Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000487915
- Subject:
- XM_017316856.1
- Aligned Length:
- 3238
- Identities:
- 2333
- Gaps:
- 593
Alignment
Query 1 ATGGCATTTTATAGCTGCTGCTGGGTCCTCTTGGCACTCACCTGGCACACCTCTGCCTACGGGCCAGACCAGCG 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 AGCCCAAAAGAAGGGGGACATTATCCTTGGGGGGCTCTTTCCTATTCATTTTGGAGTAGCAGCTAAAGATCAAG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 ATCTCAAATCAAGGCCGGAGTCTGTGGAATGTATCAGGTATAATTTCCGTGGGTTTCGCTGGTTACAGGCTATG 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 ATATTTGCCATAGAGGAGATAAACAGCAGCCCAGCCCTTCTTCCCAACTTGACGCTGGGATACAGGATATTTGA 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 CACTTGCAACACCGTTTCTAAGGCCTTGGAAGCCACCCTGAGTTTTGTTGCTCAAAACAAAATTGATTCTTTGA 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 ACCTTGATGAGTTCTGCAACTGCTCAGAGCACATTCCCTCTACGATTGCTGTGGTGGGAGCAACTGGCTCAGGC 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 GTCTCCACGGCAGTGGCAAATCTGCTGGGGCTCTTCTACATTCCCCAGGTCAGTTATGCCTCCTCCAGCAGACT 518
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 519 CCTCAGCAACAAGAATCAATTCAAGTCTTTCCTCCGAACCATCCCCAATGATGAGCACCAGGCCACTGCCATGG 592
||||
Sbjct 1 ----------------------------------------------------------------------ATGG 4
Query 593 CAGACATCATCGAGTATTTCCGCTGGAACTGGGTGGGCACAATTGCAGCTGATGACGACTATGGGCGGCCGGGG 666
|.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||..||||.||.
Sbjct 5 CTGACATTATCGAGTATTTCCGTTGGAACTGGGTGGGCACAATTGCAGCCGACGACGACTATGGCAGGCCTGGC 78
Query 667 ATTGAGAAATTCCGAGAGGAAGCTGAGGAAAGGGATATCTGCATCGACTTCAGTGAACTCATCTCCCAGTACTC 740
||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 79 ATTGAGAAGTTCCGAGAGGAAGCCGAGGAGAGGGACATCTGCATTGACTTCAGCGAGCTCATCTCCCAGTACTC 152
Query 741 TGATGAGGAAGAGATCCAGCATGTGGTAGAGGTGATTCAAAATTCCACGGCCAAAGTCATCGTGGTTTTCTCCA 814
|||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.||.||.||.|||||.|||||.||.||||||||||
Sbjct 153 TGATGAGGAAGAGATCCAGCAGGTGGTGGAAGTGATCCAGAACTCTACAGCCAAGGTCATTGTCGTTTTCTCCA 226
Query 815 GTGGCCCAGATCTTGAGCCCCTCATCAAGGAGATTGTCCGGCGCAATATCACGGGCAAGATCTGGCTGGCCAGC 888
|.||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||.||.||.||.|||||.||||.||||||||||||||||
Sbjct 227 GCGGCCCAGACCTAGAACCTCTCATCAAGGAGATTGTGCGCCGTAACATCACAGGCAGGATCTGGCTGGCCAGC 300
Query 889 GAGGCCTGGGCCAGCTCCTCCCTGATCGCCATGCCTCAGTACTTCCACGTGGTTGGCGGCACCATTGGATTCGC 962
||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||.||||||||||.||.||.||.||.||||||||.||||.
