Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488149
• Subject: XM_017313464.1
• Aligned Length: 1946
• Identities: 1598
• Gaps: 132

Alignment

Query    1  ATGTCCCAGCTCTCCTCCACCCTGAAGCGCTACACAGAATCGGCCCGCTACACAGATGCCCACTATGCCAAGTC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||..|
Sbjct    1  ATGTCCCAGCTCTCCTCCACCCTGAAGCGCTATACAGAATCGTCCCGCTACACAGATGCCCCCTATGCCAAACC  74

Query   75  GGGCTATGGTGCCTACACCCCATCCTCCTATGGGGCCAATCTGGCTGCCTCCTTACTGGAGAAGGAGAAACTTG  148
            |||||||||..||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct   75  GGGCTATGGCACCTACACCCCTTCTTCCTATGGGGCCAACCTGGCCGCCTCCTTCCTGGAGAAGGAAAAACTTG  148

Query  149  GTTTCAAGCCGGTCCCCACCAGCAGCTTCCTCACCCGTCCCCGTACCTATGGCCCCTCCTCCCTCCTGGACTAT  222
            ||||||||||||||.||.|||.||||||||||.|.||.|||||.|||||.||||||||||||.|.|||||||.|
Sbjct  149  GTTTCAAGCCGGTCTCCCCCACCAGCTTCCTCCCACGGCCCCGCACCTACGGCCCCTCCTCCATTCTGGACTGT  222

Query  223  GACCGGGGCCGCCCCCTGCTGAGACCCGACATCACTGGGGGTGGTAAGCGGGCAGAGAGCCAGACCCGGGGTAC  296
            |||.||||||||||||||||||||.|.|||||||.||||.||.||||||||.||||||||||||||||.||.|.
Sbjct  223  GACAGGGGCCGCCCCCTGCTGAGATCTGACATCATTGGGAGTAGTAAGCGGTCAGAGAGCCAGACCCGTGGCAA  296

Query  297  TGAGCGGCCTTTAGGCAGTGGCCTCAGCGGGGGCAGCGGATTCCCTTATGGAGTGACCAACAACTGCCTCAGCT  370
            |||..||||.|..||||||||.||||.|||.|||||.|||||..||||||||||..|||.|||||.||||||||
Sbjct  297  TGAAAGGCCCTCGGGCAGTGGACTCAACGGAGGCAGTGGATTTTCTTATGGAGTTTCCAGCAACTCCCTCAGCT  370

Query  371  ACCTGCCCATCAATGCCTATGACCAGGGGGTGACCCTAACCCAGAAG----CTGGACAGCCAATCAGACCTGGC  440
            ||||||||||.||||||...|||||||||||||||||.|.|||||||    | |.|||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACCTGCCCATGAATGCCAGAGACCAGGGGGTGACCCTGAGCCAGAAGAAATC-GAACAGCCAATCAGACCTGGC  443

Query  441  CCGGGATTTCTCCAGCCTCCGGACCTCAGATAGCTACC------------------------------------  478
            ||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||                                    
Sbjct  444  CCGGGATTTCTCCAGCCTCCGGACTTCAGATGGCTACCGGACTTCAGATGGCTACCGGACCTCAGAGGGCTTTA  517

Query  479  GGATAGACCCCAGGAACCTGGGCCGCAGCCCCATGCTGGCCCGGACGCGCAAGGAGCTCTGCACCCTGCAGGGG  552
            ||||||||||..|.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||..||||||||||.
Sbjct  518  GGATAGACCCTGGAAACCTGGGTCGCAGCCCCATGCTGGCCCGCACGCGTAAGGAGCTCTGTGCCCTGCAGGGC  591

Query  553  CTCTACCAGACAGCCAGCTGCCCTGAATACCTGGTCGACTACCTGGAGAACTATGGTCGCAAGGGCAGTGCATC  626
            ||||||||..||||||||.|..||||.|||||....|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||.|
Sbjct  592  CTCTACCAAGCAGCCAGCCGTTCTGAGTACCTAACAGACTATCTGGAGAACTATGGTCGAAAGGGCAGTGCACC  665

Query  627  TCAGGTGCCCTCCCAGGCC---CCTCCCTCACGAGTCCCTGAAATCATCAGCCCAACCTACCGACCCATTGGCC  697
            .|||||||.|.|.||.|||   ||||||||.||||||||||||.||.||||.||.|||||||||||.|.|||||
Sbjct  666  ACAGGTGCTCACGCAAGCCCCTCCTCCCTCCCGAGTCCCTGAAGTCCTCAGTCCCACCTACCGACCAAGTGGCC  739

Query  698  GCTACACGCTGTGGGAGACGGGAAAGGGTCAGGCCCCTGGGCCCAGCCGCTCCAGCTCCCCGGGAAGAGACGGC  771
            |.|||||.||||||||||.|.|.|||||.||||||.|||||||||||||||||||.||.||.||..|||||..|
Sbjct  740  GTTACACACTGTGGGAGAAGAGCAAGGGCCAGGCCTCTGGGCCCAGCCGCTCCAGTTCTCCAGGGCGAGACACC  813

Query  772  ATGAATTCTAAGAGTGCCCAGGGTCTGGCTGGTCTTCGAAACCTTGGGAACACGTGCTTCATGAACTCAATTCT  845
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  814  ATGAATTCAAAGAGTGCCCAGGGTCTGGCTGGTCTTCGAAACCTTGGGAACACGTGCTTCATGAACTCAATTCT  887

Query  846  GCAGTGCCTGAGCAACACTCGGGAGTTGAGAGATTACTGCCTCCAGAGGCTCTACATGCGGGACCTGCACCACG  919
            .|||||||||||||||||.||.|||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||...||||.
Sbjct  888  TCAGTGCCTGAGCAACACCCGAGAGCTGAGAGATTACTGCCTCCAGAGGCTGTACATGCGGGACCTCGGCCACA  961

