Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000488014
- Subject:
- NM_015529.4
- Aligned Length:
- 1849
- Identities:
- 1609
- Gaps:
- 223
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGTGCTGCTGGCCGCTGCTCCTGCTGTGGGGGCTGCTCCCCGGGACGGCGGCGGGGGGCTCGGGCCGAACCTA 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 TCCGCACCGGACCCTCCTGGACTCGGAGGGCAAGTACTGGCTGGGCTGGAGCCAGCGGGGCAGCCAGATCGCCT 148
Query 1 ---------ATGAATTCTTTTCTCTCTG-----TATTTAGGTATCCTGATTTTT------------CCTT---- 44
|.| |.|.|.||| ||..|.||..|| |..||.| ||.|
Sbjct 149 TCCGCCTCCAGG-------TGCGCACTGCAGGCTACGTGGGCTTC--GGCTTCTCGCCCACCGGGGCCATGGCG 213
Query 45 TCC----ATATTTT---------------CCA----------------CAGGATTATTTTACAAATGCAAATAG 83
||| |.||..| ||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 214 TCCGCCGACATCGTCGTGGGCGGGGTGGCCCACGGGCGGCCCTACCTCCAGGATTATTTTACAAATGCAAATAG 287
Query 84 AGAGTTGAAAAAAGATGCCCAGCAAGATTACCATCTAGAATATGCCATGGAAAATAGCACACACACAATAATTG 157
||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 288 AGAGTTGAAAAAAGATGCTCAGCAAGATTACCATCTAGAATATGCCATGGAAAATAGCACACACACAATAATTG 361
Query 158 AATTTACCAGAGAGCTGCATACATGTGACATAAATGACAAGAGTATAACGGATAGCACTGTGAGAGTGATCTGG 231
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 362 AATTTACCAGAGAGCTGCATACATGTGACATAAATGACAAGAGTATAACGGATAGCACTGTGAGAGTGATCTGG 435
Query 232 GCCTACCACCATGAAGATGCAGGAGAAGCTGGTCCCAAGTACCATGACTCCAATAGGGGCACCAAGAGTTTGCG 305
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 436 GCCTACCACCATGAAGATGCAGGAGAAGCTGGTCCCAAGTACCATGACTCCAATAGGGGCACCAAGAGTTTGCG 509
Query 306 GTTATTGAATCCTGAGAAAACTAGTGTGCTATCTACAGCCTTACCATACTTTGATCTGGTAAATCAGGACGTCC 379
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 510 GTTATTGAATCCTGAGAAAACTAGTGTGCTATCTACAGCCTTACCATACTTTGATCTGGTAAATCAGGACGTCC 583
Query 380 CCATCCCAAACAAAGATACAACATATTGGTGCCAAATGTTTAAGATTCCTGTGTTCCAAGAAAAGCATCATGTA 453
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 584 CCATCCCAAACAAAGATACAACATATTGGTGCCAAATGTTTAAGATTCCTGTGTTCCAAGAAAAGCATCATGTA 657
Query 454 ATAAAGGTTGAGCCAGTGATACAGAGAGGCCATGAGAGTCTGGTGCACCACATCCTGCTCTATCAGTGCAGCAA 527
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 658 ATAAAGGTTGAGCCAGTGATACAGAGAGGCCATGAGAGTCTGGTGCACCACATCCTGCTCTATCAGTGCAGCAA 731
Query 528 CAACTTTAACGACAGCGTTCTGGAGTCCGGCCACGAGTGCTATCACCCCAACATGCCCGATGCATTCCTCACCT 601
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 732 CAACTTTAACGACAGCGTTCTGGAGTCCGGCCACGAGTGCTATCACCCCAACATGCCCGATGCATTCCTCACCT 805
Query 602 GTGAAACTGTGATTTTTGCCTGGGCTATTGGTGGAGAGGGCTTTTCTTATCCACCTCATGTTGGATTATCCCTT 675
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 806 GTGAAACTGTGATTTTTGCCTGGGCTATTGGTGGAGAGGGCTTTTCTTATCCACCTCATGTTGGATTATCCCTT 879
Query 676 GGCACTCCATTAGATCCGCATTATGTGCTCCTAGAAGTCCATTATGATAATCCCACTTATGAGGAAGGCTTAAT 749
