Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000488029
- Subject:
- NM_001318712.2
- Aligned Length:
- 2172
- Identities:
- 2059
- Gaps:
- 111
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGATCAAGGTAGAACACCTGAAGGAGAAGCTCATTAGCCAGGCCCAGGAAGTGAGCCGACTGCGATCTGAGCT 74
Query 1 -------------------------------------ATGGTGGAGAATGAGCGACTGAGGCAGGAGATGCGGC 37
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Sbjct 75 GGGGGGCACCGACTTGGAGAAGCACCGGGACCTGCTGATGGTGGAGAATGAGCGACTGAGGCAGGAGATGCGGC 148
Query 38 GCTGTGAGGCCGAGCTGCAAGAGCTGCGCACAAAGCCAGCAGGTCCCTGCCCAGGTTGTGAGCACAGCCAGGAG 111
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Sbjct 149 GCTGTGAGGCCGAGCTGCAAGAGCTGCGCACAAAGCCAGCAGGTCCCTGCCCAGGTTGTGAGCACAGCCAGGAG 222
Query 112 AGCGCCCAGCTCCGTGACAAGCTGTCCCAGCTGCAGCTGGAGATGGCGGAAAGCAAAGGCATGCTGTCAGAGCT 185
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Sbjct 223 AGCGCCCAGCTCCGTGACAAGCTGTCCCAGCTGCAGCTGGAGATGGCGGAAAGCAAAGGCATGCTGTCAGAGCT 296
Query 186 GAACCTAGAGGTGCAGCAGAAGACCGACCGGCTGGCTGAGGTGGAGCTGCGACTCAAGGACTGCCTGGCTGAGA 259
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Sbjct 297 GAACCTAGAGGTGCAGCAGAAGACCGACCGGCTGGCTGAGGTGGAGCTGCGACTCAAGGACTGCCTGGCTGAGA 370
Query 260 AGGCACAGGAGGAGGAGCGGCTTAGTCGGCGCCTGCGTGACAGCCACGAGACCATTGCCAGCCTGCGGGCCCAG 333
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Sbjct 371 AGGCACAGGAGGAGGAGCGGCTTAGTCGGCGCCTGCGTGACAGCCACGAGACCATTGCCAGCCTGCGGGCCCAG 444
Query 334 TCCCCACCTGTCAAGTATGTCATCAAGACAGTGGAGGTGGAGTCGTCCAAGACCAAGCAGGCCCTCAGCGAGTC 407
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Sbjct 445 TCCCCACCTGTCAAGTATGTCATCAAGACAGTGGAGGTGGAGTCGTCCAAGACCAAGCAGGCCCTCAGCGAGTC 518
Query 408 CCAGGCCCGGAACCAGCACCTGCAGGAGCAGGTGGCTATGCAGAGGCAGGTGCTGAAGGAGATGGAACAGCAGC 481
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Sbjct 519 CCAGGCCCGGAACCAGCACCTGCAGGAGCAGGTGGCTATGCAGAGGCAGGTGCTGAAGGAGATGGAACAGCAGC 592
Query 482 TGCAGAGCTCACACCAGCTGACCGCGCGGCTCCGGGCGCAGATTGCCATGTACGAGTCAGAGCTGGAGCGGGCC 555
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Sbjct 593 TGCAGAGCTCACACCAGCTGACCGCGCGGCTCCGGGCGCAGATTGCCATGTACGAGTCAGAGCTGGAGCGGGCC 666
Query 556 CATGGGCAGATGCTGGAGGAGATGCAGTCCCTGGAAGAGGACAAGAACCGGGCCATTGAGGAGGCCTTTGCCAG 629
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Sbjct 667 CATGGGCAGATGCTGGAGGAGATGCAGTCCCTGGAAGAGGACAAGAACCGGGCCATTGAGGAGGCCTTTGCCAG 740
