Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000487915
• Subject: XM_006521735.2
• Aligned Length: 3245
• Identities: 2441
• Gaps: 469

Alignment

Query    1  ATGGCATTTTATAGCTGCTGCTGGGTCCTCTTGGCACTCACCTGGCACACCTCTGCCTACGGGCCAGACCAGCG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  AGCCCAAAAGAAGGGGGACATTATCCTTGGGGGGCTCTTTCCTATTCATTTTGGAGTAGCAGCTAAAGATCAAG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  ATCTCAAATCAAGGCCGGAGTCTGTGGAATGTATCAGGTATAATTTCCGTGGGTTTCGCTGGTTACAGGCTATG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  ATATTTGCCATAGAGGAGATAAACAGCAGCCCAGCCCTTCTTCCCAACTTGACGCTGGGATACAGGATATTTGA  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  CACTTGCAACACCGTTTCTAAGGCCTTGGAAGCCACCCTGAGTTTTGTTGCTCAAAACAAAATTGATTCTTTGA  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  ACCTTGATGAGTTCTGCAACTGCTCAGAGCACATTCCCTCTACGATTGCTGTGGTGGGAGCAACTGGCTCAGGC  444
                                                        ||           ||.||            
Sbjct    1  --------------------------------------------AT-----------GAACA------------  7

Query  445  GTCTCCA--CGGCAGTGGCAAATCTGC-----TGGGGCTCTTCTACATTCCCCAGGTCAGTTATGCCTCCTCCA  511
            |||||||  |.|||   |.||.||.||     .|||                 ||||.||.||.||||||||.|
Sbjct    8  GTCTCCATCCTGCA---GGAACTCAGCCTAGGCGGG-----------------AGGTGAGCTACGCCTCCTCTA  61

Query  512  GCAGACTCCTCAGCAACAAGAATCAATTCAAGTCTTTCCTCCGAACCATCCCCAATGATGAGCACCAGGCCACT  585
            ||||.||.||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.||.||.|||||||||||.
Sbjct   62  GCAGGCTTCTCAGCAATAAGAACCAGTTCAAGTCCTTCCTCCGCACCATTCCCAACGACGAACACCAGGCCACC  135

Query  586  GCCATGGCAGACATCATCGAGTATTTCCGCTGGAACTGGGTGGGCACAATTGCAGCTGATGACGACTATGGGCG  659
            ||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||..|
Sbjct  136  GCGATGGCTGACATTATCGAGTATTTCCGTTGGAACTGGGTGGGCACAATTGCAGCCGACGACGACTATGGCAG  209

Query  660  GCCGGGGATTGAGAAATTCCGAGAGGAAGCTGAGGAAAGGGATATCTGCATCGACTTCAGTGAACTCATCTCCC  733
            |||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.||.||||||||||
Sbjct  210  GCCTGGCATTGAGAAGTTCCGAGAGGAAGCCGAGGAGAGGGACATCTGCATTGACTTCAGCGAGCTCATCTCCC  283

Query  734  AGTACTCTGATGAGGAAGAGATCCAGCATGTGGTAGAGGTGATTCAAAATTCCACGGCCAAAGTCATCGTGGTT  807
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.||.||.||.|||||.|||||.||.|||
Sbjct  284  AGTACTCTGATGAGGAAGAGATCCAGCAGGTGGTGGAAGTGATCCAGAACTCTACAGCCAAGGTCATTGTCGTT  357

Query  808  TTCTCCAGTGGCCCAGATCTTGAGCCCCTCATCAAGGAGATTGTCCGGCGCAATATCACGGGCAAGATCTGGCT  881
            ||||||||.||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||.||.||.||.|||||.||||.|||||||||
Sbjct  358  TTCTCCAGCGGCCCAGACCTAGAACCTCTCATCAAGGAGATTGTGCGCCGTAACATCACAGGCAGGATCTGGCT  431

Query  882  GGCCAGCGAGGCCTGGGCCAGCTCCTCCCTGATCGCCATGCCTCAGTACTTCCACGTGGTTGGCGGCACCATTG  955
            |||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||.||||||||||.||.||.||.||.|||||||
Sbjct  432  GGCCAGCGAGGCCTGGGCCAGTTCCTCCCTGATTGCTATGCCTGAGTACTTCCATGTAGTCGGGGGTACCATTG  505

