Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000488036
- Subject:
- NM_009370.3
- Aligned Length:
- 1522
- Identities:
- 1366
- Gaps:
- 26
Alignment
Query 1 ATGGAGGCGGCGGTCGCTGCTCCGCGTCCCCGGCTGCTCCTCCTCGTGCTGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGC 74
|||||||||||||.|||||||||.||||..|.||.|||||||.|||||.| ||.|||||||||
Sbjct 1 ATGGAGGCGGCGGCCGCTGCTCCACGTCGTCCGCAGCTCCTCATCGTGTT------------GGTGGCGGCGGC 62
Query 75 GGCGCTGCTCCCGGGGGCGACGGCGTTACAGTGTTTCTGCCACCTCTGTACAAAAGACAATTTTACTTGTGTGA 148
|.||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||.||
Sbjct 63 GACGCTGCTCCCGGGGGCGAAGGCATTACAGTGTTTCTGCCACCTCTGTACAAAGGATAATTTTACCTGTGAGA 136
Query 149 CAGATGGGCTCTGCTTTGTCTCTGTCACAGAGACCACAGACAAAGTTATACACAACAGCATGTGTATAGCTGAA 222
|||||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 137 CAGATGGTCTTTGCTTTGTCTCAGTCACTGAGACCACAGACAAAGTTATACACAATAGTATGTGTATAGCTGAA 210
Query 223 ATTGACTTAATTCCTCGAGATAGGCCGTTTGTATGTGCACCCTCTTCAAAAACTGGGTCTGTGACTACAACATA 296
||||||.|||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||.|.||.|||||||||||
Sbjct 211 ATTGACCTAATTCCTCGAGACAGGCCATTTGTATGTGCACCATCTTCAAAAACAGGGGCAGTTACTACAACATA 284
Query 297 TTGCTGCAATCAGGACCATTGCAATAAAATAGAACTTCCAACTA------------CTGTAAAGTCA-TCACCT 357
||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||| |.|.|||| || |||.||
Sbjct 285 TTGCTGCAATCAGGACCACTGCAATAAAATAGAACTCCCAACTACAGGACCTTTTTCAGAAAAG-CAGTCAGCT 357
Query 358 GGCCTTGGTCCTGTGGAACTGGCAGCTGTCATTGCTGGACCAGTGTGCTTCGTCTGCATCTCACTCATGTTGAT 431
|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||..||||.|||.||||
Sbjct 358 GGCCTTGGTCCTGTGGAGCTGGCAGCTGTCATTGCTGGTCCAGTCTGCTTCGTCTGCATTGCACTTATGCTGAT 431
Query 432 GGTCTATATCTGCCACAACCGCACTGTCATTCACCATCGAGTGCCAAATGAAGAGGACCCTTCATTAGATCGCC 505
|||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||.|||||||||
Sbjct 432 GGTCTATATCTGCCATAACCGCACTGTCATTCACCACCGTGTGCCAAATGAAGAGGATCCATCACTAGATCGCC 505
Query 506 CTTTTATTTCAGAGGGTACTACGTTGAAAGACTTAATTTATGATATGACAACGTCAGGTTCTGGCTCAGGTTTA 579
||||.|||||||||||.||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||
Sbjct 506 CTTTCATTTCAGAGGGCACCACCTTAAAAGATTTAATTTATGATATGACAACATCAGGGTCTGGATCAGGTTTA 579
Query 580 CCATTGCTTGTTCAGAGAACAATTGCGAGAACTATTGTGTTACAAGAAAGCATTGGCAAAGGTCGATTTGGAGA 653
|||.||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 580 CCACTGCTTGTTCAAAGAACAATTGCCAGGACCATTGTGTTACAAGAAAGCATTGGCAAAGGTCGGTTTGGAGA 653
Query 654 AGTTTGGAGAGGAAAGTGGCGGGGAGAAGAAGTTGCTGTTAAGATATTCTCCTCTAGAGAAGAACGTTCGTGGT 727
|||||||.||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||||
