Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000487915
Subject:
XM_017316856.1
Aligned Length:
3238
Identities:
2333
Gaps:
593

Alignment

Query    1  ATGGCATTTTATAGCTGCTGCTGGGTCCTCTTGGCACTCACCTGGCACACCTCTGCCTACGGGCCAGACCAGCG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  AGCCCAAAAGAAGGGGGACATTATCCTTGGGGGGCTCTTTCCTATTCATTTTGGAGTAGCAGCTAAAGATCAAG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  ATCTCAAATCAAGGCCGGAGTCTGTGGAATGTATCAGGTATAATTTCCGTGGGTTTCGCTGGTTACAGGCTATG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  ATATTTGCCATAGAGGAGATAAACAGCAGCCCAGCCCTTCTTCCCAACTTGACGCTGGGATACAGGATATTTGA  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  CACTTGCAACACCGTTTCTAAGGCCTTGGAAGCCACCCTGAGTTTTGTTGCTCAAAACAAAATTGATTCTTTGA  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  ACCTTGATGAGTTCTGCAACTGCTCAGAGCACATTCCCTCTACGATTGCTGTGGTGGGAGCAACTGGCTCAGGC  444
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  445  GTCTCCACGGCAGTGGCAAATCTGCTGGGGCTCTTCTACATTCCCCAGGTCAGTTATGCCTCCTCCAGCAGACT  518
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  519  CCTCAGCAACAAGAATCAATTCAAGTCTTTCCTCCGAACCATCCCCAATGATGAGCACCAGGCCACTGCCATGG  592
                                                                                  ||||
Sbjct    1  ----------------------------------------------------------------------ATGG  4

Query  593  CAGACATCATCGAGTATTTCCGCTGGAACTGGGTGGGCACAATTGCAGCTGATGACGACTATGGGCGGCCGGGG  666
            |.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||..||||.||.
Sbjct    5  CTGACATTATCGAGTATTTCCGTTGGAACTGGGTGGGCACAATTGCAGCCGACGACGACTATGGCAGGCCTGGC  78

Query  667  ATTGAGAAATTCCGAGAGGAAGCTGAGGAAAGGGATATCTGCATCGACTTCAGTGAACTCATCTCCCAGTACTC  740
            ||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct   79  ATTGAGAAGTTCCGAGAGGAAGCCGAGGAGAGGGACATCTGCATTGACTTCAGCGAGCTCATCTCCCAGTACTC  152

Query  741  TGATGAGGAAGAGATCCAGCATGTGGTAGAGGTGATTCAAAATTCCACGGCCAAAGTCATCGTGGTTTTCTCCA  814
            |||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.||.||.||.|||||.|||||.||.||||||||||
Sbjct  153  TGATGAGGAAGAGATCCAGCAGGTGGTGGAAGTGATCCAGAACTCTACAGCCAAGGTCATTGTCGTTTTCTCCA  226

Query  815  GTGGCCCAGATCTTGAGCCCCTCATCAAGGAGATTGTCCGGCGCAATATCACGGGCAAGATCTGGCTGGCCAGC  888
            |.||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||.||.||.||.|||||.||||.||||||||||||||||
Sbjct  227  GCGGCCCAGACCTAGAACCTCTCATCAAGGAGATTGTGCGCCGTAACATCACAGGCAGGATCTGGCTGGCCAGC  300

Query  889  GAGGCCTGGGCCAGCTCCTCCCTGATCGCCATGCCTCAGTACTTCCACGTGGTTGGCGGCACCATTGGATTCGC  962
            ||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||.||||||||||.||.||.||.||.||||||||.||||.
Sbjct  301  GAGGCCTGGGCCAGTTCCTCCCTGATTGCTATGCCTGAGTACTTCCATGTAGTCGGGGGTACCATTGGGTTCGG  374

Query  963  TCTGAAGGCTGGGCAGATCCCAGGCTTCCGGGAATTCCTGAAGAAGGTCCATCCCAGGAAGTCTGTCCACAATG  1036
            ||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||..||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  375  TCTGAAGGCTGGGCAGATTCCAGGCTTCCGAGAATTCCTACAGAAAGTCCATCCCAGGAAGTCTGTCCACAATG  448

