Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488050
• Subject: XM_006538848.3
• Aligned Length: 1500
• Identities: 1314
• Gaps: 15

Alignment

Query    1  ATGCCGTTAGTAACGAGGAACATCGAGCCAAGGCACCTGTGCCGTCAGACGTTGCCTAGCGTTAGAAGCGAGCT  74
            ||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct    1  ATGCCGTTAGTAACCAGGAACATCGAGCCAAGGCACCTGTGCCGTCAGACGTTGCCTAGCGATACAAGCGAGCT  74

Query   75  GGAATGCGTGACCAACATCACCCTGGCAAATGTCATCCGACAGCTGGGCAGCCTGAGTAAATATGCAGAGGACA  148
            |||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct   75  GGAATGCAGGACCAACATCACCCTGGCAAATGTCATCCGACAGCTGGGCAGCCTGAGTAAGTATGCAGAGGACA  148

Query  149  TTTTTGGAGAGCTCTTTACTCAGGCAAATACCTTTGCCTCTCGGGTAAGCTCCCTTGCTGAGAGGGTCGACCGA  222
            ||||.||||||.|.|.|||||||||||.|.||||||||||.||.||||.|||||||||||||.||||.||||||
Sbjct  149  TTTTCGGAGAGATTTGTACTCAGGCAAGTGCCTTTGCCTCCCGAGTAAACTCCCTTGCTGAGCGGGTTGACCGA  222

Query  223  CTACAGGTTAAAGTCACTCAGCTGGATCCCAAGGAAGAAGAAGTGTCACTGCAAGGAATCAACACCCGAAAAGC  296
            .||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.||
Sbjct  223  GTACAAGTTAAAGTCACTCAGCTGGATCCCAAGGAAGAAGAAGTGTCACTACAAGGAATCAACACTCGGAAGGC  296

Query  297  CTTCAGAAGTTCCACCATTCAAGACCAGAAGCTTTTTGACAGAAACTCTCTCCCAGTGCCTGTCTTAGAAACAT  370
            ||||||||||||.||||..||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.|
Sbjct  297  CTTCAGAAGTTCTACCACCCAAGACCAGAAGCTCTTTGACAGGAACTCTCTCCCGGTGCCCGTCTTAGAGACCT  370

Query  371  ACAATACCTGTGATACTCCTCCCCCTCTCAACAATCTTACCCCTTACAGGGACGATGGAAAAGAGGCACTCAAA  444
            |.||.|.||||||..|||||||||||||.||||||||.|..|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATAACAGCTGTGACGCTCCTCCCCCTCTTAACAATCTCAGTCCTTACAGGGACGATGGAAAAGAGGCACTCAAA  444

Query  445  TTCTACACAGACCCTTCATACTTCTTTGATCTTTGGAAGGAGAAGATGCTGCAGGACACCAAGGATATCATGAA  518
            ||||||||..||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTCTACACCAACCCCTCATACTTCTTTGATCTTTGGAAGGAGAAGATGCTGCAGGACACCAAGGATATCATGAA  518

Query  519  AGAGAAGAGAAAGCATAGGAAAGAAAAGAAAGATAATCCAAATCGAGGGAATGTAAACCCACGTAAAATCAAGA  592
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGAGAAGAGAAAGCATAGGAAAGAAAAGAAAGATAATCCAAATAGAGGGAATGTGAACCCACGTAAAATCAAGA  592

Query  593  CACGTAAGGAAGAGTGGGAGAAAATGAAGATGGGGCAAGAATTTGTGGAGTCCAAAGAAAAGCTGGGGACTTCT  666
            ||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.|.|||||||.|||||
Sbjct  593  CACGCAAGGAAGAGTGGGAGAAGATGAAAATGGGACAAGAATTTGTAGAGTCCAAGGAGAGGCTGGGGCCTTCT  666

Query  667  GGGTATCCACCCACTTTGGTGTACCAGAATGGCAGCATTGGCTGTGTTGAAAACGTGGATGCAAGTAGCTATCC  740
            ||||||.|..||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||....|||||.||
Sbjct  667  GGGTATTCGTCCACCTTGGTGTACCAGAATGGCAGCATTGGCTCTGTTGAAAATGTGGATGCGGCCAGCTACCC  740

Query  741  GCCACCACCACAGTCAGACTCTGCTTCTTCACCTTCTCCTTCCTTCTCCGAGGACAACTTGCCTCCTCCACCAG  814
            .||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||.||||
Sbjct  741  ACCACCACCACAGTCGGACTCTGCCTCCTCACCTTCCCCTTCATTCTCTGAAGACAACTTGCCTCCCCCGCCAG  814

