Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000488070
- Subject:
- XM_017317835.1
- Aligned Length:
- 2387
- Identities:
- 2083
- Gaps:
- 67
Alignment
Query 1 ATGGACTCCAAAGAATCATTAACT---CCTGGTAGAGAAGAAAACCCCAGCAGTGTGCTTGCTCAGGAGAGGGG 71
|||||||||||||||||.|||.|| |||||||||||.|||..||||||||||.||||||..|.||.||||||
Sbjct 1 ATGGACTCCAAAGAATCCTTAGCTCCCCCTGGTAGAGACGAAGTCCCCAGCAGTTTGCTTGGCCGGGGGAGGGG 74
Query 72 AGATGTGATGGACTTCTATAAAACCCTAAGAGGAGGAGCTACTGTGAAGGTTTCTGCGTCTTCACCCTCACTGG 145
|...|||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 75 AAGCGTGATGGACTTGTATAAAACCCTGAGGGGTGGAGCTACAGTCAAGGTTTCTGCGTCTTCACCCTCAGTGG 148
Query 146 CTGTCGCTTCTCAATCAGACTCCAAGCAGC-GAAGACTTTTGGTTGATTTTCCAAAAGGCTCAGTAAGCAATGC 218
|||..||||||||..||||.|||||||||| ||.|| ||.|..||||||||.||||||||||||.|||||||||
Sbjct 149 CTGCTGCTTCTCAGGCAGATTCCAAGCAGCAGAGGA-TTCTCCTTGATTTTTCAAAAGGCTCAGCAAGCAATGC 221
Query 219 GCA---------------------------------------------------GCAGCCAGATCTGTCCAAAG 241
||| ||||||||||.|.|||||||
Sbjct 222 GCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCGCAGCCAGATTTATCCAAAG 295
Query 242 CAGTTTCACTCTCAATGGGACTGTATATGGGAGAGACAGAAACAAAAGTGATGGGAAATGACCTGGGATTCCCA 315
|.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.||||.|.||||
Sbjct 296 CCGTTTCACTGTCCATGGGACTGTATATGGGAGAGACCGAAACAAAAGTGATGGGGAATGACTTGGGCTACCCA 369
Query 316 CAGCAGGGCCAAATCAGCCTTTCCTCGGGGGAAACAGACTTAAAGCTTTTGGAAGAAAGCATTGCAAACCTCAA 389
|||||||||||..|..||||.|||||.||||||||||||||...||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 370 CAGCAGGGCCAGCTTGGCCTCTCCTCTGGGGAAACAGACTTTCGGCTTCTGGAAGAAAGCATTGCAAACCTCAA 443
Query 390 TAGGTCGACCAGTGTTCCAGAGAACCCCAAGAGTTCAGCATCCACTGCTGTGTCTGCTGCCCCCACAGAGAAGG 463
||||||||||||...||||||||||||||||||||||.||.|..|.||||.||.||||.||||.||||||||||
Sbjct 444 TAGGTCGACCAGCCGTCCAGAGAACCCCAAGAGTTCAACACCTGCAGCTGGGTGTGCTACCCCGACAGAGAAGG 517
Query 464 AGTTTCCAAAAACTCACTCTGATGTATCTTCAGAACAGCAACATTTGAAGGGCCAGACTGGCACCAACGGTGGC 537
|||||||..|.||||||||||||..||||||||||||||||.||...||..|||||.|||||||||||||||||
Sbjct 518 AGTTTCCCCAGACTCACTCTGATCCATCTTCAGAACAGCAAAATAGAAAAAGCCAGCCTGGCACCAACGGTGGC 591
Query 538 AATGTGAAATTGTATACCACAGACCAAAGCACCTTTGACATTTTGCAGGATTTGGAGTTTTCTTCTGGGTCCCC 611
|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|.||||||||
Sbjct 592 AGTGTGAAATTGTATACCACAGACCAAAGCACCTTTGACATCTTGCAGGATTTGGAGTTTTCTGCCGGGTCCCC 665
Query 612 AGGTAAAGAGACGAATGAGAGTCCTTGGAGATCAGACCTGTTGATAGATGAAAACTGTTTGCTTTCTCCTCTGG 685
||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||.|||
Sbjct 666 AGGTAAAGAGACAAACGAGAGTCCTTGGAGGTCAGACCTGTTGATAGATGAAAAC---TTGCTTTCTCCTTTGG 736
Query 686 CGGGAGAAGACGATTCATTCCTTTTGGAAGGAAACTCGAATGAGGACTGCAAGCCTCTCATTTTACCGGACACT 759
