Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000487893
• Subject: XM_006516245.3
• Aligned Length: 1576
• Identities: 1228
• Gaps: 131

Alignment

Query    1  ATGGCCAGAAAGGCTCTCAAGCTTGCTTCGTGGACCAGCATGGCTCTTGCTGCCTCTGGCATCTACTTCTACAG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TAACAAGTACTTGGACCCTAATGACTTTGGCGCTGTCAGGGTGGGCAGAGCAGTTGCTACGACGGCTGTCATCA  148
                                            .|||                 ||.||..|||.||||||||||
Sbjct    1  --------------------------------ATGT-----------------TTTCTCTGACAGCTGTCATCA  25

Query  149  GTTACGACTACCTCACTTCCCTGAAGAGTGTCCCTTATGGCTCAGAGGAGTACTTGCAGCTGAGATCTAAGGTG  222
            |.||.|||||||||||.|||||||.|||||||||.||||||||.||||||||.|||||||...||||..|||||
Sbjct   26  GCTATGACTACCTCACCTCCCTGAGGAGTGTCCCATATGGCTCTGAGGAGTATTTGCAGCGTCGATCCCAGGTG  99

Query  223  CACCTTCGCTCTGCCAGGCGTCTCTGTGAGCTCTGCTGTGCCAACCGGGGCACCTTCATCAAGGTGGGCCAGCA  296
            |||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  100  CACCTCCGCTCTGCCAGGCGTCTCTTTGAGCTCTGCTGTGCCAACCGGGGCACTTTCATCAAGGTGGGCCAGCA  173

Query  297  CCTGGGGGCTCTGGACTACCTGTTGCCAGAGGAGTACACCAGCACGCTGAAGGTACTGCACAGCCAGGCTCCAC  370
            |||||||||.||||||||||||.|||||||.||||||||||||||.||||||||..|||||||.||.||.||||
Sbjct  174  CCTGGGGGCGCTGGACTACCTGCTGCCAGAAGAGTACACCAGCACACTGAAGGTGTTGCACAGTCAAGCCCCAC  247

Query  371  AGAGCAGCATGCAAGAGATCCGCCAGGTCATCCGAGAAGATCTGGGCAAGGAGATCCATGATTTGTTCCAGAGC  444
            |||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||.||||
Sbjct  248  AGAGCAGCATGCAAGAGGTCCGGCAGGTCATCCGAGAAGACCTGGGCAAGGAGATCCACGATTTGTTCCTGAGC  321

Query  445  TTCGATGACACCCCTCTGGGGACGGCCTCCCTGGCCCAGGTCCACAAGGCAGTGCTGCATGATGGGCGGACGGT  518
            |||||||||||||||||.|||.|.||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||.|||||.||
Sbjct  322  TTCGATGACACCCCTCTTGGGGCAGCCTCCCTGGCCCAGGTCCACAAGGCGGTGTTGCATGATGGTCGGACAGT  395

Query  519  GGCCGTGAAGGTCCAGCACCCAAAGGTGCGGGCTCAGAGCTCGAAGGACATTCTCCTGATGGAGGTGCTCGTTC  592
            |||.||.||||||||||||||.|||||.|.||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct  396  GGCAGTTAAGGTCCAGCACCCGAAGGTTCAGGCTCAAAGCTCTAAGGACATTCTCCTGATGGAGGTGCTTGTCC  469

Query  593  TGGCTGTGAAGCAGCTGTTCCCAGAGTTTGAGTTTATGTGGCTTGTGGATGAAGCCAAGAAGAACCTGCCTTTG  666
            ||||.||||||||.||.||||||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||.|.
Sbjct  470  TGGCCGTGAAGCAACTTTTCCCAGATTTTGAATTCATGTGGCTGGTGGATGAAGCGAAGAAGAACCTGCCTCTC  543

Query  667  GAGCTGGATTTCCTCAATGAAGGGAGGAATGCTGAGAAGGTGTCCCAGATGCTCAGGCATTTTGACTTCTTGAA  740
            |||.||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||.||||.|||||||||||.|||||||||.|.||
Sbjct  544  GAGTTGGACTTCCTGAATGAAGGGAGGAACGCTGAGAAAGTGGCCCACATGCTCAGGCACTTTGACTTCCTAAA  617

Query  741  GGTCCCCCGAATCCACTGGGACCTGTCCACGGAGCGGGTCCTCCTGATGGAGTTTGTGGATGGCGGGCAGGTCA  814
            |||.||||..|||||||||||.|||||.||..||.||||.|||||||||||.|||||.||.||.||.||.||||
Sbjct  618  GGTTCCCCAGATCCACTGGGAGCTGTCTACCAAGAGGGTGCTCCTGATGGAATTTGTAGAGGGAGGTCAAGTCA  691

