Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488203
• Subject: XM_006508167.3
• Aligned Length: 1221
• Identities: 1094
• Gaps: 6

Alignment

Query    1  ATGACGCTGGACGTGGGGCCGGAGGATGAGCTGCCCGACTGGGCCGCCGCCAAAGAGTTTTACCAGAAGTACGA  74
            ||||||.||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGACGTTGGACGTGGGGCCGGAGGATGAACTCCCTGACTGGGCTGCGGCCAAAGAGTTTTACCAGAAGTACGA  74

Query   75  CCCTAAGGACGTCATCGGCAGAGGAGTGAGCTCTGTGGTCCGCCGTTGTGTTCATCGAGCTACTGGCCACGAGT  148
            ||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||..|.||||
Sbjct   75  CCCTAAGGACATCATTGGCAGAGGAGTGAGCTCTGTGGTCCGCCGCTGTGTCCATCGAGCTACCGGTGATGAGT  148

Query  149  TTGCGGTGAAGATTATGGAAGTGACAGCTGAGCGGCTGAGTCCTGAGCAGCTGGAGGAGGTGCGGGAAGCCACA  222
            |.||.||||||||.|||||.|||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  149  TCGCAGTGAAGATCATGGAGGTGTCAGCTGAGCGGCTGAGTCTTGAGCAGCTGGAGGAGGTGCGGGATGCCACA  222

Query  223  CGGCGAGAGACACACATCCTTCGCCAGGTCGCCGGCCACCCCCACATCATCACCCTCATCGATTCCTACGAGTC  296
            ||||||||||..|||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CGGCGAGAGATGCACATTCTTCGCCAGGTCGCTGGCCACCCCCATATCATCACCCTCATCGATTCCTACGAGTC  296

Query  297  TTCTAGCTTCATGTTCCTGGTGTTTGACCTGATGCGGAAGGGAGAGCTGTTTGACTATCTCACAGAGAAGGTGG  370
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct  297  TTCTAGCTTCATGTTCCTGGTGTTTGACCTGATGCGGAAAGGAGAGCTGTTTGACTATCTCACCGAGAAAGTGG  370

Query  371  CCCTCTCTGAAAAGGAAACCAGGTCCATCATGCGGTCTCTGCTGGAAGCAGTGAGCTTTCTCCATGCCAACAAC  444
            |||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCCTCTCAGAAAAGGAAACCAGGTCCATCATGAGGTCTCTACTGGAAGCAGTGAGCTTTCTCCATGCCAACAAC  444

Query  445  ATTGTGCATCGAGATCTGAAGCCCGAGAATATTCTCCTAGATGACAATATGCAGATCCGACTTTCAGATTTCGG  518
            |||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||
Sbjct  445  ATTGTACATCGAGACCTGAAGCCTGAGAATATTCTCCTAGATGACAATATGCAGATACGCCTTTCAGATTTTGG  518

Query  519  GTTCTCCTGCCACTTGGAACCTGGCGAGAAGCTTCGAGAGTTGTGTGGGACCCCAGGGTATCTAGCGCCAGAGA  592
            ||||||||||||.||||||.|||||||||||||||||||..||||.|||||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct  519  GTTCTCCTGCCATTTGGAAGCTGGCGAGAAGCTTCGAGAACTGTGCGGGACTCCAGGGTATCTAGCACCAGAGA  592

Query  593  TCCTTAAATGCTCCATGGATGAAACCCACCCAGGCTATGGCAAGGAGGTCGACCTCTGGGCCTGTGGGGTGATC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||
Sbjct  593  TCCTTAAATGCTCCATGGATGAAACCCACCCAGGCTATGGCAAGGAAGTTGATCTCTGGGCTTGTGGGGTGATC  666

Query  667  TTGTTCACACTCCTGGCTGGCTCGCCACCCTTCTGGCACCGGCGGCAGATCCTGATGTTACGCATGATCATGGA  740
            .||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  667  CTGTTCACACTTCTGGCTGGCTCACCACCATTCTGGCACCGGCGCCAAATCCTGATGCTACGCATGATCATGGA  740

Query  741  GGGCCAGTACCAGTTCAGTTCCCCCGAGTGGGATGACCGTTCCAGCACTGTCAAAGACCTGATCTCCAGGCTGC  814
            .|||||.||.|||||.|.|||.||.|||||||||||.|||||.|.|||.|||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  741  AGGCCAATATCAGTTTACTTCACCTGAGTGGGATGATCGTTCAAACACCGTCAAAGACCTGATCTCCAAGCTGC  814

Query  815  TGCAGGTGGATCCTGAGGCACGCCTGACAGCTGAGCAGGCCCTACAGCACCCCTTCTTTGAGCGTTGTGAAGGC  888
            ||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  815  TGCAGGTGGATCCTGAAGCGCGCCTGACAGCTGAGCAAGCCCTGCAGCACCCCTTCTTTGAGCGCTGTGAAGGC  888

Query  889  AGCCAACCCTGGAACCTCACCCCCCGCCAGCGGTTCCGGGTGGCAGTGTGGACAGTGCTGGCTGCTGGACGAGT  962
            ||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||.||||||||
Sbjct  889  AGCCAACCTTGGAACCTCACGCCTCGCCAGCGGTTCCGGGTGGCAGTGTGGACAATACTGGCTGCCGGACGAGT  962

Query  963  GGCCCTAAGCACCCATCGTGTACGGCCACTGACCAAGAATGCACTGTTGAGGGACCCTTATGCGCTGCGGTCAG  1036
            ||||.||||||..||.|||.||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||.|||
Sbjct  963  GGCCTTAAGCAGTCACCGTTTACGGCCACTAACTAAGAATGCACTATTGAGAGACCCCTATGCACTGCGGCCAG  1036

Query 1037  TGCGGCACCTCATCGACAACTGTGCCTTCCGGCTCTACGGGCACTGGGTAAAGAAAGGGGAGCAGCAGAACCGG  1110
            |.||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 1037  TACGGCGCCTCATCGACAACTGTGCCTTCCGGCTCTATGGGCACTGGGTAAAGAAGGGTGAGCAGCAGAACCGG  1110

Query 1111  GCGGCTCTCTTTCAGCACCGGCCCCCTGGGCCTTTTCCCATCATGG--GCC-CTGAAGAGGAGGGAGACTCTGC  1181
            ||.||.|||||.|||||||.|||.|||.|| ||.|||||  |||.|  ||| |||||...||.||||||||.|.
Sbjct 1111  GCAGCCCTCTTCCAGCACCAGCCTCCTAGG-CTGTTCCC--CATTGCTGCCACTGAACTCGAAGGAGACTCCGG  1181

Query 1182  TGCTATAACTGAGGATGAGGCCGTGCTTGTGCTGGGC  1218
            |||.||.||.|||||||||||....||.||.|.|.||
Sbjct 1182  TGCCATCACAGAGGATGAGGCTACACTGGTACGGAGC  1218