Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488029
• Subject: XM_006530724.3
• Aligned Length: 2389
• Identities: 1829
• Gaps: 332

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGAATGTAGAAAATACAGGTGGGCGGCTCTTTGGCATCGGGAGGTGCTCAAGCCTGTCCGGGGCACCAGGCCC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  AGACCCCGTGGTACATAGGACCGTGGAGGCCATGTCCCAGCTTCAGGAGGAGCTGGTAGTCCTTCGGGAGAGGC  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  TGGCCCTCCACGACAGTGACCGGCAAGCCACAACCACCCAGCTGCAGAACCAGGTGGAGAATCTAAAGGAAAAG  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  CTCATTAGCCAGGCCCAGGAAGTGAGCCGACTGCGATCAGAACTGGGAGGCACGGACGCGGAGAAGCACAGGGA  296

Query    1  -------ATGGTGGAGAATGAGCGACTGAGGCAGGAGATGCGGCGCTGTGAGGCCGAGCTGCAAGAGCTGCGCA  67
                   ||||||||||||||||..||||||||||||.||.||||||||||||.|||.|||||.|||||.||..
Sbjct  297  CAGACTGATGGTGGAGAATGAGCAGCTGAGGCAGGAGCTGAGGCGCTGTGAGGTCGAACTGCAGGAGCTTCGGG  370

Query   68  CAAAGCCAGCAGGT----CCCTGCCCAGGTTGTGAGCACAGCCAGGAGAGCGCCCAGCTCCGTGACAAGCTGTC  137
            |    |||||.|||    ||||||...||.|||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||
Sbjct  371  C----CCAGCCGGTGGTGCCCTGCGAGGGCTGTGAGCACAGCCAGGAGAGCAGCCAGCTCCGTGACAAGCTGTC  440

Query  138  CCAGCTGCAGCTGGAGATGGCGGAAAGCAAAGGCATGCTGTCAGAGCTGAACCTAGAGGTGCAGCAGAAGACCG  211
            ||||||||||.||||..||||.||.|.|||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||.|
Sbjct  441  CCAGCTGCAGTTGGAAGTGGCTGAGAACAAAGGCATGCTGTCGGAACTGAACCTGGAGGTGCAGCAGAAAACGG  514

Query  212  ACCGGCTGGCTGAGGTGGAGCTGCGACTCAAGGACTGCCTGGCTGAGAAGGCACAGGAGGAGGAGCGGCTTAGT  285
            ||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.
Sbjct  515  ACCGGCTGGCAGAGGTAGAGCTGCGCCTCAAGGACTGTCTGGCTGAGAAAGCCCAGGAGGAGGAACGGCTCAGC  588

Query  286  CGGCGCCTGCGTGACAGCCACGAGACCATTGCCAGCCTGCGGGCCCAGTCCCCACCTGTCAAGTATGTCATCAA  359
            ||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  589  CGGCGCCTGCGTGACAGCCATGAGACTATCGCCAGTCTGAGGGCCCAGTCCCCACCTGTTAAGTATGTCATCAA  662

Query  360  GACAGTGGAGGTGGAGTCGTCCAAGACCAAGCAGGCCCTCAGCGAGTCCCAGGCCCGGAACCAGCACCTGCAGG  433
            ||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  663  GACAGTGGAGGTAGAGTCTTCCAAGACCAAGCAGGCCCTCAGCGAGTCCCAGACCCGGAACCAGCACCTGCAGG  736

Query  434  AGCAGGTGGCTATGCAGAGGCAGGTGCTGAAGGAGATGGAACAGCAGCTGCAGAGCTCACACCAGCTGACCGCG  507
            ||||.|||||.||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||.||||.|||.|||||||||||.|..
Sbjct  737  AGCAAGTGGCCATGCAGCGGCAGGTGCTGAAGGAGATGGAGCAGCAGCTACAGAACTCCCACCAGCTGACAGTC  810

Query  508  CGGCTCCGGGCGCAGATTGCCATGTACGAGTCAGAGCTGGAGCGGGCCCATGGGCAGATGCTGGAGGAGATGCA  581
            |.|.|.|||||.||||||||||||||.|||.||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  811  CAGTTGCGGGCTCAGATTGCCATGTATGAGGCAGAGCTGGAGCGGGCACACGGGCAGATGCTGGAGGAGATGCA  884