Query  815  ATGACAGAGACTACATGGAGAGGAACAAGATCGACGTCAATGAGATCTCACGCCACCTGGGCAAGATGTATAGT  888
            |.|||||.|.|||||||||||.||||.|||||||.||.|||||||||||..|||||||||||||||||||.|||
Sbjct  692  ACGACAGGGCCTACATGGAGAAGAACCAGATCGATGTGAATGAGATCTCCTGCCACCTGGGCAAGATGTACAGT  765

Query  889  GAGATGATCTTCGTCAATGGCTTCGTGCACTGCGATCCCCACCCCGGCAATGTACTGGTGCGGAAGCACCCCGG  962
            |||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||..||.|.
Sbjct  766  GAGATGATCTTTGTCAATGGCTTCGTGCACTGTGACCCCCACCCAGGCAACGTACTGGTACGGAAGCGTCCTGA  839

Query  963  CACGGGAAAGGCGGAGATTGTCCTGTTGGACCATGGGCTTTACCAGATGCTCACGGAAGAATTCCGCCTGAATT  1036
            ||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||.||||||||||.||.|||||||||.|.|
Sbjct  840  CACGGGCAAGGCTGAGATTGTCCTCTTAGACCATGGGCTTTACCAGGTGCTCACGGAGGAGTTCCGCCTGGACT  913

Query 1037  ACTGCCACCTCTGGCAGTCTCTGATCTGGACTGACATGAAGAGAGTGAAGGAGTACAGCCAGCGACTGGGAGCC  1110
            |||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||.|..|..||||..|||||||||||||.||||||||.
Sbjct  914  ACTGCCATCTGTGGCAGTCTCTGATCTGGACTGACATGGACGGGCTGAAACAGTACAGCCAGCGCCTGGGAGCT  987

Query 1111  GGGGATCTCTACCCCTTGTTTGCCTGCATGCTGACGGCGCGATCGTGGGACTCGGTC-AACAGAGGCATCAGCC  1183
            |..||.||||||||..||||||||||.||||||||.||.||.||.||||||||.||| ||||| |||||..|.|
Sbjct  988  GCAGACCTCTACCCACTGTTTGCCTGTATGCTGACAGCCCGGTCCTGGGACTCAGTCAAACAG-GGCATTGGGC  1060

Query 1184  AAGCTCCCGTCACTGCCACTGAGGACTTAGAGATTCGCAACAACGCGGCCAACTACCTCCCCCAGATCAGCCAT  1257
            |||||||.|||.||||.||||||||||.||||||||||||.||.||.|||..||||||.||..||||||||||.
Sbjct 1061  AAGCTCCAGTCTCTGCTACTGAGGACTCAGAGATTCGCAATAATGCAGCCTGCTACCTGCCTGAGATCAGCCAG  1134

Query 1258  CTCCTCAACCACGTGCCGCGCCAGATGCTGCTCATCTTGAAGACCAACGACCTGCTGCGTGGCATTGAGGCCGC  1331
            |||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||.|||||||.||.||.||.||.|||.||||||||.||.|
Sbjct 1135  CTCCTTAACCATGTGCCTCGCCAGATGCTGCTCATCCTGAAGACTAATGATCTACTCCGTAGCATTGAGACCAC  1208

Query 1332  CCTGGGCACCCGCGCCAGCGCCAGCTCCTTTCTCAACATGTCACGTTGCTGCATCAGAGCGCTAGCTGAGCACA  1405
            |||||||||.|||.||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.||.||.|||||.|||||.|||||.||||
Sbjct 1209  CCTGGGCACGCGCTCCAGTGCCAGTTCCTTCCTCAACATGTCTCGGTGTTGTATCAGGGCGCTGGCTGAACACA  1282

Query 1406  AGAAGAAGAATACCTGTTCATTCTTCAGAAGGACCCAGATCTCTTTCAGCGAGGCCTTCAACTTATGGCAGATC  1479
            ||||||.|.||.||.|.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|.|.|.|||||||||
Sbjct 1283  AGAAGAGGGATGCCGGCTCTTTCTTCAGAAGGACTCAGATATCTTTCAGTGAGGCCTTTAGCCTGTGGCAGATC  1356

Query 1480  AACCTCCATGAGCTCATCCTGCGTGTGAAGGGGTTGAAGCTGGCTGACCGGGTCTTGGCCCTAATATGCTGGCT  1553
            |||||.|||||.||..|.||.||.||||.||..||||.|||.|||..|.||||||..||.||..|..|||||||
Sbjct 1357  AACCTTCATGAACTTCTGCTTCGAGTGAGGGCCTTGAGGCTAGCTTGCTGGGTCTCAGCTCTCCTGGGCTGGCT  1430

Query 1554  GTTCCCTGCTCCACTC------  1569
            |...|..|||||||.|      
Sbjct 1431  GACTCGGGCTCCACACAGAATG  1452