Sbjct 301 GAGGCCTGGGCCAGTTCCTCCCTGATTGCTATGCCTGAGTACTTCCATGTAGTCGGGGGTACCATTGGGTTCGG 374
Query 963 TCTGAAGGCTGGGCAGATCCCAGGCTTCCGGGAATTCCTGAAGAAGGTCCATCCCAGGAAGTCTGTCCACAATG 1036
||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||..||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 375 TCTGAAGGCTGGGCAGATTCCAGGCTTCCGAGAATTCCTACAGAAAGTCCATCCCAGGAAGTCTGTCCACAATG 448
Query 1037 GTTTTGCCAAGGAGTTTTGGGAAGAAACATTTAACTGCCACCTCCAAGAAGGTGCAAAAGGACCTTTACCTGTG 1110
||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 449 GTTTTGCCAAAGAGTTTTGGGAAGAAACATTTAATTGCCACCTGCAAGACGGCGCAAAAGGACCTTTACCCGTG 522
Query 1111 GACACCTTTCTGAGAGGTCACGAAGAAAGTGGCGACAGGTTTAGCAACAGCTCGACAGCCTTCCGACCCCTCTG 1184
||||||||..|||||.|||||||.|||.|.|||.|||||||...|||.|||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 523 GACACCTTCGTGAGAAGTCACGAGGAAGGCGGCAACAGGTTACTCAATAGCTCCACTGCCTTCCGACCCCTCTG 596
Query 1185 TACAGGGGATGAGAACATCAGCAGTGTCGAGACCCCTTACATAGATTACACGCATTTACGGATATCCTACAATG 1258
.||.||||||||.|||||||..||||||||||||||||||||.||.|||...||||||||||||||||||||.|
Sbjct 597 CACGGGGGATGAAAACATCAATAGTGTCGAGACCCCTTACATGGACTACGAACATTTACGGATATCCTACAACG 670
Query 1259 TGTACTTAGCAGTCTACTCCATTGCCCACGCCTTGCAAGATATATATACCTGCTTACCTGGGAGAGGGCTCTTC 1332
||||||||||.||||||||||||||.||||||.|||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||
Sbjct 671 TGTACTTAGCCGTCTACTCCATTGCGCACGCCCTGCAAGATATATACACCTGCTTACCCGGAAGAGGGCTTTTC 744
Query 1333 ACCAATGGCTCCTGTGCAGACATCAAGAAAGTTGAGGCGTGGCAGGTCCTGAAGCACCTACGGCATCTAAACTT 1406
|||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||
Sbjct 745 ACCAACGGGTCCTGTGCAGACATCAAGAAGGTTGAGGCCTGGCAGGTCCTGAAACACCTACGGCACCTGAATTT 818
Query 1407 TACAAACAATATGGGGGAGCAGGTGACCTTTGATGAGTGTGGTGACCTGGTGGGGAACTATTCCATCATCAACT 1480
.||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 819 CACCAACAACATGGGGGAGCAGGTGACCTTCGATGAGTGCGGTGACCTGGTGGGGAACTACTCCATCATCAACT 892
Query 1481 GGCACCTCTCCCCAGAGGATGGCTCCATCGTGTTTAAGGAAGTCGGGTATTACAACGTCTATGCCAAGAAGGGA 1554
|||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 893 GGCACCTCTCCCCAGAGGACGGCTCCATTGTGTTCAAGGAAGTTGGGTACTACAATGTGTATGCCAAGAAGGGA 966
Query 1555 GAAAGACTCTTCATCAACGAGGAGAAAATCCTGTGGAGTGGGTTCTCCAGGGAGGTGCCCTTCTCCAACTGCAG 1628
||||||||.||||||||.||||.|||.|||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 967 GAAAGACTGTTCATCAATGAGGGGAAGATCTTGTGGAGTGGGTTCTCCAGAGAGGTGCCCTTCTCCAACTGCAG 1040
Query 1629 CCGAGACTGCCTGGCAGGGACCAGGAAAGGGATCATTGAGGGGGAGCCCACCTGCTGCTTTGAGTGTGTGGAGT 1702
|||.|||||.|.|||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1041 CCGGGACTGTCAGGCAGGGACCAGGAAGGGCATCATTGAGGGAGAGCCCACCTGCTGTTTTGAGTGTGTGGAGT 1114
Query 1703 GTCCTGATGGGGAGTATAGTGATGAGACAGATGCCAGTGCCTGTAACAAGTGCCCAGATGACTTCTGGTCCAAT 1776
|||||||.||.|||||.||||.||||||||||||.|||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1115 GTCCTGACGGCGAGTACAGTGGTGAGACAGATGCGAGTGCCTGTGACAAGTGCCCGGATGACTTCTGGTCCAAT 1188
