Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000487915
• Subject: XM_017007324.1
• Aligned Length: 3234
• Identities: 3231
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGCATTTTATAGCTGCTGCTGGGTCCTCTTGGCACTCACCTGGCACACCTCTGCCTACGGGCCAGACCAGCG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCATTTTATAGCTGCTGCTGGGTCCTCTTGGCACTCACCTGGCACACCTCTGCCTACGGGCCAGACCAGCG  74

Query   75  AGCCCAAAAGAAGGGGGACATTATCCTTGGGGGGCTCTTTCCTATTCATTTTGGAGTAGCAGCTAAAGATCAAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGCCCAAAAGAAGGGGGACATTATCCTTGGGGGGCTCTTTCCTATTCATTTTGGAGTAGCAGCTAAAGATCAAG  148

Query  149  ATCTCAAATCAAGGCCGGAGTCTGTGGAATGTATCAGGTATAATTTCCGTGGGTTTCGCTGGTTACAGGCTATG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATCTCAAATCAAGGCCGGAGTCTGTGGAATGTATCAGGTATAATTTCCGTGGGTTTCGCTGGTTACAGGCTATG  222

Query  223  ATATTTGCCATAGAGGAGATAAACAGCAGCCCAGCCCTTCTTCCCAACTTGACGCTGGGATACAGGATATTTGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATATTTGCCATAGAGGAGATAAACAGCAGCCCAGCCCTTCTTCCCAACTTGACGCTGGGATACAGGATATTTGA  296

Query  297  CACTTGCAACACCGTTTCTAAGGCCTTGGAAGCCACCCTGAGTTTTGTTGCTCAAAACAAAATTGATTCTTTGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CACTTGCAACACCGTTTCTAAGGCCTTGGAAGCCACCCTGAGTTTTGTTGCTCAAAACAAAATTGATTCTTTGA  370

Query  371  ACCTTGATGAGTTCTGCAACTGCTCAGAGCACATTCCCTCTACGATTGCTGTGGTGGGAGCAACTGGCTCAGGC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACCTTGATGAGTTCTGCAACTGCTCAGAGCACATTCCCTCTACGATTGCTGTGGTGGGAGCAACTGGCTCAGGC  444

Query  445  GTCTCCACGGCAGTGGCAAATCTGCTGGGGCTCTTCTACATTCCCCAGGTCAGTTATGCCTCCTCCAGCAGACT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTCTCCACGGCAGTGGCAAATCTGCTGGGGCTCTTCTACATTCCCCAGGTCAGTTATGCCTCCTCCAGCAGACT  518

Query  519  CCTCAGCAACAAGAATCAATTCAAGTCTTTCCTCCGAACCATCCCCAATGATGAGCACCAGGCCACTGCCATGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCTCAGCAACAAGAATCAATTCAAGTCTTTCCTCCGAACCATCCCCAATGATGAGCACCAGGCCACTGCCATGG  592

Query  593  CAGACATCATCGAGTATTTCCGCTGGAACTGGGTGGGCACAATTGCAGCTGATGACGACTATGGGCGGCCGGGG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CAGACATCATCGAGTATTTCCGCTGGAACTGGGTGGGCACAATTGCAGCTGATGACGACTATGGGCGGCCGGGG  666

Query  667  ATTGAGAAATTCCGAGAGGAAGCTGAGGAAAGGGATATCTGCATCGACTTCAGTGAACTCATCTCCCAGTACTC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATTGAGAAATTCCGAGAGGAAGCTGAGGAAAGGGATATCTGCATCGACTTCAGTGAACTCATCTCCCAGTACTC  740

Query  741  TGATGAGGAAGAGATCCAGCATGTGGTAGAGGTGATTCAAAATTCCACGGCCAAAGTCATCGTGGTTTTCTCCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGATGAGGAAGAGATCCAGCATGTGGTAGAGGTGATTCAAAATTCCACGGCCAAAGTCATCGTGGTTTTCTCCA  814

