Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000487995
• Subject: NM_001044.5
• Aligned Length: 1860
• Identities: 1859
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGAGTAAGAGCAAATGCTCCGTGGGACTCATGTCTTCCGTGGTGGCCCCGGCTAAGGAGCCCAATGCCGTGGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGTAAGAGCAAATGCTCCGTGGGACTCATGTCTTCCGTGGTGGCCCCGGCTAAGGAGCCCAATGCCGTGGG  74

Query   75  CCCGAAGGAGGTGGAGCTCATCCTTGTCAAGGAGCAGAACGGAGTGCAGCTCACCAGCTCCACCCTCACCAACC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCCGAAGGAGGTGGAGCTCATCCTTGTCAAGGAGCAGAACGGAGTGCAGCTCACCAGCTCCACCCTCACCAACC  148

Query  149  CGCGGCAGAGCCCCGTGGAGGCCCAGGATCGGGAGACCTGGGGCAAGAAGATCGACTTTCTCCTGTCCGTCATT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CGCGGCAGAGCCCCGTGGAGGCCCAGGATCGGGAGACCTGGGGCAAGAAGATCGACTTTCTCCTGTCCGTCATT  222

Query  223  GGCTTTGCTGTGGACCTGGCCAACGTCTGGCGGTTCCCCTACCTGTGCTACAAAAATGGTGGCGGTGCCTTCCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGCTTTGCTGTGGACCTGGCCAACGTCTGGCGGTTCCCCTACCTGTGCTACAAAAATGGTGGCGGTGCCTTCCT  296

Query  297  GGTCCCCTACCTGCTCTTCATGGTCATTGCTGGGATGCCACTTTTCTACATGGAGCTGGCCCTCGGCCAGTTCA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGTCCCCTACCTGCTCTTCATGGTCATTGCTGGGATGCCACTTTTCTACATGGAGCTGGCCCTCGGCCAGTTCA  370

Query  371  ACAGGGAAGGGGCCGCTGGTGTCTGGAAGATCTGCCCCATACTGAAAGGTGTGGGCTTCACGGTCATCCTCATC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACAGGGAAGGGGCCGCTGGTGTCTGGAAGATCTGCCCCATACTGAAAGGTGTGGGCTTCACGGTCATCCTCATC  444

Query  445  TCACTGTATGTCGGCTTCTTCTACAACGTCATCATCGCCTGGGCGCTGCACTATCTCTTCTCCTCCTTCACCAC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TCACTGTATGTCGGCTTCTTCTACAACGTCATCATCGCCTGGGCGCTGCACTATCTCTTCTCCTCCTTCACCAC  518

Query  519  GGAGCTCCCCTGGATCCACTGCAACAACTCCTGGAACAGCCCCAACTGCTCGGATGCCCATCCTGGTGACTCCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGAGCTCCCCTGGATCCACTGCAACAACTCCTGGAACAGCCCCAACTGCTCGGATGCCCATCCTGGTGACTCCA  592

Query  593  GTGGAGACAGCTCGGGCCTCAACGACACTTTTGGGACCACACCTGCTGCCGAGTACTTTGAACGTGGCGTGCTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GTGGAGACAGCTCGGGCCTCAACGACACTTTTGGGACCACACCTGCTGCCGAGTACTTTGAACGTGGCGTGCTG  666

Query  667  CACCTCCACCAGAGCCATGGCATCGACGACCTGGGGCCTCCGCGGTGGCAGCTCACAGCCTGCCTGGTGCTGGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CACCTCCACCAGAGCCATGGCATCGACGACCTGGGGCCTCCGCGGTGGCAGCTCACAGCCTGCCTGGTGCTGGT  740

Query  741  CATCGTGCTGCTCTACTTCAGCCTCTGGAAGGGCGTGAAGACCTCAGGGAAGGTGGTATGGATCACAGCCACCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CATCGTGCTGCTCTACTTCAGCCTCTGGAAGGGCGTGAAGACCTCAGGGAAGGTGGTATGGATCACAGCCACCA  814

Query  815  TGCCATACGTGGTCCTCACTGCCCTGCTCCTGCGTGGGGTCACCCTCCCTGGAGCCATAGACGGCATCAGAGCA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGCCATACGTGGTCCTCACTGCCCTGCTCCTGCGTGGGGTCACCCTCCCTGGAGCCATAGACGGCATCAGAGCA  888

Query  889  TACCTGAGCGTTGACTTCTACCGGCTCTGCGAGGCGTCTGTTTGGATTGACGCGGCCACCCAGGTGTGCTTCTC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TACCTGAGCGTTGACTTCTACCGGCTCTGCGAGGCGTCTGTTTGGATTGACGCGGCCACCCAGGTGTGCTTCTC  962

