Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488029
• Subject: XM_017023225.1
• Aligned Length: 2328
• Identities: 2059
• Gaps: 267

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCAAGGACAGAACAGAACCCTGGGCCGCAGGCAGGTGGCTGGTGGGTATCCCGCCTCCCACCCCCAGCAAAC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  ACTGGCAAACCCCACTCTCCCTGCATCAGGGTCTGAGTGCCTGGCAGGGGCGGCAGTGGAGATGATCAAGGTAG  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  AACACCTGAAGGAGAAGCTCATTAGCCAGGCCCAGGAAGTGAGCCGACTGCGATCTGAGCTGGGGGGCACCGAC  222

Query    1  ------------------------ATGGTGGAGAATGAGCGACTGAGGCAGGAGATGCGGCGCTGTGAGGCCGA  50
                                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTGGAGAAGCACCGGGACCTGCTGATGGTGGAGAATGAGCGACTGAGGCAGGAGATGCGGCGCTGTGAGGCCGA  296

Query   51  GCTGCAAGAGCTGCGCACAAAGCCAGCAGGTCCCTGCCCAGGTTGTGAGCACAGCCAGGAGAGCGCCCAGCTCC  124
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCTGCAAGAGCTGCGCACAAAGCCAGCAGGTCCCTGCCCAGGTTGTGAGCACAGCCAGGAGAGCGCCCAGCTCC  370

Query  125  GTGACAAGCTGTCCCAGCTGCAGCTGGAGATGGCGGAAAGCAAAGGCATGCTGTCAGAGCTGAACCTAGAGGTG  198
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GTGACAAGCTGTCCCAGCTGCAGCTGGAGATGGCGGAAAGCAAAGGCATGCTGTCAGAGCTGAACCTAGAGGTG  444

Query  199  CAGCAGAAGACCGACCGGCTGGCTGAGGTGGAGCTGCGACTCAAGGACTGCCTGGCTGAGAAGGCACAGGAGGA  272
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CAGCAGAAGACCGACCGGCTGGCTGAGGTGGAGCTGCGACTCAAGGACTGCCTGGCTGAGAAGGCACAGGAGGA  518

Query  273  GGAGCGGCTTAGTCGGCGCCTGCGTGACAGCCACGAGACCATTGCCAGCCTGCGGGCCCAGTCCCCACCTGTCA  346
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGAGCGGCTTAGTCGGCGCCTGCGTGACAGCCACGAGACCATTGCCAGCCTGCGGGCCCAGTCCCCACCTGTCA  592

Query  347  AGTATGTCATCAAGACAGTGGAGGTGGAGTCGTCCAAGACCAAGCAGGCCCTCAGCGAGTCCCAGGCCCGGAAC  420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGTATGTCATCAAGACAGTGGAGGTGGAGTCGTCCAAGACCAAGCAGGCCCTCAGCGAGTCCCAGGCCCGGAAC  666

Query  421  CAGCACCTGCAGGAGCAGGTGGCTATGCAGAGGCAGGTGCTGAAGGAGATGGAACAGCAGCTGCAGAGCTCACA  494
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CAGCACCTGCAGGAGCAGGTGGCTATGCAGAGGCAGGTGCTGAAGGAGATGGAACAGCAGCTGCAGAGCTCACA  740

Query  495  CCAGCTGACCGCGCGGCTCCGGGCGCAGATTGCCATGTACGAGTCAGAGCTGGAGCGGGCCCATGGGCAGATGC  568
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCAGCTGACCGCGCGGCTCCGGGCGCAGATTGCCATGTACGAGTCAGAGCTGGAGCGGGCCCATGGGCAGATGC  814

Query  569  TGGAGGAGATGCAGTCCCTGGAAGAGGACAAGAACCGGGCCATTGAGGAGGCCTTTGCCAGAGCCCAGGTGGAG  642
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGGAGGAGATGCAGTCCCTGGAAGAGGACAAGAACCGGGCCATTGAGGAGGCCTTTGCCAGAGCCCAGGTGGAG  888

Query  643  ATGAAGGCTGTGCACGAGAATCTAGCAGGCGTCCGGACCAACTTGCTGACCTTGCAGCCGGCACTGCGGACCCT  716
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATGAAGGCTGTGCACGAGAATCTAGCAGGCGTCCGGACCAACTTGCTGACCTTGCAGCCGGCACTGCGGACCCT  962

Query  717  CACCAACGACTACAATGGGCTCAAGCGGCAGGTGCGCGTCTTCCCACTGCTGCTGCAGGAGGCCCTCAGGAGTG  790
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CACCAACGACTACAATGGGCTCAAGCGGCAGGTGCGCGGCTTCCCACTGCTGCTGCAGGAGGCCCTCAGGAGTG  1036

Query  791  TCAAGGCCGAGATAGGCCAGGCCATCGAGGAGGTCAACAGCAACAACCAGGAGCTGCTGCGCAAGTACCGCCGC  864
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TCAAGGCCGAGATAGGCCAGGCCATCGAGGAGGTCAACAGCAACAACCAGGAGCTGCTGCGCAAGTACCGCCGC  1110

Query  865  GAGCTGCAGCTGCGTAAGAAGTGCCACAATGAGCTCGTGCGGCTGAAAGGGAACATCCGAGTGATTGCTCGTGT  938
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GAGCTGCAGCTGCGTAAGAAGTGCCACAATGAGCTCGTGCGGCTGAAAGGGAACATCCGAGTGATTGCTCGTGT  1184

Query  939  CCGGCCAGTCACCAAAGAGGATGGGGAAGGACCTGAGGCCACCAATGCTGTGACTTTCGATGCCGACGACGACT  1012
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCGGCCAGTCACCAAAGAGGATGGGGAAGGACCTGAGGCCACCAATGCTGTGACTTTCGATGCCGACGACGACT  1258