Query 1037  GTTTTGCCAAGGAGTTTTGGGAAGAAACATTTAACTGCCACCTCCAAGAAGGTGCAAAAGGACCTTTACCTGTG  1110
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct  449  GTTTTGCCAAAGAGTTTTGGGAAGAAACATTTAATTGCCACCTGCAAGACGGCGCAAAAGGACCTTTACCCGTG  522

Query 1111  GACACCTTTCTGAGAGGTCACGAAGAAAGTGGCGACAGGTTTAGCAACAGCTCGACAGCCTTCCGACCCCTCTG  1184
            ||||||||..|||||.|||||||.|||.|.|||.|||||||...|||.|||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct  523  GACACCTTCGTGAGAAGTCACGAGGAAGGCGGCAACAGGTTACTCAATAGCTCCACTGCCTTCCGACCCCTCTG  596

Query 1185  TACAGGGGATGAGAACATCAGCAGTGTCGAGACCCCTTACATAGATTACACGCATTTACGGATATCCTACAATG  1258
            .||.||||||||.|||||||..||||||||||||||||||||.||.|||...||||||||||||||||||||.|
Sbjct  597  CACGGGGGATGAAAACATCAATAGTGTCGAGACCCCTTACATGGACTACGAACATTTACGGATATCCTACAACG  670

Query 1259  TGTACTTAGCAGTCTACTCCATTGCCCACGCCTTGCAAGATATATATACCTGCTTACCTGGGAGAGGGCTCTTC  1332
            ||||||||||.||||||||||||||.||||||.|||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||
Sbjct  671  TGTACTTAGCCGTCTACTCCATTGCGCACGCCCTGCAAGATATATACACCTGCTTACCCGGAAGAGGGCTTTTC  744

Query 1333  ACCAATGGCTCCTGTGCAGACATCAAGAAAGTTGAGGCGTGGCAGGTCCTGAAGCACCTACGGCATCTAAACTT  1406
            |||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||
Sbjct  745  ACCAACGGGTCCTGTGCAGACATCAAGAAGGTTGAGGCCTGGCAGGTCCTGAAACACCTACGGCACCTGAATTT  818

Query 1407  TACAAACAATATGGGGGAGCAGGTGACCTTTGATGAGTGTGGTGACCTGGTGGGGAACTATTCCATCATCAACT  1480
            .||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  819  CACCAACAACATGGGGGAGCAGGTGACCTTCGATGAGTGCGGTGACCTGGTGGGGAACTACTCCATCATCAACT  892

Query 1481  GGCACCTCTCCCCAGAGGATGGCTCCATCGTGTTTAAGGAAGTCGGGTATTACAACGTCTATGCCAAGAAGGGA  1554
            |||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||
Sbjct  893  GGCACCTCTCCCCAGAGGACGGCTCCATTGTGTTCAAGGAAGTTGGGTACTACAATGTGTATGCCAAGAAGGGA  966

Query 1555  GAAAGACTCTTCATCAACGAGGAGAAAATCCTGTGGAGTGGGTTCTCCAGGGAGGTGCCCTTCTCCAACTGCAG  1628
            ||||||||.||||||||.||||.|||.|||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  967  GAAAGACTGTTCATCAATGAGGGGAAGATCTTGTGGAGTGGGTTCTCCAGAGAGGTGCCCTTCTCCAACTGCAG  1040

Query 1629  CCGAGACTGCCTGGCAGGGACCAGGAAAGGGATCATTGAGGGGGAGCCCACCTGCTGCTTTGAGTGTGTGGAGT  1702
            |||.|||||.|.|||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1041  CCGGGACTGTCAGGCAGGGACCAGGAAGGGCATCATTGAGGGAGAGCCCACCTGCTGTTTTGAGTGTGTGGAGT  1114

Query 1703  GTCCTGATGGGGAGTATAGTGATGAGACAGATGCCAGTGCCTGTAACAAGTGCCCAGATGACTTCTGGTCCAAT  1776
            |||||||.||.|||||.||||.||||||||||||.|||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1115  GTCCTGACGGCGAGTACAGTGGTGAGACAGATGCGAGTGCCTGTGACAAGTGCCCGGATGACTTCTGGTCCAAT  1188