Sbjct 654 AGTTTGGCGAGGCAAATGGCGGGGAGAAGAAGTTGCTGTGAAGATATTCTCTTCTAGAGAAGAGCGTTCATGGT 727
Query 728 TCCGTGAGGCAGAGATTTATCAAACTGTAATGTTACGTCATGAAAACATCCTGGGATTTATAGCAGCAGACAAT 801
||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 728 TCCGAGAGGCAGAGATTTATCAGACTGTAATGTTACGCCATGAAAATATCCTGGGATTTATAGCAGCAGACAAC 801
Query 802 AAAGACAATGGTACTTGGACTCAGCTCTGGTTGGTGTCAGATTATCATGAGCATGGATCCCTTTTTGATTACTT 875
|||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 802 AAAGACAATGGGACATGGACGCAGCTGTGGTTGGTGTCAGATTATCATGAGCATGGATCCCTTTTCGATTACTT 875
Query 876 AAACAGATACACAGTTACTGTGGAAGGAATGATAAAACTTGCTCTGTCCACGGCGAGCGGTCTTGCCCATCTTC 949
.||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||
Sbjct 876 GAATAGATACACTGTTACTGTGGAAGGAATGATCAAGCTTGCTCTGTCCACAGCAAGTGGTCTTGCCCATCTTC 949
Query 950 ACATGGAGATTGTTGGTACCCAAGGAAAGCCAGCCATTGCTCATAGAGATTTGAAATCAAAGAATATCTTGGTA 1023
||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 950 ACATGGAGATTGTTGGTACCCAAGGAAAACCAGCTATTGCCCATAGAGATTTGAAATCAAAGAATATCTTGGTG 1023
Query 1024 AAGAAGAATGGAACTTGCTGTATTGCAGACTTAGGACTGGCAGTAAGACATGATTCAGCCACAGATACCATTGA 1097
|||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1024 AAGAAAAATGGAACCTGTTGTATTGCAGACTTGGGACTTGCTGTGAGACATGATTCTGCCACAGATACAATTGA 1097
Query 1098 TATTGCTCCAAACCACAGAGTGGGAACAAAAAGGTACATGGCCCCTGAAGTTCTCGATGATTCCATAAATATGA 1171
|||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1098 TATTGCTCCAAACCACAGAGTAGGCACTAAAAGGTACATGGCCCCTGAAGTTCTAGATGATTCCATAAATATGA 1171
Query 1172 AACATTTTGAATCCTTCAAACGTGCTGACATCTATGCAATGGGCTTAGTATTCTGGGAAATTGCTCGACGATGT 1245
||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1172 AACATTTTGAATCCTTCAAACGCGCTGACATCTATGCAATGGGCTTAGTGTTCTGGGAAATTGCTCGACGCTGT 1245
Query 1246 TCCATTGGTGGAATTCATGAAGATTACCAACTGCCTTATTATGATCTTGTACCTTCTGACCCATCAGTTGAAGA 1319
||.|||||||||||.||||||||.||.||..||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 1246 TCTATTGGTGGAATCCATGAAGACTATCAGTTGCCTTATTATGATCTTGTACCTTCTGATCCATCGGTTGAAGA 1319
Query 1320 AATGAGAAAAGTTGTTTGTGAACAGAAGTTAAGGCCAAATATCCCAAACAGATGGCAGAGCTGTGAAGCCTTGA 1393
||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1320 AATGAGAAAAGTAGTTTGCGAACAGAAGTTAAGGCCAAATATTCCAAACAGATGGCAGAGCTGTGAGGCCTTGA 1393
Query 1394 GAGTAATGGCTAAAATTATGAGAGAATGTTGGTATGCCAATGGAGCAGCTAGGCTTACAGCATTGCGGATTAAG 1467
||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.
Sbjct 1394 GAGTGATGGCTAAAATTATGAGAGAATGCTGGTATGCCAATGGAGCAGCAAGGCTGACAGCTTTGCGAATTAAA 1467
Query 1468 AAAACATTATCGCAACTCAGTCAACAGGAAGGCATCAAAATG 1509
||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1468 AAAACATTGTCACAACTCAGCCAACAGGAAGGCATCAAAATG 1509