Query 1777 GAGAACCACACCTCCTGCATTGCCAAGGAGATCGAGTTTCTGTCGTGGACGGAGCCCTTTGGGATCGCACTCAC 1850
|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||.|||||||.|||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1189 GAGAACCACACTTCCTGCATTGCCAAGGAGATTGAGTTCCTGGCGTGGACTGAGCCCTTTGGAATCGCTCTCAC 1262
Query 1851 CCTCTTTGCCGTGCTGGGCATTTTCCTGACAGCCTTTGTGCTGGGTGTGTTTATCAAGTTCCGCAACACACCCA 1924
.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.||||
Sbjct 1263 TCTCTTTGCGGTGCTGGGCATTTTCCTGACCGCCTTTGTGCTGGGCGTCTTCATCAAGTTCCGAAACACGCCCA 1336
Query 1925 TTGTCAAGGCCACCAACCGAGAGCTCTCCTACCTCCTCCTCTTCTCCCTGCTCTGCTGCTTCTCCAGCTCCCTG 1998
|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1337 TTGTCAAGGCCACCAACCGAGAGCTGTCCTACCTCCTGCTCTTCTCACTCCTCTGCTGCTTCTCCAGCTCCCTG 1410
Query 1999 TTCTTCATCGGGGAGCCCCAGGACTGGACGTGCCGCCTGCGCCAGCCGGCCTTTGGCATCAGCTTCGTGCTCTG 2072
||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 1411 TTCTTCATTGGGGAGCCCCAGGACTGGACCTGCCGCCTGCGACAGCCCGCCTTCGGCATCAGCTTCGTGCTTTG 1484
Query 2073 CATCTCATGCATCCTGGTGAAAACCAACCGTGTCCTCCTGGTGTTTGAGGCCAAGATCCCCACCAGCTTCCACC 2146
.|||||.||||||.|||||||.|||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||
Sbjct 1485 TATCTCGTGCATCTTGGTGAAGACCAATCGAGTCCTCCTGGTATTTGAGGCCAAAATACCCACCAGCTTCCACC 1558
Query 2147 GCAAGTGGTGGGGGCTCAACCTGCAGTTCCTGCTGGTTTTCCTCTGCACCTTCATGCAGATTGTCATCTGTGTG 2220
|.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|.
Sbjct 1559 GGAAGTGGTGGGGACTCAACCTGCAGTTCCTGCTGGTTTTCCTCTGCACCTTCATGCAGATTGTCATCTGCATC 1632
Query 2221 ATCTGGCTCTACACCGCGCCCCCCTCAAGCTACCGCAACCAGGAGCTGGAGGATGAGATCATCTTCATCACGTG 2294
||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 1633 ATCTGGCTCTACACGGCACCCCCCTCCAGCTACCGCAACCACGAGCTGGAAGACGAAATCATCTTCATCACGTG 1706
Query 2295 CCACGAGGGCTCCCTCATGGCCCTGGGCTTCCTGATCGGCTACACCTGCCTGCTGGCTGCCATCTGCTTCTTCT 2368
|||.||||||||.||||||||.||.||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1707 CCATGAGGGCTCACTCATGGCGCTCGGCTCCCTGATCGGCTACACCTGCCTCCTGGCTGCCATCTGCTTCTTCT 1780
Query 2369 TTGCCTTCAAGTCCCGGAAGCTGCCGGAGAACTTCAATGAAGCCAAGTTCATCACCTTCAGCATGCTCATCTTC 2442
|||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1781 TTGCCTTCAAGTCTCGGAAGCTGCCAGAGAACTTCAACGAAGCCAAGTTCATTACCTTCAGCATGCTCATCTTC 1854
Query 2443 TTCATCGTCTGGATCTCCTTCATTCCAGCCTATGCCAGCACCTATGGCAAGTTTGTCTCTGCCGTAGAGGTGAT 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1855 TTCATCGTCTGGATCTCCTTCATTCCAGCCTATGCCAGCACCTACGGCAAGTTTGTCTCTGCCGTGGAGGTGAT 1928
Query 2517 TGCCATCCTGGCAGCCAGCTTTGGCTTGCTGGCGTGCATCTTCTTCAACAAGATCTACATCATTCTCTTCAAGC 2590
.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||
Sbjct 1929 CGCCATCCTGGCAGCCAGCTTTGGCTTGCTAGCCTGCATCTTCTTCAACAAGGTCTACATCATCCTCTTCAAGC 2002
Query 2591 CATCCCGCAACACCATCGAGGAGGTGCGTTGCAGCACCGCAGCTCACGCTTTCAAGGTGGCTGCCCGGGCCACG 2664
|.||.||.||||||||||||||||||||.|.||||||.||.|||||.||||||||.|||||.|||||.|||||.