Query 1777  GAGAACCACACCTCCTGCATTGCCAAGGAGATCGAGTTTCTGTCGTGGACGGAGCCCTTTGGGATCGCACTCAC  1850
            |||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||.|||||||.|||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1189  GAGAACCACACTTCCTGCATTGCCAAGGAGATTGAGTTCCTGGCGTGGACTGAGCCCTTTGGAATCGCTCTCAC  1262

Query 1851  CCTCTTTGCCGTGCTGGGCATTTTCCTGACAGCCTTTGTGCTGGGTGTGTTTATCAAGTTCCGCAACACACCCA  1924
            .||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.||||
Sbjct 1263  TCTCTTTGCGGTGCTGGGCATTTTCCTGACCGCCTTTGTGCTGGGCGTCTTCATCAAGTTCCGAAACACGCCCA  1336

Query 1925  TTGTCAAGGCCACCAACCGAGAGCTCTCCTACCTCCTCCTCTTCTCCCTGCTCTGCTGCTTCTCCAGCTCCCTG  1998
            |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1337  TTGTCAAGGCCACCAACCGAGAGCTGTCCTACCTCCTGCTCTTCTCACTCCTCTGCTGCTTCTCCAGCTCCCTG  1410

Query 1999  TTCTTCATCGGGGAGCCCCAGGACTGGACGTGCCGCCTGCGCCAGCCGGCCTTTGGCATCAGCTTCGTGCTCTG  2072
            ||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 1411  TTCTTCATTGGGGAGCCCCAGGACTGGACCTGCCGCCTGCGACAGCCCGCCTTCGGCATCAGCTTCGTGCTTTG  1484

Query 2073  CATCTCATGCATCCTGGTGAAAACCAACCGTGTCCTCCTGGTGTTTGAGGCCAAGATCCCCACCAGCTTCCACC  2146
            .|||||.||||||.|||||||.|||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||
Sbjct 1485  TATCTCGTGCATCTTGGTGAAGACCAATCGAGTCCTCCTGGTATTTGAGGCCAAAATACCCACCAGCTTCCACC  1558

Query 2147  GCAAGTGGTGGGGGCTCAACCTGCAGTTCCTGCTGGTTTTCCTCTGCACCTTCATGCAGATTGTCATCTGTGTG  2220
            |.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|.
Sbjct 1559  GGAAGTGGTGGGGACTCAACCTGCAGTTCCTGCTGGTTTTCCTCTGCACCTTCATGCAGATTGTCATCTGCATC  1632

Query 2221  ATCTGGCTCTACACCGCGCCCCCCTCAAGCTACCGCAACCAGGAGCTGGAGGATGAGATCATCTTCATCACGTG  2294
            ||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 1633  ATCTGGCTCTACACGGCACCCCCCTCCAGCTACCGCAACCACGAGCTGGAAGACGAAATCATCTTCATCACGTG  1706

Query 2295  CCACGAGGGCTCCCTCATGGCCCTGGGCTTCCTGATCGGCTACACCTGCCTGCTGGCTGCCATCTGCTTCTTCT  2368
            |||.||||||||.||||||||.||.||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1707  CCATGAGGGCTCACTCATGGCGCTCGGCTCCCTGATCGGCTACACCTGCCTCCTGGCTGCCATCTGCTTCTTCT  1780

Query 2369  TTGCCTTCAAGTCCCGGAAGCTGCCGGAGAACTTCAATGAAGCCAAGTTCATCACCTTCAGCATGCTCATCTTC  2442
            |||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1781  TTGCCTTCAAGTCTCGGAAGCTGCCAGAGAACTTCAACGAAGCCAAGTTCATTACCTTCAGCATGCTCATCTTC  1854

Query 2443  TTCATCGTCTGGATCTCCTTCATTCCAGCCTATGCCAGCACCTATGGCAAGTTTGTCTCTGCCGTAGAGGTGAT  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1855  TTCATCGTCTGGATCTCCTTCATTCCAGCCTATGCCAGCACCTACGGCAAGTTTGTCTCTGCCGTGGAGGTGAT  1928

Query 2517  TGCCATCCTGGCAGCCAGCTTTGGCTTGCTGGCGTGCATCTTCTTCAACAAGATCTACATCATTCTCTTCAAGC  2590
            .|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||
Sbjct 1929  CGCCATCCTGGCAGCCAGCTTTGGCTTGCTAGCCTGCATCTTCTTCAACAAGGTCTACATCATCCTCTTCAAGC  2002

