Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488160
• Subject: XM_005264716.3
• Aligned Length: 2949
• Identities: 2753
• Gaps: 195

Alignment

Query    1  ATGGATTGTCAGCTCTCCATCCTCCTCCTTCTCAGCTGCTCTGTTCTCGACAGCTTCGGGGAACTGATTCCGCA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGATTGTCAGCTCTCCATCCTCCTCCTTCTCAGCTGCTCTGTTCTCGACAGCTTCGGGGAACTGATTCCGCA  74

Query   75  GCCTTCCAATGAAGTCAATCTACTGGATTCAAAAACAATTCAAGGGGAGCTGGGCTGGATCTCTTATCCATCAC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCCTTCCAATGAAGTCAATCTACTGGATTCAAAAACAATTCAAGGGGAGCTGGGCTGGATCTCTTATCCATCAC  148

Query  149  ATGGGTGGGAAGAGATCAGTGGTGTGGATGAACATTACACACCCATCAGGACTTACCAGGTGTGCAATGTCATG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATGGGTGGGAAGAGATCAGTGGTGTGGATGAACATTACACACCCATCAGGACTTACCAGGTGTGCAATGTCATG  222

Query  223  GACCACAGTCAAAACAATTGGCTGAGAACAAACTGGGTCCCCAGGAACTCAGCTCAGAAGATTTATGTGGAGCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GACCACAGTCAAAACAATTGGCTGAGAACAAACTGGGTCCCCAGGAACTCAGCTCAGAAGATTTATGTGGAGCT  296

Query  297  CAAGTTCACTCTACGAGACTGCAATAGCATTCCATTGGTTTTAGGAACTTGCAAGGAGACATTCAACCTGTACT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CAAGTTCACTCTACGAGACTGCAATAGCATTCCATTGGTTTTAGGAACTTGCAAGGAGACATTCAACCTGTACT  370

Query  371  ACATGGAGTCTGATGATGATCATGGGGTGAAATTTCGAGAGCATCAGTTTACAAAGATTGACACCATTGCAGCT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACATGGAGTCTGATGATGATCATGGGGTGAAATTTCGAGAGCATCAGTTTACAAAGATTGACACCATTGCAGCT  444

Query  445  GATGAAAGTTTCACTCAAATGGATCTTGGGGACCGTATTCTGAAGCTCAACACTGAGATTAGAGAAGTAGGTCC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GATGAAAGTTTCACTCAAATGGATCTTGGGGACCGTATTCTGAAGCTCAACACTGAGATTAGAGAAGTAGGTCC  518

Query  519  TGTCAACAAGAAGGGATTTTATTTGGCATTTCAAGATGTTGGTGCTTGTGTTGCCTTGGTGTCTGTGAGAGTAT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGTCAACAAGAAGGGATTTTATTTGGCATTTCAAGATGTTGGTGCTTGTGTTGCCTTGGTGTCTGTGAGAGTAT  592

Query  593  ACTTCAAAAAGTGCCCATTTACAGTGAAGAATCTGGCTATGTTTCCAGACACGGTACCCATGGACTCCCAGTCC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACTTCAAAAAGTGCCCATTTACAGTGAAGAATCTGGCTATGTTTCCAGACACGGTACCCATGGACTCCCAGTCC  666

Query  667  CTGGTGGAGGTTAGAGGGTCTTGTGTCAACAATTCTAAGGAGGAAGATCCTCCAAGGATGTACTGCAGTACAGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTGGTGGAGGTTAGAGGGTCTTGTGTCAACAATTCTAAGGAGGAAGATCCTCCAAGGATGTACTGCAGTACAGA  740

Query  741  AGGCGAATGGCTTGTACCCATTGGCAAGTGTTCCTGCAATGCTGGCTATGAAGAAAGAGGTTTTATGTGCCAAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGGCGAATGGCTTGTACCCATTGGCAAGTGTTCCTGCAATGCTGGCTATGAAGAAAGAGGTTTTATGTGCCAAG  814

Query  815  CTTGTCGACCAGGTTTCTACAAGGCATTGGATGGTAATATGAAGTGTGCTAAGTGCCCGCCTCACAGTTCTACT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTTGTCGACCAGGTTTCTACAAGGCATTGGATGGTAATATGAAGTGTGCTAAGTGCCCGCCTCACAGTTCTACT  888

Query  889  CAGGAAGATGGTTCAATGAACTGCAGGTGTGAGAATAATTACTTCCGGGCAGACAAAGACCCTCCATCCATGGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CAGGAAGATGGTTCAATGAACTGCAGGTGTGAGAATAATTACTTCCGGGCAGACAAAGACCCTCCATCCATGGC  962