Query  815  GTGGCCCAGATCTTGAGCCCCTCATCAAGGAGATTGTCCGGCGCAATATCACGGGCAAGATCTGGCTGGCCAGC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GTGGCCCAGATCTTGAGCCCCTCATCAAGGAGATTGTCCGGCGCAATATCACGGGCAAGATCTGGCTGGCCAGC  888

Query  889  GAGGCCTGGGCCAGCTCCTCCCTGATCGCCATGCCTCAGTACTTCCACGTGGTTGGCGGCACCATTGGATTCGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAGGCCTGGGCCAGCTCCTCCCTGATCGCCATGCCTCAGTACTTCCACGTGGTTGGCGGCACCATTGGATTCGC  962

Query  963  TCTGAAGGCTGGGCAGATCCCAGGCTTCCGGGAATTCCTGAAGAAGGTCCATCCCAGGAAGTCTGTCCACAATG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TCTGAAGGCTGGGCAGATCCCAGGCTTCCGGGAATTCCTGAAGAAGGTCCATCCCAGGAAGTCTGTCCACAATG  1036

Query 1037  GTTTTGCCAAGGAGTTTTGGGAAGAAACATTTAACTGCCACCTCCAAGAAGGTGCAAAAGGACCTTTACCTGTG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GTTTTGCCAAGGAGTTTTGGGAAGAAACATTTAACTGCCACCTCCAAGAAGGTGCAAAAGGACCTTTACCTGTG  1110

Query 1111  GACACCTTTCTGAGAGGTCACGAAGAAAGTGGCGACAGGTTTAGCAACAGCTCGACAGCCTTCCGACCCCTCTG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GACACCTTTCTGAGAGGTCACGAAGAAAGTGGCGACAGGTTTAGCAACAGCTCGACAGCCTTCCGACCCCTCTG  1184

Query 1185  TACAGGGGATGAGAACATCAGCAGTGTCGAGACCCCTTACATAGATTACACGCATTTACGGATATCCTACAATG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TACAGGGGATGAGAACATCAGCAGTGTCGAGACCCCTTACATAGATTACACGCATTTACGGATATCCTACAATG  1258

Query 1259  TGTACTTAGCAGTCTACTCCATTGCCCACGCCTTGCAAGATATATATACCTGCTTACCTGGGAGAGGGCTCTTC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGTACTTAGCAGTCTACTCCATTGCCCACGCCTTGCAAGATATATATACCTGCTTACCTGGGAGAGGGCTCTTC  1332

Query 1333  ACCAATGGCTCCTGTGCAGACATCAAGAAAGTTGAGGCGTGGCAGGTCCTGAAGCACCTACGGCATCTAAACTT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ACCAATGGCTCCTGTGCAGACATCAAGAAAGTTGAGGCGTGGCAGGTCCTGAAGCACCTACGGCATCTAAACTT  1406

Query 1407  TACAAACAATATGGGGGAGCAGGTGACCTTTGATGAGTGTGGTGACCTGGTGGGGAACTATTCCATCATCAACT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TACAAACAATATGGGGGAGCAGGTGACCTTTGATGAGTGTGGTGACCTGGTGGGGAACTATTCCATCATCAACT  1480

Query 1481  GGCACCTCTCCCCAGAGGATGGCTCCATCGTGTTTAAGGAAGTCGGGTATTACAACGTCTATGCCAAGAAGGGA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GGCACCTCTCCCCAGAGGATGGCTCCATCGTGTTTAAGGAAGTCGGGTATTACAACGTCTATGCCAAGAAGGGA  1554

Query 1555  GAAAGACTCTTCATCAACGAGGAGAAAATCCTGTGGAGTGGGTTCTCCAGGGAGGTGCCCTTCTCCAACTGCAG  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GAAAGACTCTTCATCAACGAGGAGAAAATCCTGTGGAGTGGGTTCTCCAGGGAGGTGCCCTTCTCCAACTGCAG  1628

