Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000488029
- Subject:
- XM_006530726.3
- Aligned Length:
- 2284
- Identities:
- 1829
- Gaps:
- 227
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGTCCCAGCTTCAGGAGGAGCTGGTAGTCCTTCGGGAGAGGCTGGCCCTCCACGACAGTGACCGGCAAGCCAC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 AACCACCCAGCTGCAGAACCAGGTGGAGAATCTAAAGGAAAAGCTCATTAGCCAGGCCCAGGAAGTGAGCCGAC 148
Query 1 --------------------------------------------------ATGGTGGAGAATGAGCGACTGAGG 24
||||||||||||||||..||||||
Sbjct 149 TGCGATCAGAACTGGGAGGCACGGACGCGGAGAAGCACAGGGACAGACTGATGGTGGAGAATGAGCAGCTGAGG 222
Query 25 CAGGAGATGCGGCGCTGTGAGGCCGAGCTGCAAGAGCTGCGCACAAAGCCAGCAGGT----CCCTGCCCAGGTT 94
||||||.||.||||||||||||.|||.|||||.|||||.||..| |||||.||| ||||||...||.|
Sbjct 223 CAGGAGCTGAGGCGCTGTGAGGTCGAACTGCAGGAGCTTCGGGC----CCAGCCGGTGGTGCCCTGCGAGGGCT 292
Query 95 GTGAGCACAGCCAGGAGAGCGCCCAGCTCCGTGACAAGCTGTCCCAGCTGCAGCTGGAGATGGCGGAAAGCAAA 168
||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||.||||..||||.||.|.||||
Sbjct 293 GTGAGCACAGCCAGGAGAGCAGCCAGCTCCGTGACAAGCTGTCCCAGCTGCAGTTGGAAGTGGCTGAGAACAAA 366
Query 169 GGCATGCTGTCAGAGCTGAACCTAGAGGTGCAGCAGAAGACCGACCGGCTGGCTGAGGTGGAGCTGCGACTCAA 242
|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||
Sbjct 367 GGCATGCTGTCGGAACTGAACCTGGAGGTGCAGCAGAAAACGGACCGGCTGGCAGAGGTAGAGCTGCGCCTCAA 440
Query 243 GGACTGCCTGGCTGAGAAGGCACAGGAGGAGGAGCGGCTTAGTCGGCGCCTGCGTGACAGCCACGAGACCATTG 316
||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|
Sbjct 441 GGACTGTCTGGCTGAGAAAGCCCAGGAGGAGGAACGGCTCAGCCGGCGCCTGCGTGACAGCCATGAGACTATCG 514
Query 317 CCAGCCTGCGGGCCCAGTCCCCACCTGTCAAGTATGTCATCAAGACAGTGGAGGTGGAGTCGTCCAAGACCAAG 390
||||.|||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 515 CCAGTCTGAGGGCCCAGTCCCCACCTGTTAAGTATGTCATCAAGACAGTGGAGGTAGAGTCTTCCAAGACCAAG 588
Query 391 CAGGCCCTCAGCGAGTCCCAGGCCCGGAACCAGCACCTGCAGGAGCAGGTGGCTATGCAGAGGCAGGTGCTGAA 464
|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||.|||||||||||||
Sbjct 589 CAGGCCCTCAGCGAGTCCCAGACCCGGAACCAGCACCTGCAGGAGCAAGTGGCCATGCAGCGGCAGGTGCTGAA 662
Query 465 GGAGATGGAACAGCAGCTGCAGAGCTCACACCAGCTGACCGCGCGGCTCCGGGCGCAGATTGCCATGTACGAGT 538
|||||||||.||||||||.||||.|||.|||||||||||.|..|.|.|.|||||.||||||||||||||.|||.
