Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000487892
• Subject: NM_002529.3
• Aligned Length: 2466
• Identities: 2368
• Gaps: 96

Alignment

Query    1  ATGTCGGGTGAGGCCTGGCAGCTGCAGCTGGGAGCGCACAGACGGCTGCCCCGCCTGAGCGAGGCGGGCGCCGC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CGCGATGCTGCGAGGCGGACGGCGCGGGCAGCTTGGCTGGCACAGCTGGGCTGCGGGGCCGGGCAGCCTGCTGG  148
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ----ATGCTGCGAGGCGGACGGCGCGGGCAGCTTGGCTGGCACAGCTGGGCTGCGGGGCCGGGCAGCCTGCTGG  70

Query  149  CTTGGCTGATACTGGCATCTGCGGGCGCCGCACCCTGCCCCGATGCCTGCTGCCCCCACGGCTCCTCGGGACTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   71  CTTGGCTGATACTGGCATCTGCGGGCGCCGCACCCTGCCCCGATGCCTGCTGCCCCCACGGCTCCTCGGGACTG  144

Query  223  CGATGCACCCGGGATGGGGCCCTGGATAGCCTCCACCACCTGCCCGGCGCAGAGAACCTGACTGAGCTCTACAT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  145  CGATGCACCCGGGATGGGGCCCTGGATAGCCTCCACCACCTGCCCGGCGCAGAGAACCTGACTGAGCTCTACAT  218

Query  297  CGAGAACCAGCAGCATCTGCAGCATCTGGAGCTCCGTGATCTGAGGGGCCTGGGGGAGCTGAGAAACCTCACCA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  219  CGAGAACCAGCAGCATCTGCAGCATCTGGAGCTCCGTGATCTGAGGGGCCTGGGGGAGCTGAGAAACCTCACCA  292

Query  371  TCGTGAAGAGTGGTCTCCGTTTCGTGGCGCCAGATGCCTTCCATTTCACTCCTCGGCTCAGTCGCCTGAATCTC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  293  TCGTGAAGAGTGGTCTCCGTTTCGTGGCGCCAGATGCCTTCCATTTCACTCCTCGGCTCAGTCGCCTGAATCTC  366

Query  445  TCCTTCAACGCTCTGGAGTCTCTCTCCTGGAAAACTGTGCAGGGCCTCTCCTTACAGGAACTGGTCCTGTCGGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  367  TCCTTCAACGCTCTGGAGTCTCTCTCCTGGAAAACTGTGCAGGGCCTCTCCTTACAGGAACTGGTCCTGTCGGG  440

Query  519  GAACCCTCTGCACTGTTCTTGTGCCCTGCGCTGGCTACAGCGCTGGGAGGAGGAGGGACTGGGCGGAGTGCCTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  441  GAACCCTCTGCACTGTTCTTGTGCCCTGCGCTGGCTACAGCGCTGGGAGGAGGAGGGACTGGGCGGAGTGCCTG  514

Query  593  AACAGAAGCTGCAGTGTCATGGGCAAGGGCCCCTGGCCCACATGCCCAATGCCAGCTGTGGTGTGCCCACGCTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  515  AACAGAAGCTGCAGTGTCATGGGCAAGGGCCCCTGGCCCACATGCCCAATGCCAGCTGTGGTGTGCCCACGCTG  588

Query  667  AAGGTCCAGGTGCCCAATGCCTCGGTGGATGTGGGGGACGACGTGCTGCTGCGGTGCCAGGTGGAGGGGCGGGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  589  AAGGTCCAGGTGCCCAATGCCTCGGTGGATGTGGGGGACGACGTGCTGCTGCGGTGCCAGGTGGAGGGGCGGGG  662

Query  741  CCTGGAGCAGGCCGGCTGGATCCTCACAGAGCTGGAGCAGTCAGCCACGGTGATGAAATCTGGGGGTCTGCCAT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  663  CCTGGAGCAGGCCGGCTGGATCCTCACAGAGCTGGAGCAGTCAGCCACGGTGATGAAATCTGGGGGTCTGCCAT  736

