Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488025
• Subject: NM_033325.2
• Aligned Length: 2341
• Identities: 1968
• Gaps: 31

Alignment

Query    1  ATGGAGAGGCCTC-----TGTGCTCCCACCTCTGCAGCTGCCTGGCTATGCTGGCCCTCCTGTCCCCCCTGAGC  69
            ||||||    |||     || |||||..|||||.|.||||..|||||.||||.|.|.|.|||.|..||||||||
Sbjct    1  ATGGAG----CTCCATTTTG-GCTCCTGCCTCTCCGGCTGTTTGGCTCTGCTTGTCTTGCTGCCTTCCCTGAGC  69

Query   70  CTGGCACAGTATGACAGCTGGCC---------CCATTACCCCGAGTACTTCCAGCAACCGGCTCCTGAGTATCA  134
            ||.||||||||.||..|||||||         |||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||.|.||
Sbjct   70  CTAGCACAGTACGAGGGCTGGCCCTACCAGCTCCAGTACCCTGAGTACTTCCAGCAGCCCGCTCCTGAGCACCA  143

Query  135  CCAGCCCCAGGCCCCCGCCAACGTGGCCAAGATTCAGCTGCGCCTGGCTGGGCAGAAGAGGAAGCACAGCGAGG  208
            .||||..||||..|||.||.|.||||.||||||.|||.|.||||||||.||.||||||||||||||||..||||
Sbjct  144  TCAGCGGCAGGTGCCCTCCGATGTGGTCAAGATCCAGGTCCGCCTGGCGGGCCAGAAGAGGAAGCACAATGAGG  217

Query  209  GCCGGGTGGAGGTGTACTATGATGGCCAGTGGGGCACCGTGTGCGATGACGACTTCTCCATCCACGCTGCCCAC  282
            ||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||.||.|||||.
Sbjct  218  GCCGCGTGGAGGTCTACTACGAAGGCCAGTGGGGCACGGTGTGCGACGATGACTTCTCGATCCATGCCGCCCAT  291

Query  283  GTCGTCTGCCGGGAGCTGGGCTACGTGGAGGCCAAGTCCTGGACTGCCAGCTCCTCCTACGG--CAAGGGAGAA  354
            ||.|||||||||.|..|||||||.||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||  ||  ||.|||
Sbjct  292  GTGGTCTGCCGGCAAGTGGGCTATGTAGAGGCCAAGTCCTGGGCTGCCAGCTCCTCCTACGGTCCA--GGCGAA  363

Query  355  GGGCCCATCTGGTTAGACAATCTCCACTGTACTGGCAACGAGGCGACCCTTGCAGCATGCACCTCCAATGGCTG  428
            ||.|||||||||||.||||||.||.|||||||||||||.|||.|||||||.|||.|.|||.|||||||||||||
Sbjct  364  GGCCCCATCTGGTTGGACAATATCTACTGTACTGGCAAAGAGTCGACCCTGGCATCTTGCTCCTCCAATGGCTG  437

Query  429  GGGCGTCACTGACTGCAAGCACACGGAGGATGTCGGTGTGGTGTGCAGCGACAAAAGGATTCCTGGGTTCAAAT  502
            |||.||||||||||||||||||||.||.||.||.||.||||||||.||.||.|||||.||||||||.|||||||
Sbjct  438  GGGTGTCACTGACTGCAAGCACACTGAAGACGTTGGAGTGGTGTGTAGTGAGAAAAGAATTCCTGGCTTCAAAT  511

Query  503  TTGACAATTCGTTGATCAACCAGATAGAGAACCTGAATATCCAGGTGGAGGACATTCGGATTCGAGCCATCCTC  576
            ||||||||||||||||||||||.|||||||.|||.|||||.||||||||.|||||.||||||||..|||||||.
Sbjct  512  TTGACAATTCGTTGATCAACCAAATAGAGAGCCTAAATATACAGGTGGAAGACATCCGGATTCGGCCCATCCTT  585

Query  577  TCAACCTACCGCAAGCGCACCCCAGTGATGGAGGGCTACGTGGAGGTGAAGGAGGGCAAGACCTGGAAGCAGAT  650
            ||..|||..|||.|.||||..||.||||..||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||
Sbjct  586  TCTGCCTTTCGCCATCGCAAGCCTGTGACAGAGGGCTACGTGGAGGTGAAGGAGGGCAAGGCTTGGAAGCAGAT  659

Query  651  CTGTGACAAGCACTGGACGGCCAAGAATTCCCGCGTGGTCTGCGGCATGTTTGGCTTCCCTGGGGAGAGGACAT  724
            |||..||||.||||||||.|||||||||||||.|||||||||.||||||||.||||||||||..||||.|||.|
Sbjct  660  CTGCAACAAACACTGGACAGCCAAGAATTCCCACGTGGTCTGTGGCATGTTCGGCTTCCCTGCAGAGAAGACCT  733