Query  963  TTGTACCCGACCTCCATCTTCACCAAGAAATGTTATCTCTAATATAAACGAGACCTCAGTTATCCTGGACTGGA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TTGTACCCGACCTCCATCTTCACCAAGAAATGTTATCTCTAATATAAACGAGACCTCAGTTATCCTGGACTGGA  1036

Query 1037  GTTGGCCCCTGGACACAGGAGGCCGGAAAGATGTTACCTTCAACATCATATGTAAAAAATGTGGGTGGAATATA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GTTGGCCCCTGGACACAGGAGGCCGGAAAGATGTTACCTTCAACATCATATGTAAAAAATGTGGGTGGAATATA  1110

Query 1111  AAACAGTGTGAGCCATGCAGCCCAAATGTCCGCTTCCTCCCTCGACAGTTTGGACTCACCAACACCACGGTGAC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AAACAGTGTGAGCCATGCAGCCCAAATGTCCGCTTCCTCCCTCGACAGTTTGGACTCACCAACACCACGGTGAC  1184

Query 1185  AGTGACAGACCTTCTGGCACATACTAACTACACCTTTGAGATTGATGCCGTTAATGGGGTGTCAGAGCTGAGCT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AGTGACAGACCTTCTGGCACATACTAACTACACCTTTGAGATTGATGCCGTTAATGGGGTGTCAGAGCTGAGCT  1258

Query 1259  CCCCACCAAGACAGTTTGCTGCGGTCAGCATCACAACTAATCAGGCTGCTCCATCACCTGTCCTGACGATTAAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CCCCACCAAGACAGTTTGCTGCGGTCAGCATCACAACTAATCAGGCTGCTCCATCACCTGTCCTGACGATTAAG  1332

Query 1333  AAAGATCGGACCTCCAGAAATAGCATCTCTTTGTCCTGGCAAGAACCTGAACATCCTAATGGGATCATATTGGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AAAGATCGGACCTCCAGAAATAGCATCTCTTTGTCCTGGCAAGAACCTGAACATCCTAATGGGATCATATTGGA  1406

Query 1407  CTACGAGGTCAAATACTATGAAAAGCAGGAACAAGAAACAAGTTATACCATTCTGAGGGCAAGAGGCACAAATG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CTACGAGGTCAAATACTATGAAAAGCAGGAACAAGAAACAAGTTATACCATTCTGAGGGCAAGAGGCACAAATG  1480

Query 1481  TTACCATCAGTAGCCTCAAGCCTGACACTATATACGTATTCCAAATCCGAGCCCGAACAGCCGCTGGATATGGG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TTACCATCAGTAGCCTCAAGCCTGACACTATATACGTATTCCAAATCCGAGCCCGAACAGCCGCTGGATATGGG  1554

Query 1555  ACGAACAGCCGCAAGTTTGAGTTTGAAACTAGTCCAGACTCTTTCTCCATCTCTGGTGAAAGTAGCCAAGTGGT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  ACGAACAGCCGCAAGTTTGAGTTTGAAACTAGTCCAGACTCTTTCTCCATCTCTGGTGAAAGTAGCCAAGTGGT  1628

Query 1629  CATGATCGCCATTTCAGCGGCAGTAGCAATTATTCTCCTCACTGTTGTCATCTATGTTTTGATTGGGAGGTTCT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CATGATCGCCATTTCAGCGGCAGTAGCAATTATTCTCCTCACTGTTGTCATCTATGTTTTGATTGGGAGGTTCT  1702

Query 1703  GTGGCTATAAGTCAAAACATGGGGCAGATGAAAAAAGACTTCATTTTGGCAATGGGCATTTAAAACTTCCAGGT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GTGGCTATAAGTCAAAACATGGGGCAGATGAAAAAAGACTTCATTTTGGCAATGGGCATTTAAAACTTCCAGGT  1776

Query 1777  CTCAGGACTTATGTTGACCCACATACATATGAAGACCCTACCCAAGCTGTTCATGAGTTTGCCAAGGAATTGGA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CTCAGGACTTATGTTGACCCACATACATATGAAGACCCTACCCAAGCTGTTCATGAGTTTGCCAAGGAATTGGA  1850

Query 1851  TGCCACCAACATATCCATTGATAAAGTTGTTGGAGCAGGTGAATTTGGAGAGGTGTGCAGTGGTCGCTTAAAAC  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  TGCCACCAACATATCCATTGATAAAGTTGTTGGAGCAGGTGAATTTGGAGAGGTGTGCAGTGGTCGCTTAAAAC  1924