Query  815  CCCTGGGGCTGACCCTGGCCAATGTCACCAGTGACCTCAACAGGAAGAACTTGACGTGCTGGGCAGAGAACGAT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  737  CCCTGGGGCTGACCCTGGCCAATGTCACCAGTGACCTCAACAGGAAGAACGTGACGTGCTGGGCAGAGAACGAT  810

Query  889  GTGGGCCGGGCAGAGGTCTCTGTTCAGGTCAACGTCTCCTTCCCGGCCAGTGTGCAGCTGCACACGGCGGTGGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  811  GTGGGCCGGGCAGAGGTCTCTGTTCAGGTCAACGTCTCCTTCCCGGCCAGTGTGCAGCTGCACACGGCGGTGGA  884

Query  963  GATGCACCACTGGTGCATCCCCTTCTCTGTGGATGGGCAGCCGGCACCGTCTCTGCGCTGGCTCTTCAATGGCT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  885  GATGCACCACTGGTGCATCCCCTTCTCTGTGGATGGGCAGCCGGCACCGTCTCTGCGCTGGCTCTTCAATGGCT  958

Query 1037  CCGTGCTCAATGAGACCAGCTTCATCTTCACTGAGTTCCTGGAGCCGGCAGCCAATGAGACCGTGCGGCACGGG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  959  CCGTGCTCAATGAGACCAGCTTCATCTTCACTGAGTTCCTGGAGCCGGCAGCCAATGAGACCGTGCGGCACGGG  1032

Query 1111  TGTCTGCGCCTCAACCAGCCCACCCACGTCAACAACGGCAACTACACGCTGCTGGCTGCCAACCCCTTCGGCCA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1033  TGTCTGCGCCTCAACCAGCCCACCCACGTCAACAACGGCAACTACACGCTGCTGGCTGCCAACCCCTTCGGCCA  1106

Query 1185  GGCCTCCGCCTCCATCATGGCTGCCTTCATGGACAACCCTTTCGAGTTCAACCCCGAGGACCCCATCCCT----  1254
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
Sbjct 1107  GGCCTCCGCCTCCATCATGGCTGCCTTCATGGACAACCCTTTCGAGTTCAACCCCGAGGACCCCATCCCTGTCT  1180

Query 1255  --------------GACACTAACAGCACATCTGGAGACCCGGTGGAGAAGAAGGACGAAACACCTTTTGGGGTC  1314
                          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1181  CCTTCTCGCCGGTGGACACTAACAGCACATCTGGAGACCCGGTGGAGAAGAAGGACGAAACACCTTTTGGGGTC  1254

Query 1315  TCGGTGGCTGTGGGCCTGGCCGTCTTTGCCTGCCTCTTCCTTTCTACGCTGCTCCTTGTGCTCAACAAATGTGG  1388
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1255  TCGGTGGCTGTGGGCCTGGCCGTCTTTGCCTGCCTCTTCCTTTCTACGCTGCTCCTTGTGCTCAACAAATGTGG  1328

Query 1389  ACGGAGAAACAAGTTTGGGATCAACCGCCCGGCTGTGCTGGCTCCAGAGGATGGGCTGGCCATGTCCCTGCATT  1462
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1329  ACGGAGAAACAAGTTTGGGATCAACCGCCCGGCTGTGCTGGCTCCAGAGGATGGGCTGGCCATGTCCCTGCATT  1402

Query 1463  TCATGACATTGGGTGGCAGCTCCCTGTCCCCCACCGAGGGCAAAGGCTCTGGGCTCCAAGGCCACATCATCGAG  1536
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1403  TCATGACATTGGGTGGCAGCTCCCTGTCCCCCACCGAGGGCAAAGGCTCTGGGCTCCAAGGCCACATCATCGAG  1476

Query 1537  AACCCACAATACTTCAGTGATGCCTGTGTTCACCACATCAAGCGCCGGGACATCGTGCTCAAGTGGGAGCTGGG  1610
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1477  AACCCACAATACTTCAGTGATGCCTGTGTTCACCACATCAAGCGCCGGGACATCGTGCTCAAGTGGGAGCTGGG  1550

Query 1611  GGAGGGCGCCTTTGGGAAGGTCTTCCTTGCTGAGTGCCACAACCTCCTGCCTGAGCAGGACAAGATGCTGGTGG  1684
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1551  GGAGGGCGCCTTTGGGAAGGTCTTCCTTGCTGAGTGCCACAACCTCCTGCCTGAGCAGGACAAGATGCTGGTGG  1624