||||||||||.|||.||||||||.|||||||..||..|||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 737 CGGGAGAAGATGATCCATTCCTTCTGGAAGGGGACGTGAATGAGGATTGCAAGCCTCTTATTTTACCGGACACT 810
Query 760 AAACCCAAAATTAAGGATAATGGAGATCTGGTTTTGTCAAGCCCCAGTAATGTAACACTGCCCCAAGTGAAAAC 833
|||||.||||||.||||||.|||||||....|.||.|||||||||||.|.|||..|||||||||||||||||||
Sbjct 811 AAACCTAAAATTCAGGATACTGGAGATACAATCTTATCAAGCCCCAGCAGTGTGGCACTGCCCCAAGTGAAAAC 884
Query 834 AGAAAAAGAAGATTTCATCGAACTCTGCACCCCTGGGGTAATTAAGCAAGAGAAACTGGGCACAGTTTACTGTC 907
|||.|||||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||.||.|
Sbjct 885 AGAGAAAGATGATTTCATTGAGCTTTGCACCCCTGGGGTAATTAAGCAAGAGAAACTGGGCCCGGTTTATTGCC 958
Query 908 AGGCAAGCTTTCCTGGAGCAAATATAATTGGTAATAAAATGTCTGCCATTTCTGTTCATGGTGTGAGTACCTCT 981
|||||||||||.||||..|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 959 AGGCAAGCTTTTCTGGGACAAATATAATTGGGAATAAAATGTCTGCCATTTCTGTTCATGGCGTGAGTACCTCT 1032
Query 982 GGAGGACAGATGTACCACTATGACATGAATACAGCATCCCTTTCTCAACAGCAGGATCAGAAGCCTATTCTTAA 1055
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 1033 GGAGGACAGATGTACCACTATGACATGAATACAGCATCCCTTTCTCAGCAGCAGGATCAGAAGCCTGTTTTTAA 1106
Query 1056 TGTCATTCCACCAATTCCCGTTGGTTCCGAAAATTGGAATAGGTGCCAAGGATCTGGAGATGACAACTTGACTT 1129
||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||.||||||
Sbjct 1107 TGTCATTCCACCAATTCCTGTTGGTTCTGAAAACTGGAATAGGTGCCAAGGGTCTGGAGAGGACAACCTGACTT 1180
Query 1130 CTCTGGGGACTCTGAACTTCCCTGGTCGAACAGTTTTTTCTAATGGCTATTCAAGCCCCAGCATGAGACCAGAT 1203
|..|||||.||.||||||||.|.||.||..||||.|||||||||||.|||||||||||..|.||||||||||||
Sbjct 1181 CCTTGGGGGCTATGAACTTCGCAGGCCGCTCAGTGTTTTCTAATGGATATTCAAGCCCTGGAATGAGACCAGAT 1254
Query 1204 GTAAGCTCTCCTCCATCCAGCTCCTCAACAGCAACAACAGGACCACCTCCCAAACTCTGCCTGGTGTGCTCTGA 1277
||.||.||||||||.|||||||||||.|||| ||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1255 GTGAGTTCTCCTCCGTCCAGCTCCTCCACAG---CAACGGGACCACCTCCCAAACTCTGCCTGGTGTGCTCCGA 1325
Query 1278 TGAAGCTTCAGGATGTCATTATGGAGTCTTAACTTGTGGAAGCTGTAAAGTTTTCTTCAAAAGAGCAGTGGAAG 1351
|||||||||.|||||.||||||||.||..|.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct 1326 TGAAGCTTCGGGATGCCATTATGGGGTGCTGACGTGTGGAAGCTGTAAAGTCTTCTTTAAAAGAGCAGTGGAAG 1399
Query 1352 GACAGCACAATTACCTATGTGCTGGAAGGAATGATTGCATCATCGATAAAATTCGAAGAAAAAACTGCCCAGCA 1425
||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1400 GACAGCACAATTACCTTTGTGCTGGAAGAAATGATTGCATCATTGATAAAATTCGAAGAAAAAACTGTCCAGCA 1473
Query 1426 TGCCGCTATCGAAAATGTCTTCAGGCTGGAATGAACCTGGAAGCTCGAAAAACAAAGAAAAAAATAAAAGGAAT 1499
|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 1474 TGCCGCTATCGAAAATGTCTTCAAGCTGGAATGAACCTGGAAGCTCGAAAAACGAAGAAAAAAATTAAAGGAAT 1547
Query 1500 TCAGCAGGCCACTACAGGAGTCTCACAAGAAACCTCTGAAAATCCTGGTAACAAAACAATAGTTCCTGCAACGT 1573
||||||.||||||.||||||||||||||||.||.|||||||| .|.|||||||||||||||||||||..||.