Sbjct 663 GGAGATGGAGCAGCAGCTACAGAACTCCCACCAGCTGACAGTCCAGTTGCGGGCTCAGATTGCCATGTATGAGG 736
Query 539 CAGAGCTGGAGCGGGCCCATGGGCAGATGCTGGAGGAGATGCAGTCCCTGGAAGAGGACAAGAACCGGGCCATT 612
||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 737 CAGAGCTGGAGCGGGCACACGGGCAGATGCTGGAGGAGATGCAGTCCTTGGAGGAGGATAAGAACCGGGCCATT 810
Query 613 GAGGAGGCCTTTGCCAGAGCCCAGGTGGAGATGAAGGCTGTGCACGAGAATCTAGCAGGCGTCCGGACCAACTT 686
||||||||||||||..|.||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||.|||.||||||||.|
Sbjct 811 GAGGAGGCCTTTGCACGGGCCCAGGTGGAGATGAAGGCAGTACACGAGAACCTGGCAGGTGTCAGGACCAACCT 884
Query 687 GCTGACCTTGCAGCCGGCACTGCGGACCCTCACCAACGACTACAATGGGCTCAAGCGGCAGGTGCGCGTCTTCC 760
||||||..|||||||.||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||
Sbjct 885 GCTGACGCTGCAGCCTGCGCTGAGGACCCTCACCAACGACTACAATGGGCTCAAGCGGCAGGTGCGGGGCTTCC 958
Query 761 CACTGCTGCTGCAGGAGGCCCTCAGGAGTGTCAAGGCCGAGATAGGCCAGGCCATCGAGGAGGTCAACAGCAAC 834
|..||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 959 CCTTGCTGCTGCAGGAGGCTCTCAGGAGTGTCAAAGCTGAGATCGGCCAGGCCATCGAGGAGGTTAATAGCAAC 1032
Query 835 AACCAGGAGCTGCTGCGCAAGTACCGCCGCGAGCTGCAGCTGCGTAAGAAGTGCCACAATGAGCTCGTGCGGCT 908
||||||||||||.||||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||.|||||
Sbjct 1033 AACCAGGAGCTGTTGCGCAAGTACCGCCGGGAACTACAGCTGCGCAAGAAATGCCATAACGAGCTGGTCCGGCT 1106
Query 909 GAAAGGGAACATCCGAGTGATTGCTCGTGTCCGGCCAGTCACCAAAGAGGATGGGGAAGGACCTGAGGCCACCA 982
|||.||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||||
Sbjct 1107 GAAGGGAAACATCCGGGTGATTGCCCGAGTCCGGCCAGTCACCAAGGAGGATGGAGAAGGACCCGAGGCAACCA 1180
Query 983 ATGCTGTGACTTTCGATGCCGACGACGACTCCATCATCCACCTGCTGCACAAGGGCAAGCCTGTGTCCTTCGAG 1056
||||||||||.||.||..|.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1181 ATGCTGTGACCTTTGACCCTGATGATGACTCCATCATCCACCTGCTGCACAAGGGCAAGCCCGTGTCCTTCGAG 1254
Query 1057 CTGGACAAGGTCTTCTCCCCACAGGCCTCGCAGCAGGACGTGTTCCAGGAGGTGCAGGCCCTGGTCACCTCTTG 1130
||||||||||||||||||||...|||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||..|.|||||.||
Sbjct 1255 CTGGACAAGGTCTTCTCCCCGTGGGCTTCCCAGCAGGACGTGTTCCAGGAGGTGCAGGCCCTCATTACCTCCTG 1328
Query 1131 CATTGATGGCTTCAATGTCTGCATCTTTGCGTACGGCCAGACGGGCGCCGGCAAGACGTACACGATGGAGGGGA 1204
|||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.||.||||||||||
Sbjct 1329 CATCGATGGCTTCAATGTCTGTATCTTTGCTTACGGCCAGACAGGTGCCGGCAAGACATATACAATGGAGGGGA 1402
Query 1205 CCGCTGAGAACCCAGGTATCAACCAGCGGGCCCTGCAGCTGCTCTTCTCCGAGGTGCAGGAGAAGGCGTCTGAC 1278
|..|.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1403 CTCCCGAGAACCCGGGCATCAACCAGCGGGCCCTGCAGCTGCTCTTCTCGGAGGTGCAGGAGAAGGCGTCTGAC 1476
Query 1279 TGGGAGTACACCATCACCGTCAGCGCTGCGGAGATCTACAATGAGGTCCTCAGGGACCTGCTAGGGAAAGAGCC 1352
