Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488129
• Subject: XM_006527555.1
• Aligned Length: 1189
• Identities: 976
• Gaps: 109

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCGGGAGCTGAGTAAGCTGATTTATGATAACTGCTTTAAACACTGGCAACTAAAAAGGTGTAAGAATTTGGA  74

Query    1  ----------------ATGAAGGGCAACTCCACCCTTGCCACTACTAGCAAAAACATTACCAGCGGCCTTCACT  58
                            |||||||.|||||.||...||||..|.||.||||.|||||||||||||.|||.||   
Sbjct   75  GTTGCTGCAGTTCAATATGAAGGACAACTTCAGTTTTGCTGCCACCAGCAGAAACATTACCAGCAGCCGTC---  145

Query   59  TCGGGCTTGTGAACATCT--------CTGGCAACAATGAGTCTACCTTGAACTGTTCACAGAAACCATCAGATA  124
                 |||.|||..||||        ||||||.|||||||||..||||.||.||.|||||.|||||||||||||
Sbjct  146  -----CTTTTGATAATCTCAACGCAACTGGCACCAATGAGTCCGCCTTTAATTGCTCACACAAACCATCAGATA  214

Query  125  AGCATTTAGATGCAATTCCTATTCTTTACTACATTATATTTGTAATTGGATTT-CTGGTCAATATTGTCGTGGT  197
            |||||||.||.|||||||||.||||.||||||||.||.|||||.|||||.||| || ||.||||||||.|||||
Sbjct  215  AGCATTTGGAAGCAATTCCTGTTCTCTACTACATGATTTTTGTGATTGGGTTTGCT-GTTAATATTGTTGTGGT  287

Query  198  TACACTGTTTTGTTGTCAAAAGGGTCCTAAAAAGGTTTCTAGCATATACATCTTCAACCTCGCTGTGGCTGATT  271
            ..||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||.||..|||||||.|
Sbjct  288  CTCACTGTTTTGTTGTCAAAAGGGCCCTAAAAAGGTGTCCAGCATTTACATCTTCAATCTGGCCTTGGCTGACT  361

Query  272  TACTCCTTTTGGCTACTCTTCCTCTATGGGCAACCTATTATTCTTATAGATATGACTGGCTCTTTGGACCTGTG  345
            ||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct  362  TACTCCTTTTGGCTACCCTCCCTCTCTGGGCAACCTATTACTCTTATAGATATGATTGGCTTTTTGGACCTGTG  435

Query  346  ATGTGCAAAGTTTTTGGTTCTTTTCTTACCCTGAACATGTTTGCAAGCATTTTTTTTATCACCTGCATGAGTGT  419
            |||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  436  ATGTGCAAAGTGTTTGGTTCTTTTCTGACTCTGAACATGTTTGCAAGCATTTTTTTTATTACCTGCATGAGTGT  509

Query  420  TGATAGGTACCAATCTGTCATCTACCCCTTTCTGTCTCAAAGAAGAAATCCCTGGCAAGCATCTTATATAGTTC  493
            .||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  510  CGATAGGTACCAATCGGTCATCTACCCTTTTCTGTCTCAAAGAAGGAATCCCTGGCAAGCATCTTATGTAGTTC  583

Query  494  CCCTTGTTTGGTGTATGGCCTGTTTGTCCTCATTGCCAACATTTTATTTTCGAGACGTCAGAACCATTGAATAC  567
            |||||||||||||||||||.|||.|.|||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||
Sbjct  584  CCCTTGTTTGGTGTATGGCTTGTCTATCCTCATTGCCAACATTTTATTTCCGGGATGTCAGAACCATTGAATAC  657

Query  568  TTAGGAGTGAATGCTTGCATTATGGCTTTCCCACCTGAGAAATATGCCCAATGGTCAGCTGGGATTGCCTTAAT  641
            |||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct  658  TTAGGTGTGAATGCTTGTATTATGGCTTTCCCACCCGAGAAATATGCTCAGTGGTCTGCTGGGATTGCCTTAAT  731

Query  642  GAAAAATATCCTTGGTTTTATTATCCCTTTAATATTCATAGCAACATGCTATTTTGGAATTAGAAAACACTTAC  715
            |||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||..|.|
Sbjct  732  GAAAAATATTCTTGGCTTTATTATTCCTTTAATATTCATAGCAACGTGTTACTTTGGAATCAGAAAACATCTGC  805

Query  716  TGAAGACGAATAGCTATGGGAAGAACAGGATAACCCGTGACCAAGTCCTGAAGATGGCAGCTGCTGTTGTTCTG  789
            |||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||
Sbjct  806  TGAAGACTAATAGCTATGGGAAGAACAGAATTACCCGTGACCAAGTCCTGAAGATGGCAGCTGCTGTTGTGTTG  879

Query  790  GCCTTCATCATTTGCTGGCTTCCCTTCCATGTTCTGACCTTCCTGGATGCTCTGGCCTGGATGGGTGTCATTAA  863
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct  880  GCATTCATCATTTGCTGGCTTCCCTTCCATGTTCTGACCTTCTTGGATGCTCTGACCTGGATGGGTATCATTAA  953

Query  864  TAGCTGCGAAGTTATAGCAGTCATTGACCTGGCACTTCCTTTTGCCATCCTCTTGGGATTCACCAACAGCTGCG  937
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|
Sbjct  954  TAGCTGTGAAGTTATAGCAGTCATTGACCTGGCACTTCCTTTTGCCATCCTCCTGGGATTCACCAACAGCTGTG  1027

Query  938  TTAATCCGTTTCTGTATTGTTTTGTTGGAAACCGGTTCCAACAGAAGCTCCGCAGTGTGTTTAGGGTTCCAATT  1011
            |||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 1028  TTAATCCCTTCCTGTATTGTTTTGTTGGAAACCGCTTCCAACAGAAGCTCCGCAGTGTGTTTAGAGTTCCCATT  1101

Query 1012  ACTTGGCTCCAAGGGAAAAGAGAGAGTATGTCTTGCCGGAAAAGCAGTTCTCTTAGAGAAATGGAGACCTTTGT  1085
            ||||||||||||||.||.|||||||.||||||||||.|.|||.||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1102  ACTTGGCTCCAAGGCAAGAGAGAGACTATGTCTTGCAGAAAAGGCAGTTCTCTTAGAGAAATGGACACCTTTGT  1175

Query 1086  GTCTG  1090
            |||| 
Sbjct 1176  GTCT-  1179