Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000487957
- Subject:
- XM_011527804.3
- Aligned Length:
- 4098
- Identities:
- 3662
- Gaps:
- 435
Alignment
Query 1 ATGCTTGCAGTGGGGCCCGCCATGGACAGGGATTACCCGCAGCATGAACCCCCGCCGGCGGGCAGCCTCCTGTA 74
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Sbjct 1 ATGCTTGCAGTGGGGCCCGCCATGGACAGGGATTACCCGCAGCATGAACCCCCGCCGGCGGGCAGCCTCCTGTA 74
Query 75 CAGCCCGCCGCCCCTGCAGAGCGCCATGCTGCACTGCCCCTACTGGAACACCTTCTCGCTGCCGCCATACCCTG 148
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Sbjct 75 CAGCCCGCCGCCCCTGCAGAGCGCCATGCTGCACTGCCCCTACTGGAACACCTTCTCGCTGCCGCCATACCCTG 148
Query 149 CCTTCTCCAGCGACAGCCGCCCGTTCATGAGCTCCGCCTCCTTCCTCGGCAGCCAGCCCTGCCCAGACACCAGC 222
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Sbjct 149 CCTTCTCCAGCGACAGCCGCCCGTTCATGAGCTCCGCCTCCTTCCTCGGCAGCCAGCCCTGCCCAGACACCAGC 222
Query 223 TATGCCCCCGTGGCCACCGCCTCCAGCTTGCCACCAAAGACCTGCGACTTTGCTCAGGACTCCTCCTATTTTGA 296
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Sbjct 223 TATGCCCCCGTGGCCACCGCCTCCAGCTTGCCACCAAAGACCTGCGACTTTGCTCAGGACTCCTCCTATTTTGA 296
Query 297 GGACTTCTCCAACATCTCCATCTTCTCCTCGTCCGTGGACTCCCTGTCGGACATCGTGGACACGCCCGACTTCC 370
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Sbjct 297 GGACTTCTCCAACATCTCCATCTTCTCCTCGTCCGTGGACTCCCTGTCGGACATCGTGGACACGCCCGACTTCC 370
Query 371 TGCCGGCTGACAGCCTCAACCAGGTGTCCACCATCTGGGACGATAACCCTGCCCCCTCCACCCACGATAAGCTG 444
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Sbjct 371 TGCCGGCTGACAGCCTCAACCAGGTGTCCACCATCTGGGACGATAACCCTGCCCCCTCCACCCACGATAAGCTG 444
Query 445 TTCCAGCTCAGCAGGCCGTTTGCAGGCTTCGAGGACTTTCTGCCCTCCCACAGCACCCCGCTTCTCGTCAGCTA 518
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Sbjct 445 TTCCAGCTCAGCAGGCCGTTTGCAGGCTTCGAGGACTTTCTGCCCTCCCACAGCACCCCGCTTCTCGTCAGCTA 518
Query 519 CCAGGAGCAGAGTGTGCAGAGCCAGCCAGAGGAGGAGGACGAGGCTGAGGAGGAGGAGGCGGAGGAGCTGGGGC 592
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Sbjct 519 CCAGGAGCAGAGTGTGCAGAGCCAGCCAGAGGAGGAGGACGAGGCTGAGGAGGAGGAGGCGGAGGAGCTGGGGC 592
Query 593 ACACAGAGACCTACGCCGACTACGTGCCGTCCAAGTCCAAGATCGGGAAGCAGCACCCAGACCGCGTGGTGGAG 666
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Sbjct 593 ACACAGAGACCTACGCCGACTACGTGCCGTCCAAGTCCAAGATCGGGAAGCAGCACCCAGACCGCGTGGTGGAG 666
Query 667 ACCAGCACACTGTCCAGCGTCCCACCCCCAGACATCACCTACACCCTGGCCCTGCCCTCGGACAGCGGGGCCCT 740
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Sbjct 667 ACCAGCACACTGTCCAGCGTCCCACCCCCAGACATCACCTACACCCTGGCCCTGCCCTCGGACAGCGGGGCCCT 740
Query 741 GTCTGCCCTGCAGCTAGAGGCCATCACCTACGCCTGCCAGCAACACGAGGTCCTGCTCCCCAGCGGGCAGCGCG 814