Query 630 AGCCCAGGTGGAGATGAAGGCTGTGCACGAGAATCTAGCAGGCGTCCGGACCAACTTGCTGACCTTGCAGCCGG 703
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Sbjct 741 AGCCCAGGTGGAGATGAAGGCTGTGCACGAGAATCTAGCAGGCGTCCGGACCAACTTGCTGACCTTGCAGCCGG 814
Query 704 CACTGCGGACCCTCACCAACGACTACAATGGGCTCAAGCGGCAGGTGCGCGTCTTCCCACTGCTGCTGCAGGAG 777
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Sbjct 815 CACTGCGGACCCTCACCAACGACTACAATGGGCTCAAGCGGCAGGTGCGCGGCTTCCCACTGCTGCTGCAGGAG 888
Query 778 GCCCTCAGGAGTGTCAAGGCCGAGATAGGCCAGGCCATCGAGGAGGTCAACAGCAACAACCAGGAGCTGCTGCG 851
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Sbjct 889 GCCCTCAGGAGTGTCAAGGCCGAGATAGGCCAGGCCATCGAGGAGGTCAACAGCAACAACCAGGAGCTGCTGCG 962
Query 852 CAAGTACCGCCGCGAGCTGCAGCTGCGTAAGAAGTGCCACAATGAGCTCGTGCGGCTGAAAGGGAACATCCGAG 925
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Sbjct 963 CAAGTACCGCCGCGAGCTGCAGCTGCGTAAGAAGTGCCACAATGAGCTCGTGCGGCTGAAAGGGAACATCCGAG 1036
Query 926 TGATTGCTCGTGTCCGGCCAGTCACCAAAGAGGATGGGGAAGGACCTGAGGCCACCAATGCTGTGACTTTCGAT 999
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Sbjct 1037 TGATTGCTCGTGTCCGGCCAGTCACCAAAGAGGATGGGGAAGGACCTGAGGCCACCAATGCTGTGACTTTCGAT 1110
Query 1000 GCCGACGACGACTCCATCATCCACCTGCTGCACAAGGGCAAGCCTGTGTCCTTCGAGCTGGACAAGGTCTTCTC 1073
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Sbjct 1111 GCCGACGACGACTCCATCATCCACCTGCTGCACAAGGGCAAGCCTGTGTCCTTCGAGCTGGACAAGGTCTTCTC 1184
Query 1074 CCCACAGGCCTCGCAGCAGGACGTGTTCCAGGAGGTGCAGGCCCTGGTCACCTCTTGCATTGATGGCTTCAATG 1147
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Sbjct 1185 CCCACAGGCCTCGCAGCAGGACGTGTTCCAGGAGGTGCAGGCCCTGGTCACCTCTTGCATTGATGGCTTCAATG 1258
Query 1148 TCTGCATCTTTGCGTACGGCCAGACGGGCGCCGGCAAGACGTACACGATGGAGGGGACCGCTGAGAACCCAGGT 1221
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Sbjct 1259 TCTGCATCTTTGCGTACGGCCAGACGGGCGCCGGCAAGACGTACACGATGGAGGGGACCGCTGAGAACCCAGGT 1332
Query 1222 ATCAACCAGCGGGCCCTGCAGCTGCTCTTCTCCGAGGTGCAGGAGAAGGCGTCTGACTGGGAGTACACCATCAC 1295
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Sbjct 1333 ATCAACCAGCGGGCCCTGCAGCTGCTCTTCTCCGAGGTGCAGGAGAAGGCGTCTGACTGGGAGTACACCATCAC 1406
Query 1296 CGTCAGCGCTGCGGAGATCTACAATGAGGTCCTCAGGGACCTGCTAGGGAAAGAGCCTCAGGAAAAACTGGAGA 1369
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Sbjct 1407 CGTCAGCGCTGCGGAGATCTACAATGAGGTCCTCAGGGACCTGCTAGGGAAAGAGCCTCAGGAAAAACTGGAGA 1480