Query 2591  CATCCCGCAACACCATCGAGGAGGTGCGTTGCAGCACCGCAGCTCACGCTTTCAAGGTGGCTGCCCGGGCCACG  2664
            |.||.||.||||||||||||||||||||.|.||||||.||.|||||.||||||||.|||||.|||||.|||||.
Sbjct 2003  CTTCACGGAACACCATCGAGGAGGTGCGCTCCAGCACTGCGGCTCATGCTTTCAAAGTGGCAGCCCGCGCCACT  2076

Query 2665  CTGCGCCGCAGCAACGTCTCCCGCAAGCGGTCCAGCAGCCTTGGAGGCTCCACGGGATCCACCCCCTCCTCCTC  2738
            ||.||||||..||||.|||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|..|||||||||||
Sbjct 2077  CTACGCCGCCCCAACATCTCCCGGAAGCGGTCCAGCAGCCTCGGAGGCTCCACTGGGTCGATTCCCTCCTCCTC  2150

Query 2739  CATCAGCAGCAAGAGCAACAGCGAAGACCCATTCCCACAGCCCGAGAGGCAGAAGCAGCAGCAGCCGCTGGCCC  2812
            ||||||||||||.||||||||||||||||..|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||
Sbjct 2151  CATCAGCAGCAAAAGCAACAGCGAAGACCGGTTCCCACAGCCGGAGAGGCAGAAGCAACAGCAACCACTGGCCC  2224

Query 2813  TAACCCAGCAAGAGCAGCAGCAGCAGCCCCTGACCCTCCCACAGCAGCAACGATC-TCAG---CAGCAGCCCAG  2882
            |.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||..|.|||||||| |.| .|||   ||||||||.||
Sbjct 2225  TGACCCAGCAAGAACAGCAGCAGCAGCCCCTGACTCTCCAGCCGCAGCAAC-AGCAACAGCCACAGCAGCCGAG  2297

Query 2883  ATGCAAGCAGAAGGTCATCTTTGGCAGCGGCACGGTCACCTTCTCACTGAGCTTTGATGAGCCTCAGAAGAACG  2956
            ||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 2298  ATGCAAACAGAAGGTCATCTTCGGCAGTGGCACAGTCACCTTCTCTCTGAGCTTTGATGAGCCTCAGAAGAATG  2371

Query 2957  CCATGGCCCACGGGAATTCTACGCACCAGAACTCCCTGGAGGCCCAGAAAAGCAGCGATACGCTGACCCGACAC  3030
            |.|||||||||.||||.||.|.||.||||||||||||||||||||||||.||||..||.||..|||.|.|||||
Sbjct 2372  CTATGGCCCACAGGAACTCCATGCGCCAGAACTCCCTGGAGGCCCAGAAGAGCAATGACACTTTGAACAGACAC  2445

Query 3031  CAGCCATTACTCCCGCTGCAGTGCGGGGAAACGGACTTAGATCTGACCGTCCAGGAAACAGGTCTGCAAGGACC  3104
            |||.|..|.||.||.||.|||||.|..||..||||||.|||..|||||.|.|||||.||.||..|||||||.||
Sbjct 2446  CAGGCCCTGCTTCCCCTACAGTGTGCAGAGGCGGACTCAGAAATGACCATTCAGGAGACGGGCTTGCAAGGGCC  2519

Query 3105  TGTGGGTGGAGACCAGCGGCCAGAGGTGGAGGACCCTGAAGAGTTGTCCCCAGCACTTGTAGTGTCCAGTTCAC  3178
            ..|||..||.|||||.|.||||||..|.||...|||.||.||..||||||||||.||.||..||||||..||.|
Sbjct 2520  AATGGTGGGGGACCACCAGCCAGAAATAGAAAGCCCAGATGAAATGTCCCCAGCTCTGGTCATGTCCACCTCTC  2593

Query 3179  AGAGCTTTGTCATCAGTGGTGGAGGCAGCACTGTTACAGAAAACGTAGTGAATTCA  3234
            .||||||.||||||||.||||||||.|||.||||.||.||||||.||.||.|.||.
Sbjct 2594  GGAGCTTCGTCATCAGCGGTGGAGGTAGCTCTGTGACGGAAAACATACTGCACTCC  2649