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Sbjct 741 GTCTGCCCTGCAGCTAGAGGCCATCACCTACGCCTGCCAGCAACACGAGGTCCTGCTCCCCAGCGGGCAGCGCG 814
Query 815 CGGGCTTTCTCATCGGCGATGGGGCCGGCGTGGGCAAAGGCCGGACGGTGGCCGGAGTCATCCTGGAGAACCAC 888
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Sbjct 815 CGGGCTTTCTCATCGGCGATGGGGCCGGCGTGGGCAAAGGCCGGACGGTGGCCGGAGTCATCCTGGAGAACCAC 888
Query 889 CTGCGCGGCCGGAAGAAAGCATTGTGGTTCAGCGTCTCCAACGACCTCAAGTACGATGCGGAGCGCGACCTGCG 962
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Sbjct 889 CTGCGCGGCCGGAAGAAAGCATTGTGGTTCAGCGTCTCCAACGACCTCAAGTACGATGCGGAGCGCGACCTGCG 962
Query 963 GGACATCGAAGCCACGGGCATCGCGGTGCACGCGCTCAGCAAGATCAAGTACGGTGACACCACTACCTCAGAGG 1036
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Sbjct 963 GGACATCGAAGCCACGGGCATCGCGGTGCACGCGCTCAGCAAGATCAAGTACGGTGACACCACTACCTCAGAGG 1036
Query 1037 GCGTCCTCTTCGCCACCTACTCCGCCCTGATTGGGGAGAGCCAGGCCGGCGGCCAGCACCGCACTCGCCTCCGG 1110
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Sbjct 1037 GCGTCCTCTTCGCCACCTACTCCGCCCTGATTGGGGAGAGCCAGGCCGGCGGCCAGCACCGCACTCGCCTCCGG 1110
Query 1111 CAGATCCTGGACTGGTGTGGGGAGGCCTTCGAGGGCGTCATCGTGTTCGACGAGTGTCACAAAGCCAAGAATGC 1184
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Sbjct 1111 CAGATCCTGGACTGGTGTGGGGAGGCCTTCGAGGGCGTCATCGTGTTCGACGAGTGTCACAAAGCCAAGAATGC 1184
Query 1185 CGGCTCCACCAAGATGGGCAAGGCTGTGCTAGACCTGCAGAACAAGCTGCCCCTGGCCCGCGTGGTCTACGCCA 1258
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Sbjct 1185 CGGCTCCACCAAGATGGGCAAGGCTGTGCTAGACCTGCAGAACAAGCTGCCCCTGGCCCGCGTGGTCTACGCCA 1258
Query 1259 GCGCCACAGGTGCCTCTGAGCCTCGGAACATGATCTACATGAGCCGCTTGGGTATCTGGGGCGAGGGCACACCC 1332
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Sbjct 1259 GCGCCACAGGTGCCTCTGAGCCTCGGAACATGATCTACATGAGCCGCTTGGGTATCTGGGGCGAGGGCACACCC 1332
Query 1333 TTCCGGAACTTTGAGGAGTTCCTGCACGCCATCGAGAAGAGGGGCGTTGGCGCCATGGAGATCGTGGCCATGGA 1406
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Sbjct 1333 TTCCGGAACTTTGAGGAGTTCCTGCACGCCATCGAGAAGAGGGGCGTTGGCGCCATGGAGATCGTGGCCATGGA 1406
Query 1407 CATGAAGGTCAGCGGCATGTACATCGCACGCCAGCTCAGCTTCTCCGGCGTCACCTTCCGCATCGAGGAGATCC 1480
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Sbjct 1407 CATGAAGGTCAGCGGCATGTACATCGCACGCCAGCTCAGCTTCTCCGGCGTCACCTTCCGCATCGAGGAGATCC 1480
Query 1481 CGCTGGCCCCAGCCTTCGAGTGCGTCTACAACCGCGCGGCCCTGCTGTGGGCCGAGGCCCTGAACGTGTTCCAG 1554
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Sbjct 1481 CGCTGGCCCCAGCCTTCGAGTGCGTCTACAACCGCGCGGCCCTGCTGTGGGCCGAGGCCCTGAACGTGTTCCAG 1554
Query 1555 CAGGCGGCCGACTGGATCGGCCTGGAGTCGCGCAAGTCCCTGTGGGGCCAGTTCTGGTCGGCACACCAGCGCTT 1628