Query 1370 TCCGGCTGTGCCCAGACGGCAGTGGGCAGCTGTATGTACCAGGGCTGACTGAGTTCCAAGTGCAGAGCGTGGAC 1443
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Sbjct 1481 TCCGGCTGTGCCCAGACGGCAGTGGGCAGCTGTATGTACCAGGGCTGACTGAGTTCCAAGTGCAGAGCGTGGAC 1554
Query 1444 GACATCAACAAGGTGTTTGAGTTTGGCCACACTAATCGCACGACCGAGTTCACCAACCTGAACGAGCACAGCTC 1517
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Sbjct 1555 GACATCAACAAGGTGTTTGAGTTTGGCCACACTAATCGCACGACCGAGTTCACCAACCTGAACGAGCACAGCTC 1628
Query 1518 CCGCTCGCACGCACTGCTCATCGTGACGGTGCGAGGCGTGGACTGCAGCACAGGCCTCCGCACCACGGGGAAGC 1591
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Sbjct 1629 CCGCTCGCACGCGCTGCTCATCGTGACGGTGCGAGGCGTGGACTGCAGCACAGGCCTCCGCACCACGGGGAAGC 1702
Query 1592 TGAACCTGGTGGACTTGGCTGGCTCGGAGCGCGTGGGCAAGTCGGGGGCCGAGGGCAGCCGCCTGCGGGAGGCG 1665
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Sbjct 1703 TGAACCTGGTGGACTTGGCTGGCTCGGAGCGCGTGGGCAAGTCGGGGGCCGAGGGCAGCCGCCTGCGGGAGGCG 1776
Query 1666 CAGCACATCAACAAGTCGCTGTCGGCTCTGGGGGACGTCATTGCTGCCCTGCGCTCCCGCCAGGGCCACGTGCC 1739
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Sbjct 1777 CAGCACATCAACAAGTCGCTGTCGGCTCTGGGGGACGTCATTGCTGCCCTGCGCTCCCGCCAGGGCCACGTGCC 1850
Query 1740 CTTCCGCAACTCCAAGCTCACCTACCTGCTGCAGGATTCGCTTAGTGGTGACAGCAAGACCCTCATGGTGGTAC 1813
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Sbjct 1851 CTTCCGCAACTCCAAGCTCACCTACCTGCTGCAGGATTCGCTTAGTGGTGACAGCAAGACCCTCATGGTGGTAC 1924
Query 1814 AGGTGTCCCCCGTGGAGAAGAACACTAGCGAGACGCTCTATTCCCTCAAGTTTGCTGAGAGGGTGCGCTCTGTG 1887
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Sbjct 1925 AGGTGTCCCCCGTGGAGAAGAACACTAGCGAGACGCTCTATTCCCTCAAGTTTGCTGAGAGGGTGCGCTCTGTG 1998
Query 1888 GAGCTGGGGCCTGGGCTACGCAGGGCAGAGCTTGGGTCCTGGTCAAGCCAGGAGCATCTAGAGTGGGAGCCGGC 1961
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Sbjct 1999 GAGCTGGGGCCTGGGCTACGCAGGGCAGAGCTTGGGTCCTGGTCAAGCCAGGAGCATCTAGAGTGGGAGCCGGC 2072
Query 1962 TTGTCAGACGCCACAGCCCTCGGCACGGGCCCACTCAGCCCCCAGCTCTGGGACCAGTAGCCGCCCTGGATCCA 2035
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Sbjct 2073 TTGTCAGACGCCACAGCCCTCGGCACGGGCCCACTCAGCCCCCAGCTCTGGGACCAGTAGCCGCCCTGGATCCA 2146
Query 2036 TCCGGAGGAAGCTGCAGCCCTCGGCC 2061
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Sbjct 2147 TCCGGAGGAAGCTGCAGCCCTCGGCC 2172