Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000487915
• Subject: NM_013803.3
• Aligned Length: 3238
• Identities: 2836
• Gaps: 5

Alignment

Query    1  ATGGCATTTTATAGCTGCTGCTGGGTCCTCTTGGCACTCACCTGGCACACCTCTGCCTACGGGCCAGACCAGCG  74
            |||||||..|.|.|||.|||.|.||.||||.||||.||||||||||||.||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct    1  ATGGCATGGTTTGGCTACTGTTTGGCCCTCCTGGCTCTCACCTGGCACTCCTCTGCCTATGGGCCTGACCAGCG  74

Query   75  AGCCCAAAAGAAGGGGGACATTATCCTTGGGGGGCTCTTTCCTATTCATTTTGGAGTAGCAGCTAAAGATCAAG  148
            |||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct   75  AGCCCAAAAGAAGGGGGACATTATCCTAGGAGGTCTCTTTCCTATCCATTTTGGAGTAGCAGCCAAAGATCAAG  148

Query  149  ATCTCAAATCAAGGCCGGAGTCTGTGGAATGTATCAGGTATAATTTCCGTGGGTTTCGCTGGTTACAGGCTATG  222
            ||||.||.|||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||.||.||||||||.||.|||
Sbjct  149  ATCTGAAGTCAAGACCAGAGTCTGTGGAGTGCATCAGGTATAACTTCCGTGGATTCCGATGGTTACAAGCCATG  222

Query  223  ATATTTGCCATAGAGGAGATAAACAGCAGCCCAGCCCTTCTTCCCAACTTGACGCTGGGATACAGGATATTTGA  296
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||.||||||||.||||||||.||
Sbjct  223  ATCTTTGCCATAGAGGAGATAAACAGCAGCCCCGCCCTTCTTCCCAACATGACTCTGGGATATAGGATATTCGA  296

Query  297  CACTTGCAACACCGTTTCTAAGGCCTTGGAAGCCACCCTGAGTTTTGTTGCTCAAAACAAAATTGATTCTTTGA  370
            |||.||.||||||||.||.|||||..||||.||||||.|||||||||||||.||.||||||||.||||||.|||
Sbjct  297  CACCTGTAACACCGTCTCCAAGGCTCTGGAGGCCACCTTGAGTTTTGTTGCCCAGAACAAAATCGATTCTCTGA  370

Query  371  ACCTTGATGAGTTCTGCAACTGCTCAGAGCACATTCCCTCTACGATTGCTGTGGTGGGAGCAACTGGCTCAGGC  444
            ||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||.||.||.||||||||||||||.|||||.||.
Sbjct  371  ACCTGGATGAGTTCTGCAACTGCTCCGAGCACATCCCTTCAACCATCGCAGTGGTGGGAGCAACCGGCTCCGGT  444

Query  445  GTCTCCACGGCAGTGGCAAATCTGCTGGGGCTCTTCTACATTCCCCAGGTCAGTTATGCCTCCTCCAGCAGACT  518
            ||||||||.||.||.||.||.||||||||.||.|||||.||.||||||||.||.||.||||||||.|||||.||
Sbjct  445  GTCTCCACAGCGGTAGCCAACCTGCTGGGACTTTTCTATATCCCCCAGGTGAGCTACGCCTCCTCTAGCAGGCT  518

Query  519  CCTCAGCAACAAGAATCAATTCAAGTCTTTCCTCCGAACCATCCCCAATGATGAGCACCAGGCCACTGCCATGG  592
            .||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.||.||.|||||||||||.||.||||
Sbjct  519  TCTCAGCAATAAGAACCAGTTCAAGTCCTTCCTCCGCACCATTCCCAACGACGAACACCAGGCCACCGCGATGG  592

Query  593  CAGACATCATCGAGTATTTCCGCTGGAACTGGGTGGGCACAATTGCAGCTGATGACGACTATGGGCGGCCGGGG  666
            |.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||..||||.||.
Sbjct  593  CTGACATTATCGAGTATTTCCGTTGGAACTGGGTGGGCACAATTGCAGCCGACGACGACTATGGCAGGCCTGGC  666

Query  667  ATTGAGAAATTCCGAGAGGAAGCTGAGGAAAGGGATATCTGCATCGACTTCAGTGAACTCATCTCCCAGTACTC  740
            ||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct  667  ATTGAGAAGTTCCGAGAGGAAGCCGAGGAGAGGGACATCTGCATTGACTTCAGCGAGCTCATCTCCCAGTACTC  740

Query  741  TGATGAGGAAGAGATCCAGCATGTGGTAGAGGTGATTCAAAATTCCACGGCCAAAGTCATCGTGGTTTTCTCCA  814
            |||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.||.||.||.|||||.|||||.||.||||||||||
Sbjct  741  TGATGAGGAAGAGATCCAGCAGGTGGTGGAAGTGATCCAGAACTCTACAGCCAAGGTCATTGTCGTTTTCTCCA  814