|||.||||||.|||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1477 TGGCAGTACAACATCACCGTCAGCGCAGCTGAGATTTACAATGAAGTCCTCAGGGACCTGCTGGGGAAAGAGCC 1550
Query 1353 TCAGGAAAAACTGGAGATCCGGCTGTGCCCAGACGGCAGTGGGCAGCTGTATGTACCAGGGCTGACTGAGTTCC 1426
||||||.||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1551 TCAGGAGAAGCTGGAGATCCGACTGTGCCCGGATGGCAGTGGGCAACTGTATGTGCCAGGGCTGACTGAGTTCC 1624
Query 1427 AAGTGCAGAGCGTGGACGACATCAACAAGGTGTTTGAGTTTGGCCACACTAATCGCACGACCGAGTTCACCAAC 1500
|.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||..||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 1625 AGGTGCAGAGCGTGGATGACATCAACAAGGTGTTTGAGTTTGGCTACAACAACCGCACCACCGAGTTCACCAAC 1698
Query 1501 CTGAACGAGCACAGCTCCCGCTCGCACGCACTGCTCATCGTGACGGTGCGAGGCGTGGACTGCAGCACAGGCCT 1574
||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||.||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 1699 CTGAACGAACACAGCTCCCGCTCCCACGCTCTGCTCATCGTGACAGTGAGAGGTGTGGATTGCAGCACAGGCCT 1772
Query 1575 CCGCACCACGGGGAAGCTGAACCTGGTGGACTTGGCTGGCTCGGAGCGCGTGGGCAAGTCGGGGGCCGAGGGCA 1648
|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1773 CCGCACCACGGGGAAGCTGAACCTGGTGGACCTGGCTGGTTCAGAGCGTGTGGGCAAGTCGGGGGCTGAGGGCA 1846
Query 1649 GCCGCCTGCGGGAGGCGCAGCACATCAACAAGTCGCTGTCGGCTCTGGGGGACGTCATTGCTGCCCTGCGCTCC 1722
.|||||||||.|||||.|||||||||||||.|||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 1847 ACCGCCTGCGAGAGGCACAGCACATCAACAGGTCACTATCCGCCCTGGGGGACGTCATTGCTGCCCTGCGTTCT 1920
Query 1723 CGCCAGGGCCACGTGCCCTTCCGCAACTCCAAGCTCACCTACCTGCTGCAGGATTCGCTTAGTGGTGACAGCAA 1796
||.||.|||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||
Sbjct 1921 CGACAAGGCCATGTGCCCTTCCGCAATTCCAAACTCACCTACCTGCTGCAGGACTCACTCAGTGGTGACAGCAA 1994
Query 1797 GACCCTCATGGTGGTACAGGTGTCCCCCGTGGAGAAGAACACTAGCGAGACGCTCTATTCCCTCAAGTTTGCTG 1870
||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||||..|||||||
Sbjct 1995 GACCCTTATGGTGGTACAGGTGTCCCCAGTGGAGAAGAACACCAGCGAGACTCTGTACTCCCTCAGATTTGCTG 2068
Query 1871 AGAGGGTGCGCTCTGTGGAGCTGGGGCCTGGGCTACGCAGGGCAGAGCTTGGGTCCTGGTCAAGCCAGGAGCAT 1944
|||||||.||||||||||||.||||.||||||...|||.|..|||||||.||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 2069 AGAGGGTTCGCTCTGTGGAGTTGGGCCCTGGGTCCCGCCGCACAGAGCTGGGTTCCTGGTCAAGCCAGGAGCAC 2142
Query 1945 CTAGAGTGGGAGCCGGCTTGTCAGACGCCACAGCCCTCGGCACGGGCCCACTCAGCCCCCAGCTCTGGGACCAG 2018
||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||..|.|||||.||||||||.|||||..|||||||||||||
Sbjct 2143 CTGGAGTGGGAGCCGGCTTGCCAGACACCACAGCCTACAGCACGAGCCCACTCTGCCCCTGGCTCTGGGACCAG 2216
Query 2019 TAGCCGCCCTGGATCCATCCGGAGGAAGCTGCAGCCCTC-----------GGCC---------- 2061
|||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||.|| ||||
Sbjct 2217 TAGCCGCCCAGGTTCCATCCGAAGGAAACTGCAGCCGTCAGGGAAGTTGAGGCCAGTGCCTGTG 2280