Query 1925  TTCCTTCAAAAAAAGAGATTTCAGTGGCCATTAAGACCCTGAAAGTTGGCTACACAGAAAAGCAGAGGAGAGAC  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  TTCCTTCAAAAAAAGAGATTTCAGTGGCCATTAAGACCCTGAAAGTTGGCTACACAGAAAAGCAGAGGAGAGAC  1998

Query 1999  TTCCTGGGAGAAGCAAGCATTATGGGACAGTTTGACCACCCCAATATCATTCGACTGGAAGGAGTTGTTACCAA  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  TTCCTGGGAGAAGCAAGCATTATGGGACAGTTTGACCACCCCAATATCATTCGACTGGAAGGAGTTGTTACCAA  2072

Query 2073  AAGTAAGCCAGTTATGATTGTCACAGAATACATGGAGAATGGTTCCTTGGATAGTTTCCTACGTAAACACGATG  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  AAGTAAGCCAGTTATGATTGTCACAGAATACATGGAGAATGGTTCCTTGGATAGTTTCCTACGTAAACACGATG  2146

Query 2147  CCCAGTTTACTGTCATTCAGCTAGTGGGGATGCTTCGAGGGATAGCATCTGGCATGAAGTACCTGTCAGACATG  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  CCCAGTTTACTGTCATTCAGCTAGTGGGGATGCTTCGAGGGATAGCATCTGGCATGAAGTACCTGTCAGACATG  2220

Query 2221  GGCTATGTTCACCGAGACCTCGCTGCTCGGAACATCTTGATCAACAGTAACTTGGTGTGTAAGGTTTCTGATTT  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  GGCTATGTTCACCGAGACCTCGCTGCTCGGAACATCTTGATCAACAGTAACTTGGTGTGTAAGGTTTCTGATTT  2294

Query 2295  CGGACTTTCGCGTGTCCTGGAGGATGACCCAGAAGCTGCTTATACAACAAGAGGAGGGAAGATCCCAATCAGGT  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  CGGACTTTCGCGTGTCCTGGAGGATGACCCAGAAGCTGCTTATACAACAAGAGGAGGGAAGATCCCAATCAGGT  2368

Query 2369  GGACATCACCAGAAGCTATAGCCTACCGCAAGTTCACGTCAGCCAGCGATGTATGGAGTTATGGGATTGTTCTC  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  GGACATCACCAGAAGCTATAGCCTACCGCAAGTTCACGTCAGCCAGCGATGTATGGAGTTATGGGATTGTTCTC  2442

Query 2443  TGGGAGGTGATGTCTTATGGAGAGAGACCATACTGGGAGATGTCCAATCAGGATGTAATTAAAGCTGTAGATGA  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  TGGGAGGTGATGTCTTATGGAGAGAGACCATACTGGGAGATGTCCAATCAGGATGTAATTAAAGCTGTAGATGA  2516

Query 2517  GGGCTATCGACTGCCACCCCCCATGGACTGCCCAGCTGCCTTGTATCAGCTGATGCTGGACTGCTGGCAGAAAG  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  GGGCTATCGACTGCCACCCCCCATGGACTGCCCAGCTGCCTTGTATCAGCTGATGCTGGACTGCTGGCAGAAAG  2590

Query 2591  ACAGGAACAACAGACCCAAGTTTGAGCAGATTGTTAGTATTCTGGACAAGCTTATCCGGAATCCCGGCAGCCTG  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  ACAGGAACAACAGACCCAAGTTTGAGCAGATTGTTAGTATTCTGGACAAGCTTATCCGGAATCCCGGCAGCCTG  2664

Query 2665  AAGATCATCACCAGTGCAGCCGCAAGGCCATCAAACCTTCTTCTGGACCAAAGCAATGTGGATATCACTACCTT  2738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  AAGATCATCACCAGTGCAGCCGCAAGGCCATCAAACCTTCTTCTGGACCAAAGCAATGTGGATATCACTACCTT  2738

Query 2739  CCGCACAACAGGTGACTGGCTTAATGGTGTCTGGACAGCACACTGCAAGGAAATCTTCACGGGTGTGGAGTACA  2812
            |||||||||| |||||.                                                         
Sbjct 2739  CCGCACAACA-GTGACA---------------------------------------------------------  2754

Query 2813  GTTCTTGTGACACAATAGCCAAGATTTCCACAGATGACATGAAAAAGGTTGGTGTCACCGTGGTTGGGCCACAG  2886
                                                                                      
Sbjct 2755  --------------------------------------------------------------------------  2754

Query 2887  AAGAAGATCATCAGTAGCATTAAAGCTCTAGAAACGCAATCAAAGAATGGCCCAGTTCCCGTG  2949
                                                                           
Sbjct 2755  ---------------------------------------------------------------  2754