Query  815  GTGGCCCAGATCTTGAGCCCCTCATCAAGGAGATTGTCCGGCGCAATATCACGGGCAAGATCTGGCTGGCCAGC  888
            |.||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||.||.||.||.|||||.||||.||||||||||||||||
Sbjct  815  GCGGCCCAGACCTAGAACCTCTCATCAAGGAGATTGTGCGCCGTAACATCACAGGCAGGATCTGGCTGGCCAGC  888

Query  889  GAGGCCTGGGCCAGCTCCTCCCTGATCGCCATGCCTCAGTACTTCCACGTGGTTGGCGGCACCATTGGATTCGC  962
            ||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||.||||||||||.||.||.||.||.||||||||.||||.
Sbjct  889  GAGGCCTGGGCCAGTTCCTCCCTGATTGCTATGCCTGAGTACTTCCATGTAGTCGGGGGTACCATTGGGTTCGG  962

Query  963  TCTGAAGGCTGGGCAGATCCCAGGCTTCCGGGAATTCCTGAAGAAGGTCCATCCCAGGAAGTCTGTCCACAATG  1036
            ||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||..||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TCTGAAGGCTGGGCAGATTCCAGGCTTCCGAGAATTCCTACAGAAAGTCCATCCCAGGAAGTCTGTCCACAATG  1036

Query 1037  GTTTTGCCAAGGAGTTTTGGGAAGAAACATTTAACTGCCACCTCCAAGAAGGTGCAAAAGGACCTTTACCTGTG  1110
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 1037  GTTTTGCCAAAGAGTTTTGGGAAGAAACATTTAATTGCCACCTGCAAGACGGCGCAAAAGGACCTTTACCCGTG  1110

Query 1111  GACACCTTTCTGAGAGGTCACGAAGAAAGTGGCGACAGGTTTAGCAACAGCTCGACAGCCTTCCGACCCCTCTG  1184
            ||||||||..|||||.|||||||.|||.|.|||.|||||||...|||.|||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 1111  GACACCTTCGTGAGAAGTCACGAGGAAGGCGGCAACAGGTTACTCAATAGCTCCACTGCCTTCCGACCCCTCTG  1184

Query 1185  TACAGGGGATGAGAACATCAGCAGTGTCGAGACCCCTTACATAGATTACACGCATTTACGGATATCCTACAATG  1258
            .||.||||||||.|||||||..||||||||||||||||||||.||.|||...||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1185  CACGGGGGATGAAAACATCAATAGTGTCGAGACCCCTTACATGGACTACGAACATTTACGGATATCCTACAACG  1258

Query 1259  TGTACTTAGCAGTCTACTCCATTGCCCACGCCTTGCAAGATATATATACCTGCTTACCTGGGAGAGGGCTCTTC  1332
            ||||||||||.||||||||||||||.||||||.|||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||
Sbjct 1259  TGTACTTAGCCGTCTACTCCATTGCGCACGCCCTGCAAGATATATACACCTGCTTACCCGGAAGAGGGCTTTTC  1332

Query 1333  ACCAATGGCTCCTGTGCAGACATCAAGAAAGTTGAGGCGTGGCAGGTCCTGAAGCACCTACGGCATCTAAACTT  1406
            |||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||
Sbjct 1333  ACCAACGGGTCCTGTGCAGACATCAAGAAGGTTGAGGCCTGGCAGGTCCTGAAACACCTACGGCACCTGAATTT  1406

Query 1407  TACAAACAATATGGGGGAGCAGGTGACCTTTGATGAGTGTGGTGACCTGGTGGGGAACTATTCCATCATCAACT  1480
            .||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1407  CACCAACAACATGGGGGAGCAGGTGACCTTCGATGAGTGCGGTGACCTGGTGGGGAACTACTCCATCATCAACT  1480

Query 1481  GGCACCTCTCCCCAGAGGATGGCTCCATCGTGTTTAAGGAAGTCGGGTATTACAACGTCTATGCCAAGAAGGGA  1554
            |||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 1481  GGCACCTCTCCCCAGAGGACGGCTCCATTGTGTTCAAGGAAGTTGGGTACTACAATGTGTATGCCAAGAAGGGA  1554

Query 1555  GAAAGACTCTTCATCAACGAGGAGAAAATCCTGTGGAGTGGGTTCTCCAGGGAGGTGCCCTTCTCCAACTGCAG  1628
            ||||||||.||||||||.||||.|||.|||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GAAAGACTGTTCATCAATGAGGGGAAGATCTTGTGGAGTGGGTTCTCCAGAGAGGTGCCCTTCTCCAACTGCAG  1628

