Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000488025
- Subject:
- XM_006519745.2
- Aligned Length:
- 2362
- Identities:
- 1968
- Gaps:
- 52
Alignment
Query 1 ATGGAGAGGCCTC-----TGTGCTCCCACCTCTGCAGCTGCCTGGCTATGCTGGCCCTCCTGTCCCCCCTGAGC 69
|||||| ||| || |||||..|||||.|.||||..|||||.||||.|.|.|.|||.|..||||||||
Sbjct 1 ATGGAG----CTCCATTTTG-GCTCCTGCCTCTCCGGCTGTTTGGCTCTGCTTGTCTTGCTGCCTTCCCTGAGC 69
Query 70 CTGGCACAGTATGACAGCTGGCC---------CCATTACCCCGAGTACTTCCAGCAACCGGCTCCTGAGTATCA 134
||.||||||||.||..||||||| |||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||.|.||
Sbjct 70 CTAGCACAGTACGAGGGCTGGCCCTACCAGCTCCAGTACCCTGAGTACTTCCAGCAGCCCGCTCCTGAGCACCA 143
Query 135 CCAGCCCCAGGCCCCCGCCAACGTGGCCAAGATTCAGCTGCGCCTGGCTGGGCAGAAGAGGAAGCACAGCGAGG 208
.||||..||||..|||.||.|.||||.||||||.|||.|.||||||||.||.||||||||||||||||..||||
Sbjct 144 TCAGCGGCAGGTGCCCTCCGATGTGGTCAAGATCCAGGTCCGCCTGGCGGGCCAGAAGAGGAAGCACAATGAGG 217
Query 209 GCCGGGTGGAGGTGTACTATGATGGCCAGTGGGGCACCGTGTGCGATGACGACTTCTCCATCCACGCTGCCCAC 282
||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||.||.|||||.
Sbjct 218 GCCGCGTGGAGGTCTACTACGAAGGCCAGTGGGGCACGGTGTGCGACGATGACTTCTCGATCCATGCCGCCCAT 291
Query 283 GTCGTCTGCCGGGAGCTGGGCTACGTGGAGGCCAAGTCCTGGACTGCCAGCTCCTCCTACGG--CAAGGGAGAA 354
||.|||||||||.|..|||||||.||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||| || ||.|||
Sbjct 292 GTGGTCTGCCGGCAAGTGGGCTATGTAGAGGCCAAGTCCTGGGCTGCCAGCTCCTCCTACGGTCCA--GGCGAA 363
Query 355 GGGCCCATCTGGTTAGACAATCTCCACTGTACTGGCAACGAGGCGACCCTTGCAGCATGCACCTCCAATGGCTG 428
||.|||||||||||.||||||.||.|||||||||||||.|||.|||||||.|||.|.|||.|||||||||||||
Sbjct 364 GGCCCCATCTGGTTGGACAATATCTACTGTACTGGCAAAGAGTCGACCCTGGCATCTTGCTCCTCCAATGGCTG 437
Query 429 GGGCGTCACTGACTGCAAGCACACGGAGGATGTCGGTGTGGTGTGCAGCGACAAAAGGATTCCTGGGTTCAAAT 502
|||.||||||||||||||||||||.||.||.||.||.||||||||.||.||.|||||.||||||||.|||||||
Sbjct 438 GGGTGTCACTGACTGCAAGCACACTGAAGACGTTGGAGTGGTGTGTAGTGAGAAAAGAATTCCTGGCTTCAAAT 511
Query 503 TTGACAATTCGTTGATCAACCAGATAGAGAACCTGAATATCCAGGTGGAGGACATTCGGATTCGAGCCATCCTC 576
||||||||||||||||||||||.|||||||.|||.|||||.||||||||.|||||.||||||||..|||||||.
Sbjct 512 TTGACAATTCGTTGATCAACCAAATAGAGAGCCTAAATATACAGGTGGAAGACATCCGGATTCGGCCCATCCTT 585
Query 577 TCAACCTACCGCAAGCGCACCCCAGTGATGGAGGGCTACGTGGAGGTGAAGGAGGGCAAGACCTGGAAGCAGAT 650
||..|||..|||.|.||||..||.||||..||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||
Sbjct 586 TCTGCCTTTCGCCATCGCAAGCCTGTGACAGAGGGCTACGTGGAGGTGAAGGAGGGCAAGGCTTGGAAGCAGAT 659
Query 651 CTGTGACAAGCACTGGACGGCCAAGAATTCCCGCGTGGTCTGCGGCATGTTTGGCTTCCCTGGGGAGAGGACAT 724
|||..||||.||||||||.|||||||||||||.|||||||||.||||||||.||||||||||..||||.|||.|
Sbjct 660 CTGCAACAAACACTGGACAGCCAAGAATTCCCACGTGGTCTGTGGCATGTTCGGCTTCCCTGCAGAGAAGACCT 733
Query 725 ACAATACCAAAGTGTACAAAATGTTTGCCTCACGGAGGAAGCAGCGCTACTGGCCATTCTCCATGGACTGCACC 798
||||..||||||..||.||||..||||||||.||||||||||.|||.||||||...||.||.|||.|||||||.
