Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488049
• Subject: NM_026582.4
• Aligned Length: 1623
• Identities: 1454
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGCTGGGGCAATTATAGAAAACATGAGCACCAAGAAGCTGTGCATTGTTGGTGGGATTCTGCTCGTGTTCCA  74
            |||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||.|||||
Sbjct    1  ATGGCTGGGGCAATTATAGAAAACATGAGTACCAAGAAGCTCTGCATTGTTGGAGGGATTCTTCTGGTTTTCCA  74

Query   75  AATCATCGCCTTTCTGGTGGGAGGCTTGATTGCTCCAGGGCCCACAACGGCAGTGTCCTACATGTCGGTGAAAT  148
            ||||.|.|||||||||||||||||||||||.|||||||..||||||||.|||||..||||||.|.|..|.||||
Sbjct   75  AATCGTTGCCTTTCTGGTGGGAGGCTTGATCGCTCCAGCACCCACAACAGCAGTACCCTACACGGCAATAAAAT  148

Query  149  GTGTGGATGCCCGTAAGAACCATCACAAGACAAAATGGTTCGTGCCTTGGGGACCCAATCATTGTGACAAGATC  222
            |||||||||.||||||||||||.||.||.||||.||||.|.|.||||||||||||.||..|.||||||||||||
Sbjct  149  GTGTGGATGTCCGTAAGAACCACCATAAAACAAGATGGCTGGCGCCTTGGGGACCTAACAAGTGTGACAAGATC  222

Query  223  CGAGACATTGAAGAGGCAATTCCAAGGGAAATTGAAGCCAATGACATCGTGTTTTCTGTTCACATTCCCCTCCC  296
            ||.|||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  223  CGTGACATCGAGGAAGCAATTCCAAGGGAAATTGAAGCAAATGACATTGTGTTTTCTGTACACATTCCCCTCCC  296

Query  297  CCACATGGAGATGAGTCCTTGGTTCCAATTCATGCTGTTTATCCTGCAGCTGGACATTGCCTTCAAGCTAAACA  370
            ....||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||.|||||||.||||||||.||||||||.||||
Sbjct  297  TTCTATGGAGATGAGTCCATGGTTCCAGTTTATGCTGTTTATCTTGCAGCTAGACATTGCTTTCAAGCTGAACA  370

Query  371  ACCAAATCAGAGAAAATGCAGAAGTCTCCATGGACGTTTCCCTGGCTTACCGTGATGACGCATTTGCTGAGTGG  444
            |||||||||||||||||||||||.|.||||||||.||||||||||.||||||||||||....|||.||||.|||
Sbjct  371  ACCAAATCAGAGAAAATGCAGAAATTTCCATGGATGTTTCCCTGGGTTACCGTGATGATATGTTTTCTGAATGG  444

Query  445  ACTGAAATGGCCCATGAAAGAGTACCACGGAAACTCAAATGCACCTTCACATCTCCCAAGACTCCAGAGCATGA  518
            |||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.||||||||.||||||||.||
Sbjct  445  ACTGAAATGGCCCATGAAAGAGTACCACGTAAACTCAAATGTACTTTTACATCCCCCAAGACCCCAGAGCACGA  518

Query  519  GGGCCGTTACTATGAATGTGATGTCCTTCCTTTCATGGAAATTGGGTCTGTGGCCCATAAGTTTTACCTTTTAA  592
            .||.|||||.|||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||.|||||||.|||
Sbjct  519  AGGTCGTTATTATAATTGTGATGTCCTTCCTTTCATGGAAATTGGGTCAGTGGCTCATAAGTATTACCTTCTAA  592

Query  593  ACATCCGGCTGCCTGTGAATGAGAAGAAGAAAATCAATGTGGGAATTGGGGAGATAAAGGATATCCGGTTGGTG  666
            |.||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct  593  ATATCCGGCTACCTGTAAATGAGAAAAAGAAAATCAATGTTGGAATTGGGGAGATAAAGGACATTCGGTTGGTG  666

Query  667  GGGATCCACCAAAATGGAGGCTTCACCAAGGTGTGGTTTGCCATGAAGACCTTCCTTACGCCCAGCATCTTCAT  740
            ||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  667  GGAATCCACCAAAACGGAGGTTTCACTAAGGTATGGTTTGCTATGAAGACCTTCCTTACACCCAGCATCTTCAT  740

