Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000488070
- Subject:
- XM_006525663.3
- Aligned Length:
- 2390
- Identities:
- 2083
- Gaps:
- 70
Alignment
Query 1 ATGGACTCCAAAGAATCATTAACT---CCTGGTAGAGAAGAAAACCCCAGCAGTGTGCTTGCTCAGGAGAGGGG 71
|||||||||||||||||.|||.|| |||||||||||.|||..||||||||||.||||||..|.||.||||||
Sbjct 1 ATGGACTCCAAAGAATCCTTAGCTCCCCCTGGTAGAGACGAAGTCCCCAGCAGTTTGCTTGGCCGGGGGAGGGG 74
Query 72 AGATGTGATGGACTTCTATAAAACCCTAAGAGGAGGAGCTACTGTGAAGGTTTCTGCGTCTTCACCCTCACTGG 145
|...|||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 75 AAGCGTGATGGACTTGTATAAAACCCTGAGGGGTGGAGCTACAGTCAAGGTTTCTGCGTCTTCACCCTCAGTGG 148
Query 146 CTGTCGCTTCTCAATCAGACTCCAAGCAGC-GAAGACTTTTGGTTGATTTTCCAAAAGGCTCAGTAAGCAATGC 218
|||..||||||||..||||.|||||||||| ||.|| ||.|..||||||||.||||||||||||.|||||||||
Sbjct 149 CTGCTGCTTCTCAGGCAGATTCCAAGCAGCAGAGGA-TTCTCCTTGATTTTTCAAAAGGCTCAGCAAGCAATGC 221
Query 219 GCA---------------------------------------------------GCAGCCAGATCTGTCCAAAG 241
||| ||||||||||.|.|||||||
Sbjct 222 GCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCGCAGCCAGATTTATCCAAAG 295
Query 242 CAGTTTCACTCTCAATGGGACTGTATATGGGAGAGACAGAAACAAAAGTGATGGGAAATGACCTGGGATTCCCA 315
|.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.||||.|.||||
Sbjct 296 CCGTTTCACTGTCCATGGGACTGTATATGGGAGAGACCGAAACAAAAGTGATGGGGAATGACTTGGGCTACCCA 369
Query 316 CAGCAGGGCCAAATCAGCCTTTCCTCGGGGGAAACAGACTTAAAGCTTTTGGAAGAAAGCATTGCAAACCTCAA 389
|||||||||||..|..||||.|||||.||||||||||||||...||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 370 CAGCAGGGCCAGCTTGGCCTCTCCTCTGGGGAAACAGACTTTCGGCTTCTGGAAGAAAGCATTGCAAACCTCAA 443
Query 390 TAGGTCGACCAGTGTTCCAGAGAACCCCAAGAGTTCAGCATCCACTGCTGTGTCTGCTGCCCCCACAGAGAAGG 463
||||||||||||...||||||||||||||||||||||.||.|..|.||||.||.||||.||||.||||||||||
Sbjct 444 TAGGTCGACCAGCCGTCCAGAGAACCCCAAGAGTTCAACACCTGCAGCTGGGTGTGCTACCCCGACAGAGAAGG 517
Query 464 AGTTTCCAAAAACTCACTCTGATGTATCTTCAGAACAGCAACATTTGAAGGGCCAGACTGGCACCAACGGTGGC 537
|||||||..|.||||||||||||..||||||||||||||||.||...||..|||||.|||||||||||||||||
Sbjct 518 AGTTTCCCCAGACTCACTCTGATCCATCTTCAGAACAGCAAAATAGAAAAAGCCAGCCTGGCACCAACGGTGGC 591
Query 538 AATGTGAAATTGTATACCACAGACCAAAGCACCTTTGACATTTTGCAGGATTTGGAGTTTTCTTCTGGGTCCCC 611
|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|.||||||||
Sbjct 592 AGTGTGAAATTGTATACCACAGACCAAAGCACCTTTGACATCTTGCAGGATTTGGAGTTTTCTGCCGGGTCCCC 665
Query 612 AGGTAAAGAGACGAATGAGAGTCCTTGGAGATCAGACCTGTTGATAGATGAAAACTGTTTGCTTTCTCCTCTGG 685
||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||.|||
Sbjct 666 AGGTAAAGAGACAAACGAGAGTCCTTGGAGGTCAGACCTGTTGATAGATGAAAAC---TTGCTTTCTCCTTTGG 736
Query 686 CGGGAGAAGACGATTCATTCCTTTTGGAAGGAAACTCGAATGAGGACTGCAAGCCTCTCATTTTACCGGACACT 759