Query  725  ACAATACCAAAGTGTACAAAATGTTTGCCTCACGGAGGAAGCAGCGCTACTGGCCATTCTCCATGGACTGCACC  798
            ||||..||||||..||.||||..||||||||.||||||||||.|||.||||||...||.||.|||.|||||||.
Sbjct  734  ACAACCCCAAAGCCTATAAAACCTTTGCCTCGCGGAGGAAGCTGCGTTACTGGAAGTTTTCTATGAACTGCACG  807

Query  799  GGCACAGAGGCCCACATCTCCAGCTGCAAGCTGGGCCC--CCAGGTGTCACTGGACCCCATGAAGAATGTCACC  870
            |||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||  ||  |||.|.|.||||||..|||||||.|.||||
Sbjct  808  GGCACTGAAGCGCATATCTCCAGCTGCAAGCTGGGCCCTTCC--GTGACCCGGGACCCTGTGAAGAACGCCACC  879

Query  871  TGCGAGAATGGGCTACCGGCCGTGGTGAGTTGTGTGCCTGGGCAGGTCTTCAGCCCTGACGGACCCTCGAGATT  944
            ||.|||||.||||..||.||.|||||.||||||||||||.|.|||.||||||||||.||.||||||||.||.||
Sbjct  880  TGTGAGAACGGGCAGCCAGCTGTGGTCAGTTGTGTGCCTAGCCAGATCTTCAGCCCCGATGGACCCTCAAGGTT  953

Query  945  CCGGAAAGCGTACAAGCCAGAGCAACCCCTGGTGCGACTGAGAGGCGGTGCCTACATCGGGGAGGGCCGCGTGG  1018
            |||||||||.||||||||||||||||||.|||||||.||||||||.||.|||.|..|||||||||||||.||||
Sbjct  954  CCGGAAAGCCTACAAGCCAGAGCAACCCTTGGTGCGCCTGAGAGGTGGAGCCCAGGTCGGGGAGGGCCGAGTGG  1027

Query 1019  AGGTGCTCAAAAATGGAGAGTGGGGGACCGTCTGCGACGACAAGTGGGACCTGGTGTCGGCCAGTGTGGTCTGC  1092
            |||||||.||.||||||||.|||||.|||.|||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 1028  AGGTGCTGAAGAATGGAGAATGGGGAACCATCTGCGATGACAAGTGGGACCTGGTATCTGCCAGTGTGGTCTGC  1101

Query 1093  AGAGAGCTGGGCTTTGGGAGTGCCAAAGAGGCAGTCACTGGCTCCCGACTGGGGCAAGGGATCGGACCCATCCA  1166
            .||||||||||||||||||..||.||||||||..||||.||||||.||||.|||||||||||.||.||||||||
Sbjct 1102  CGAGAGCTGGGCTTTGGGACCGCTAAAGAGGCCATCACAGGCTCCAGACTAGGGCAAGGGATTGGGCCCATCCA  1175

Query 1167  CCTCAACGAGATCCAGTGCACAGGCAATGAGAAGTCCATTATAGACTGCAAGTTCAATGCCGAGTCTCAGGGCT  1240
            .|||||.||..|||||||||||||.|.||||||||||||.|||||||||||.|||||..|.||||||||.||||
Sbjct 1176  TCTCAATGAAGTCCAGTGCACAGGGACTGAGAAGTCCATCATAGACTGCAAATTCAACACAGAGTCTCAAGGCT  1249

Query 1241  GCAACCACGAGGAGGATGCTGGTGTGAGATGCAACACCCCTGCCATGGGCTTGCAGAAGAAGCTGCGCCTGAAC  1314
            |||||||.||.||.|||||.||.|||.|||||||||.|||...||||||.||.|||||.|||.||||||||||.
Sbjct 1250  GCAACCATGAAGAAGATGCCGGGGTGCGATGCAACATCCCCATCATGGGTTTCCAGAAAAAGGTGCGCCTGAAT  1323

Query 1315  GGCGGCCGCAATCCCTACGAGGGCCGAGTGGAGGTGCTGGTGGAGAGAAACGGGTCCCTTGTGTGGGGGATGGT  1388
            ||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||....||||||||.|||||||||||.|||||||..||
Sbjct 1324  GGAGGCCGCAATCCTTATGAGGGCCGAGTGGAGGTGCTAACAGAGAGAAATGGGTCCCTTGTTTGGGGGACTGT  1397

Query 1389  GTGTGGCCAAAACTGGGGCATCGTGGAGGCCATGGTGGTCTGCCGCCAGCTGGGCCTGGGATTCGCCAGCAACG  1462
            .||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||.|
Sbjct 1398  ATGCGGCCAGAACTGGGGCATTGTGGAAGCCATGGTGGTCTGCCGGCAGCTAGGCCTGGGCTTTGCCAGCAATG  1471