Query  920  GCAGCAATGCACACACAGCCCTCGTGGAAGAGTTTGCAAAACTAATTCAGACCATATGGACTTCATCCCCCAAT  993
            .|||||..||.|||||.||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct  962  CCAGCAGCGCTCACACGGCCCTCATGGAAGAGTTTGCAAAACTAATCCAGACCATATGGACGTCGTCCCCCAAT  1035

Query  994  GATGTGGTGAGCCCATCTGAGTTCAAGACCCAGATCCAGAGATATGCACCGCGCTTTGTTGGCTATAATCAGCA  1067
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||..|.||||||||||||||
Sbjct 1036  GATGTGGTGAGCCCATCTGAGTTCAAGACCCAGATCCAGAGATATGCGCCACGCTTCATGGGCTATAATCAGCA  1109

Query 1068  GGATGCTCAGGAGTTCCTTCGCTTTCTTCTGGATGGGCTCCATAACGAGGTGAACCGAGTGACACTGAGACCTA  1141
            ||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||.|||.||...||.||||
Sbjct 1110  GGATGCTCAGGAATTCCTTCGTTTCCTTCTGGATGGTCTCCACAATGAGGTGAACCGGGTGGCAGCAAGGCCTA  1183

Query 1142  AGTCCAACCCTGAGAACCTCGATCATCTTCCTGATGACGAGAAAGGCCGACAGATGTGGAGAAAATATCTAGAA  1215
            ||.|||.||||||||.|||.||||||||.||||||||.||.||.||.||||||||||||||.||.|||||.|||
Sbjct 1184  AGGCCAGCCCTGAGACCCTTGATCATCTCCCTGATGAAGAAAAGGGGCGACAGATGTGGAGGAAGTATCTGGAA  1257

Query 1216  CGGGAAGACAGTAGGATCGGGGATCTCTTTGTTGGGCAGCTAAAGAGCTCGCTGACGTGTACAGATTGTGGTTA  1289
            .|||||||||||.||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||.||.||.||||||||.||
Sbjct 1258  AGGGAAGACAGTCGGATTGGGGATCTCTTCGTTGGGCAGCTGAAGAGCTCCCTCACATGCACCGATTGTGGCTA  1331

Query 1290  CTGTTCTACGGTCTTCGACCCCTTCTGGGACCTCTCACTGCCCAT----------TGCTAAGC-----------  1342
            |||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||..|||||||          ||||.|||           
Sbjct 1332  CTGCTCTACAGTCTTCGATCCCTTCTGGGATCTCTCGTTGCCCATCGCAAAGGTATGCTCAGCTGTGGTCCCCA  1405

Query 1343  ------------------------------------------------------------------GAGGTTAT  1350
                                                                              |||||||.
Sbjct 1406  CTTCAGCATTGCGCTCGGGGCTCAGTGAGGTCGTGACCTCTGACCTGGACCCTTTTCCTTTGCAGAGAGGTTAC  1479

Query 1351  CCTGAGGTGACATTAATGGACTGCATGAGGCTCTTCACCAAAGAGGATGTGCTTGATGGAGATGAAAAGCCAAC  1424
            |||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||..|..|.|||||.|||||.||||||||
Sbjct 1480  CCTGAGGTGACGTTAATGGATTGTATGAGGCTCTTCACCAAAGAGGACATATTGGATGGTGATGAGAAGCCAAC  1553

Query 1425  ATGCTGTCGCTGCCGAGGCAGAAAACGGTGTATAAAGAAGTTCTCCATCCAGAGGTTCCCAAAGATCTTGGTGC  1498
            .|||||.||||||||||.|||||||||.||.|||||.||||||||..|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1554  TTGCTGCCGCTGCCGAGCCAGAAAACGATGCATAAAAAAGTTCTCTGTCCAGAGGTTCCCAAAGATCTTGGTGC  1627

Query 1499  TCCATCTGAAGCGGTTCTCAGAATCCAGGATCCGAACCAGCAAGCTCACAACATTTGTGAACTTCCCCCTAAGA  1572
            ||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1628  TCCACCTGAAGCGATTCTCAGAATCCAGGATACGAACCAGCAAGCTCACAACATTTGTGAATTTCCCACTAAGA  1701

Query 1573  GACCTGGACTTAAGAGAATTTGCCTCAGAAAACACCAACCATGCTGTTTACAACCTGTACGCTGTGTCCAATCA  1646
            |||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1702  GACCTGGACTTGAGAGAATTTGCTTCAGAAAACACCAACCATGCTGTTTACAACCTGTATGCTGTGTCCAATCA  1775

Query 1647  CTCCGGAACCACCATGGGTGGCCACTATACAGCCTACTGTCGCAGTCCAGGGACAGGAGAATGGCACACTTTCA  1720
            ||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.|..|||||.||||||||||||||||
Sbjct 1776  CTCCGGAACCACCATGGGAGGCCACTATACAGCCTACTGCCGAAGTCCGGTTACAGGCGAATGGCACACTTTCA  1849

Query 1721  ACGACTCCAGCGTCACTCCCATGTCCTCCAGCCAAGTGCGCACCAGCGACGCCTACCTGCTCTTCTACGAACTG  1794
            |.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||.||||||
Sbjct 1850  ATGATTCCAGTGTCACACCCATGTCCTCCAGCCAAGTGCGCACCAGCGACGCCTATTTGCTCTTCTATGAACTG  1923

Query 1795  GCCAGCCCGCCCTCCCGAATGG  1816
            |||||.||.||||||||.||| 
Sbjct 1924  GCCAGTCCACCCTCCCGTATG-  1944