||||||||||.|||.||||||||.|||||||..||..|||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 737 CGGGAGAAGATGATCCATTCCTTCTGGAAGGGGACGTGAATGAGGATTGCAAGCCTCTTATTTTACCGGACACT 810
Query 760 AAACCCAAAATTAAGGATAATGGAGATCTGGTTTTGTCAAGCCCCAGTAATGTAACACTGCCCCAAGTGAAAAC 833
|||||.||||||.||||||.|||||||....|.||.|||||||||||.|.|||..|||||||||||||||||||
Sbjct 811 AAACCTAAAATTCAGGATACTGGAGATACAATCTTATCAAGCCCCAGCAGTGTGGCACTGCCCCAAGTGAAAAC 884
Query 834 AGAAAAAGAAGATTTCATCGAACTCTGCACCCCTGGGGTAATTAAGCAAGAGAAACTGGGCACAGTTTACTGTC 907
|||.|||||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||.||.|
Sbjct 885 AGAGAAAGATGATTTCATTGAGCTTTGCACCCCTGGGGTAATTAAGCAAGAGAAACTGGGCCCGGTTTATTGCC 958
Query 908 AGGCAAGCTTTCCTGGAGCAAATATAATTGGTAATAAAATGTCTGCCATTTCTGTTCATGGTGTGAGTACCTCT 981
|||||||||||.||||..|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 959 AGGCAAGCTTTTCTGGGACAAATATAATTGGGAATAAAATGTCTGCCATTTCTGTTCATGGCGTGAGTACCTCT 1032
Query 982 GGAGGACAGATGTACCACTATGACATGAATACAGCATCCCTTTCTCAACAGCAGGATCAGAAGCCTATTCTTAA 1055
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 1033 GGAGGACAGATGTACCACTATGACATGAATACAGCATCCCTTTCTCAGCAGCAGGATCAGAAGCCTGTTTTTAA 1106
Query 1056 TGTCATTCCACCAATTCCCGTTGGTTCCGAAAATTGGAATAGGTGCCAAGGATCTGGAGATGACAACTTGACTT 1129
||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||.||||||
Sbjct 1107 TGTCATTCCACCAATTCCTGTTGGTTCTGAAAACTGGAATAGGTGCCAAGGGTCTGGAGAGGACAACCTGACTT 1180
Query 1130 CTCTGGGGACTCTGAACTTCCCTGGTCGAACAGTTTTTTCTAATGGCTATTCAAGCCCCAGCATGAGACCAGAT 1203
|..|||||.||.||||||||.|.||.||..||||.|||||||||||.|||||||||||..|.||||||||||||
Sbjct 1181 CCTTGGGGGCTATGAACTTCGCAGGCCGCTCAGTGTTTTCTAATGGATATTCAAGCCCTGGAATGAGACCAGAT 1254
Query 1204 GTAAGCTCTCCTCCATCCAGCTCCTCAACAGCAACAACAGGACCACCTCCCAAACTCTGCCTGGTGTGCTCTGA 1277
||.||.||||||||.|||||||||||.|||| ||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1255 GTGAGTTCTCCTCCGTCCAGCTCCTCCACAG---CAACGGGACCACCTCCCAAACTCTGCCTGGTGTGCTCCGA 1325
Query 1278 TGAAGCTTCAGGATGTCATTATGGAGTCTTAACTTGTGGAAGCTGTAAAGTTTTCTTCAAAAGAGCAGTGGAAG 1351
|||||||||.|||||.||||||||.||..|.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct 1326 TGAAGCTTCGGGATGCCATTATGGGGTGCTGACGTGTGGAAGCTGTAAAGTCTTCTTTAAAAGAGCAGTGGAAG 1399
Query 1352 ---GACAGCACAATTACCTATGTGCTGGAAGGAATGATTGCATCATCGATAAAATTCGAAGAAAAAACTGCCCA 1422
||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1400 GTAGACAGCACAATTACCTTTGTGCTGGAAGAAATGATTGCATCATTGATAAAATTCGAAGAAAAAACTGTCCA 1473
Query 1423 GCATGCCGCTATCGAAAATGTCTTCAGGCTGGAATGAACCTGGAAGCTCGAAAAACAAAGAAAAAAATAAAAGG 1496
||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1474 GCATGCCGCTATCGAAAATGTCTTCAAGCTGGAATGAACCTGGAAGCTCGAAAAACGAAGAAAAAAATTAAAGG 1547
Query 1497 AATTCAGCAGGCCACTACAGGAGTCTCACAAGAAACCTCTGAAAATCCTGGTAACAAAACAATAGTTCCTGCAA 1570
|||||||||.||||||.||||||||||||||||.||.|||||||| .|.|||||||||||||||||||||..
