149  TTGATGATGTAGTAAGGTTTTTGGATTCAAAGCATAAAAACCATTACAAGATATACAATCTTTGTGCTGAAAGA  222
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct  149  TTGATGATGTAGTAAGGTTTTTGGATTCAAAGCATAAAAACCATTACAAGATATACAATCTATGTGCTGAGAGA  222

Query  223  CATTATGACACCGCCAAATTTAATTGCAGAGTTGCACAATATCCTTTTGAAGACCATAACCCACCACAGCTAGA  296
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CATTATGACACCGCCAAATTTAACTGCAGAGTTGCACAGTATCCTTTTGAAGACCATAACCCACCACAGCTAGA  296

Query  297  ACTTATCAAACCCTTTTGTGAAGATCTTGACCAATGGCTAAGTGAAGATGACAATCATGTTGCAGCAATTCACT  370
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ACTTATCAAACCCTTCTGTGAAGATCTTGACCAATGGCTAAGTGAAGATGACAATCATGTTGCAGCAATTCACT  370

Query  371  GTAAAGCTGGAAAGGGACGAACTGGTGTAATGATATGTGCATATTTATTACATCGGGGCAAATTTTTAAAGGCA  444
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GTAAAGCTGGAAAGGGACGGACTGGTGTAATGATTTGTGCATATTTATTGCATCGGGGCAAATTTTTAAAGGCA  444

Query  445  CAAGAGGCCCTAGATTTCTATGGGGAAGTAAGGACCAGAGACAAAAAGGGAGTAACTATTCCCAGTCAGAGGCG  518
            |||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct  445  CAAGAGGCCCTAGATTTTTATGGGGAAGTAAGGACCAGAGACAAAAAGGGAGTCACAATTCCCAGTCAGAGGCG  518

Query  519  CTATGTGTATTATTATAGCTACCTGTTAAAGAATCATCTGGATTATAGACCAGTGGCACTGTTGTTTCACAAGA  592
            ||||||.||||||||||||||||||.||||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||.||||||||||||
Sbjct  519  CTATGTATATTATTATAGCTACCTGCTAAAAAATCACCTGGATTACAGACCCGTGGCACTGCTGTTTCACAAGA  592

Query  593  TGATGTTTGAAACTATTCCAATGTTCAGTGGCGGAACTTGCAATCCTCAGTTTGTGGTCTGCCAGCTAAAGGTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGATGTTTGAAACTATTCCAATGTTCAGTGGCGGAACTTGCAATCCTCAGTTTGTGGTCTGCCAGCTAAAGGTG  666

Query  667  AAGATATATTCCTCCAATTCAGGACCCACACGACGGGAAGACAAGTTCATGTACTTTGAGTTCCCTCAGCCGTT  740
            |||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  667  AAGATATATTCCTCCAATTCAGGACCCACGCGGCGGGAGGACAAGTTCATGTACTTTGAGTTCCCTCAGCCATT  740

Query  741  ACCTGTGTGTGGTGATATCAAAGTAGAGTTCTTCCACAAACAGAACAAGATGCTAAAAAAGGACAAAATGTTTC  814
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCCTGTGTGTGGTGATATCAAAGTAGAGTTCTTCCACAAACAGAACAAGATGCTCAAAAAGGACAAAATGTTTC  814

Query  815  ACTTTTGGGTAAATACATTCTTCATACCAGGACCAGAGGAAACCTCAGAAAAAGTAGAAAATGGAAGTCTATGT  888
            ||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct  815  ACTTTTGGGTAAATACGTTCTTCATACCAGGACCAGAGGAAACCTCAGAAAAAGTGGAAAATGGAAGTCTTTGT  888

Query  889  GATCAAGAAATCGATAGCATTTGCAGTATAGAGCGTGCAGATAATGACAAGGAATATCTAGTACTTACTTTAAC  962
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||..||||
Sbjct  889  GATCAGGAAATCGATAGCATTTGCAGTATAGAGCGTGCAGATAATGACAAGGAGTATCTTGTACTCACCCTAAC  962

Query  963  AAAAAATGATCTTGACAAAGCAAATAAAGACAAAGCCAACCGATACTTTTCTCCAAATTTTAAGGTGAAGCTGT  1036
            ||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct  963  AAAAAACGATCTTGACAAAGCAAACAAAGACAAGGCCAACCGATACTTCTCTCCAAATTTTAAGGTGAAACTAT  1036

Query 1037  ACTTCACAAAAACAGTAGAGGAGCCGTCAAATCCAGAGGCTAGCAGTTCAACTTCTGTAACACCAGATGTTAGT  1110
            ||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 1037  ACTTTACAAAAACAGTAGAGGAGCCATCAAATCCAGAGGCTAGCAGTTCAACTTCTGTGACTCCAGATGTTAGT  1110

Query 1111  GACAATGAACCTGATCATTATAGATATTCTGACACCACTGACTCTGATCCAGAGAATGAACCTTTTGATGAAGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GACAATGAACCTGATCATTATAGATATTCTGACACCACTGACTCTGATCCAGAGAATGAACCTTTTGATGAAGA  1184

Query 1185  TCAGCATACACAAATTACAAAAGTC  1209
            |||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1185  TCAGCATTCACAAATTACAAAAGTC  1209