Query 1629  CCGAGACTGCCTGGCAGGGACCAGGAAAGGGATCATTGAGGGGGAGCCCACCTGCTGCTTTGAGTGTGTGGAGT  1702
            |||.|||||.|.|||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1629  CCGGGACTGTCAGGCAGGGACCAGGAAGGGCATCATTGAGGGAGAGCCCACCTGCTGTTTTGAGTGTGTGGAGT  1702

Query 1703  GTCCTGATGGGGAGTATAGTGATGAGACAGATGCCAGTGCCTGTAACAAGTGCCCAGATGACTTCTGGTCCAAT  1776
            |||||||.||.|||||.||||.||||||||||||.|||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GTCCTGACGGCGAGTACAGTGGTGAGACAGATGCGAGTGCCTGTGACAAGTGCCCGGATGACTTCTGGTCCAAT  1776

Query 1777  GAGAACCACACCTCCTGCATTGCCAAGGAGATCGAGTTTCTGTCGTGGACGGAGCCCTTTGGGATCGCACTCAC  1850
            |||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||.|||||||.|||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1777  GAGAACCACACTTCCTGCATTGCCAAGGAGATTGAGTTCCTGGCGTGGACTGAGCCCTTTGGAATCGCTCTCAC  1850

Query 1851  CCTCTTTGCCGTGCTGGGCATTTTCCTGACAGCCTTTGTGCTGGGTGTGTTTATCAAGTTCCGCAACACACCCA  1924
            .||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.||||
Sbjct 1851  TCTCTTTGCGGTGCTGGGCATTTTCCTGACCGCCTTTGTGCTGGGCGTCTTCATCAAGTTCCGAAACACGCCCA  1924

Query 1925  TTGTCAAGGCCACCAACCGAGAGCTCTCCTACCTCCTCCTCTTCTCCCTGCTCTGCTGCTTCTCCAGCTCCCTG  1998
            |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  TTGTCAAGGCCACCAACCGAGAGCTGTCCTACCTCCTGCTCTTCTCACTCCTCTGCTGCTTCTCCAGCTCCCTG  1998

Query 1999  TTCTTCATCGGGGAGCCCCAGGACTGGACGTGCCGCCTGCGCCAGCCGGCCTTTGGCATCAGCTTCGTGCTCTG  2072
            ||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 1999  TTCTTCATTGGGGAGCCCCAGGACTGGACCTGCCGCCTGCGACAGCCCGCCTTCGGCATCAGCTTCGTGCTTTG  2072

Query 2073  CATCTCATGCATCCTGGTGAAAACCAACCGTGTCCTCCTGGTGTTTGAGGCCAAGATCCCCACCAGCTTCCACC  2146
            .|||||.||||||.|||||||.|||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||
Sbjct 2073  TATCTCGTGCATCTTGGTGAAGACCAATCGAGTCCTCCTGGTATTTGAGGCCAAAATACCCACCAGCTTCCACC  2146

Query 2147  GCAAGTGGTGGGGGCTCAACCTGCAGTTCCTGCTGGTTTTCCTCTGCACCTTCATGCAGATTGTCATCTGTGTG  2220
            |.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|.
Sbjct 2147  GGAAGTGGTGGGGACTCAACCTGCAGTTCCTGCTGGTTTTCCTCTGCACCTTCATGCAGATTGTCATCTGCATC  2220

Query 2221  ATCTGGCTCTACACCGCGCCCCCCTCAAGCTACCGCAACCAGGAGCTGGAGGATGAGATCATCTTCATCACGTG  2294
            ||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 2221  ATCTGGCTCTACACGGCACCCCCCTCCAGCTACCGCAACCACGAGCTGGAAGACGAAATCATCTTCATCACGTG  2294

Query 2295  CCACGAGGGCTCCCTCATGGCCCTGGGCTTCCTGATCGGCTACACCTGCCTGCTGGCTGCCATCTGCTTCTTCT  2368
            |||.||||||||.||||||||.||.||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  CCATGAGGGCTCACTCATGGCGCTCGGCTCCCTGATCGGCTACACCTGCCTCCTGGCTGCCATCTGCTTCTTCT  2368

Query 2369  TTGCCTTCAAGTCCCGGAAGCTGCCGGAGAACTTCAATGAAGCCAAGTTCATCACCTTCAGCATGCTCATCTTC  2442
            |||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  TTGCCTTCAAGTCTCGGAAGCTGCCAGAGAACTTCAACGAAGCCAAGTTCATTACCTTCAGCATGCTCATCTTC  2442

Query 2443  TTCATCGTCTGGATCTCCTTCATTCCAGCCTATGCCAGCACCTATGGCAAGTTTGTCTCTGCCGTAGAGGTGAT  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 2443  TTCATCGTCTGGATCTCCTTCATTCCAGCCTATGCCAGCACCTACGGCAAGTTTGTCTCTGCCGTGGAGGTGAT  2516

