Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000487889
• Subject: XM_005254374.4
• Aligned Length: 1557
• Identities: 1459
• Gaps: 84

Alignment

Query    1  ATGGA------CACAAGTCCCCTGTGTTT--CTCCATTCTGTTGGTTTTATGCATCTT-------------TAT  53
            |||||      |||             ||  |||.|||       |..|||.|.||.|             |||
Sbjct    1  ATGGATTTGATCAC-------------TTACCTCAATT-------TAATATTCCTCCTCCTAAAACCACAGTAT  54

Query   54  -----CCA-------ATCA--AGTG-------CCCTT----GGAC------AAAGC--------CTGAAACCAG  88
                 |||       ||||  .|||       |.|||    .|||      |||||        |.||    ||
Sbjct   55  CATCCCCAGATTCTTATCACTGGTGTGACTACCTCTTCTGAAGACATGAGAAAAGCTCCAGTTTCAGA----AG  124

Query   89  AGCCATTTGGAAGAAGAGCTCAAGCTGTTGAAACAAACAAAACGCTGCATGAGATGAAGACCAGATTCCTGCTC  162
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  125  AGCCATTTGGAAGAAGAGCTCAAGCTGTTGAAACAAACAAAACGCTGCATGAGATGAAGACCAGATTCCTGCTC  198

Query  163  TTTGGAGAAACCAATCAGGGCTGTCAGATTCGAATCAATCATCCGGACACGTTACAGGAGTGCGGCTTCAACTC  236
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  199  TTTGGAGAAACCAATCAGGGCTGTCAGATTCGAATCAATCATCCGGACACGTTACAGGAGTGCGGCTTCAACTC  272

Query  237  CTCCCTGCCTCTGGTGATGATAATCCACGGGTGGTCGGTGGACGGCGTGCTAGAAAACTGGATCTGGCAGATGG  310
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  273  CTCCCTGCCTCTGGTGATGATAATCCACGGGTGGTCGGTGGACGGCGTGCTAGAAAACTGGATCTGGCAGATGG  346

Query  311  TGGCCGCGCTGAAGTCTCAGCCGGCCCAGCCAGTGAACGTGGGGCTGGTGGACTGGATCACCCTGGCCCACGAC  384
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  347  TGGCCGCGCTGAAGTCTCAGCCGGCCCAGCCAGTGAACGTGGGGCTGGTGGACTGGATCACCCTGGCCCACGAC  420

Query  385  CACTACACCATCGCCGTCCGCAACACCCGCCTTGTGGGCAAGGAGGTCGCGGCTCTTCTCCGGTGGCTGGAGGA  458
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421  CACTACACCATCGCCGTCCGCAACACCCGCCTTGTGGGCAAGGAGGTCGCGGCTCTTCTCCGGTGGCTGGAGGA  494

Query  459  ATCTGTGCAACTCTCTCGAAGCCATGTTCACCTAATTGGGTACAGCCTGGGTGCACACGTGTCAGGATTTGCCG  532
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  495  ATCTGTGCAACTCTCTCGAAGCCATGTTCACCTAATTGGGTACAGCCTGGGTGCACACGTGTCAGGATTTGCCG  568

Query  533  GCAGTTCCATCGGTGGAACGCACAAGATTGGGAGAATCACAGGGCTGGATGCCGCGGGACCTTTGTTTGAGGGA  606
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  569  GCAGTTCCATCGGTGGAACGCACAAGATTGGGAGAATCACAGGGCTGGATGCCGCGGGACCTTTGTTTGAGGGA  642

Query  607  AGCGCCCCCAGCAATCGTCTTTCTCCAGATGATGCCAATTTTGTGGATGCCATTCATACCTTTACGCGGGAGCA  680
            ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  643  AGTGCCCCCAGCAATCGTCTTTCTCCAGATGATGCCAATTTTGTGGATGCCATTCATACCTTTACCCGGGAGCA  716

