Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000488149
- Subject:
- XM_017313462.1
- Aligned Length:
- 1946
- Identities:
- 1598
- Gaps:
- 132
Alignment
Query 1 ATGTCCCAGCTCTCCTCCACCCTGAAGCGCTACACAGAATCGGCCCGCTACACAGATGCCCACTATGCCAAGTC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||..|
Sbjct 1 ATGTCCCAGCTCTCCTCCACCCTGAAGCGCTATACAGAATCGTCCCGCTACACAGATGCCCCCTATGCCAAACC 74
Query 75 GGGCTATGGTGCCTACACCCCATCCTCCTATGGGGCCAATCTGGCTGCCTCCTTACTGGAGAAGGAGAAACTTG 148
|||||||||..||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 75 GGGCTATGGCACCTACACCCCTTCTTCCTATGGGGCCAACCTGGCCGCCTCCTTCCTGGAGAAGGAAAAACTTG 148
Query 149 GTTTCAAGCCGGTCCCCACCAGCAGCTTCCTCACCCGTCCCCGTACCTATGGCCCCTCCTCCCTCCTGGACTAT 222
||||||||||||||.||.|||.||||||||||.|.||.|||||.|||||.||||||||||||.|.|||||||.|
Sbjct 149 GTTTCAAGCCGGTCTCCCCCACCAGCTTCCTCCCACGGCCCCGCACCTACGGCCCCTCCTCCATTCTGGACTGT 222
Query 223 GACCGGGGCCGCCCCCTGCTGAGACCCGACATCACTGGGGGTGGTAAGCGGGCAGAGAGCCAGACCCGGGGTAC 296
|||.||||||||||||||||||||.|.|||||||.||||.||.||||||||.||||||||||||||||.||.|.
Sbjct 223 GACAGGGGCCGCCCCCTGCTGAGATCTGACATCATTGGGAGTAGTAAGCGGTCAGAGAGCCAGACCCGTGGCAA 296
Query 297 TGAGCGGCCTTTAGGCAGTGGCCTCAGCGGGGGCAGCGGATTCCCTTATGGAGTGACCAACAACTGCCTCAGCT 370
|||..||||.|..||||||||.||||.|||.|||||.|||||..||||||||||..|||.|||||.||||||||
Sbjct 297 TGAAAGGCCCTCGGGCAGTGGACTCAACGGAGGCAGTGGATTTTCTTATGGAGTTTCCAGCAACTCCCTCAGCT 370
Query 371 ACCTGCCCATCAATGCCTATGACCAGGGGGTGACCCTAACCCAGAAG----CTGGACAGCCAATCAGACCTGGC 440
||||||||||.||||||...|||||||||||||||||.|.||||||| | |.|||||||||||||||||||
Sbjct 371 ACCTGCCCATGAATGCCAGAGACCAGGGGGTGACCCTGAGCCAGAAGAAATC-GAACAGCCAATCAGACCTGGC 443
Query 441 CCGGGATTTCTCCAGCCTCCGGACCTCAGATAGCTACC------------------------------------ 478
||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||
Sbjct 444 CCGGGATTTCTCCAGCCTCCGGACTTCAGATGGCTACCGGACTTCAGATGGCTACCGGACCTCAGAGGGCTTTA 517
Query 479 GGATAGACCCCAGGAACCTGGGCCGCAGCCCCATGCTGGCCCGGACGCGCAAGGAGCTCTGCACCCTGCAGGGG 552
||||||||||..|.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||..||||||||||.
Sbjct 518 GGATAGACCCTGGAAACCTGGGTCGCAGCCCCATGCTGGCCCGCACGCGTAAGGAGCTCTGTGCCCTGCAGGGC 591
Query 553 CTCTACCAGACAGCCAGCTGCCCTGAATACCTGGTCGACTACCTGGAGAACTATGGTCGCAAGGGCAGTGCATC 626
||||||||..||||||||.|..||||.|||||....|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||.|
Sbjct 592 CTCTACCAAGCAGCCAGCCGTTCTGAGTACCTAACAGACTATCTGGAGAACTATGGTCGAAAGGGCAGTGCACC 665
Query 627 TCAGGTGCCCTCCCAGGCC---CCTCCCTCACGAGTCCCTGAAATCATCAGCCCAACCTACCGACCCATTGGCC 697
.|||||||.|.|.||.||| ||||||||.||||||||||||.||.||||.||.|||||||||||.|.|||||
Sbjct 666 ACAGGTGCTCACGCAAGCCCCTCCTCCCTCCCGAGTCCCTGAAGTCCTCAGTCCCACCTACCGACCAAGTGGCC 739
Query 698 GCTACACGCTGTGGGAGACGGGAAAGGGTCAGGCCCCTGGGCCCAGCCGCTCCAGCTCCCCGGGAAGAGACGGC 771
|.|||||.||||||||||.|.|.|||||.||||||.|||||||||||||||||||.||.||.||..|||||..|
Sbjct 740 GTTACACACTGTGGGAGAAGAGCAAGGGCCAGGCCTCTGGGCCCAGCCGCTCCAGTTCTCCAGGGCGAGACACC 813
Query 772 ATGAATTCTAAGAGTGCCCAGGGTCTGGCTGGTCTTCGAAACCTTGGGAACACGTGCTTCATGAACTCAATTCT 845
||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 814 ATGAATTCAAAGAGTGCCCAGGGTCTGGCTGGTCTTCGAAACCTTGGGAACACGTGCTTCATGAACTCAATTCT 887
Query 846 GCAGTGCCTGAGCAACACTCGGGAGTTGAGAGATTACTGCCTCCAGAGGCTCTACATGCGGGACCTGCACCACG 919
.|||||||||||||||||.||.|||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||...||||.