Query  956  GATTCGCTCTGAAGGCTGGGCAGATCCCAGGCTTCCGGGAATTCCTGAAGAAGGTCCATCCCAGGAAGTCTGTC  1029
            |.||||.||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||..||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  506  GGTTCGGTCTGAAGGCTGGGCAGATTCCAGGCTTCCGAGAATTCCTACAGAAAGTCCATCCCAGGAAGTCTGTC  579

Query 1030  CACAATGGTTTTGCCAAGGAGTTTTGGGAAGAAACATTTAACTGCCACCTCCAAGAAGGTGCAAAAGGACCTTT  1103
            |||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||
Sbjct  580  CACAATGGTTTTGCCAAAGAGTTTTGGGAAGAAACATTTAATTGCCACCTGCAAGACGGCGCAAAAGGACCTTT  653

Query 1104  ACCTGTGGACACCTTTCTGAGAGGTCACGAAGAAAGTGGCGACAGGTTTAGCAACAGCTCGACAGCCTTCCGAC  1177
            |||.|||||||||||..|||||.|||||||.|||.|.|||.|||||||...|||.|||||.||.||||||||||
Sbjct  654  ACCCGTGGACACCTTCGTGAGAAGTCACGAGGAAGGCGGCAACAGGTTACTCAATAGCTCCACTGCCTTCCGAC  727

Query 1178  CCCTCTGTACAGGGGATGAGAACATCAGCAGTGTCGAGACCCCTTACATAGATTACACGCATTTACGGATATCC  1251
            |||||||.||.||||||||.|||||||..||||||||||||||||||||.||.|||...|||||||||||||||
Sbjct  728  CCCTCTGCACGGGGGATGAAAACATCAATAGTGTCGAGACCCCTTACATGGACTACGAACATTTACGGATATCC  801

Query 1252  TACAATGTGTACTTAGCAGTCTACTCCATTGCCCACGCCTTGCAAGATATATATACCTGCTTACCTGGGAGAGG  1325
            |||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||.|||||||||||||.|||||||||||.||.|||||
Sbjct  802  TACAACGTGTACTTAGCCGTCTACTCCATTGCGCACGCCCTGCAAGATATATACACCTGCTTACCCGGAAGAGG  875

Query 1326  GCTCTTCACCAATGGCTCCTGTGCAGACATCAAGAAAGTTGAGGCGTGGCAGGTCCTGAAGCACCTACGGCATC  1399
            |||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct  876  GCTTTTCACCAACGGGTCCTGTGCAGACATCAAGAAGGTTGAGGCCTGGCAGGTCCTGAAACACCTACGGCACC  949

Query 1400  TAAACTTTACAAACAATATGGGGGAGCAGGTGACCTTTGATGAGTGTGGTGACCTGGTGGGGAACTATTCCATC  1473
            |.||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  950  TGAATTTCACCAACAACATGGGGGAGCAGGTGACCTTCGATGAGTGCGGTGACCTGGTGGGGAACTACTCCATC  1023

Query 1474  ATCAACTGGCACCTCTCCCCAGAGGATGGCTCCATCGTGTTTAAGGAAGTCGGGTATTACAACGTCTATGCCAA  1547
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||.||.||||||||
Sbjct 1024  ATCAACTGGCACCTCTCCCCAGAGGACGGCTCCATTGTGTTCAAGGAAGTTGGGTACTACAATGTGTATGCCAA  1097

Query 1548  GAAGGGAGAAAGACTCTTCATCAACGAGGAGAAAATCCTGTGGAGTGGGTTCTCCAGGGAGGTGCCCTTCTCCA  1621
            |||||||||||||||.||||||||.||||.|||.|||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1098  GAAGGGAGAAAGACTGTTCATCAATGAGGGGAAGATCTTGTGGAGTGGGTTCTCCAGAGAGGTGCCCTTCTCCA  1171

Query 1622  ACTGCAGCCGAGACTGCCTGGCAGGGACCAGGAAAGGGATCATTGAGGGGGAGCCCACCTGCTGCTTTGAGTGT  1695
            ||||||||||.|||||.|.|||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1172  ACTGCAGCCGGGACTGTCAGGCAGGGACCAGGAAGGGCATCATTGAGGGAGAGCCCACCTGCTGTTTTGAGTGT  1245

Query 1696  GTGGAGTGTCCTGATGGGGAGTATAGTGATGAGACAGATGCCAGTGCCTGTAACAAGTGCCCAGATGACTTCTG  1769
            ||||||||||||||.||.|||||.||||.||||||||||||.|||||||||.||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1246  GTGGAGTGTCCTGACGGCGAGTACAGTGGTGAGACAGATGCGAGTGCCTGTGACAAGTGCCCGGATGACTTCTG  1319