Query 2517  TGCCATCCTGGCAGCCAGCTTTGGCTTGCTGGCGTGCATCTTCTTCAACAAGATCTACATCATTCTCTTCAAGC  2590
            .|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||
Sbjct 2517  CGCCATCCTGGCAGCCAGCTTTGGCTTGCTAGCCTGCATCTTCTTCAACAAGGTCTACATCATCCTCTTCAAGC  2590

Query 2591  CATCCCGCAACACCATCGAGGAGGTGCGTTGCAGCACCGCAGCTCACGCTTTCAAGGTGGCTGCCCGGGCCACG  2664
            |.||.||.||||||||||||||||||||.|.||||||.||.|||||.||||||||.|||||.|||||.|||||.
Sbjct 2591  CTTCACGGAACACCATCGAGGAGGTGCGCTCCAGCACTGCGGCTCATGCTTTCAAAGTGGCAGCCCGCGCCACT  2664

Query 2665  CTGCGCCGCAGCAACGTCTCCCGCAAGCGGTCCAGCAGCCTTGGAGGCTCCACGGGATCCACCCCCTCCTCCTC  2738
            ||.||||||..||||.|||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|..|||||||||||
Sbjct 2665  CTACGCCGCCCCAACATCTCCCGGAAGCGGTCCAGCAGCCTCGGAGGCTCCACTGGGTCGATTCCCTCCTCCTC  2738

Query 2739  CATCAGCAGCAAGAGCAACAGCGAAGACCCATTCCCACAGCCCGAGAGGCAGAAGCAGCAGCAGCCGCTGGCCC  2812
            ||||||||||||.||||||||||||||||..|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||
Sbjct 2739  CATCAGCAGCAAAAGCAACAGCGAAGACCGGTTCCCACAGCCGGAGAGGCAGAAGCAACAGCAACCACTGGCCC  2812

Query 2813  TAACCCAGCAAGAGCAGCAGCAGCAGCCCCTGACCCTCCCACAGCAGCAACGATC-TCAG---CAGCAGCCCAG  2882
            |.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||..|.|||||||| |.| .|||   ||||||||.||
Sbjct 2813  TGACCCAGCAAGAACAGCAGCAGCAGCCCCTGACTCTCCAGCCGCAGCAAC-AGCAACAGCCACAGCAGCCGAG  2885

Query 2883  ATGCAAGCAGAAGGTCATCTTTGGCAGCGGCACGGTCACCTTCTCACTGAGCTTTGATGAGCCTCAGAAGAACG  2956
            ||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 2886  ATGCAAACAGAAGGTCATCTTCGGCAGTGGCACAGTCACCTTCTCTCTGAGCTTTGATGAGCCTCAGAAGAATG  2959

Query 2957  CCATGGCCCACGGGAATTCTACGCACCAGAACTCCCTGGAGGCCCAGAAAAGCAGCGATACGCTGACCCGACAC  3030
            |.|||||||||.||||.||.|.||.||||||||||||||||||||||||.||||..||.||..|||.|.|||||
Sbjct 2960  CTATGGCCCACAGGAACTCCATGCGCCAGAACTCCCTGGAGGCCCAGAAGAGCAATGACACTTTGAACAGACAC  3033

Query 3031  CAGCCATTACTCCCGCTGCAGTGCGGGGAAACGGACTTAGATCTGACCGTCCAGGAAACAGGTCTGCAAGGACC  3104
            |||.|..|.||.||.||.|||||.|..||..||||||.|||..|||||.|.|||||.||.||..|||||||.||
Sbjct 3034  CAGGCCCTGCTTCCCCTACAGTGTGCAGAGGCGGACTCAGAAATGACCATTCAGGAGACGGGCTTGCAAGGGCC  3107

Query 3105  TGTGGGTGGAGACCAGCGGCCAGAGGTGGAGGACCCTGAAGAGTTGTCCCCAGCACTTGTAGTGTCCAGTTCAC  3178
            ..|||..||.|||||.|.||||||..|.||...|||.||.||..||||||||||.||.||..||||||..||.|
Sbjct 3108  AATGGTGGGGGACCACCAGCCAGAAATAGAAAGCCCAGATGAAATGTCCCCAGCTCTGGTCATGTCCACCTCTC  3181

Query 3179  AGAGCTTTGTCATCAGTGGTGGAGGCAGCACTGTTACAGAAAACGTAGTGAATTCA  3234
            .||||||.||||||||.||||||||.|||.||||.||.||||||.||.||.|.||.
Sbjct 3182  GGAGCTTCGTCATCAGCGGTGGAGGTAGCTCTGTGACGGAAAACATACTGCACTCC  3237