Sbjct 734 ACAACCCCAAAGCCTATAAAACCTTTGCCTCGCGGAGGAAGCTGCGTTACTGGAAGTTTTCTATGAACTGCACG 807
Query 799 GGCACAGAGGCCCACATCTCCAGCTGCAAGCTGGGCCC--CCAGGTGTCACTGGACCCCATGAAGAATGTCACC 870
|||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||| || |||.|.|.||||||..|||||||.|.||||
Sbjct 808 GGCACTGAAGCGCATATCTCCAGCTGCAAGCTGGGCCCTTCC--GTGACCCGGGACCCTGTGAAGAACGCCACC 879
Query 871 TGCGAGAATGGGCTACCGGCCGTGGTGAGTTGTGTGCCTGGGCAGGTCTTCAGCCCTGACGGACCCTCGAGATT 944
||.|||||.||||..||.||.|||||.||||||||||||.|.|||.||||||||||.||.||||||||.||.||
Sbjct 880 TGTGAGAACGGGCAGCCAGCTGTGGTCAGTTGTGTGCCTAGCCAGATCTTCAGCCCCGATGGACCCTCAAGGTT 953
Query 945 CCGGAAAGCGTACAAGCCAG---------------------AGCAACCCCTGGTGCGACTGAGAGGCGGTGCCT 997
|||||||||.|||||||||| ||||||||.|||||||.||||||||.||.|||.
Sbjct 954 CCGGAAAGCCTACAAGCCAGAGCAGGACCGTGTGTCTCCCCAGCAACCCTTGGTGCGCCTGAGAGGTGGAGCCC 1027
Query 998 ACATCGGGGAGGGCCGCGTGGAGGTGCTCAAAAATGGAGAGTGGGGGACCGTCTGCGACGACAAGTGGGACCTG 1071
|..|||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||.|||.|||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1028 AGGTCGGGGAGGGCCGAGTGGAGGTGCTGAAGAATGGAGAATGGGGAACCATCTGCGATGACAAGTGGGACCTG 1101
Query 1072 GTGTCGGCCAGTGTGGTCTGCAGAGAGCTGGGCTTTGGGAGTGCCAAAGAGGCAGTCACTGGCTCCCGACTGGG 1145
||.||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||..||.||||||||..||||.||||||.||||.||
Sbjct 1102 GTATCTGCCAGTGTGGTCTGCCGAGAGCTGGGCTTTGGGACCGCTAAAGAGGCCATCACAGGCTCCAGACTAGG 1175
Query 1146 GCAAGGGATCGGACCCATCCACCTCAACGAGATCCAGTGCACAGGCAATGAGAAGTCCATTATAGACTGCAAGT 1219
|||||||||.||.||||||||.|||||.||..|||||||||||||.|.||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 1176 GCAAGGGATTGGGCCCATCCATCTCAATGAAGTCCAGTGCACAGGGACTGAGAAGTCCATCATAGACTGCAAAT 1249
Query 1220 TCAATGCCGAGTCTCAGGGCTGCAACCACGAGGAGGATGCTGGTGTGAGATGCAACACCCCTGCCATGGGCTTG 1293
||||..|.||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.||.|||.|||||||||.|||...||||||.||.
