Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488009
• Subject: NM_008054.2
• Aligned Length: 1634
• Identities: 1434
• Gaps: 55

Alignment

Query    1  ATGGGCTGTGTGCAATGTAAGGATAAAGAAGCAACAAAACTGACGGAGGAGAGGGACGGCAGCCTGAACCAGAG  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGCTGTGTGCAATGTAAGGATAAAGAAGCAGCGAAACTGACAGAGGAGAGGGACGGCAGCCTGAACCAGAG  74

Query   75  CTCTGGGTACCGCTATGGCACAGACCCCACCCCTCAGCACTACCCCAGCTTCGGTGTGACCTCCATCCCCAACT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct   75  CTCTGGGTACCGCTATGGCACAGACCCCACCCCTCAGCACTACCCCAGCTTCGGCGTGACCTCCATCCCGAACT  148

Query  149  ACAACAACTTCCACGCAGCCGGGGGCCAAGGACTCACCGTCTTTGGAGGTGTGAACTCTTCGTCTCATACGGGG  222
            |||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.|||
Sbjct  149  ACAACAACTTCCACGCAGCTGGGGGCCAGGGACTCACCGTCTTTGGGGGTGTGAACTCCTCCTCTCACACTGGG  222

Query  223  ACCTTGCGTACGAGAGGAGGAACAGGAGTGACACTCTTTGTGGCCCTTTATGACTATGAAGCACGGACAGAAGA  296
            |||.|.||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  223  ACCCTACGCACGAGAGGAGGGACAGGAGTGACACTGTTTGTGGCGCTTTATGACTATGAAGCACGGACGGAAGA  296

Query  297  TGACCTGAGTTTTCACAAAGGAGAAAAATTTCAAATATTGAACAGCTCGGAAGGAGATTGGTGGGAAGCCCGCT  370
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  297  TGACCTGAGTTTTCACAAAGGAGAAAAATTTCAAATATTGAACAGCTCGGAAGGAGACTGGTGGGAAGCCCGCT  370

Query  371  CCTTGACAACTGGAGAGACAGGTTACATTCCCAGCAATTATGTGGCTCCAGTTGACTCTATCCAGGCAGAAGAG  444
            ||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  371  CCTTGACAACCGGGGAAACTGGTTACATTCCCAGCAATTACGTGGCTCCAGTTGACTCCATCCAGGCAGAAGAG  444

Query  445  TGGTACTTTGGAAAACTTGGCCGAAAAGATGCTGAGCGACAGCTATTGTCCTTTGGAAACCCAAGAGGTACCTT  518
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||..||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TGGTACTTTGGAAAACTTGGCCGCAAAGATGCTGAGAGACAGCTCCTGTCCTTTGGAAACCCAAGAGGTACCTT  518

Query  519  TCTTATCCGCGAGAGTGAAACCACCAAAGGTGCCTATTCACTTTCTATCCGTGATTGGGATGATATGAAAGGAG  592
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  519  TCTTATCCGCGAGAGCGAAACCACCAAAGGTGCCTACTCACTTTCCATCCGTGATTGGGATGATATGAAAGGGG  592

Query  593  ACCATGTCAAACATTATAAAATTCGCAAACTTGACAATGGTGGATACTACATTACCACCCGGGCCCAGTTTGAA  666
            ||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||
Sbjct  593  ACCACGTCAAACATTATAAAATCCGCAAGCTTGACAATGGTGGATACTATATCACAACGCGGGCCCAGTTTGAA  666

Query  667  ACACTTCAGCAGCTTGTACAACATTACTCAGAGAGAGCTGCAGGT----------------CTCTGCTGCCGCC  724
            |||||||||||.||.|||||.|||||||||||||.|||||..|||                ||.||.|..|..|
Sbjct  667  ACACTTCAGCAACTGGTACAGCATTACTCAGAGAAAGCTGATGGTTTGTGTTTTAACTTAACTGTGGTTTCATC  740

Query  725  TAGTAGTTCCCTGTCACAAAGGGATGCCAAGGCTTACCGATCTGTCTGTCAAAACCAAAGATGTCTGGGAAATC  798
            .|||.||.|||   ||||||            |||...||| ||.||         |||||||..||||||.|.
Sbjct  741  AAGTTGTACCC---CACAAA------------CTTCTGGAT-TGGCT---------AAAGATGCTTGGGAAGTT  789