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Sbjct 1555 CAGGCGGCCGACTGGATCGGCCTGGAGTCGCGCAAGTCCCTGTGGGGCCAGTTCTGGTCGGCACACCAGCGCTT 1628
Query 1629 CTTCAAGTATCTGTGCATCGCAGCCAAGGTGCGCCGGCTGGTGGAGCTGGCCCGAGAGGAGCTGGCGCGAGACA 1702
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Sbjct 1629 CTTCAAGTATCTGTGCATCGCAGCCAAGGTGCGCCGGCTGGTGGAGCTGGCCCGAGAGGAGCTGGCGCGAGACA 1702
Query 1703 AGTGCGTGGTCATCGGGCTGCAGTCCACGGGCGAGGCGCGCACGCGGGAGGTGCTGGGGGAGAACGATGGGCAC 1776
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Sbjct 1703 AGTGCGTGGTCATCGGGCTGCAGTCCACGGGCGAGGCGCGCACGCGGGAGGTGCTGGGGGAGAACGATGGGCAC 1776
Query 1777 CTCAACTGCTTCGTCTCGGCCGCTGAAGGCGTGTTCCTGTCGCTAATTCAGAAGCACTTTCCGTCCACCAAGAG 1850
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Sbjct 1777 CTCAACTGCTTCGTCTCGGCCGCTGAAGGCGTGTTCCTGTCGCTAATTCAGAAGCACTTTCCGTCCACCAAGAG 1850
Query 1851 AAAGCGGGACAGAGGAGCGGGCAGCAAGCGGAAACGGCGACCTCGGGGACGCGGGGCCAAAGCCCCCCGGCTGG 1924
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Sbjct 1851 AAAGCGGGACAGAGGAGCGGGCAGCAAGCGGAAACGGCGACCTCGGGGACGCGGGGCCAAAGCCCCCCGGCTGG 1924
Query 1925 CGTGCGAGACAGCGGGCGTCATCCGCATCAGTGACGACAGCAGCACGGAGTCGGACCCTGGCCTGGACAGCGAC 1998
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Sbjct 1925 CGTGCGAGACAGCGGGCGTCATCCGCATCAGTGACGACAGCAGCACGGAGTCGGACCCTGGCCTGGACAGCGAC 1998
Query 1999 TTCAACTCCTCCCCCGAGTCCCTGGTGGATGACGACGTTGTCATCGTTGATGCAGTCGGGCTCCCCAGTGACGA 2072
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Sbjct 1999 TTCAACTCCTCCCCCGAGTCCCTGGTGGATGACGACGTTGTCATCGTTGATGCAGTCGGGCTCCCCAGTGACGA 2072
Query 2073 CCGGGGACCCCTGTGCCTCCTGCAGAGAGACCCGCATGGCCCCGGGGTCCTGGAGCGGGTGGAGCGGCTGAAGC 2146
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Sbjct 2073 CCGGGGACCCCTGTGCCTCCTGCAGAGAGACCCGCATGGCCCCGGGGTCCTGGAGCGGGTGGAGCGGCTGAAGC 2146
Query 2147 AGGATCTGCTGGACAAAGTGCGGCGGCTGGGCCGGGAACTGCCAGTCAACACCCTGGACGAGCTCATCGACCAG 2220
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Sbjct 2147 AGGATCTGCTGGACAAAGTGCGGCGGCTGGGCCGGGAACTGCCAGTCAACACCCTGGACGAGCTCATCGACCAG 2220
Query 2221 CTGGGCGGCCCCCAGCGGGTGGCGGAGATGACCGGCAGGAAAGGCCGCGTGGTGTCCAGGCCCGACGGGACGGT 2294
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Sbjct 2221 CTGGGCGGCCCCCAGCGGGTGGCGGAGATGACCGGCAGGAAAGGCCGCGTGGTGTCCAGGCCCGACGGGACGGT 2294
Query 2295 GGCCTTCGAGTCGCGGGCAGAGCAGGGTCTGTCCATCGACCACGTGAACCTCAGGGAGAAGCAGCGCTTCATGA 2368
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Sbjct 2295 GGCCTTCGAGTCGCGGGCAGAGCAGGGTCTGTCCATCGACCACGTGAACCTCAGGGAGAAGCAGCGCTTCATGA 2368
Query 2369 GCGGCGAGAAGCTCGTGGCCATCATCTCGGAGGCCTCCAGCTCGGGTGTCTCCCTCCAAGCCGACCGCCGTGTC 2442