Query  963  CCTGGGCGTGGGGTTCGGGGTGCTGATCGCCTTCTCCAGCTACAACAAGTTCACCAACAACTGCTACAGGGACG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCTGGGCGTGGGGTTCGGGGTGCTGATCGCCTTCTCCAGCTACAACAAGTTCACCAACAACTGCTACAGGGACG  1036

Query 1037  CGATTGTCACCACCTCCATCAACTCCCTGACGAGCTTCTCCTCCGGCTTCGTCGTCTTCTCCTTCCTGGGGTAC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CGATTGTCACCACCTCCATCAACTCCCTGACGAGCTTCTCCTCCGGCTTCGTCGTCTTCTCCTTCCTGGGGTAC  1110

Query 1111  ATGGCACAGAAGCACAGTGTGCCCATCGGGGACGTGGCCAAGGACGGGCCAGGGCTGATCTTCATCATCTACCC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ATGGCACAGAAGCACAGTGTGCCCATCGGGGACGTGGCCAAGGACGGGCCAGGGCTGATCTTCATCATCTACCC  1184

Query 1185  GGAAGCCATCGCCACGCTCCCTCTGTCCTCAGCCTGGGCCGTGGTCTTCTTCATCATGCTGCTCACCCTGGGTA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGAAGCCATCGCCACGCTCCCTCTGTCCTCAGCCTGGGCCGTGGTCTTCTTCATCATGCTGCTCACCCTGGGTA  1258

Query 1259  TCGACAGCGCCATGGGTGGTATGGAGTCAGTGATCACCGGGCTCATCGATGAGTTCCAGCTGCTGCACAGACAC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TCGACAGCGCCATGGGTGGTATGGAGTCAGTGATCACCGGGCTCATCGATGAGTTCCAGCTGCTGCACAGACAC  1332

Query 1333  CGTGAGCTCTTCACGCTCTTCATCGTCCTGGCGACCTTCCTCCTGTCCCTGTTCTGCGTCACCAACGGTGGCAT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CGTGAGCTCTTCACGCTCTTCATCGTCCTGGCGACCTTCCTCCTGTCCCTGTTCTGCGTCACCAACGGTGGCAT  1406

Query 1407  CTACGTCTTCACGCTCCTGGACCATTTTGCAGCCGGCACGTCCATCCTCTTTGGAGTGCTAATCGAAGCCATCG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1407  CTACGTCTTCACGCTCCTGGACCATTTTGCAGCCGGCACGTCCATCCTCTTTGGAGTGCTCATCGAAGCCATCG  1480

Query 1481  GAGTGGCCTGGTTCTATGGTGTTGGGCAGTTCAGCGACGACATCCAGCAGATGACCGGGCAGCGGCCCAGCCTG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GAGTGGCCTGGTTCTATGGTGTTGGGCAGTTCAGCGACGACATCCAGCAGATGACCGGGCAGCGGCCCAGCCTG  1554

Query 1555  TACTGGCGGCTGTGCTGGAAGCTGGTCAGCCCCTGCTTTCTCCTGTTCGTGGTCGTGGTCAGCATTGTGACCTT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TACTGGCGGCTGTGCTGGAAGCTGGTCAGCCCCTGCTTTCTCCTGTTCGTGGTCGTGGTCAGCATTGTGACCTT  1628

Query 1629  CAGACCCCCCCACTACGGAGCCTACATCTTCCCCGACTGGGCCAACGCGCTGGGCTGGGTCATCGCCACATCCT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CAGACCCCCCCACTACGGAGCCTACATCTTCCCCGACTGGGCCAACGCGCTGGGCTGGGTCATCGCCACATCCT  1702

Query 1703  CCATGGCCATGGTGCCCATCTATGCGGCCTACAAGTTCTGCAGCCTGCCTGGGTCCTTTCGAGAGAAACTGGCC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CCATGGCCATGGTGCCCATCTATGCGGCCTACAAGTTCTGCAGCCTGCCTGGGTCCTTTCGAGAGAAACTGGCC  1776

Query 1777  TACGCCATTGCACCCGAGAAGGACCGTGAGCTGGTGGACAGAGGGGAGGTGCGCCAGTTCACGCTCCGCCACTG  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TACGCCATTGCACCCGAGAAGGACCGTGAGCTGGTGGACAGAGGGGAGGTGCGCCAGTTCACGCTCCGCCACTG  1850

Query 1851  GCTCAAGGTG  1860
            ||||||||||
Sbjct 1851  GCTCAAGGTG  1860