Query  815  CAGAATTCAGTTACCCAGTGGACAACCAAAGAGGATCTGGTTTGGCTGGACCCAAAAGATCCAGTGTGGTCAGC  888
            ||||||||||.|||||.|..|||||||||||||||||||..||||||||||||||||||.||||..||||||||
Sbjct  815  CAGAATTCAGCTACCCTGCAGACAACCAAAGAGGATCTGTCTTGGCTGGACCCAAAAGAACCAGCATGGTCAGC  888

Query  889  CCAAGCCATCCACCACCAGCTCCTCCTCTAGGCTCTCCACCAGGCCCTAAACCCGGGTTTGCTCCACCACCTGC  962
            ||||||||||||||.||||||||||||||..|||||||.|||||.||.||.||.||.||.|||||.||||||||
Sbjct  889  CCAAGCCATCCACCCCCAGCTCCTCCTCTGAGCTCTCCGCCAGGTCCCAAGCCTGGCTTCGCTCCTCCACCTGC  962

Query  963  CCCTCCGCCACCTCCGCCTCCAATGATAGGCATCCCACCTCCACCACCGCCTGTAGGATTTGGGTCTCCAGGGA  1036
            ||||   ||||||||.|||||.||||   |..|.||||||||||.|||..|..|.|||||.||||||||.||||
Sbjct  963  CCCT---CCACCTCCACCTCCCATGA---GTGTGCCACCTCCACTACCATCGATGGGATTCGGGTCTCCTGGGA  1030

Query 1037  CGCCTCCACCACCCTCACCCCCATCTTTCCCACCTCACCCTGATTTTGCTGCCCCTCCACCTCCTCCTCCACCA  1110
            |.||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1031  CCCCTCCACCCCCATCACCTCCATCTTTCCCTCCTCACCCTGATTTTGCTGCTCCTCCACCACCTCCCCCACCA  1104

Query 1111  CCAGCAGCTGACTACCCAACTCTGCCACCACCTCCCTTGTCCCAGCCAACAGGAGGAGCACCTCCTCCTCCCCC  1184
            |||||||||||||||||||   |||||||||||||.||||||||.||..|.|||||.||.|||||.|||||.||
Sbjct 1105  CCAGCAGCTGACTACCCAA---TGCCACCACCTCCTTTGTCCCAACCGTCTGGAGGTGCTCCTCCGCCTCCTCC  1175

Query 1185  TCCTCCTCCTCCTCCGGGGCCCCCTCCTCCCCCTTTCACTGGTGCAGATGGCCAACCTGCT------ATACCAC  1252
            |||.|||||.|||||.||||||||.||||.|||.||||..|||||.||||||||.||||||      ..|||||
Sbjct 1176  TCCCCCTCCCCCTCCAGGGCCCCCGCCTCTCCCCTTCAGCGGTGCTGATGGCCAGCCTGCTGCACCACCACCAC  1249

Query 1253  CACCGCTTTCTGATACCACCAAGCCCAAGTCCTCCTTGCCTGCCGTGAGCGATGCCCGTAGCGACCTGCTTTCA  1326
            ||||.|.||||||..||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||.||.||.||.|||||||||||.
Sbjct 1250  CACCACCTTCTGAGGCCACCAAGCCCAAGTCTTCATTGCCTGCTGTGAGTGACGCGCGCAGTGACCTGCTTTCT  1323

Query 1327  GCCATCCGTCAAGGTTTTCAGCTGCGCAGGGTTGAGGAGCAGCGGGAACAAGAGAAGCGGGATGTTGTGGGCAA  1400
            |||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 1324  GCCATTCGCCAAGGCTTTCAGCTGCGAAGGGTTGAAGAGCAACGGGAGCAAGAGAAGCGTGATGTGGTGGGCAA  1397

Query 1401  TGACGTGGCCACCATCTTGTCTCGTCGCATTGCTGTTGAGTACAGTGACTCAGAAGATGACTCCTCTGAATTTG  1474
            |||.||||||||||||.||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||
Sbjct 1398  TGATGTGGCCACCATCCTGTCCCGTCGGATCGCTGTTGAGTACAGCGACTCGGAAGATGATTCTTCTGAATTTG  1471

Query 1475  ATGAGGACGACTGGTCCGAT  1494
            ||||.|||||||||||.|||
Sbjct 1472  ATGAAGACGACTGGTCGGAT  1491