Query 1685  CTGTCAAGGCACTGAAGGAGGCGTCCGAGAGTGCTCGGCAGGACTTCCAACGTGAGGCTGAGCTGCTCACCATG  1758
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1625  CTGTCAAGGCACTGAAGGAGGCGTCCGAGAGTGCTCGGCAGGACTTCCAGCGTGAGGCTGAGCTGCTCACCATG  1698

Query 1759  CTGCAGCACCAGCACATCGTGCGCTTCTTCGGCGTCTGCACCGAGGGCCGCCCCCTGCTCATGGTCTTTGAGTA  1832
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1699  CTGCAGCACCAGCACATCGTGCGCTTCTTCGGCGTCTGCACCGAGGGCCGCCCCCTGCTCATGGTCTTTGAGTA  1772

Query 1833  TATGCGGCACGGGGACCTCAACCGCTTCCTCCGATCCCATGGACCTGATGCCAAGCTGCTGGCTGGTGGGGAGG  1906
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1773  TATGCGGCACGGGGACCTCAACCGCTTCCTCCGATCCCATGGACCTGATGCCAAGCTGCTGGCTGGTGGGGAGG  1846

Query 1907  ATGTGGCTCCAGGCCCCCTGGGTCTGGGGCAGCTGCTGGCCGTGGCTAGCCAGGTCGCTGCGGGGATGGTGTAC  1980
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1847  ATGTGGCTCCAGGCCCCCTGGGTCTGGGGCAGCTGCTGGCCGTGGCTAGCCAGGTCGCTGCGGGGATGGTGTAC  1920

Query 1981  CTGGCGGGTCTGCATTTTGTGCACCGGGACCTGGCCACACGCAACTGTCTAGTGGGCCAGGGACTGGTGGTCAA  2054
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1921  CTGGCGGGTCTGCATTTTGTGCACCGGGACCTGGCCACACGCAACTGTCTAGTGGGCCAGGGACTGGTGGTCAA  1994

Query 2055  GATTGGTGATTTTGGCATGAGCAGGGATATCTACAGCACCGACTATTACCGTGTGGGAGGCCGCACCATGCTGC  2128
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1995  GATTGGTGATTTTGGCATGAGCAGGGATATCTACAGCACCGACTATTACCGTGTGGGAGGCCGCACCATGCTGC  2068

Query 2129  CCATTCGCTGGATGCCGCCCGAGAGCATCCTGTACCGTAAGTTCACCACCGAGAGCGACGTGTGGAGCTTCGGC  2202
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2069  CCATTCGCTGGATGCCGCCCGAGAGCATCCTGTACCGTAAGTTCACCACCGAGAGCGACGTGTGGAGCTTCGGC  2142

Query 2203  GTGGTGCTCTGGGAGATCTTCACCTACGGCAAGCAGCCCTGGTACCAGCTCTCCAACACGGAGGCAATCGACTG  2276
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2143  GTGGTGCTCTGGGAGATCTTCACCTACGGCAAGCAGCCCTGGTACCAGCTCTCCAACACGGAGGCAATCGACTG  2216

Query 2277  CATCACGCAGGGACGTGAGTTGGAGCGGCCACGTGCCTGCCCACCAGAGGTCTACGCCATCATGCGGGGCTGCT  2350
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2217  CATCACGCAGGGACGTGAGTTGGAGCGGCCACGTGCCTGCCCACCAGAGGTCTACGCCATCATGCGGGGCTGCT  2290

Query 2351  GGCAGCGGGAGCCCCAGCAACGCCACAGCATCAAGGATGTGCACGCCCGGCTGCAAGCCCTGGCCCAGGCACCT  2424
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2291  GGCAGCGGGAGCCCCAGCAACGCCACAGCATCAAGGATGTGCACGCCCGGCTGCAAGCCCTGGCCCAGGCACCT  2364

Query 2425  CCTGTCTACCTGGATGTCCTGGGC  2448
            ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2365  CCTGTCTACCTGGATGTCCTGGGC  2388