Sbjct 888 TCAGTGCCTGAGCAACACCCGAGAGCTGAGAGATTACTGCCTCCAGAGGCTGTACATGCGGGACCTCGGCCACA 961
Query 920 GCAGCAATGCACACACAGCCCTCGTGGAAGAGTTTGCAAAACTAATTCAGACCATATGGACTTCATCCCCCAAT 993
.|||||..||.|||||.||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 962 CCAGCAGCGCTCACACGGCCCTCATGGAAGAGTTTGCAAAACTAATCCAGACCATATGGACGTCGTCCCCCAAT 1035
Query 994 GATGTGGTGAGCCCATCTGAGTTCAAGACCCAGATCCAGAGATATGCACCGCGCTTTGTTGGCTATAATCAGCA 1067
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||..|.||||||||||||||
Sbjct 1036 GATGTGGTGAGCCCATCTGAGTTCAAGACCCAGATCCAGAGATATGCGCCACGCTTCATGGGCTATAATCAGCA 1109
Query 1068 GGATGCTCAGGAGTTCCTTCGCTTTCTTCTGGATGGGCTCCATAACGAGGTGAACCGAGTGACACTGAGACCTA 1141
||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||.|||.||...||.||||
Sbjct 1110 GGATGCTCAGGAATTCCTTCGTTTCCTTCTGGATGGTCTCCACAATGAGGTGAACCGGGTGGCAGCAAGGCCTA 1183
Query 1142 AGTCCAACCCTGAGAACCTCGATCATCTTCCTGATGACGAGAAAGGCCGACAGATGTGGAGAAAATATCTAGAA 1215
||.|||.||||||||.|||.||||||||.||||||||.||.||.||.||||||||||||||.||.|||||.|||
Sbjct 1184 AGGCCAGCCCTGAGACCCTTGATCATCTCCCTGATGAAGAAAAGGGGCGACAGATGTGGAGGAAGTATCTGGAA 1257
Query 1216 CGGGAAGACAGTAGGATCGGGGATCTCTTTGTTGGGCAGCTAAAGAGCTCGCTGACGTGTACAGATTGTGGTTA 1289
.|||||||||||.||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||.||.||.||||||||.||
Sbjct 1258 AGGGAAGACAGTCGGATTGGGGATCTCTTCGTTGGGCAGCTGAAGAGCTCCCTCACATGCACCGATTGTGGCTA 1331
Query 1290 CTGTTCTACGGTCTTCGACCCCTTCTGGGACCTCTCACTGCCCAT----------TGCTAAGC----------- 1342
|||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||..||||||| ||||.|||
Sbjct 1332 CTGCTCTACAGTCTTCGATCCCTTCTGGGATCTCTCGTTGCCCATCGCAAAGGTATGCTCAGCTGTGGTCCCCA 1405
Query 1343 ------------------------------------------------------------------GAGGTTAT 1350
|||||||.
Sbjct 1406 CTTCAGCATTGCGCTCGGGGCTCAGTGAGGTCGTGACCTCTGACCTGGACCCTTTTCCTTTGCAGAGAGGTTAC 1479
Query 1351 CCTGAGGTGACATTAATGGACTGCATGAGGCTCTTCACCAAAGAGGATGTGCTTGATGGAGATGAAAAGCCAAC 1424
|||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||..|..|.|||||.|||||.||||||||
Sbjct 1480 CCTGAGGTGACGTTAATGGATTGTATGAGGCTCTTCACCAAAGAGGACATATTGGATGGTGATGAGAAGCCAAC 1553
Query 1425 ATGCTGTCGCTGCCGAGGCAGAAAACGGTGTATAAAGAAGTTCTCCATCCAGAGGTTCCCAAAGATCTTGGTGC 1498
.|||||.||||||||||.|||||||||.||.|||||.||||||||..|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1554 TTGCTGCCGCTGCCGAGCCAGAAAACGATGCATAAAAAAGTTCTCTGTCCAGAGGTTCCCAAAGATCTTGGTGC 1627
Query 1499 TCCATCTGAAGCGGTTCTCAGAATCCAGGATCCGAACCAGCAAGCTCACAACATTTGTGAACTTCCCCCTAAGA 1572
||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1628 TCCACCTGAAGCGATTCTCAGAATCCAGGATACGAACCAGCAAGCTCACAACATTTGTGAATTTCCCACTAAGA 1701
Query 1573 GACCTGGACTTAAGAGAATTTGCCTCAGAAAACACCAACCATGCTGTTTACAACCTGTACGCTGTGTCCAATCA 1646
|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1702 GACCTGGACTTGAGAGAATTTGCTTCAGAAAACACCAACCATGCTGTTTACAACCTGTATGCTGTGTCCAATCA 1775
Query 1647 CTCCGGAACCACCATGGGTGGCCACTATACAGCCTACTGTCGCAGTCCAGGGACAGGAGAATGGCACACTTTCA 1720
||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.|..|||||.||||||||||||||||
Sbjct 1776 CTCCGGAACCACCATGGGAGGCCACTATACAGCCTACTGCCGAAGTCCGGTTACAGGCGAATGGCACACTTTCA 1849
Query 1721 ACGACTCCAGCGTCACTCCCATGTCCTCCAGCCAAGTGCGCACCAGCGACGCCTACCTGCTCTTCTACGAACTG 1794
|.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||.||||||
Sbjct 1850 ATGATTCCAGTGTCACACCCATGTCCTCCAGCCAAGTGCGCACCAGCGACGCCTATTTGCTCTTCTATGAACTG 1923
Query 1795 GCCAGCCCGCCCTCCCGAATGG 1816
|||||.||.||||||||.|||
Sbjct 1924 GCCAGTCCACCCTCCCGTATG- 1944