Query 1770  GTCCAATGAGAACCACACCTCCTGCATTGCCAAGGAGATCGAGTTTCTGTCGTGGACGGAGCCCTTTGGGATCG  1843
            ||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||.|||||||.|||||||||||.||||
Sbjct 1320  GTCCAATGAGAACCACACTTCCTGCATTGCCAAGGAGATTGAGTTCCTGGCGTGGACTGAGCCCTTTGGAATCG  1393

Query 1844  CACTCACCCTCTTTGCCGTGCTGGGCATTTTCCTGACAGCCTTTGTGCTGGGTGTGTTTATCAAGTTCCGCAAC  1917
            |.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||
Sbjct 1394  CTCTCACTCTCTTTGCGGTGCTGGGCATTTTCCTGACCGCCTTTGTGCTGGGCGTCTTCATCAAGTTCCGAAAC  1467

Query 1918  ACACCCATTGTCAAGGCCACCAACCGAGAGCTCTCCTACCTCCTCCTCTTCTCCCTGCTCTGCTGCTTCTCCAG  1991
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 1468  ACGCCCATTGTCAAGGCCACCAACCGAGAGCTGTCCTACCTCCTGCTCTTCTCACTCCTCTGCTGCTTCTCCAG  1541

Query 1992  CTCCCTGTTCTTCATCGGGGAGCCCCAGGACTGGACGTGCCGCCTGCGCCAGCCGGCCTTTGGCATCAGCTTCG  2065
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 1542  CTCCCTGTTCTTCATTGGGGAGCCCCAGGACTGGACCTGCCGCCTGCGACAGCCCGCCTTCGGCATCAGCTTCG  1615

Query 2066  TGCTCTGCATCTCATGCATCCTGGTGAAAACCAACCGTGTCCTCCTGGTGTTTGAGGCCAAGATCCCCACCAGC  2139
            ||||.||.|||||.||||||.|||||||.|||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 1616  TGCTTTGTATCTCGTGCATCTTGGTGAAGACCAATCGAGTCCTCCTGGTATTTGAGGCCAAAATACCCACCAGC  1689

Query 2140  TTCCACCGCAAGTGGTGGGGGCTCAACCTGCAGTTCCTGCTGGTTTTCCTCTGCACCTTCATGCAGATTGTCAT  2213
            ||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1690  TTCCACCGGAAGTGGTGGGGACTCAACCTGCAGTTCCTGCTGGTTTTCCTCTGCACCTTCATGCAGATTGTCAT  1763

Query 2214  CTGTGTGATCTGGCTCTACACCGCGCCCCCCTCAAGCTACCGCAACCAGGAGCTGGAGGATGAGATCATCTTCA  2287
            |||..|.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||||
Sbjct 1764  CTGCATCATCTGGCTCTACACGGCACCCCCCTCCAGCTACCGCAACCACGAGCTGGAAGACGAAATCATCTTCA  1837

Query 2288  TCACGTGCCACGAGGGCTCCCTCATGGCCCTGGGCTTCCTGATCGGCTACACCTGCCTGCTGGCTGCCATCTGC  2361
            ||||||||||.||||||||.||||||||.||.||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1838  TCACGTGCCATGAGGGCTCACTCATGGCGCTCGGCTCCCTGATCGGCTACACCTGCCTCCTGGCTGCCATCTGC  1911

Query 2362  TTCTTCTTTGCCTTCAAGTCCCGGAAGCTGCCGGAGAACTTCAATGAAGCCAAGTTCATCACCTTCAGCATGCT  2435
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1912  TTCTTCTTTGCCTTCAAGTCTCGGAAGCTGCCAGAGAACTTCAACGAAGCCAAGTTCATTACCTTCAGCATGCT  1985

Query 2436  CATCTTCTTCATCGTCTGGATCTCCTTCATTCCAGCCTATGCCAGCACCTATGGCAAGTTTGTCTCTGCCGTAG  2509
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1986  CATCTTCTTCATCGTCTGGATCTCCTTCATTCCAGCCTATGCCAGCACCTACGGCAAGTTTGTCTCTGCCGTGG  2059