Sbjct 1548 TCAGCAAGCCACTGCAGGAGTCTCACAAGACACTTCTGAAAA---CGCTAACAAAACAATAGTTCCTGCCGCGC 1618
Query 1574 TACCACAACTCACCCCTACCCTGGTGTCACTGTTGGAGGTTATTGAACCTGAAGTGTTATATGCAGGATATGAT 1647
|.|||||.||.|||||||||||||||||||||.|||||||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 1619 TGCCACAGCTTACCCCTACCCTGGTGTCACTGCTGGAGGTGATCGAGCCTGAGGTGTTATATGCAGGATATGAC 1692
Query 1648 AGCTCTGTTCCAGACTCAACTTGGAGGATCATGACTACGCTCAACATGTTAGGAGGGCGGCAAGTGATTGCAGC 1721
||||||||||||||||||.|.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||
Sbjct 1693 AGCTCTGTTCCAGACTCAGCATGGAGAATTATGACCACGCTCAACATGTTAGGTGGGCGCCAAGTGATTGCCGC 1766
Query 1722 AGTGAAATGGGCAAAGGCAATACCAGGTTTCAGGAACTTACACCTGGATGACCAAATGACCCTACTGCAGTACT 1795
||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 1767 AGTGAAATGGGCAAAGGCGATACCAGGATTCAGAAACTTACACCTGGATGACCAAATGACCCTTCTACAGTACT 1840
Query 1796 CCTGGATGTTTCTTATGGCATTTGCTCTGGGGTGGAGATCATATAGACAATCAAGTGCAAACCTGCTGTGTTTT 1869
|.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||.||||||.|||||||||.||.|||
Sbjct 1841 CATGGATGTTTCTCATGGCATTTGCCCTGGGTTGGAGATCATACAGACAAGCAAGTGGAAACCTGCTATGCTTT 1914
Query 1870 GCTCCTGATCTGATTATTAATGAGCAGAGAATGACTCTACCCTGCATGTACGACCAATGTAAACACATGCTGTA 1943
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1915 GCTCCTGATCTGATTATTAATGAGCAGAGAATGACTCTACCCTGCATGTATGACCAATGTAAACACATGCTGTT 1988
Query 1944 TGTTTCCTCTGAGTTACACAGGCTTCAGGTATCTTATGAAGAGTATCTCTGTATGAAAACCTTACTGCTTCTCT 2017
|.|.|||.||||.|||||.||..|.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1989 TATCTCCACTGAATTACAAAGATTGCAGGTATCCTATGAAGAGTATCTCTGTATGAAAACCTTACTGCTTCTCT 2062
Query 2018 CTTCAGTTCCTAAGGACGGTCTGAAGAGCCAAGAGCTATTTGATGAAATTAGAATGACCTACATCAAAGAGCTA 2091
|.||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||.|||.|||||||.||.||||||||||||
Sbjct 2063 CCTCAGTTCCTAAGGAAGGTCTGAAGAGCCAAGAGTTATTTGATGAGATTCGAATGACTTATATCAAAGAGCTA 2136
Query 2092 GGAAAAGCCATTGTCAAGAGGGAAGGAAACTCCAGCCAGAACTGGCAGCGGTTTTATCAACTGACAAAACTCTT 2165
|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 2137 GGAAAAGCCATTGTCAAAAGGGAAGGAAACTCCAGTCAGAATTGGCAGCGGTTTTATCAACTGACAAAACTTTT 2210
Query 2166 GGATTCTATGCATGAAGTGGTTGAAAATCTCCTTAACTATTGCTTCCAAACATTTTTGGATAAGACCATGAGTA 2239
|||.||.||||||||.|||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 2211 GGACTCCATGCATGATGTGGTTGAAAATCTCCTTAGCTACTGCTTCCAAACATTTTTGGATAAGTCCATGAGTA 2284
Query 2240 TTGAATTCCCCGAGATGTTAGCTGAAATCATCACCAATCAGATACCAAAATATTCAAACGGAAATATCAAAAAA 2313
||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.
Sbjct 2285 TTGAATTCCCAGAGATGTTAGCTGAAATCATCACTAATCAGATACCAAAATACTCAAATGGAAATATCAAAAAG 2358
Query 2314 CTTCTGTTTCATCA-AAAG 2331
|||||||||||||| |||
Sbjct 2359 CTTCTGTTTCATCAGAAA- 2376