Query 1463  CCTTCCAGGAGACCTGGTATTGGCACGGAGATGTCAACAGCAACAAAGTGGTCATGAGTGGAGTGAAGTGCTCG  1536
            ||||.||||||||||||||.|||||.|||.||.||..|..||||||.||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1472  CCTTTCAGGAGACCTGGTACTGGCATGGAAATATCTTCGCCAACAACGTGGTCATGAGTGGAGTGAAGTGCTCA  1545

Query 1537  GGAACGGAGCTGTCCCTGGCGCACTGCCGCCACGACGGGGAGGACGTGGCCTGCCCCCAGGGCGGAGTGCAGTA  1610
            |||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||   |||||.||||||||||||.|||||||.||||.||.
Sbjct 1546  GGAACGGAGCTGTCCCTAGCACACTGCCGCCATGAC---GAGGAGGTGGCCTGCCCCGAGGGCGGGGTGCGGTT  1616

Query 1611  CGGGGCCGGAGTTGCCTGCTCAGAAACCGCCCCTGACCTGGTCCTCAATGCGGAGATGGTGCAGCAGACCACCT  1684
            .||.||.|||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.|||||.|||||.||.||||||||..|||
Sbjct 1617  TGGTGCTGGAGTCGCCTGCTCGGAAACTGCACCTGACCTGGTGCTTAATGCTGAGATTGTCCAGCAGACTGCCT  1690

Query 1685  ACCTGGAGGACCGGCCCATGTTCCTGCTGCAGTGTGCCATGGAGGAGAACTGCCTCTCGGCCTCAGCCGCGCAG  1758
            |||||||||||.|||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|.|||.
Sbjct 1691  ACCTGGAGGACAGGCCCATGTCCTTGCTGCAGTGTGCCATGGAGGAGAACTGCCTCTCCGCCTCCGCTGTGCAC  1764

Query 1759  ACCGACCCCACCACGGGCTACCGCCGGCTCCTGCGCTTCTCCTCCCAGATCCACAACAATGGCCAGTCCGACTT  1832
            |||||||||||||..|||.||||.||.||..|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1765  ACCGACCCCACCAGAGGCCACCGGCGCCTTTTACGCTTCTCCTCCCAGATCCACAACAATGGCCAGTCTGACTT  1838

Query 1833  CCGGCCCAAGAACGGCCGCCACGCGTGGATCTGGCACGACTGTCACAGGCACTACCACAGCATGGAGGTGTTCA  1906
            |||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 1839  CCGCCCCAAGAATGGCCGCCATGCGTGGATTTGGCACGACTGCCACAGGCACTACCACAGCATGGAAGTCTTCA  1912

Query 1907  CCCACTATGACCTGCTGAACCTCAATGGCACCAAGGTGGCAGAGGGCCACAAGGCCAGCTTCTGCTTGGAGGAC  1980
            |..|||||||||||||||.||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1913  CTTACTATGACCTGCTGAGCCTCAACGGCACCAAGGTGGCTGAGGGCCACAAGGCCAGCTTCTGCCTGGAGGAC  1986

Query 1981  ACAGAATGTGAAGGAGACATCCAGAAGAATTACGAGTGTGCCAACTTCGGCGATCAGGGCATCACCATGGGCTG  2054
            ||.||.|||||.||||||||.|||||||.||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 1987  ACTGAGTGTGAGGGAGACATTCAGAAGAGTTACGAGTGTGCCAACTTTGGAGAACAAGGCATCACCATGGGCTG  2060

Query 2055  CTGGGACATGTACCGCCATGACATCGACTGCCAGTGGGTTGACATCACTGACGTGCCCCCTGGAGACTACCTGT  2128
            |||||||||||||||.||||||||.||||||||||||.|.||||||||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 2061  CTGGGACATGTACCGTCATGACATTGACTGCCAGTGGATAGACATCACCGATGTGCCCCCTGGAGACTACCTGT  2134

Query 2129  TCCAGGTTGTTATTAACCCCAACTTCGAGGTTGCAGAATCCGATTACTCCAACAACATCATGAAATGCAGGAGC  2202
            ||||||||||.|||||||||||||..||.||..|||||||.||||.|||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 2135  TCCAGGTTGTCATTAACCCCAACTATGAAGTGCCAGAATCAGATTTCTCTAACAACATCATGAAGTGCAGGAGC  2208

Query 2203  CGCTATGACGGCCACCGCATCTGGATGTACAACTGCCACATAGGTGGTTCCTTCAGCGAAGAGACGGAAAAAAA  2276
            ||||||||.|||.||||||||||||||||||||||.|||.|||||||..|||||||.||.|||||.|||.|.||
Sbjct 2209  CGCTATGATGGCTACCGCATCTGGATGTACAACTGTCACGTAGGTGGAGCCTTCAGTGAGGAGACAGAACAGAA  2282

Query 2277  GTTTGAGCACTTCAGCGGGCTCTTAAACAACCAGCTGTCCCCGCAGG  2323
            |||.||.||||||||.||.||..||||.||||||||.||....||| 
Sbjct 2283  GTTCGAACACTTCAGTGGACTTCTAAATAACCAGCTCTCTGTACAG-  2328