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Sbjct 2369 GCGGCGAGAAGCTCGTGGCCATCATCTCGGAGGCCTCCAGCTCGGGTGTCTCCCTCCAAGCCGACCGCCGTGTC 2442
Query 2443 CAGAACCAGCGGCGCCGCGTGCACATGACCTTGGAGCTGCCGTGGAGCGCCGACCGCGCCATCCAGCAGTTCGG 2516
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Sbjct 2443 CAGAACCAGCGGCGCCGCGTGCACATGACCTTGGAGCTGCCGTGGAGCGCCGACCGCGCCATCCAGCAGTTCGG 2516
Query 2517 CCGCACCCACCGGTCCAACCAGGTCTCCGCGCCAGAGTATGTCTTCCTCATCTCGGAGCTGGCCGGGGAGCGCC 2590
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Sbjct 2517 CCGCACCCACCGGTCCAACCAGGTCTCCGCGCCAGAGTATGTCTTCCTCATCTCGGAGCTGGCCGGGGAGCGCC 2590
Query 2591 GGTTCGCCTCCATCGTGGCCAAGCGCCTGGAGAGTCTGGGGGCCCTGACCCACGGAGACCGCCGCGCCACGGAG 2664
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Sbjct 2591 GGTTCGCCTCCATCGTGGCCAAGCGCCTGGAGAGTCTGGGGGCCCTGACCCACGGAGACCGCCGCGCCACGGAG 2664
Query 2665 TCCCGTGACCTCAGCAAGTACAACTTTGAGAACAAGTATGGCACCCGGGCCCTGCACTGTGTCCTCACCACCAT 2738
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Sbjct 2665 TCCCGTGACCTCAGCAAGTACAACTTTGAGAACAAGTATGGCACCCGGGCCCTGCACTGTGTCCTCACCACCAT 2738
Query 2739 CCTGAGCCAGACTGAGAACAAAGTGCCTGTGCCCCAGGGATACCCTGGAGGGGTCCCCACCTTCTTCCGGGACA 2812
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Sbjct 2739 CCTGAGCCAGACTGAGAACAAAGTGCCTGTGCCCCAGGGATACCCTGGAGGGGTCCCCACCTTCTTCCGGGACA 2812
Query 2813 TGAAGCAGGGCCTGCTGTCTGTGGGCATTGGTGGCCGGGAGTCCCGGAATGGCTGCCTGGACGTGGAGAAGGAC 2886
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Sbjct 2813 TGAAGCAGGGCCTGCTGTCTGTGGGCATTGGTGGCCGGGAGTCCCGGAATGGCTGCCTGGACGTGGAGAAGGAC 2886
Query 2887 TGTTCCATCACCAAGTTCCTGAACCGCATCCTGGGGCTGGAGGTGCACAAGCAGAACGCCCTGTTCCAGTACTT 2960
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Sbjct 2887 TGTTCCATCACCAAGTTCCTGAACCGCATCCTGGGGCTGGAGGTGCACAAGCAGAACGCCCTGTTCCAGTACTT 2960
Query 2961 CTCAGACACCTTCGACCACCTCATCGAGATGGACAAGCGGGAGGGCAAATACGACATGGGCATCCTGGACCTTG 3034
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Sbjct 2961 CTCAGACACCTTCGACCACCTCATCGAGATGGACAAGCGGGAGGGCAAATACGACATGGGCATCCTGGACCTTG 3034
Query 3035 CTCCCGGTATCGAGGAGATCTACGAGGAGAGCCAGCAGGTGTTCCTGGCTCCCGGGCACCCGCAGGACGGGCAG 3108
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Sbjct 3035 CTCCCGGTATCGAGGAGATCTACGAGGAGAGCCAGCAGGTGTTCCTGGCTCCCGGGCACCCGCAGGACGGGCAG 3108
Query 3109 GTGGTCTTCTACAAGATCAGCGTGGACCGCGGCCTGAAGTGGGAGGACGCCTTTGCCAAGTCGCTGGCGCTGAC 3182
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Sbjct 3109 GTGGTCTTCTACAAGATCAGCGTGGACCGCGGCCTGAAGTGGGAGGACGCCTTTGCCAAGTCGCTGGCGCTGAC 3182
Query 3183 GGGCCCCTATGACGGCTTCTACCTCTCCTACAAGGTCCGCGGTAACAAGCCCAGCTGCCTGCTGGCGGAGCAGA 3256
