Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000488117
- Subject:
- NM_001008505.2
- Aligned Length:
- 1526
- Identities:
- 1190
- Gaps:
- 327
Alignment
Query 1 ATGTCAGATGCTCAGCTCGGTCCCCTCCGCCTGACGCTCCTCTCTGTCTCAGCCAGGACTGGTTTCTGTAAGAA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 ACAGCAGGAGCTGTGGCAGCGGCGAAAGGAAGCGGCTGAGGCGCTTGGAACCCGAAAAGTCTCGGTGCTCCTGG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 CTACCTCGCACAGCGGTGCCCGCCCGGCCGTCAGTACCATGGACAGCAGCGCTGCCCCCACGAACGCCAGCAAT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 --------------------------------------ATGGACAGCAGCGCTGCCCCCACGAACGCCAGCAAT 36
Query 223 TGCACTGATGCCTTGGCGTACTCAAGTTGCTCCCCAGCACCCAGCCCCGGTTCCTGGGTCAACTTGTCCCACTT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 37 TGCACTGATGCCTTGGCGTACTCAAGTTGCTCCCCAGCACCCAGCCCCGGTTCCTGGGTCAACTTGTCCCACTT 110
Query 297 AGATGGCAACCTGTCCGACCCATGTGGTCCGAACCGCACCGACCTGGGCGGGAGAGACAGCCTGTGCCCTCCGA 370
||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 111 AGATGGCAACCTGTCCGACCCATGCGGTCCGAACCGCACCGACCTGGGCGGGAGAGACAGCCTGTGCCCTCCGA 184
Query 371 CCGGCAGTCCCTCCATGATCACGGCCATCACGATCATGGCCCTCTACTCCATCGTGTGCGTGGTGGGGCTCTTC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 185 CCGGCAGTCCCTCCATGATCACGGCCATCACGATCATGGCCCTCTACTCCATCGTGTGCGTGGTGGGGCTCTTC 258
Query 445 GGAAACTTCCTGGTCATGTATGTGATTGTCAGATACACCAAGATGAAGACTGCCACCAACATCTACATTTTCAA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 259 GGAAACTTCCTGGTCATGTATGTGATTGTCAGATACACCAAGATGAAGACTGCCACCAACATCTACATTTTCAA 332
Query 519 CCTTGCTCTGGCAGATGCCTTAGCCACCAGTACCCTGCCCTTCCAGAGTGTGAATTACCTAATGGGAACATGGC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 333 CCTTGCTCTGGCAGATGCCTTAGCCACCAGTACCCTGCCCTTCCAGAGTGTGAATTACCTAATGGGAACATGGC 406
Query 593 CATTTGGAACCATCCTTTGCAAGATAGTGATCTCCATAGATTACTATAACATGTTCACCAGCATATTCACCCTC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 407 CATTTGGAACCATCCTTTGCAAGATAGTGATCTCCATAGATTACTATAACATGTTCACCAGCATATTCACCCTC 480
Query 667 TGCACCATGAGTGTTGATCGATACATTGCAGTCTGCCACCCTGTCAAGGCCTTAGATTTCCGTACTCCCCGAAA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 TGCACCATGAGTGTTGATCGATACATTGCAGTCTGCCACCCTGTCAAGGCCTTAGATTTCCGTACTCCCCGAAA 554
Query 741 TGCCAAAATTATCAATGTCTGCAACTGGATCCTCTCTTCAGCCATTGGTCTTCCTGTAATGTTCATGGCTACAA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 555 TGCCAAAATTATCAATGTCTGCAACTGGATCCTCTCTTCAGCCATTGGTCTTCCTGTAATGTTCATGGCTACAA 628
Query 815 CAAAATACAGGCAAGGTTCCATAGATTGTACACTAACATTCTCTCATCCAACCTGGTACTGGGAAAACCTGCTG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 629 CAAAATACAGGCAAGGTTCCATAGATTGTACACTAACATTCTCTCATCCAACCTGGTACTGGGAAAACCTGCTG 702
Query 889 AAGATCTGTGTTTTCATCTTCGCCTTCATTATGCCAGTGCTCATCATTACCGTGTGCTATGGACTGATGATCTT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 703 AAGATCTGTGTTTTCATCTTCGCCTTCATTATGCCAGTGCTCATCATTACCGTGTGCTATGGACTGATGATCTT 776
Query 963 GCGCCTCAAGAGTGTCCGCATGCTCTCTGGCTCCAAAGAAAAGGACAGGAATCTTCGAAGGATCACCAGGATGG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 777 GCGCCTCAAGAGTGTCCGCATGCTCTCTGGCTCCAAAGAAAAGGACAGGAATCTTCGAAGGATCACCAGGATGG 850
Query 1037 TGCTGGTGGTGGTGGCTGTGTTCATCGTCTGCTGGACTCCCATTCACATTTACGTCATCATTAAAGCCTTGGTT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 851 TGCTGGTGGTGGTGGCTGTGTTCATCGTCTGCTGGACTCCCATTCACATTTACGTCATCATTAAAGCCTTGGTT 924
Query 1111 ACAATCCCAGAAACTACGTTCCAGACTGTTTCTTGGCACTTCTGCATTGCTCTAGGTTACACAAACAGCTGCCT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 925 ACAATCCCAGAAACTACGTTCCAGACTGTTTCTTGGCACTTCTGCATTGCTCTAGGTTACACAAACAGCTGCCT 998
Query 1185 CAACCCAGTCCTTTATGCATTTCTGGATGAAAACTTCAAACGATGCTTCAGAGAGTTCTGTATCCCAACCTCTT 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 999 CAACCCAGTCCTTTATGCATTTCTGGATGAAAACTTCAAACGATGCTTCAGAGAGTTCTGTATCCCAACCTCTT 1072
Query 1259 CCAACATTGAGCAACAAAACTCCACTCGAATTCGTCAGAACACTAGAGACCACCCCTCCACGGCCAATACAGTG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1073 CCAACATTGAGCAACAAAACTCCACTCGAATTCGTCAGAACACTAGAGACCACCCCTCCACGGCCAATACAGTG 1146
Query 1333 GATAGAACTAATCATCAG-------CTAGAAAAT----------CTGGAAGC-----AGAAA--CTGCTCCGTT 1382
|||||||||||||||||| |||.|...| |||| || ||.|| |||||..|||
Sbjct 1147 GATAGAACTAATCATCAGTGCCTACCTATACCTTCCCTGTCTTGCTGG--GCTCTAGAGCAAGGCTGCTTGGTT 1218
Query 1383 G----CCCG----------------------------------------------------------------- 1387
| |||.
Sbjct 1219 GTGTACCCTGGACCACTGCAAGGACCTCTTGTCAGATATGACCTCCCAGCTATCCTTCACTCGTCCTGCCTTCG 1292
Query 1388 ---------------------------------------------- 1387
Sbjct 1293 TGGAAATACTGCTCCCAGCCCGTCTGGTGGAGCATTTCTCCTGAGT 1338