Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488040
• Subject: NM_172584.3
• Aligned Length: 1262
• Identities: 1101
• Gaps: 25

Alignment

Query    1  ATGCAGACCTTTCTGAAAGGGAAGAGAGTTGGCTACTGGCTGAGCGAGAAGAAAATCAAGAAGCTGAATTTCCA  74
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||
Sbjct    1  ATGCAGACCTTCCTGAAAGGGAAGAGAGTTGGCTACTGGCTGAGCGAGAAGAAAGTCAAGAAGCTCAATTTCCA  74

Query   75  GGCCTTCGCCGAGCTGTGCAGGAAGCGAGGGATGGAGGTTGTGCAGCTGAACCTTAGCCGGCCGATCGAGGAGC  148
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.|||.|.|||||.|||||||
Sbjct   75  GGCCTTCGCGGAGCTGTGCAGGAAGCGAGGGATAGAAGTCGTGCAGCTGAACCTCAGCAGACCGATTGAGGAGC  148

Query  149  AGGGCCCCCTGGACGTCATCATCCACAAGCTGACTGACGTCATCCTTGAAGCCGACCAGAATGATAGCCAGTCC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct  149  AGGGCCCCCTGGACGTCATCATCCACAAGCTGACCGATGTCATCCTCGAGGCAGACCAGAATGACAGCCAGTCC  222

Query  223  CTGGAGCTGGTGCACAGGTTCCAGGAGTACATCGATGCCCACCCTGAGACCATCGTCCTGGACCCGCTCCCTGC  296
            |||||..||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||.||.|||||.||
Sbjct  223  CTGGAATTGGTGCACAGGTTCCAAGAGTACATCGATGCTCACCCTGAGACCATCGTCTTGGATCCCCTCCCCGC  296

Query  297  CATCAGAACCCTGCTTGACCGCTCCAAGTCCTATGAGCTCATCCGGAAGATTGAGGCCTACATGGAAGACGACA  370
            ||||||.||||||.|.|||||.|||||||||||.||.||.|||||.|||||.||||||||||||.||||.||||
Sbjct  297  CATCAGGACCCTGTTAGACCGTTCCAAGTCCTACGAACTTATCCGAAAGATCGAGGCCTACATGAAAGATGACA  370

Query  371  GGATCTGCTCGCCACCCTTCATGGAGCTCACGAGCCTGTGCGGGGATGACACCATGCGGCTGCTGGAGAAGAAC  444
            |.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct  371  GAATCTGCTCGCCGCCTTTCATGGAGCTCACGAGCCTGTGTGGGGAGGACACCATGAGGCTGCTGGAGCAGAAC  444

Query  445  GGCTTGACTTTCCCATTCATTTGCAAAACCAGAGTGGCTCATGGCACCAACTCTCACGAGATGGCTATCGTGTT  518
            |||.||.|.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct  445  GGCCTGGCCTTCCCCTTCATTTGCAAAACCAGAGTGGCTCATGGAACCAACTCTCATGAGATGGCTATTGTGTT  518

Query  519  CAACCAGGAGGGCCTGAACGCCATCCAGCCACCCTGCGTGGTCCAGAATTTCATCAACCACAACGCCGTCCTGT  592
            ||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct  519  CAACCAAGAGGGCCTGAATGCCATCCAGCCTCCCTGTGTGGTCCAGAACTTCATCAACCACAATGCTGTCCTGT  592

Query  593  ACAAGGTGTTCGTGGTTGGCGAGTCCTACACCGTGGTCCAGAGGCCCTCACTCAAGAACTTCTCCGCAGGCACA  666
            ||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct  593  ACAAGGTGTTTGTGGTGGGCGAGTCCTACACAGTGGTCCAGAGACCCTCACTCAAGAACTTCTCTGCGGGCACA  666

Query  667  TCAGACCGTGAGTCCATCTTCTTCAACAGCCACAACGTGTCAAAGCCGGAGTCGTCATCGGTCCTGACGGAGCT  740
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||
Sbjct  667  TCAGATCGTGAGTCCATCTTCTTCAACAGCCACAATGTGTCAAAGCCGGAGTCTTCATCAGTCCTCACTGAGCT  740

Query  741  GGACAAGATCGAGGGCGTGTTCGAGCGGCCGAGCGACGAGGTCATCCGGGAGCTCTCCCGGGCCCTGCGGCAGG  814
            |||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct  741  GGACAAGATCGAGGGTGTGTTCGAACGGCCAAGCGATGAGGTTATCCGGGAGCTGTCCCGGGCTCTGCGGCAGG  814

Query  815  CACTGGGCGTGTCACTCTTCGGCATCGACATCATCATCAACAACCAGACAGGGCAGCACGCTGTCATTGACATC  888
            |.|||||.||||||||.||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.||..||
Sbjct  815  CGCTGGGAGTGTCACTGTTTGGAATTGACATCATCATTAACAACCAGACCGGGCAGCATGCAGTCATCGATGTC  888

Query  889  AATGCCTTCCCAGGCTACGAGGGCGTGAGCGAGTTCTTCACAGACCTCCTGAACCACATCGCCACTGTCCTGCA  962
            |||||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||
Sbjct  889  AATGCCTTCCCAGGCTATGAAGGAGTGAGTGAGTTCTTTACCGACCTCCTGAACCACATTGCCACAGTTCTGCA  962

Query  963  GGGCCAGAGCACAGCCATG----GCAGCCACAGGGGACGTGGCCCTGCTGAGGCACAGCAAGCTTCTGGCCGAG  1032
            .|||||||||||.|    |    ||.|||||.|.|||.|||||||.|||.|||||||.||.|||.|||||.||.
Sbjct  963  AGGCCAGAGCACGG----GAGGAGCTGCCACGGAGGAAGTGGCCCCGCTAAGGCACAACAGGCTCCTGGCGGAA  1032

Query 1033  CCGGCGGGCGGCCTGG-TGGGCGAGCGGACATGCAGCGCCAGCCCCGGCTGCTGCGGCAGCATGATGGGCCAGG  1105
            |||||.|||.|||||| |||| ||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||||.||||||||
Sbjct 1033  CCGGCAGGCAGCCTGGCTGGG-GAGCGGACGTGCAGTGCCAGCCCTGGCTGCTGTGGCAGCATGAAGGGCCAGG  1105

Query 1106  ACGCGCCCTGGAAGGCTGAGGCCGACGCGGGCGGCA---------------CCGCCAAGCTGCCGCACCAGAGA  1164
            ||.|.|||||||||.|||||.||||.||.|||..||               |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1106  ACACACCCTGGAAGACTGAGACCGAAGCAGGCAACATGGGCGCTGGTGCTTCCGCCAAGCTGCCGCACCAGAGA  1179

Query 1165  CTCGGCTGCAACGCCGGCGTGTCGCCCAGCTTCCAGCAGCATTGTGTGGCCTCCCTGGCCACCAAGGCCTCCTC  1238
            ||.|||||||.|.|.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 1180  CTTGGCTGCACCACTGGCGTATCACCCAGCTTCCAGCAGCACTGTGTGGCCTCTCTGGCCACCAAGGCTTCCTC  1253

Query 1239  CCAG  1242
            .|||
Sbjct 1254  ACAG  1257