Query  582  GTCCCTGGAAGAGGACAAGAACCGGGCCATTGAGGAGGCCTTTGCCAGAGCCCAGGTGGAGATGAAGGCTGTGC  655
            ||||.||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||..|.||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct  885  GTCCTTGGAGGAGGATAAGAACCGGGCCATTGAGGAGGCCTTTGCACGGGCCCAGGTGGAGATGAAGGCAGTAC  958

Query  656  ACGAGAATCTAGCAGGCGTCCGGACCAACTTGCTGACCTTGCAGCCGGCACTGCGGACCCTCACCAACGACTAC  729
            |||||||.||.|||||.|||.||||||||.|||||||..|||||||.||.|||.||||||||||||||||||||
Sbjct  959  ACGAGAACCTGGCAGGTGTCAGGACCAACCTGCTGACGCTGCAGCCTGCGCTGAGGACCCTCACCAACGACTAC  1032

Query  730  AATGGGCTCAAGCGGCAGGTGCGCGTCTTCCCACTGCTGCTGCAGGAGGCCCTCAGGAGTGTCAAGGCCGAGAT  803
            |||||||||||||||||||||||.|.||||||..||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 1033  AATGGGCTCAAGCGGCAGGTGCGGGGCTTCCCCTTGCTGCTGCAGGAGGCTCTCAGGAGTGTCAAAGCTGAGAT  1106

Query  804  AGGCCAGGCCATCGAGGAGGTCAACAGCAACAACCAGGAGCTGCTGCGCAAGTACCGCCGCGAGCTGCAGCTGC  877
            .||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||.||.|||||||
Sbjct 1107  CGGCCAGGCCATCGAGGAGGTTAATAGCAACAACCAGGAGCTGTTGCGCAAGTACCGCCGGGAACTACAGCTGC  1180

Query  878  GTAAGAAGTGCCACAATGAGCTCGTGCGGCTGAAAGGGAACATCCGAGTGATTGCTCGTGTCCGGCCAGTCACC  951
            |.|||||.|||||.||.|||||.||.||||||||.||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 1181  GCAAGAAATGCCATAACGAGCTGGTCCGGCTGAAGGGAAACATCCGGGTGATTGCCCGAGTCCGGCCAGTCACC  1254

Query  952  AAAGAGGATGGGGAAGGACCTGAGGCCACCAATGCTGTGACTTTCGATGCCGACGACGACTCCATCATCCACCT  1025
            ||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||..|.||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 1255  AAGGAGGATGGAGAAGGACCCGAGGCAACCAATGCTGTGACCTTTGACCCTGATGATGACTCCATCATCCACCT  1328

Query 1026  GCTGCACAAGGGCAAGCCTGTGTCCTTCGAGCTGGACAAGGTCTTCTCCCCACAGGCCTCGCAGCAGGACGTGT  1099
            ||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||...|||.||.|||||||||||||
Sbjct 1329  GCTGCACAAGGGCAAGCCCGTGTCCTTCGAGCTGGACAAGGTCTTCTCCCCGTGGGCTTCCCAGCAGGACGTGT  1402

Query 1100  TCCAGGAGGTGCAGGCCCTGGTCACCTCTTGCATTGATGGCTTCAATGTCTGCATCTTTGCGTACGGCCAGACG  1173
            |||||||||||||||||||..|.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.
Sbjct 1403  TCCAGGAGGTGCAGGCCCTCATTACCTCCTGCATCGATGGCTTCAATGTCTGTATCTTTGCTTACGGCCAGACA  1476

Query 1174  GGCGCCGGCAAGACGTACACGATGGAGGGGACCGCTGAGAACCCAGGTATCAACCAGCGGGCCCTGCAGCTGCT  1247
            ||.|||||||||||.||.||.|||||||||||..|.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1477  GGTGCCGGCAAGACATATACAATGGAGGGGACTCCCGAGAACCCGGGCATCAACCAGCGGGCCCTGCAGCTGCT  1550

Query 1248  CTTCTCCGAGGTGCAGGAGAAGGCGTCTGACTGGGAGTACACCATCACCGTCAGCGCTGCGGAGATCTACAATG  1321
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||.||.|||||.|||||||
Sbjct 1551  CTTCTCGGAGGTGCAGGAGAAGGCGTCTGACTGGCAGTACAACATCACCGTCAGCGCAGCTGAGATTTACAATG  1624

