Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488036
• Subject: NM_001312868.1
• Aligned Length: 1510
• Identities: 1366
• Gaps: 14

Alignment

Query    1  ATGGAGGCGGCGGTCGCTGCTCCGCGTCCCCGGCTGCTCCTCCTCGTGCTGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGC  74
            |||||||||||||.|||||||||.||||..|.||.|||||||.|||||.|            ||.|||||||||
Sbjct    1  ATGGAGGCGGCGGCCGCTGCTCCACGTCGTCCGCAGCTCCTCATCGTGTT------------GGTGGCGGCGGC  62

Query   75  GGCGCTGCTCCCGGGGGCGACGGCGTTACAGTGTTTCTGCCACCTCTGTACAAAAGACAATTTTACTTGTGTGA  148
            |.||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||.||
Sbjct   63  GACGCTGCTCCCGGGGGCGAAGGCATTACAGTGTTTCTGCCACCTCTGTACAAAGGATAATTTTACCTGTGAGA  136

Query  149  CAGATGGGCTCTGCTTTGTCTCTGTCACAGAGACCACAGACAAAGTTATACACAACAGCATGTGTATAGCTGAA  222
            |||||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct  137  CAGATGGTCTTTGCTTTGTCTCAGTCACTGAGACCACAGACAAAGTTATACACAATAGTATGTGTATAGCTGAA  210

Query  223  ATTGACTTAATTCCTCGAGATAGGCCGTTTGTATGTGCACCCTCTTCAAAAACTGGGTCTGTGACTACAACATA  296
            ||||||.|||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||.|.||.|||||||||||
Sbjct  211  ATTGACCTAATTCCTCGAGACAGGCCATTTGTATGTGCACCATCTTCAAAAACAGGGGCAGTTACTACAACATA  284

Query  297  TTGCTGCAATCAGGACCATTGCAATAAAATAGAACTTCCAACTACTGTAAAGTCA-TCACCTGGCCTTGGTCCT  369
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|.|||| || |||.||||||||||||||
Sbjct  285  TTGCTGCAATCAGGACCACTGCAATAAAATAGAACTCCCAACTACAGAAAAG-CAGTCAGCTGGCCTTGGTCCT  357

Query  370  GTGGAACTGGCAGCTGTCATTGCTGGACCAGTGTGCTTCGTCTGCATCTCACTCATGTTGATGGTCTATATCTG  443
            |||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||..||||.|||.||||||||||||||||
Sbjct  358  GTGGAGCTGGCAGCTGTCATTGCTGGTCCAGTCTGCTTCGTCTGCATTGCACTTATGCTGATGGTCTATATCTG  431

Query  444  CCACAACCGCACTGTCATTCACCATCGAGTGCCAAATGAAGAGGACCCTTCATTAGATCGCCCTTTTATTTCAG  517
            |||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||.|||||||||||||.|||||||
Sbjct  432  CCATAACCGCACTGTCATTCACCACCGTGTGCCAAATGAAGAGGATCCATCACTAGATCGCCCTTTCATTTCAG  505

Query  518  AGGGTACTACGTTGAAAGACTTAATTTATGATATGACAACGTCAGGTTCTGGCTCAGGTTTACCATTGCTTGTT  591
            ||||.||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||.||||||||
Sbjct  506  AGGGCACCACCTTAAAAGATTTAATTTATGATATGACAACATCAGGGTCTGGATCAGGTTTACCACTGCTTGTT  579

Query  592  CAGAGAACAATTGCGAGAACTATTGTGTTACAAGAAAGCATTGGCAAAGGTCGATTTGGAGAAGTTTGGAGAGG  665
            ||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||
Sbjct  580  CAAAGAACAATTGCCAGGACCATTGTGTTACAAGAAAGCATTGGCAAAGGTCGGTTTGGAGAAGTTTGGCGAGG  653

Query  666  AAAGTGGCGGGGAGAAGAAGTTGCTGTTAAGATATTCTCCTCTAGAGAAGAACGTTCGTGGTTCCGTGAGGCAG  739
            .||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||||
Sbjct  654  CAAATGGCGGGGAGAAGAAGTTGCTGTGAAGATATTCTCTTCTAGAGAAGAGCGTTCATGGTTCCGAGAGGCAG  727