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Sbjct 3183 GGGCCCCTATGACGGCTTCTACCTCTCCTACAAGGTCCGCGGTAACAAGCCCAGCTGCCTGCTGGCGGAGCAGA 3256
Query 3257 ACCGCGGCCAGTTCTTCACGGTGTACAAGCCCAACATCGGCCGGCAGAGCCAGCTGGAGGTCCTGGACAGCCTC 3330
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Sbjct 3257 ACCGCGGCCAGTTCTTCACGGTGTACAAGCCCAACATCGGCCGGCAGAGCCAGCTGGAGGCCCTGGACAGCCTC 3330
Query 3331 CGCCGCAAGTTCCACCGGGTCACCGCGGAGGAGGCCAAGGAGCCCTGGGAGAGTGGCTACGCTTTGTCGCTGAC 3404
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Sbjct 3331 CGCCGCAAGTTCCACCGGGTCACCGCGGAGGAGGCCAAGGAGCCCTGGGAGAGTGGCTACGCTTTGTCGCTGAC 3404
Query 3405 GCACTGCAGCCACAGCGCCTGGAACCGGCACTGCCGGCTGGCGCAGGAGGGTAAGGACTGCCTGCAGGGGCTGC 3478
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Sbjct 3405 GCACTGCAGCCACAGCGCCTGGAACCGGCACTGCCGGCTGGCGCAGGAGGGTAAGGACTGCCTGCAGGGGCTGC 3478
Query 3479 GGCTGCGGCACCACTACATGCTGTGCGGCGCGCTGCTGCGCGTGTGGGGCCGCATCGCCGCCGTCATGGCCGAC 3552
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Sbjct 3479 GGCTGCGGCACCACTACATGCTGTGCGGCGCGCTGCTGCGCGTGTGGGGCCGCATCGCCGCCGTCATGGCCGAC 3552
Query 3553 GTCAGCAGCAGCAGCTACCTGCAGATCGTGCGGCTGAAGACCAAGGACAGGAAGAAGCAAGTGGGCATCAAGAT 3626
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Sbjct 3553 GTCAGCAGCAGCAGCTACCTGCAGATCGTGCGGCTGAAGACCAAGGACAGGAAGAAGCAA----GCATCAAGAT 3622
Query 3627 CCCCGAGGGCTGCGTGCGCCGGGTGCTGCAGGAGCTGCGGCTGATGGATGCGGACGTGAAGCCCAGGCAGGCGC 3700
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Sbjct 3623 CCCCGAGGGCTGCGTGCGCCGGGTGCTGCAGGAGCTGCGGC--------------------------------- 3663
Query 3701 CCGCCCTGGGCTGCCCCGCCCCGCCCGCCCCGCGCCCGCTGGCGCTGCCTTGCGGCCCCGGAGAGGTGCTGGAC 3774
Sbjct 3664 -------------------------------------------------------------------------- 3663
Query 3775 CTCACCTACAGCCCCCCGGCCGAGGCCTTCCCGCCGCCCCCGCACTTCTCTTTCCCGGCGCCGCTGTCCCTGGA 3848
Sbjct 3664 -------------------------------------------------------------------------- 3663
Query 3849 CGCCGGCCCCGGCGTCGTGCCGCTGGGCACCCCCGACGCCCAGGCCGACCCTGCGGCCCTCGCGCACCAGGGCT 3922
Sbjct 3664 -------------------------------------------------------------------------- 3663
Query 3923 GCGACATCAACTTCAAGGAGGTGCTGGAGGACATGCTGCGCTCGCTGCACGCGGGGCCGCCCTCCGAGGGCGCG 3996
Sbjct 3664 -------------------------------------------------------------------------- 3663
Query 3997 CTGGGGGAGGGCGCGGGGGCGGGGGGCGCGGCGGGCGGTGGTCCCGAGCGGCAGAGCGTGATCCAGTTCAGCCC 4070
Sbjct 3664 -------------------------------------------------------------------------- 3663
Query 4071 ACCCTTCCCCGGCGCCCAGGCTCCTTTC 4098
Sbjct 3664 ---------------------------- 3663