Query  741  CATTATGGTGTGGTATTGGAGGAGGATCACCATGATGTCCCGACCCCCAGTGCTTCTGGAAAAAGTCATCTTTG  814
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CATTATGGTGTGGTATTGGAGGAGGATCACCATGATGTCCCGACCTCCAGTGCTTCTGGAAAAAGTCATCTTTG  814

Query  815  CCCTTGGGATTTCCATGACCTTTATCAATATCCCAGTGGAATGGTTTTCCATCGGGTTTGACTGGACCTGGATG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCCTTGGGATTTCCATGACCTTTATCAATATCCCTGTGGAATGGTTTTCTATTGGATTTGACTGGACCTGGATG  888

Query  889  CTGCTGTTTGGTGACATCCGACAGGGCATCTTCTATGCGATGCTTCTGTCCTTCTGGATCATCTTCTGTGGCGA  962
            |||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTGTTATTTGGTGACATCCGACAGGGCATCTTCTATGCAATGCTTCTTTCTTTCTGGATCATCTTCTGTGGCGA  962

Query  963  GCACATGATGGATCAGCACGAGCGGAACCACATCGCAGGGTATTGGAAGCAAGTCGGACCCATTGCCGTTGGCT  1036
            |||||||||||||||.||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||
Sbjct  963  GCACATGATGGATCAACATGAACGGAATCACATTGCAGGGTACTGGAAGCAAGTTGGACCAATTGCTGTTGGCT  1036

Query 1037  CCTTCTGCCTCTTCATATTTGACATGTGTGAGAGAGGGGTACAACTCACGAATCCCTTCTACAGTATCTGGACT  1110
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCTTCTGCCTCTTCATATTTGACATGTGTGAAAGAGGAGTACAACTCACAAATCCTTTCTACAGTATCTGGACT  1110

Query 1111  ACAGACATTGGAACAGAGCTGGCCATGGCCTTCATCATCGTGGCTGGAATCTGCCTCTGCCTCTACTTCCTGTT  1184
            |||||..||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1111  ACAGATGTTGGAACAGAACTGGCTATGGCTTTCATCATTGTGGCAGGTATCTGCCTCTGCCTCTATTTCCTGTT  1184

Query 1185  TCTATGCTTCATGGTATTTCAGGTGTTTCGGAACATCAGTGGGAAGCAGTCCAGCCTGCCAGCTATGAGCAAAG  1258
            |||.||||||||||||||||||||.|||.|.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||
Sbjct 1185  TCTGTGCTTCATGGTATTTCAGGTATTTAGAAACATCAGTGGGAAGCAGTCTAGCCTCCCAGCCATGAGCAAAG  1258

Query 1259  TCCGGCGGCTACACTATGAGGGGCTAATTTTTAGGTTCAAGTTCCTCATGCTTATCACCTTGGCCTGCGCTGCC  1332
            |||||.||||.|||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 1259  TCCGGAGGCTGCACTATGAGGGTCTGATCTTCAGGTTCAAGTTCCTCATGCTTATCACCTTGGCTTGTGCTGCC  1332

Query 1333  ATGACTGTCATCTTCTTCATCGTTAGTCAGGTAACGGAAGGCCATTGGAAATGGGGCGGCGTCACAGTCCAAGT  1406
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||..|.||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||
Sbjct 1333  ATGACTGTTATCTTCTTCATCGTTAGTCAGGTGTCAGAAGGCCATTGGAAATGGGGTGGTGTCACAGTTCAAGT  1406

Query 1407  GAACAGTGCCTTTTTCACAGGCATCTATGGGATGTGGAATCTGTATGTCTTTGCTCTGATGTTCTTGTATGCAC  1480
            ||.||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GAGCAGTGCTTTCTTCACTGGAATCTATGGGATGTGGAACCTGTATGTCTTTGCTTTGATGTTCTTGTATGCAC  1480

Query 1481  CATCCCATAAAAACTATGGAGAAGACCAGTCCAATGGCGATCTGGGTGTCCATAGTGGGGAAGAACTCCAGCTC  1554
            ||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||.
Sbjct 1481  CATCCCATAAGAACTATGGGGAAGACCAGTCTAATGGTGACCTGGGTGTCCACAGCGGGGAAGAACTGCAGCTT  1554

Query 1555  ACCACCACTATCACCCATGTGGACGGACCCACTGAGATCTACAAGTTGACCCGCAAGGAGGCCCAGGAG  1623
            ||.||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||.
Sbjct 1555  ACTACCACTATAACCCATGTAGATGGACCAACTGAGATCTACAAGTTGACCCGTAAAGAAGCACAGGAA  1623