Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488036
• Subject: NM_001312869.1
• Aligned Length: 1515
• Identities: 1140
• Gaps: 261

Alignment

Query    1  ATGGAGGCGGCGGTCGCTGCTCCGCGTCCCCGGCTGCTCCTCCTCGTGCTGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GGCGCTGCTCCCGGGGGCGACGGCGTTACAGTGTTTCTGCCACCTCTGTACAAAAGACAATTTTACTTGTGTGA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CAGATGGGCTCTGCTTTGTCTCT---GTCACAGAGACCACAGACAAAGTTATACACAACAGCATGTGT-ATAGC  218
               ||||            .|||   |||||                 ||||         |||| || || |.
Sbjct    1  ---ATGG------------ATCTAAAGTCAC-----------------TTAT---------CATG-GTGAT-GA  31

Query  219  TGAAATTGACT-TAATTCCTCGAGATAGGCCGTTTGTATGTGCACCCTCTTCAAAAACTGGGTCTGTGACTACA  291
            ||.||  |||| |||     .||.|||                ||.|.|||.||.||           |.||||
Sbjct   32  TGGAA--GACTATAA-----GGATATA----------------ACTCCCTTAAAGAA-----------ATTACA  71

Query  292  ACATATTGCTGCAATCAGGACCATTGCAATAAAATAGAACTTCCAACTACTGTAAAGTCA-TCACCTGGCCTTG  364
            ..|.|.|     ||  ||||||.||                      |.|.|.|||| || |||.|||||||||
Sbjct   72  GGAGAAT-----AA--AGGACCTTT----------------------TTCAGAAAAG-CAGTCAGCTGGCCTTG  115

Query  365  GTCCTGTGGAACTGGCAGCTGTCATTGCTGGACCAGTGTGCTTCGTCTGCATCTCACTCATGTTGATGGTCTAT  438
            ||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||..||||.|||.|||||||||||
Sbjct  116  GTCCTGTGGAGCTGGCAGCTGTCATTGCTGGTCCAGTCTGCTTCGTCTGCATTGCACTTATGCTGATGGTCTAT  189

Query  439  ATCTGCCACAACCGCACTGTCATTCACCATCGAGTGCCAAATGAAGAGGACCCTTCATTAGATCGCCCTTTTAT  512
            ||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||.|||||||||||||.||
Sbjct  190  ATCTGCCATAACCGCACTGTCATTCACCACCGTGTGCCAAATGAAGAGGATCCATCACTAGATCGCCCTTTCAT  263

Query  513  TTCAGAGGGTACTACGTTGAAAGACTTAATTTATGATATGACAACGTCAGGTTCTGGCTCAGGTTTACCATTGC  586
            |||||||||.||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||.|||
Sbjct  264  TTCAGAGGGCACCACCTTAAAAGATTTAATTTATGATATGACAACATCAGGGTCTGGATCAGGTTTACCACTGC  337

Query  587  TTGTTCAGAGAACAATTGCGAGAACTATTGTGTTACAAGAAAGCATTGGCAAAGGTCGATTTGGAGAAGTTTGG  660
            |||||||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  338  TTGTTCAAAGAACAATTGCCAGGACCATTGTGTTACAAGAAAGCATTGGCAAAGGTCGGTTTGGAGAAGTTTGG  411

Query  661  AGAGGAAAGTGGCGGGGAGAAGAAGTTGCTGTTAAGATATTCTCCTCTAGAGAAGAACGTTCGTGGTTCCGTGA  734
            .||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||
Sbjct  412  CGAGGCAAATGGCGGGGAGAAGAAGTTGCTGTGAAGATATTCTCTTCTAGAGAAGAGCGTTCATGGTTCCGAGA  485

Query  735  GGCAGAGATTTATCAAACTGTAATGTTACGTCATGAAAACATCCTGGGATTTATAGCAGCAGACAATAAAGACA  808
            |||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  486  GGCAGAGATTTATCAGACTGTAATGTTACGCCATGAAAATATCCTGGGATTTATAGCAGCAGACAACAAAGACA  559

Query  809  ATGGTACTTGGACTCAGCTCTGGTTGGTGTCAGATTATCATGAGCATGGATCCCTTTTTGATTACTTAAACAGA  882
            ||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||
Sbjct  560  ATGGGACATGGACGCAGCTGTGGTTGGTGTCAGATTATCATGAGCATGGATCCCTTTTCGATTACTTGAATAGA  633

Query  883  TACACAGTTACTGTGGAAGGAATGATAAAACTTGCTCTGTCCACGGCGAGCGGTCTTGCCCATCTTCACATGGA  956
            |||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  634  TACACTGTTACTGTGGAAGGAATGATCAAGCTTGCTCTGTCCACAGCAAGTGGTCTTGCCCATCTTCACATGGA  707

Query  957  GATTGTTGGTACCCAAGGAAAGCCAGCCATTGCTCATAGAGATTTGAAATCAAAGAATATCTTGGTAAAGAAGA  1030
            |||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct  708  GATTGTTGGTACCCAAGGAAAACCAGCTATTGCCCATAGAGATTTGAAATCAAAGAATATCTTGGTGAAGAAAA  781

Query 1031  ATGGAACTTGCTGTATTGCAGACTTAGGACTGGCAGTAAGACATGATTCAGCCACAGATACCATTGATATTGCT  1104
            |||||||.||.||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct  782  ATGGAACCTGTTGTATTGCAGACTTGGGACTTGCTGTGAGACATGATTCTGCCACAGATACAATTGATATTGCT  855

Query 1105  CCAAACCACAGAGTGGGAACAAAAAGGTACATGGCCCCTGAAGTTCTCGATGATTCCATAAATATGAAACATTT  1178
            ||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  856  CCAAACCACAGAGTAGGCACTAAAAGGTACATGGCCCCTGAAGTTCTAGATGATTCCATAAATATGAAACATTT  929

Query 1179  TGAATCCTTCAAACGTGCTGACATCTATGCAATGGGCTTAGTATTCTGGGAAATTGCTCGACGATGTTCCATTG  1252
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct  930  TGAATCCTTCAAACGCGCTGACATCTATGCAATGGGCTTAGTGTTCTGGGAAATTGCTCGACGCTGTTCTATTG  1003

Query 1253  GTGGAATTCATGAAGATTACCAACTGCCTTATTATGATCTTGTACCTTCTGACCCATCAGTTGAAGAAATGAGA  1326
            |||||||.||||||||.||.||..||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 1004  GTGGAATCCATGAAGACTATCAGTTGCCTTATTATGATCTTGTACCTTCTGATCCATCGGTTGAAGAAATGAGA  1077

Query 1327  AAAGTTGTTTGTGAACAGAAGTTAAGGCCAAATATCCCAAACAGATGGCAGAGCTGTGAAGCCTTGAGAGTAAT  1400
            |||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1078  AAAGTAGTTTGCGAACAGAAGTTAAGGCCAAATATTCCAAACAGATGGCAGAGCTGTGAGGCCTTGAGAGTGAT  1151

Query 1401  GGCTAAAATTATGAGAGAATGTTGGTATGCCAATGGAGCAGCTAGGCTTACAGCATTGCGGATTAAGAAAACAT  1474
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.|||||||
Sbjct 1152  GGCTAAAATTATGAGAGAATGCTGGTATGCCAATGGAGCAGCAAGGCTGACAGCTTTGCGAATTAAAAAAACAT  1225

Query 1475  TATCGCAACTCAGTCAACAGGAAGGCATCAAAATG  1509
            |.||.||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1226  TGTCACAACTCAGCCAACAGGAAGGCATCAAAATG  1260