Query  681  CATGGGCCTGAGCGTGGGCATCAAACAGCCCATAGGACACTATGACTTCTATCCCAACGGGGGCTCCTTCCAGC  754
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  717  CATGGGCCTGAGCGTGGGCATCAAACAGCCCATAGGACACTATGACTTCTATCCCAACGGGGGCTCCTTCCAGC  790

Query  755  CTGGCTGCCACTTCCTAGAGCTCTACAGACATATTGCCCAGCACGGCTTCAATGCCATCACCCAGACCATAAAA  828
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  791  CTGGCTGCCACTTCCTAGAGCTCTACAGACATATTGCCCAGCACGGCTTCAATGCCATCACCCAGACCATAAAA  864

Query  829  TGCTCCCACGAGCGATCGGTGCACCTTTTCATCGACTCCTTGCTGCACGCCGGCACGCAGAGCATGGCCTACCC  902
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  865  TGCTCCCACGAGCGATCGGTGCACCTTTTCATCGACTCCTTGCTGCACGCCGGCACGCAGAGCATGGCCTACCC  938

Query  903  GTGTGGTGACATGAACAGCTTCAGCCAGGGCCTGTGCCTGAGCTGCAAGAAGGGCCGCTGCAACACGCTGGGCT  976
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  939  GTGTGGTGACATGAACAGCTTCAGCCAGGGCCTGTGCCTGAGCTGCAAGAAGGGCCGCTGCAACACGCTGGGCT  1012

Query  977  ACCACGTCCGCCAGGAGCCGCGGAGCAAGAGCAAGAGGCTCTTCCTCGTAACGCGAGCCCAGTCCCCCTTCAAA  1050
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1013  ACCACGTCCGCCAGGAGCCGCGGAGCAAGAGCAAGAGGCTCTTCCTCGTAACGCGAGCCCAGTCCCCCTTCAAA  1086

Query 1051  GTTTATCATTACCAGTTAAAGATCCAGTTCATCAACCAAACTGAGACGCCAATACAAACAACTTTTACCATGTC  1124
            |||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1087  GTTTATCATTACCAGTTCAAGATCCAGTTCATCAACCAAACTGAGACACCAATACAAACAACTTTTACCATGTC  1160

Query 1125  ACTACTCGGAACAAAAGAGAAAATGCAGAAAATTCCCATCACTCTGGGCAAAGGAATTGCTAGTAATAAAACGT  1198
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1161  ACTACTCGGAACAAAAGAGAAAATGCAGAAAATTCCCATCACTCTGGGCAAAGGAATTGCTAGTAATAAAACGT  1234

Query 1199  ATTCCTTTCTTATCACGCTGGATGTGGATATCGGCGAGCTGATCATGATCAAGTTCAAGTGGGAAAACAGTGCA  1272
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1235  ATTCCTTTCTTATCACGCTGGATGTGGATATCGGCGAGCTGATCATGATCAAGTTCAAGTGGGAAAACAGTGCA  1308

Query 1273  GTGTGGGCCAATGTCTGGGACACGGTCCAGACCATCATCCCATGGAGCACAGGGCCGCGCCACTCAGGCCTCGT  1346
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1309  GTGTGGGCCAATGTCTGGGACACGGTCCAGACCATCATCCCATGGAGCACAGGGCCGCGCCACTCAGGCCTCGT  1382

Query 1347  TCTGAAGACGATCAGAGTCAAAGCAGGAGAAACCCAGCAAAGAATGACATTTTGTTCAGAAAACACAGATGACC  1420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1383  TCTGAAGACGATCAGAGTCAAAGCAGGAGAAACCCAGCAAAGAATGACATTTTGTTCAGAAAACACAGATGACC  1456

Query 1421  TACTACTTCGCCCAACCCAGGAAAAAATCTTCGTGAAATGTGAAATAAAGTCTAAAACATCAAAGCGAAAGATC  1494
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1457  TACTACTTCGCCCAACCCAGGAAAAAATCTTCGTGAAATGTGAAATAAAGTCTAAAACATCAAAGCGAAAGATC  1530

Query 1495  AGA  1497
            |||
Sbjct 1531  AGA  1533