Sbjct 2003 CTTCACGGAACACCATCGAGGAGGTGCGCTCCAGCACTGCGGCTCATGCTTTCAAAGTGGCAGCCCGCGCCACT 2076
Query 2665 CTGCGCCGCAGCAACGTCTCCCGCAAGCGGTCCAGCAGCCTTGGAGGCTCCACGGGATCCACCCCCTCCTCCTC 2738
||.||||||..||||.|||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|..|||||||||||
Sbjct 2077 CTACGCCGCCCCAACATCTCCCGGAAGCGGTCCAGCAGCCTCGGAGGCTCCACTGGGTCGATTCCCTCCTCCTC 2150
Query 2739 CATCAGCAGCAAGAGCAACAGCGAAGACCCATTCCCACAGCCCGAGAGGCAGAAGCAGCAGCAGCCGCTGGCCC 2812
||||||||||||.||||||||||||||||..|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||
Sbjct 2151 CATCAGCAGCAAAAGCAACAGCGAAGACCGGTTCCCACAGCCGGAGAGGCAGAAGCAACAGCAACCACTGGCCC 2224
Query 2813 TAACCCAGCAAGAGCAGCAGCAGCAGCCCCTGACCCTCCCACAGCAGCAACGATC-TCAG---CAGCAGCCCAG 2882
|.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||..|.|||||||| |.| .||| ||||||||.||
Sbjct 2225 TGACCCAGCAAGAACAGCAGCAGCAGCCCCTGACTCTCCAGCCGCAGCAAC-AGCAACAGCCACAGCAGCCGAG 2297
Query 2883 ATGCAAGCAGAAGGTCATCTTTGGCAGCGGCACGGTCACCTTCTCACTGAGCTTTGATGAGCCTCAGAAGAACG 2956
||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 2298 ATGCAAACAGAAGGTCATCTTCGGCAGTGGCACAGTCACCTTCTCTCTGAGCTTTGATGAGCCTCAGAAGAATG 2371
Query 2957 CCATGGCCCACGGGAATTCTACGCACCAGAACTCCCTGGAGGCCCAGAAAAGCAGCGATACGCTGACCCGACAC 3030
|.|||||||||.||||.||.|.||.||||||||||||||||||||||||.||||..||.||..|||.|.|||||
Sbjct 2372 CTATGGCCCACAGGAACTCCATGCGCCAGAACTCCCTGGAGGCCCAGAAGAGCAATGACACTTTGAACAGACAC 2445
Query 3031 CAGCCATTACTCCCGCTGCAGTGCGGGGAAACGGACTTAGATCTGACCGTCCAGGAAACAGGTCTGCAAGGACC 3104
|||.|..|.||.||.||.|||||.|..||..||||||.|||..|||||.|.|||||.||.||..|||||||.||
Sbjct 2446 CAGGCCCTGCTTCCCCTACAGTGTGCAGAGGCGGACTCAGAAATGACCATTCAGGAGACGGGCTTGCAAGGGCC 2519
Query 3105 TGTGGGTGGAGACCAGCGGCCAGAGGTGGAGGACCCTGAAGAGTTGTCCCCAGCACTTGTAGTGTCCAGTTCAC 3178
..|||..||.|||||.|.||||||..|.||...|||.||.||..||||||||||.||.||..||||||..||.|
Sbjct 2520 AATGGTGGGGGACCACCAGCCAGAAATAGAAAGCCCAGATGAAATGTCCCCAGCTCTGGTCATGTCCACCTCTC 2593
Query 3179 AGAGCTTTGTCATCAGTGGTGGAGGCAGCACTGTTACAGAAAACGTAGTGAATTCA 3234
.||||||.||||||||.||||||||.|||.||||.||.||||||.||.||.|.||.
Sbjct 2594 GGAGCTTCGTCATCAGCGGTGGAGGTAGCTCTGTGACGGAAAACATACTGCACTCC 2649