Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000488064
- Subject:
- XM_017313273.1
- Aligned Length:
- 1318
- Identities:
- 1048
- Gaps:
- 164
Alignment
Query 1 ATGGACCATCCTAGTAGGGAAAAGGATGAAAGACAACGGACAACTAAACCCATGGCACAAAGGAGTGCACACTG 74
|||||||||.|||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.|||||||
Sbjct 1 ATGGACCATTCTAATAGGGAAAAGGATGATAGACAACGGACAACTAAAACCATGGCACAAAGGAATACACACTG 74
Query 75 CTCTCGACCATCTGGCTCCTCATCGTCCTCTGGGGTTCTTATGGTGGGACCCAACTTCAGGGTTGGCAAGAAGA 148
.||..|||||||||||.|.|||.|.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TTCGAGACCATCTGGCACTTCAACATCCTCTGGGGTTCTCATGGTGGGACCCAACTTCAGGGTTGGCAAGAAGA 148
Query 149 TAGGATGTGGGAACTTCGGAGAGCTCAGATTAGGTAAAAATCTCTACACCAATGAATATGTAGCAATCAAACTG 222
||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 149 TAGGGTGTGGGAACTTCGGAGAGCTCAGATTAGGTAAAAATCTCTACACCAATGAATATGTAGCCATTAAACTG 222
Query 223 GAACCAATAAAATCACGTGCTCCACAGCTTCATTTAGAGTACAGATTTTATAAACAGCTTGGCAGTGCAGGTGA 296
||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GAACCAATAAAATCACGTGCTCCACAACTTCATTTAGAGTACAGGTTTTATAAACAGCTTGGCAGTGCAGGTGA 296
Query 297 AGGTCTCCCACAGGTGTATTACTTTGGACCATGTGGGAAATATAATGCCATGGTGCTGGAGCTCCTTGGCCCTA 370
|||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 297 AGGCCTCCCACAGGTTTATTACTTTGGACCATGTGGGAAGTACAATGCCATGGTGCTGGAACTCCTTGGCCCTA 370
Query 371 GCTTGGAGGACTTGTTTGACCTCTGTGACCGAACATTTACTTTGAAGACGGTGTTAATGATAGCCATCCAGTTG 444
|||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GCTTGGAAGACTTGTTTGACCTCTGTGACCGAACGTTTACTTTGAAGACGGTGTTAATGATAGCCATCCAGTTG 444
Query 445 CTTTCTCGAATGGAATACGTGCACTCAAAGAACCTCATTTACCGAGATGTCAAGCCAGAGAACTTCCTGATTGG 518
||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||
Sbjct 445 CTTTCTCGAATGGAGTATGTACACTCAAAGAATCTTATTTACCGAGATGTCAAACCAGAGAACTTCTTGATTGG 518
Query 519 TCGACAAGGCAATAAGAAAGAGCATGTTATACACATTATAGACTTTGGACTGGCCAAGGAATACATTGACCCCG 592
.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||..||||.||.|
Sbjct 519 CCGACAAGGCAATAAGAAAGAGCATGTAATACACATTATAGATTTTGGACTGGCCAAGGAATATGTTGATCCTG 592
Query 593 AAACCAAAAAACACATACCTTATAGGGAACACAAAAGTTTAACTGGAACTGCAAGATATATGTCTATCAACACG 666
||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.
Sbjct 593 AAACCAAAAAACACATACCTTACAGAGAGCACAAAAGTTTGACTGGAACTGCGAGATACATGTCTATCAACACA 666
Query 667 CATCTTGGCAAAGAGCAAAGCCGGAGAGATGATTTGGAAGCCCTAGGCCATATGTTCATGTATTTCCTTCGAGG 740
|||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 667 CATCTAGGCAAAGAGCAAAGCCGGCGAGATGATTTGGAAGCCTTAGGCCATATGTTCATGTACTTCCTCCGAGG 740
Query 741 CAGCCTCCCCTGGCAAGGACTCAAGGCTGACACATTAAAAGAGAGATATCAAAAAATTGGTGACACCAAAAGGA 814
||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 741 CAGCCTACCCTGGCAAGGACTCAAGGCTGATACATTAAAAGAGAGATATCAAAAAATCGGTGATACCAAAAGGA 814
Query 815 ATACTCCCATTGAAGCTCTCTGTGAGAACTTTCCAGAGGAGATGGCAACCTACCTTCGATATGTCAGGCGACTG 888
||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.
Sbjct 815 ATACTCCCATCGAAGCTCTCTGTGAGAACTTTCCAGAGGAGATGGCAACCTACCTTCGATATGTCAGGCGATTA 888
Query 889 GACTTCTTTGAAAAACCTGATTATGAGTATTTACGGACCCTCTTCACAGACCTCTTTGAAAAGAAAGGCTACAC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||..|||||||||.||
Sbjct 889 GACTTCTTTGAAAAACCTGATTATGAGTATTTACGGACCCTCTTCACAGATCTGTTTGAACGGAAAGGCTATAC 962
Query 963 CTTTGACTATGCCTATGATTGGGTTGGGAGACCTATTCCTACTCCAGTAGGGTCAGTTCAC---GTAGATTCTG 1033
|||||||||||||||||||||||||||.||.||||||.||||..|| ||||..|.| |.|||
Sbjct 963 CTTTGACTATGCCTATGATTGGGTTGGAAGGCCTATTACTACATCA------TCAGAGCGCCGAGGAGA----- 1025
Query 1034 GTG------------CATCTG------CAATAACTCGAGAAA----------------GCCACACA----CATA 1069
||| ||.|.| |||||.||| |.| |||.||.| |||.
Sbjct 1026 GTGGGAAATCCAGCCCAGCCGGCAGACCAATACCTC---ATACCTGACGTCTCACTTGGCCGCAGACCGCCATG 1096
Query 1070 GGGATCGGCCATCACAACAG-----CAGCCTCTTCGAAATCAGAGCCTTAGG-----------ACTG------- 1120
|||.| |||..|||| .|| |||..|.||...|||||...|.| ||||
Sbjct 1097 GGGGT------TCAGTACAGGTGGTTAG-CTCAACCAATGGAGAGCTGAATGTCGATGACCCCACTGGAGCTCA 1163
Query 1121 --------------TTACAGCTGAGCAT------------------TATGATGTTAAC------AA----CTCA 1152
|.|||||| ||| .|.||.|.|||| || ||||
Sbjct 1164 CTCCAATGCACCAATCACAGCT---CATGCCGAAGTGGAGGTAGTGGAGGAAGCTAACTGCCTGAAAATGCTCA 1234
Query 1153 GCCATCTGGCAC-------------AGGGGAAGAGG-------CACC------------- 1179
.|| |.|||..| ||.||||.||| ||.|
Sbjct 1235 ACC-TGTGGTGCTGCTGTTTCTTTAAGAGGAAAAGGAAGAAGACAGCCCAGCGACACAAG 1293