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 880 GGCACTCCATTAGATCCGCATTATGTGCTCCTAGAAGTCCATTATGATAATCCCACTTATGAGGAAGGCTTAAT 953
Query 750 AGATAATTCTGGACTGAGGTTATTTTACACAATGGATATAAGGAAATATGATGCTGGGGTGATTGAGGCTGGCC 823
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 954 AGATAATTCTGGACTGAGGTTATTTTACACAATGGATATAAGGAAATATGATGCTGGGGTGATTGAGGCTGGCC 1027
Query 824 TCTGGGTGAGCCTCTTCCATACCATCCCTCCAGGGATGCCTGAGTTCCAGTCTGAGGGTCACTGCACTTTGGAG 897
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1028 TCTGGGTGAGCCTCTTCCATACCATCCCTCCAGGGATGCCTGAGTTCCAGTCTGAGGGTCACTGCACTTTGGAG 1101
Query 898 TGCCTGGAAGAGGCTCTGGAAGCCGAAAAGCCAAGTGGAATTCATGTGTTTGCTGTTCTTCTCCATGCTCACCT 971
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1102 TGCCTGGAAGAGGCTCTGGAAGCCGAAAAGCCAAGTGGAATTCATGTGTTTGCTGTTCTTCTCCATGCTCACCT 1175
Query 972 GGCTGGCAGAGGCATCAGGCTGCGTCATTTTCGAAAAGGGAAGGAAATGAAATTACTTGCCTATGATGATGATT 1045
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1176 GGCTGGCAGAGGCATCAGGCTGCGTCATTTTCGAAAAGGGAAGGAAATGAAATTACTTGCCTATGATGATGATT 1249
Query 1046 TTGACTTCAATTTCCAGGAGTTTCAGTATCTAAAGGAAGAACAAACAATCTTACCAGGAGATAACCTAATTACT 1119
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1250 TTGACTTCAATTTCCAGGAGTTTCAGTATCTAAAGGAAGAACAAACAATCTTACCAGGAGATAACCTAATTACT 1323
Query 1120 GAGTGTCGCTACAACACGAAAGATAGAGCTGAGATGACTTGGGGAGGACTAAGCACCAGGAGTGAAATGTGTCT 1193
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1324 GAGTGTCGCTACAACACGAAAGATAGAGCTGAGATGACTTGGGGAGGACTAAGCACCAGGAGTGAAATGTGTCT 1397
Query 1194 CTCATACCTTCTTTATTACCCAAGAATTAATCTTACTCGATGTGCAAGTATTCCAGACATTATGGAACAACTTC 1267
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1398 CTCATACCTTCTTTATTACCCAAGAATTAATCTTACTCGATGTGCAAGTATTCCAGACATTATGGAACAACTTC 1471
Query 1268 AGTTCATTGGGGTTAAGGAGATCTACAGACCAGTCACGACCTGGCCTTTCATTATCAAAAGTCCCAAGCAATAT 1341
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1472 AGTTCATTGGGGTTAAGGAGATCTACAGACCAGTCACGACCTGGCCTTTCATTATCAAAAGTCCCAAGCAATAT 1545
Query 1342 AAAAACCTTTCTTTCATGGATGCTATGAATAAGTTTAAATGGACTAAAAAGGAAGGTCTCTCCTTCAACAAGCT 1415
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1546 AAAAACCTTTCTTTCATGGATGCTATGAATAAGTTTAAATGGACTAAAAAGGAAGGTCTCTCCTTCAACAAGCT 1619
Query 1416 GGTCCTCAGCCTGCCAGTGAATGTGAGATGTTCCAAGACAGACAATGCTGAGTGGTCGATTCAAGGAATGACAG 1489
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1620 GGTCCTCAGCCTGCCAGTGAATGTGAGATGTTCCAAGACAGACAATGCTGAGTGGTCGATTCAAGGAATGACAG 1693
Query 1490 CATTACCTCCAGATATAGAAAGACCCTATAAAGCAGAACCTTTGGTGTGTGGCACGTCTTCTTCCTCTTCCCTG 1563
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1694 CATTACCTCCAGATATAGAAAGACCCTATAAAGCAGAACCTTTGGTGTGTGGCACGTCTTCTTCCTCTTCCCTG 1767
Query 1564 CACAGAGATTTCTCCATCAACTTGCTTGTTTGCCTTCTGCTACTCAGCTGCACGCTGAGCACCAAGAGCTTGG 1636
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1768 CACAGAGATTTCTCCATCAACTTGCTTGTTTGCCTTCTGCTACTCAGCTGCACGCTGAGCACCAAGAGCTTG- 1839