Query 1013  CCATCATCCACCTGCTGCACAAGGGCAAGCCTGTGTCCTTCGAGCTGGACAAGGTCTTCTCCCCACAGGCCTCG  1086
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CCATCATCCACCTGCTGCACAAGGGCAAGCCTGTGTCCTTCGAGCTGGACAAGGTCTTCTCCCCACAGGCCTCG  1332

Query 1087  CAGCAGGACGTGTTCCAGGAGGTGCAGGCCCTGGTCACCTCTTGCATTGATGGCTTCAATGTCTGCATCTTTGC  1160
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CAGCAGGACGTGTTCCAGGAGGTGCAGGCCCTGGTCACCTCTTGCATTGATGGCTTCAATGTCTGCATCTTTGC  1406

Query 1161  GTACGGCCAGACGGGCGCCGGCAAGACGTACACGATGGAGGGGACCGCTGAGAACCCAGGTATCAACCAGCGGG  1234
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GTACGGCCAGACGGGCGCCGGCAAGACGTACACGATGGAGGGGACCGCTGAGAACCCAGGTATCAACCAGCGGG  1480

Query 1235  CCCTGCAGCTGCTCTTCTCCGAGGTGCAGGAGAAGGCGTCTGACTGGGAGTACACCATCACCGTCAGCGCTGCG  1308
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CCCTGCAGCTGCTCTTCTCCGAGGTGCAGGAGAAGGCGTCTGACTGGGAGTACACCATCACCGTCAGCGCTGCG  1554

Query 1309  GAGATCTACAATGAGGTCCTCAGGGACCTGCTAGGGAAAGAGCCTCAGGAAAAACTGGAGATCCGGCTGTGCCC  1382
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GAGATCTACAATGAGGTCCTCAGGGACCTGCTAGGGAAAGAGCCTCAGGAAAAACTGGAGATCCGGCTGTGCCC  1628

Query 1383  AGACGGCAGTGGGCAGCTGTATGTACCAGGGCTGACTGAGTTCCAAGTGCAGAGCGTGGACGACATCAACAAGG  1456
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  AGACGGCAGTGGGCAGCTGTATGTACCAGGGCTGACTGAGTTCCAAGTGCAGAGCGTGGACGACATCAACAAGG  1702

Query 1457  TGTTTGAGTTTGGCCACACTAATCGCACGACCGAGTTCACCAACCTGAACGAGCACAGCTCCCGCTCGCACGCA  1530
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1703  TGTTTGAGTTTGGCCACACTAATCGCACGACCGAGTTCACCAACCTGAACGAGCACAGCTCCCGCTCGCACGCG  1776

Query 1531  CTGCTCATCGTGACGGTGCGAGGCGTGGACTGCAGCACAGGCCTCCGCACCACGGGGAAGCTGAACCTGGTGGA  1604
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CTGCTCATCGTGACGGTGCGAGGCGTGGACTGCAGCACAGGCCTCCGCACCACGGGGAAGCTGAACCTGGTGGA  1850

Query 1605  CTTGGCTGGCTCGGAGCGCGTGGGCAAGTCGGGGGCCGAGGGCAGCCGCCTGCGGGAGGCGCAGCACATCAACA  1678
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CTTGGCTGGCTCGGAGCGCGTGGGCAAGTCGGGGGCCGAGGGCAGCCGCCTGCGGGAGGCGCAGCACATCAACA  1924

Query 1679  AGTCGCTGTCGGCTCTGGGGGACGTCATTGCTGCCCTGCGCTCCCGCCAGGGCCACGTGCCCTTCCGCAACTCC  1752
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  AGTCGCTGTCGGCTCTGGGGGACGTCATTGCTGCCCTGCGCTCCCGCCAGGGCCACGTGCCCTTCCGCAACTCC  1998

Query 1753  AAGCTCACCTACCTGCTGCAGGATTCGCTTAGTGGTGACAGCAAGACCCTCATGGTGGTACAGGTGTCCCCCGT  1826
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  AAGCTCACCTACCTGCTGCAGGATTCGCTTAGTGGTGACAGCAAGACCCTCATGGTGGTACAGGTGTCCCCCGT  2072

Query 1827  GGAGAAGAACACTAGCGAGACGCTCTATTCCCTCAAGTTTGCTGAGAGGGTGCGCTCTGTGGAGCTGGGGCCTG  1900
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  GGAGAAGAACACTAGCGAGACGCTCTATTCCCTCAAGTTTGCTGAGAGGGTGCGCTCTGTGGAGCTGGGGCCTG  2146

Query 1901  GGCTACGCAGGGCAGAGCTTGGGTCCTGGTCAAGCCAGGAGCATCTAGAGTGGGAGCCGGCTTGTCAGACGCCA  1974
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  GGCTACGCAGGGCAGAGCTTGGGTCCTGGTCAAGCCAGGAGCATCTAGAGTGGGAGCCGGCTTGTCAGACGCCA  2220

Query 1975  CAGCCCTCGGCACGGGCCCACTCAGCCCCCAGCTCTGGGACCAGTAGCCGCCCTGGATCCATCCGGAGGAAGCT  2048
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  CAGCCCTCGGCACGGGCCCACTCAGCCCCCAGCTCTGGGACCAGTAGCCGCCCTGGATCCATCCGGAGGAAGCT  2294

Query 2049  GCAGCCCT-----------CGGCC----------  2061
            ||||||||           |||||          
Sbjct 2295  GCAGCCCTCGGGGAAGTCGCGGCCACTGCCTGTG  2328