Query 2510  AGGTGATTGCCATCCTGGCAGCCAGCTTTGGCTTGCTGGCGTGCATCTTCTTCAACAAGATCTACATCATTCTC  2583
            |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||.||||||||||.|||
Sbjct 2060  AGGTGATCGCCATCCTGGCAGCCAGCTTTGGCTTGCTAGCCTGCATCTTCTTCAACAAGGTCTACATCATCCTC  2133

Query 2584  TTCAAGCCATCCCGCAACACCATCGAGGAGGTGCGTTGCAGCACCGCAGCTCACGCTTTCAAGGTGGCTGCCCG  2657
            ||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.|.||||||.||.|||||.||||||||.|||||.|||||
Sbjct 2134  TTCAAGCCTTCACGGAACACCATCGAGGAGGTGCGCTCCAGCACTGCGGCTCATGCTTTCAAAGTGGCAGCCCG  2207

Query 2658  GGCCACGCTGCGCCGCAGCAACGTCTCCCGCAAGCGGTCCAGCAGCCTTGGAGGCTCCACGGGATCCACCCCCT  2731
            .|||||.||.||||||..||||.|||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|..||||
Sbjct 2208  CGCCACTCTACGCCGCCCCAACATCTCCCGGAAGCGGTCCAGCAGCCTCGGAGGCTCCACTGGGTCGATTCCCT  2281

Query 2732  CCTCCTCCATCAGCAGCAAGAGCAACAGCGAAGACCCATTCCCACAGCCCGAGAGGCAGAAGCAGCAGCAGCCG  2805
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||..|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.
Sbjct 2282  CCTCCTCCATCAGCAGCAAAAGCAACAGCGAAGACCGGTTCCCACAGCCGGAGAGGCAGAAGCAACAGCAACCA  2355

Query 2806  CTGGCCCTAACCCAGCAAGAGCAGCAGCAGCAGCCCCTGACCCTCCCACAGCAGCAACGATC-TCAG---CAGC  2875
            ||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||..|.|||||||| |.| .|||   ||||
Sbjct 2356  CTGGCCCTGACCCAGCAAGAACAGCAGCAGCAGCCCCTGACTCTCCAGCCGCAGCAAC-AGCAACAGCCACAGC  2428

Query 2876  AGCCCAGATGCAAGCAGAAGGTCATCTTTGGCAGCGGCACGGTCACCTTCTCACTGAGCTTTGATGAGCCTCAG  2949
            ||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 2429  AGCCGAGATGCAAACAGAAGGTCATCTTCGGCAGTGGCACAGTCACCTTCTCTCTGAGCTTTGATGAGCCTCAG  2502

Query 2950  AAGAACGCCATGGCCCACGGGAATTCTACGCACCAGAACTCCCTGGAGGCCCAGAAAAGCAGCGATACGCTGAC  3023
            |||||.||.|||||||||.||||.||.|.||.||||||||||||||||||||||||.||||..||.||..|||.
Sbjct 2503  AAGAATGCTATGGCCCACAGGAACTCCATGCGCCAGAACTCCCTGGAGGCCCAGAAGAGCAATGACACTTTGAA  2576

Query 3024  CCGACACCAGCCATTACTCCCGCTGCAGTGCGGGGAAACGGACTTAGATCTGACCGTCCAGGAAACAGGTCTGC  3097
            |.||||||||.|..|.||.||.||.|||||.|..||..||||||.|||..|||||.|.|||||.||.||..|||
Sbjct 2577  CAGACACCAGGCCCTGCTTCCCCTACAGTGTGCAGAGGCGGACTCAGAAATGACCATTCAGGAGACGGGCTTGC  2650

Query 3098  AAGGACCTGTGGGTGGAGACCAGCGGCCAGAGGTGGAGGACCCTGAAGAGTTGTCCCCAGCACTTGTAGTGTCC  3171
            ||||.||..|||..||.|||||.|.||||||..|.||...|||.||.||..||||||||||.||.||..|||||
Sbjct 2651  AAGGGCCAATGGTGGGGGACCACCAGCCAGAAATAGAAAGCCCAGATGAAATGTCCCCAGCTCTGGTCATGTCC  2724

Query 3172  AGTTCACAGAGCTTTGTCATCAGTGGTGGAGGCAGCACTGTTACAGAAAACGTAGTGAATTCA  3234
            |..||.|.||||||.||||||||.||||||||.|||.||||.||.||||||.||.||.|.||.
Sbjct 2725  ACCTCTCGGAGCTTCGTCATCAGCGGTGGAGGTAGCTCTGTGACGGAAAACATACTGCACTCC  2787