Query 1629  CCGAGACTGCCTGGCAGGGACCAGGAAAGGGATCATTGAGGGGGAGCCCACCTGCTGCTTTGAGTGTGTGGAGT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CCGAGACTGCCTGGCAGGGACCAGGAAAGGGATCATTGAGGGGGAGCCCACCTGCTGCTTTGAGTGTGTGGAGT  1702

Query 1703  GTCCTGATGGGGAGTATAGTGATGAGACAGATGCCAGTGCCTGTAACAAGTGCCCAGATGACTTCTGGTCCAAT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GTCCTGATGGGGAGTATAGTGATGAGACAGATGCCAGTGCCTGTAACAAGTGCCCAGATGACTTCTGGTCCAAT  1776

Query 1777  GAGAACCACACCTCCTGCATTGCCAAGGAGATCGAGTTTCTGTCGTGGACGGAGCCCTTTGGGATCGCACTCAC  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GAGAACCACACCTCCTGCATTGCCAAGGAGATCGAGTTTCTGTCGTGGACGGAGCCCTTTGGGATCGCACTCAC  1850

Query 1851  CCTCTTTGCCGTGCTGGGCATTTTCCTGACAGCCTTTGTGCTGGGTGTGTTTATCAAGTTCCGCAACACACCCA  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CCTCTTTGCCGTGCTGGGCATTTTCCTGACAGCCTTTGTGCTGGGTGTGTTTATCAAGTTCCGCAACACACCCA  1924

Query 1925  TTGTCAAGGCCACCAACCGAGAGCTCTCCTACCTCCTCCTCTTCTCCCTGCTCTGCTGCTTCTCCAGCTCCCTG  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  TTGTCAAGGCCACCAACCGAGAGCTCTCCTACCTCCTCCTCTTCTCCCTGCTCTGCTGCTTCTCCAGCTCCCTG  1998

Query 1999  TTCTTCATCGGGGAGCCCCAGGACTGGACGTGCCGCCTGCGCCAGCCGGCCTTTGGCATCAGCTTCGTGCTCTG  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  TTCTTCATCGGGGAGCCCCAGGACTGGACGTGCCGCCTGCGCCAGCCGGCCTTTGGCATCAGCTTCGTGCTCTG  2072

Query 2073  CATCTCATGCATCCTGGTGAAAACCAACCGTGTCCTCCTGGTGTTTGAGGCCAAGATCCCCACCAGCTTCCACC  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CATCTCATGCATCCTGGTGAAAACCAACCGTGTCCTCCTGGTGTTTGAGGCCAAGATCCCCACCAGCTTCCACC  2146

Query 2147  GCAAGTGGTGGGGGCTCAACCTGCAGTTCCTGCTGGTTTTCCTCTGCACCTTCATGCAGATTGTCATCTGTGTG  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  GCAAGTGGTGGGGGCTCAACCTGCAGTTCCTGCTGGTTTTCCTCTGCACCTTCATGCAGATTGTCATCTGTGTG  2220

Query 2221  ATCTGGCTCTACACCGCGCCCCCCTCAAGCTACCGCAACCAGGAGCTGGAGGATGAGATCATCTTCATCACGTG  2294
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  ATCTGGCTCTACACCGCGCCCCCGTCAAGCTACCGCAACCAGGAGCTGGAGGATGAGATCATCTTCATCACGTG  2294

Query 2295  CCACGAGGGCTCCCTCATGGCCCTGGGCTTCCTGATCGGCTACACCTGCCTGCTGGCTGCCATCTGCTTCTTCT  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  CCACGAGGGCTCCCTCATGGCCCTGGGCTTCCTGATCGGCTACACCTGCCTGCTGGCTGCCATCTGCTTCTTCT  2368

Query 2369  TTGCCTTCAAGTCCCGGAAGCTGCCGGAGAACTTCAATGAAGCCAAGTTCATCACCTTCAGCATGCTCATCTTC  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  TTGCCTTCAAGTCCCGGAAGCTGCCGGAGAACTTCAATGAAGCCAAGTTCATCACCTTCAGCATGCTCATCTTC  2442