Sbjct 1548 AATTCAGCAAGCCACTGCAGGAGTCTCACAAGACACTTCTGAAAA---CGCTAACAAAACAATAGTTCCTGCCG 1618
Query 1571 CGTTACCACAACTCACCCCTACCCTGGTGTCACTGTTGGAGGTTATTGAACCTGAAGTGTTATATGCAGGATAT 1644
||.|.|||||.||.|||||||||||||||||||||.|||||||.||.||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1619 CGCTGCCACAGCTTACCCCTACCCTGGTGTCACTGCTGGAGGTGATCGAGCCTGAGGTGTTATATGCAGGATAT 1692
Query 1645 GATAGCTCTGTTCCAGACTCAACTTGGAGGATCATGACTACGCTCAACATGTTAGGAGGGCGGCAAGTGATTGC 1718
||.||||||||||||||||||.|.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 1693 GACAGCTCTGTTCCAGACTCAGCATGGAGAATTATGACCACGCTCAACATGTTAGGTGGGCGCCAAGTGATTGC 1766
Query 1719 AGCAGTGAAATGGGCAAAGGCAATACCAGGTTTCAGGAACTTACACCTGGATGACCAAATGACCCTACTGCAGT 1792
.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 1767 CGCAGTGAAATGGGCAAAGGCGATACCAGGATTCAGAAACTTACACCTGGATGACCAAATGACCCTTCTACAGT 1840
Query 1793 ACTCCTGGATGTTTCTTATGGCATTTGCTCTGGGGTGGAGATCATATAGACAATCAAGTGCAAACCTGCTGTGT 1866
||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||.||||||.|||||||||.||.
Sbjct 1841 ACTCATGGATGTTTCTCATGGCATTTGCCCTGGGTTGGAGATCATACAGACAAGCAAGTGGAAACCTGCTATGC 1914
Query 1867 TTTGCTCCTGATCTGATTATTAATGAGCAGAGAATGACTCTACCCTGCATGTACGACCAATGTAAACACATGCT 1940
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1915 TTTGCTCCTGATCTGATTATTAATGAGCAGAGAATGACTCTACCCTGCATGTATGACCAATGTAAACACATGCT 1988
Query 1941 GTATGTTTCCTCTGAGTTACACAGGCTTCAGGTATCTTATGAAGAGTATCTCTGTATGAAAACCTTACTGCTTC 2014
||.|.|.|||.||||.|||||.||..|.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1989 GTTTATCTCCACTGAATTACAAAGATTGCAGGTATCCTATGAAGAGTATCTCTGTATGAAAACCTTACTGCTTC 2062
Query 2015 TCTCTTCAGTTCCTAAGGACGGTCTGAAGAGCCAAGAGCTATTTGATGAAATTAGAATGACCTACATCAAAGAG 2088
||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||.|||.|||||||.||.|||||||||
Sbjct 2063 TCTCCTCAGTTCCTAAGGAAGGTCTGAAGAGCCAAGAGTTATTTGATGAGATTCGAATGACTTATATCAAAGAG 2136
Query 2089 CTAGGAAAAGCCATTGTCAAGAGGGAAGGAAACTCCAGCCAGAACTGGCAGCGGTTTTATCAACTGACAAAACT 2162
||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2137 CTAGGAAAAGCCATTGTCAAAAGGGAAGGAAACTCCAGTCAGAATTGGCAGCGGTTTTATCAACTGACAAAACT 2210
Query 2163 CTTGGATTCTATGCATGAAGTGGTTGAAAATCTCCTTAACTATTGCTTCCAAACATTTTTGGATAAGACCATGA 2236
.|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 2211 TTTGGACTCCATGCATGATGTGGTTGAAAATCTCCTTAGCTACTGCTTCCAAACATTTTTGGATAAGTCCATGA 2284
Query 2237 GTATTGAATTCCCCGAGATGTTAGCTGAAATCATCACCAATCAGATACCAAAATATTCAAACGGAAATATCAAA 2310
|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 2285 GTATTGAATTCCCAGAGATGTTAGCTGAAATCATCACTAATCAGATACCAAAATACTCAAATGGAAATATCAAA 2358
Query 2311 AAACTTCTGTTTCATCA-AAAG 2331
||.|||||||||||||| |||
Sbjct 2359 AAGCTTCTGTTTCATCAGAAA- 2379