Sbjct 1250 TCAACACAGAGTCTCAAGGCTGCAACCATGAAGAAGATGCCGGGGTGCGATGCAACATCCCCATCATGGGTTTC 1323
Query 1294 CAGAAGAAGCTGCGCCTGAACGGCGGCCGCAATCCCTACGAGGGCCGAGTGGAGGTGCTGGTGGAGAGAAACGG 1367
|||||.|||.||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||....||||||||.||
Sbjct 1324 CAGAAAAAGGTGCGCCTGAATGGAGGCCGCAATCCTTATGAGGGCCGAGTGGAGGTGCTAACAGAGAGAAATGG 1397
Query 1368 GTCCCTTGTGTGGGGGATGGTGTGTGGCCAAAACTGGGGCATCGTGGAGGCCATGGTGGTCTGCCGCCAGCTGG 1441
|||||||||.|||||||..||.||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 1398 GTCCCTTGTTTGGGGGACTGTATGCGGCCAGAACTGGGGCATTGTGGAAGCCATGGTGGTCTGCCGGCAGCTAG 1471
Query 1442 GCCTGGGATTCGCCAGCAACGCCTTCCAGGAGACCTGGTATTGGCACGGAGATGTCAACAGCAACAAAGTGGTC 1515
|||||||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||.||.||..|..||||||.||||||
Sbjct 1472 GCCTGGGCTTTGCCAGCAATGCCTTTCAGGAGACCTGGTACTGGCATGGAAATATCTTCGCCAACAACGTGGTC 1545
Query 1516 ATGAGTGGAGTGAAGTGCTCGGGAACGGAGCTGTCCCTGGCGCACTGCCGCCACGACGGGGAGGACGTGGCCTG 1589
||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.||| |||||.||||||||
Sbjct 1546 ATGAGTGGAGTGAAGTGCTCAGGAACGGAGCTGTCCCTAGCACACTGCCGCCATGAC---GAGGAGGTGGCCTG 1616
Query 1590 CCCCCAGGGCGGAGTGCAGTACGGGGCCGGAGTTGCCTGCTCAGAAACCGCCCCTGACCTGGTCCTCAATGCGG 1663
||||.|||||||.||||.||..||.||.|||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.|||||.|
Sbjct 1617 CCCCGAGGGCGGGGTGCGGTTTGGTGCTGGAGTCGCCTGCTCGGAAACTGCACCTGACCTGGTGCTTAATGCTG 1690
Query 1664 AGATGGTGCAGCAGACCACCTACCTGGAGGACCGGCCCATGTTCCTGCTGCAGTGTGCCATGGAGGAGAACTGC 1737
||||.||.||||||||..||||||||||||||.|||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1691 AGATTGTCCAGCAGACTGCCTACCTGGAGGACAGGCCCATGTCCTTGCTGCAGTGTGCCATGGAGGAGAACTGC 1764
Query 1738 CTCTCGGCCTCAGCCGCGCAGACCGACCCCACCACGGGCTACCGCCGGCTCCTGCGCTTCTCCTCCCAGATCCA 1811
|||||.|||||.||.|.|||.|||||||||||||..|||.||||.||.||..|.||||||||||||||||||||
Sbjct 1765 CTCTCCGCCTCCGCTGTGCACACCGACCCCACCAGAGGCCACCGGCGCCTTTTACGCTTCTCCTCCCAGATCCA 1838
Query 1812 CAACAATGGCCAGTCCGACTTCCGGCCCAAGAACGGCCGCCACGCGTGGATCTGGCACGACTGTCACAGGCACT 1885
|||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct 1839 CAACAATGGCCAGTCTGACTTCCGCCCCAAGAATGGCCGCCATGCGTGGATTTGGCACGACTGCCACAGGCACT 1912
Query 1886 ACCACAGCATGGAGGTGTTCACCCACTATGACCTGCTGAACCTCAATGGCACCAAGGTGGCAGAGGGCCACAAG 1959
|||||||||||||.||.|||||..|||||||||||||||.||||||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1913 ACCACAGCATGGAAGTCTTCACTTACTATGACCTGCTGAGCCTCAACGGCACCAAGGTGGCTGAGGGCCACAAG 1986
Query 1960 GCCAGCTTCTGCTTGGAGGACACAGAATGTGAAGGAGACATCCAGAAGAATTACGAGTGTGCCAACTTCGGCGA 2033
||||||||||||.||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||.||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 1987 GCCAGCTTCTGCCTGGAGGACACTGAGTGTGAGGGAGACATTCAGAAGAGTTACGAGTGTGCCAACTTTGGAGA 2060
Query 2034 TCAGGGCATCACCATGGGCTGCTGGGACATGTACCGCCATGACATCGACTGCCAGTGGGTTGACATCACTGACG 2107
.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||.|.||||||||.||.|
Sbjct 2061 ACAAGGCATCACCATGGGCTGCTGGGACATGTACCGTCATGACATTGACTGCCAGTGGATAGACATCACCGATG 2134
Query 2108 TGCCCCCTGGAGACTACCTGTTCCAGGTTGTTATTAACCCCAACTTCGAGGTTGCAGAATCCGATTACTCCAAC 2181
|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||..||.||..|||||||.||||.|||.|||
Sbjct 2135 TGCCCCCTGGAGACTACCTGTTCCAGGTTGTCATTAACCCCAACTATGAAGTGCCAGAATCAGATTTCTCTAAC 2208
Query 2182 AACATCATGAAATGCAGGAGCCGCTATGACGGCCACCGCATCTGGATGTACAACTGCCACATAGGTGGTTCCTT 2255
|||||||||||.|||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||.|||.|||||||..||||
Sbjct 2209 AACATCATGAAGTGCAGGAGCCGCTATGATGGCTACCGCATCTGGATGTACAACTGTCACGTAGGTGGAGCCTT 2282
Query 2256 CAGCGAAGAGACGGAAAAAAAGTTTGAGCACTTCAGCGGGCTCTTAAACAACCAGCTGTCCCCGCAGG 2323
|||.||.|||||.|||.|.|||||.||.||||||||.||.||..||||.||||||||.||....|||
Sbjct 2283 CAGTGAGGAGACAGAACAGAAGTTCGAACACTTCAGTGGACTTCTAAATAACCAGCTCTCTGTACAG- 2349