Query  740  AGATTTATCAAACTGTAATGTTACGTCATGAAAACATCCTGGGATTTATAGCAGCAGACAATAAAGACAATGGT  813
            ||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct  728  AGATTTATCAGACTGTAATGTTACGCCATGAAAATATCCTGGGATTTATAGCAGCAGACAACAAAGACAATGGG  801

Query  814  ACTTGGACTCAGCTCTGGTTGGTGTCAGATTATCATGAGCATGGATCCCTTTTTGATTACTTAAACAGATACAC  887
            ||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||
Sbjct  802  ACATGGACGCAGCTGTGGTTGGTGTCAGATTATCATGAGCATGGATCCCTTTTCGATTACTTGAATAGATACAC  875

Query  888  AGTTACTGTGGAAGGAATGATAAAACTTGCTCTGTCCACGGCGAGCGGTCTTGCCCATCTTCACATGGAGATTG  961
            .||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  876  TGTTACTGTGGAAGGAATGATCAAGCTTGCTCTGTCCACAGCAAGTGGTCTTGCCCATCTTCACATGGAGATTG  949

Query  962  TTGGTACCCAAGGAAAGCCAGCCATTGCTCATAGAGATTTGAAATCAAAGAATATCTTGGTAAAGAAGAATGGA  1035
            ||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct  950  TTGGTACCCAAGGAAAACCAGCTATTGCCCATAGAGATTTGAAATCAAAGAATATCTTGGTGAAGAAAAATGGA  1023

Query 1036  ACTTGCTGTATTGCAGACTTAGGACTGGCAGTAAGACATGATTCAGCCACAGATACCATTGATATTGCTCCAAA  1109
            ||.||.||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1024  ACCTGTTGTATTGCAGACTTGGGACTTGCTGTGAGACATGATTCTGCCACAGATACAATTGATATTGCTCCAAA  1097

Query 1110  CCACAGAGTGGGAACAAAAAGGTACATGGCCCCTGAAGTTCTCGATGATTCCATAAATATGAAACATTTTGAAT  1183
            |||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1098  CCACAGAGTAGGCACTAAAAGGTACATGGCCCCTGAAGTTCTAGATGATTCCATAAATATGAAACATTTTGAAT  1171

Query 1184  CCTTCAAACGTGCTGACATCTATGCAATGGGCTTAGTATTCTGGGAAATTGCTCGACGATGTTCCATTGGTGGA  1257
            ||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct 1172  CCTTCAAACGCGCTGACATCTATGCAATGGGCTTAGTGTTCTGGGAAATTGCTCGACGCTGTTCTATTGGTGGA  1245

Query 1258  ATTCATGAAGATTACCAACTGCCTTATTATGATCTTGTACCTTCTGACCCATCAGTTGAAGAAATGAGAAAAGT  1331
            ||.||||||||.||.||..||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1246  ATCCATGAAGACTATCAGTTGCCTTATTATGATCTTGTACCTTCTGATCCATCGGTTGAAGAAATGAGAAAAGT  1319

Query 1332  TGTTTGTGAACAGAAGTTAAGGCCAAATATCCCAAACAGATGGCAGAGCTGTGAAGCCTTGAGAGTAATGGCTA  1405
            .|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 1320  AGTTTGCGAACAGAAGTTAAGGCCAAATATTCCAAACAGATGGCAGAGCTGTGAGGCCTTGAGAGTGATGGCTA  1393

Query 1406  AAATTATGAGAGAATGTTGGTATGCCAATGGAGCAGCTAGGCTTACAGCATTGCGGATTAAGAAAACATTATCG  1479
            ||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.||||||||.||.
Sbjct 1394  AAATTATGAGAGAATGCTGGTATGCCAATGGAGCAGCAAGGCTGACAGCTTTGCGAATTAAAAAAACATTGTCA  1467

Query 1480  CAACTCAGTCAACAGGAAGGCATCAAAATG  1509
            ||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1468  CAACTCAGCCAACAGGAAGGCATCAAAATG  1497