Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488036
• Subject: XM_017320103.1
• Aligned Length: 1522
• Identities: 1193
• Gaps: 221

Alignment

Query    1  ATGGAGGCGGCGGTCGCTGCTCCGCGTCCCCGGCTGCTCCTCCTCGTGCTGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GGCGCTGCTCCCGGGGGCGACGGCGTTACAGTGTTTCTGCCACCTCTGTACAAAAGACAATTTTACTTGTGTGA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CAGATGGGCTCTGCTTTGTCTCTGTCACAGAGACCACAGACAAAGTTATACACAACAGCATGTGTATAGCTGAA  222
                                                                       |||||||||||||||
Sbjct    1  -----------------------------------------------------------ATGTGTATAGCTGAA  15

Query  223  ATTGACTTAATTCCTCGAGATAGGCCGTTTGTATGTGCACCCTCTTCAAAAACTGGGTCTGTGACTACAACATA  296
            ||||||.|||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||.|.||.|||||||||||
Sbjct   16  ATTGACCTAATTCCTCGAGACAGGCCATTTGTATGTGCACCATCTTCAAAAACAGGGGCAGTTACTACAACATA  89

Query  297  TTGCTGCAATCAGGACCATTGCAATAAAATAGAACTTCCAACTA------------CTGTAAAGTCA-TCACCT  357
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||            |.|.|||| || |||.||
Sbjct   90  TTGCTGCAATCAGGACCACTGCAATAAAATAGAACTCCCAACTACAGGACCTTTTTCAGAAAAG-CAGTCAGCT  162

Query  358  GGCCTTGGTCCTGTGGAACTGGCAGCTGTCATTGCTGGACCAGTGTGCTTCGTCTGCATCTCACTCATGTTGAT  431
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||..||||.|||.||||
Sbjct  163  GGCCTTGGTCCTGTGGAGCTGGCAGCTGTCATTGCTGGTCCAGTCTGCTTCGTCTGCATTGCACTTATGCTGAT  236

Query  432  GGTCTATATCTGCCACAACCGCACTGTCATTCACCATCGAGTGCCAAATGAAGAGGACCCTTCATTAGATCGCC  505
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||.|||||||||
Sbjct  237  GGTCTATATCTGCCATAACCGCACTGTCATTCACCACCGTGTGCCAAATGAAGAGGATCCATCACTAGATCGCC  310

Query  506  CTTTTATTTCAGAGGGTACTACGTTGAAAGACTTAATTTATGATATGACAACGTCAGGTTCTGGCTCAGGTTTA  579
            ||||.|||||||||||.||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||
Sbjct  311  CTTTCATTTCAGAGGGCACCACCTTAAAAGATTTAATTTATGATATGACAACATCAGGGTCTGGATCAGGTTTA  384

Query  580  CCATTGCTTGTTCAGAGAACAATTGCGAGAACTATTGTGTTACAAGAAAGCATTGGCAAAGGTCGATTTGGAGA  653
            |||.||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  385  CCACTGCTTGTTCAAAGAACAATTGCCAGGACCATTGTGTTACAAGAAAGCATTGGCAAAGGTCGGTTTGGAGA  458

Query  654  AGTTTGGAGAGGAAAGTGGCGGGGAGAAGAAGTTGCTGTTAAGATATTCTCCTCTAGAGAAGAACGTTCGTGGT  727
            |||||||.||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||||
Sbjct  459  AGTTTGGCGAGGCAAATGGCGGGGAGAAGAAGTTGCTGTGAAGATATTCTCTTCTAGAGAAGAGCGTTCATGGT  532

Query  728  TCCGTGAGGCAGAGATTTATCAAACTGTAATGTTACGTCATGAAAACATCCTGGGATTTATAGCAGCAGACAAT  801
            ||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  533  TCCGAGAGGCAGAGATTTATCAGACTGTAATGTTACGCCATGAAAATATCCTGGGATTTATAGCAGCAGACAAC  606

Query  802  AAAGACAATGGTACTTGGACTCAGCTCTGGTTGGTGTCAGATTATCATGAGCATGGATCCCTTTTTGATTACTT  875
            |||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  607  AAAGACAATGGGACATGGACGCAGCTGTGGTTGGTGTCAGATTATCATGAGCATGGATCCCTTTTCGATTACTT  680

Query  876  AAACAGATACACAGTTACTGTGGAAGGAATGATAAAACTTGCTCTGTCCACGGCGAGCGGTCTTGCCCATCTTC  949
            .||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||
Sbjct  681  GAATAGATACACTGTTACTGTGGAAGGAATGATCAAGCTTGCTCTGTCCACAGCAAGTGGTCTTGCCCATCTTC  754

Query  950  ACATGGAGATTGTTGGTACCCAAGGAAAGCCAGCCATTGCTCATAGAGATTTGAAATCAAAGAATATCTTGGTA  1023
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  755  ACATGGAGATTGTTGGTACCCAAGGAAAACCAGCTATTGCCCATAGAGATTTGAAATCAAAGAATATCTTGGTG  828

Query 1024  AAGAAGAATGGAACTTGCTGTATTGCAGACTTAGGACTGGCAGTAAGACATGATTCAGCCACAGATACCATTGA  1097
            |||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct  829  AAGAAAAATGGAACCTGTTGTATTGCAGACTTGGGACTTGCTGTGAGACATGATTCTGCCACAGATACAATTGA  902

Query 1098  TATTGCTCCAAACCACAGAGTGGGAACAAAAAGGTACATGGCCCCTGAAGTTCTCGATGATTCCATAAATATGA  1171
            |||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  903  TATTGCTCCAAACCACAGAGTAGGCACTAAAAGGTACATGGCCCCTGAAGTTCTAGATGATTCCATAAATATGA  976

Query 1172  AACATTTTGAATCCTTCAAACGTGCTGACATCTATGCAATGGGCTTAGTATTCTGGGAAATTGCTCGACGATGT  1245
            ||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  977  AACATTTTGAATCCTTCAAACGCGCTGACATCTATGCAATGGGCTTAGTGTTCTGGGAAATTGCTCGACGCTGT  1050

Query 1246  TCCATTGGTGGAATTCATGAAGATTACCAACTGCCTTATTATGATCTTGTACCTTCTGACCCATCAGTTGAAGA  1319
            ||.|||||||||||.||||||||.||.||..||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 1051  TCTATTGGTGGAATCCATGAAGACTATCAGTTGCCTTATTATGATCTTGTACCTTCTGATCCATCGGTTGAAGA  1124

Query 1320  AATGAGAAAAGTTGTTTGTGAACAGAAGTTAAGGCCAAATATCCCAAACAGATGGCAGAGCTGTGAAGCCTTGA  1393
            ||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1125  AATGAGAAAAGTAGTTTGCGAACAGAAGTTAAGGCCAAATATTCCAAACAGATGGCAGAGCTGTGAGGCCTTGA  1198

Query 1394  GAGTAATGGCTAAAATTATGAGAGAATGTTGGTATGCCAATGGAGCAGCTAGGCTTACAGCATTGCGGATTAAG  1467
            ||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.
Sbjct 1199  GAGTGATGGCTAAAATTATGAGAGAATGCTGGTATGCCAATGGAGCAGCAAGGCTGACAGCTTTGCGAATTAAA  1272

Query 1468  AAAACATTATCGCAACTCAGTCAACAGGAAGGCATCAAAATG  1509
            ||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1273  AAAACATTGTCACAACTCAGCCAACAGGAAGGCATCAAAATG  1314