Query 1322  AGGTCCTCAGGGACCTGCTAGGGAAAGAGCCTCAGGAAAAACTGGAGATCCGGCTGTGCCCAGACGGCAGTGGG  1395
            |.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||
Sbjct 1625  AAGTCCTCAGGGACCTGCTGGGGAAAGAGCCTCAGGAGAAGCTGGAGATCCGACTGTGCCCGGATGGCAGTGGG  1698

Query 1396  CAGCTGTATGTACCAGGGCTGACTGAGTTCCAAGTGCAGAGCGTGGACGACATCAACAAGGTGTTTGAGTTTGG  1469
            ||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1699  CAACTGTATGTGCCAGGGCTGACTGAGTTCCAGGTGCAGAGCGTGGATGACATCAACAAGGTGTTTGAGTTTGG  1772

Query 1470  CCACACTAATCGCACGACCGAGTTCACCAACCTGAACGAGCACAGCTCCCGCTCGCACGCACTGCTCATCGTGA  1543
            |.|||..||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 1773  CTACAACAACCGCACCACCGAGTTCACCAACCTGAACGAACACAGCTCCCGCTCCCACGCTCTGCTCATCGTGA  1846

Query 1544  CGGTGCGAGGCGTGGACTGCAGCACAGGCCTCCGCACCACGGGGAAGCTGAACCTGGTGGACTTGGCTGGCTCG  1617
            |.|||.||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||.
Sbjct 1847  CAGTGAGAGGTGTGGATTGCAGCACAGGCCTCCGCACCACGGGGAAGCTGAACCTGGTGGACCTGGCTGGTTCA  1920

Query 1618  GAGCGCGTGGGCAAGTCGGGGGCCGAGGGCAGCCGCCTGCGGGAGGCGCAGCACATCAACAAGTCGCTGTCGGC  1691
            |||||.|||||||||||||||||.|||||||.|||||||||.|||||.|||||||||||||.|||.||.||.||
Sbjct 1921  GAGCGTGTGGGCAAGTCGGGGGCTGAGGGCAACCGCCTGCGAGAGGCACAGCACATCAACAGGTCACTATCCGC  1994

Query 1692  TCTGGGGGACGTCATTGCTGCCCTGCGCTCCCGCCAGGGCCACGTGCCCTTCCGCAACTCCAAGCTCACCTACC  1765
            .||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 1995  CCTGGGGGACGTCATTGCTGCCCTGCGTTCTCGACAAGGCCATGTGCCCTTCCGCAATTCCAAACTCACCTACC  2068

Query 1766  TGCTGCAGGATTCGCTTAGTGGTGACAGCAAGACCCTCATGGTGGTACAGGTGTCCCCCGTGGAGAAGAACACT  1839
            ||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 2069  TGCTGCAGGACTCACTCAGTGGTGACAGCAAGACCCTTATGGTGGTACAGGTGTCCCCAGTGGAGAAGAACACC  2142

Query 1840  AGCGAGACGCTCTATTCCCTCAAGTTTGCTGAGAGGGTGCGCTCTGTGGAGCTGGGGCCTGGGCTACGCAGGGC  1913
            ||||||||.||.||.|||||||..||||||||||||||.||||||||||||.||||.||||||...|||.|..|
Sbjct 2143  AGCGAGACTCTGTACTCCCTCAGATTTGCTGAGAGGGTTCGCTCTGTGGAGTTGGGCCCTGGGTCCCGCCGCAC  2216

Query 1914  AGAGCTTGGGTCCTGGTCAAGCCAGGAGCATCTAGAGTGGGAGCCGGCTTGTCAGACGCCACAGCCCTCGGCAC  1987
            ||||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||..|.||||
Sbjct 2217  AGAGCTGGGTTCCTGGTCAAGCCAGGAGCACCTGGAGTGGGAGCCGGCTTGCCAGACACCACAGCCTACAGCAC  2290

Query 1988  GGGCCCACTCAGCCCCCAGCTCTGGGACCAGTAGCCGCCCTGGATCCATCCGGAGGAAGCTGCAGCCCTC----  2057
            |.||||||||.|||||..||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||.||    
Sbjct 2291  GAGCCCACTCTGCCCCTGGCTCTGGGACCAGTAGCCGCCCAGGTTCCATCCGAAGGAAACTGCAGCCGTCAGGG  2364

Query 2058  -------GGCC----------  2061
                   ||||          
Sbjct 2365  AAGTTGAGGCCAGTGCCTGTG  2385