Query 2443  TTCATCGTCTGGATCTCCTTCATTCCAGCCTATGCCAGCACCTATGGCAAGTTTGTCTCTGCCGTAGAGGTGAT  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  TTCATCGTCTGGATCTCCTTCATTCCAGCCTATGCCAGCACCTATGGCAAGTTTGTCTCTGCCGTAGAGGTGAT  2516

Query 2517  TGCCATCCTGGCAGCCAGCTTTGGCTTGCTGGCGTGCATCTTCTTCAACAAGATCTACATCATTCTCTTCAAGC  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  TGCCATCCTGGCAGCCAGCTTTGGCTTGCTGGCGTGCATCTTCTTCAACAAGATCTACATCATTCTCTTCAAGC  2590

Query 2591  CATCCCGCAACACCATCGAGGAGGTGCGTTGCAGCACCGCAGCTCACGCTTTCAAGGTGGCTGCCCGGGCCACG  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  CATCCCGCAACACCATCGAGGAGGTGCGTTGCAGCACCGCAGCTCACGCTTTCAAGGTGGCTGCCCGGGCCACG  2664

Query 2665  CTGCGCCGCAGCAACGTCTCCCGCAAGCGGTCCAGCAGCCTTGGAGGCTCCACGGGATCCACCCCCTCCTCCTC  2738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  CTGCGCCGCAGCAACGTCTCCCGCAAGCGGTCCAGCAGCCTTGGAGGCTCCACGGGATCCACCCCCTCCTCCTC  2738

Query 2739  CATCAGCAGCAAGAGCAACAGCGAAGACCCATTCCCACAGCCCGAGAGGCAGAAGCAGCAGCAGCCGCTGGCCC  2812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  CATCAGCAGCAAGAGCAACAGCGAAGACCCATTCCCACAGCCCGAGAGGCAGAAGCAGCAGCAGCCGCTGGCCC  2812

Query 2813  TAACCCAGCAAGAGCAGCAGCAGCAGCCCCTGACCCTCCCACAGCAGCAACGATCTCAGCAGCAGCCCAGATGC  2886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  TAACCCAGCAAGAGCAGCAGCAGCAGCCCCTGACCCTCCCACAGCAGCAACGATCTCAGCAGCAGCCCAGATGC  2886

Query 2887  AAGCAGAAGGTCATCTTTGGCAGCGGCACGGTCACCTTCTCACTGAGCTTTGATGAGCCTCAGAAGAACGCCAT  2960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  AAGCAGAAGGTCATCTTTGGCAGCGGCACGGTCACCTTCTCACTGAGCTTTGATGAGCCTCAGAAGAACGCCAT  2960

Query 2961  GGCCCACGGGAATTCTACGCACCAGAACTCCCTGGAGGCCCAGAAAAGCAGCGATACGCTGACCCGACACCAGC  3034
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 2961  GGCCCACAGGAATTCTACGCACCAGAACTCCCTGGAGGCCCAGAAAAGCAGCGATACGCTGACCCGACACGAGC  3034

Query 3035  CATTACTCCCGCTGCAGTGCGGGGAAACGGACTTAGATCTGACCGTCCAGGAAACAGGTCTGCAAGGACCTGTG  3108
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035  CATTACTCCCGCTGCAGTGCGGGGAAACGGACTTAGATCTGACCGTCCAGGAAACAGGTCTGCAAGGACCTGTG  3108

Query 3109  GGTGGAGACCAGCGGCCAGAGGTGGAGGACCCTGAAGAGTTGTCCCCAGCACTTGTAGTGTCCAGTTCACAGAG  3182
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109  GGTGGAGACCAGCGGCCAGAGGTGGAGGACCCTGAAGAGTTGTCCCCAGCACTTGTAGTGTCCAGTTCACAGAG  3182

Query 3183  CTTTGTCATCAGTGGTGGAGGCAGCACTGTTACAGAAAACGTAGTGAATTCA  3234
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183  CTTTGTCATCAGTGGTGGAGGCAGCACTGTTACAGAAAACGTAGTGAATTCA  3234