Query  799  CCTCGAGAATCCCTGCAGTTGAT------CAAGAGACTGGGAAATGGGCAGTTT-GGGGAAGTATGGATGGGTA  865
            .|.||.||.||      ||||.|      .||||..|||||..| |||..|||| |..|||||.|||.|.||||
Sbjct  790  GCACGTGACTC------GTTGTTTCTGGAGAAGAAGCTGGGGCA-GGGGTGTTTCGCTGAAGTGTGGCTTGGTA  856

Query  866  CCTGGAATGGAAACACAAAAGTAGCCATAAAGACTCTTAAACCAGGCACAATGTCCCCCGAATCATTCCTTGAG  939
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||.||.||.|||||.|||
Sbjct  857  CCTGGAATGGAAATACAAAAGTAGCCATAAAGACCCTTAAGCCAGGCACCATGTCTCCGGAGTCCTTCCTGGAG  930

Query  940  GAAGCGCAGATCATGAAGAAGCTGAAGCACGACAAGCTGGTCCAGCTCTATGCAGTGGTGTCTGAGGAGCCCAT  1013
            ||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||
Sbjct  931  GAGGCGCAGATCATGAAGAAGCTGAAGCATGACAAGCTGGTGCAGCTCTACGCGGTCGTGTCTGAGGAGCCCAT  1004

Query 1014  CTACATCGTCACCGAGTATATGAACAAAGGAAGTTTACTGGATTTCTTAAAAGATGGAGAAGGAAGAGCTCTGA  1087
            .|||||||||||.|||||.||||.||||||||||||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1005  TTACATCGTCACGGAGTACATGAGCAAAGGAAGTTTGCTTGACTTCTTAAAAGATGGTGAAGGAAGAGCTCTGA  1078

Query 1088  AATTACCAAATCTTGTGGACATGGCAGCACAGGTGGCTGCAGGAATGGCTTACATCGAGCGCATGAATTATATC  1161
            |.||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1079  AGTTGCCAAACCTTGTGGACATGGCGGCACAGGTTGCTGCAGGAATGGCTTACATCGAGCGCATGAATTATATC  1152

Query 1162  CATAGAGATCTGCGATCAGCAAACATTCTAGTGGGGAATGGACTCATATGCAAGATTGCTGACTTCGGATTGGC  1235
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1153  CACAGAGATCTGCGATCAGCAAACATTCTAGTGGGGAATGGACTAATTTGCAAGATTGCTGACTTTGGATTGGC  1226

Query 1236  CCGATTGATAGAAGACAATGAGTACACAGCAAGACAAGGTGCAAAGTTCCCCATCAAGTGGACGGCCCCCGAGG  1309
            .||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.|
Sbjct 1227  TCGGTTGATTGAAGACAATGAATACACAGCAAGACAAGGTGCGAAGTTTCCCATTAAGTGGACAGCCCCCGAAG  1300

Query 1310  CAGCCCTGTACGGGAGGTTCACAATCAAGTCTGACGTGTGGTCTTTTGGAATCTTACTCACAGAGCTGGTCACC  1383
            |.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1301  CGGCCCTGTATGGAAGGTTCACAATCAAGTCTGACGTATGGTCTTTTGGAATCTTACTCACAGAGCTGGTCACC  1374

Query 1384  AAAGGAAGAGTGCCATACCCAGGCATGAACAACCGGGAGGTGCTGGAGCAGGTGGAGCGAGGCTACAGGATGCC  1457
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||
Sbjct 1375  AAAGGAAGAGTGCCATACCCAGGCATGAACAACCGGGAGGTGCTGGAGCAGGTGGAGAGAGGCTATAGGATGCC  1448

Query 1458  CTGCCCGCAGGACTGCCCCATCTCTCTGCATGAGCTCATGATCCACTGCTGGAAAAAGGACCCTGAAGAACGCC  1531
            ||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||
Sbjct 1449  CTGCCCACAGGACTGCCCGATCTCCCTGCACGAGCTCATGATCCACTGCTGGAAAAAGGATCCGGAAGAGCGCC  1522

Query 1532  CCACTTTTGAGTACTTGCAGAGCTTCCTGGAAGACTACTTTACCGCGACAGAGCCCCAGTACCAACCTGGTGAA  1605
            |.||.||.||||||||||||.||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||.||.||||||
Sbjct 1523  CGACCTTCGAGTACTTGCAGGGCTTCCTGGAGGACTACTTTACGGCCACAGAGCCCCAGTATCAGCCCGGTGAA  1596

Query 1606  AACCTG  1611
            ||||||
Sbjct 1597  AACCTG  1602