Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488213
• Subject: XM_006712195.3
• Aligned Length: 1313
• Identities: 975
• Gaps: 306

Alignment

Query    1  ---------------------------------------------------------------------ATGGC  5
                                                                                 |||||
Sbjct    1  ATGACTCCTCTCTGCCTCAATTGCTCTGTCCTCCCTGGAGACCTGTACCCAGGGGGTGCAAGGAACCCCATGGC  74

Query    6  TTGCAATGGCAGTGCGGCCAGGGGGCACTTTGACCCTGAGGACTTGAACCTGACTGACGAGGCACTGAGACTCA  79
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TTGCAATGGCAGTGCGGCCAGGGGGCACTTTGACCCTGAGGACTTGAACCTGACTGACGAGGCACTGAGACTCA  148

Query   80  AGTACCTGGGGCCCCAGCAGACAGAGCTGTTCATGCCCATCTGTGCCACATACCTGCTGATCTTCGTGGTGGGC  153
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGTACCTGGGGCCCCAGCAGACAGAGCTGTTCATGCCCATCTGTGCCACATACCTGCTGATCTTCGTGGTGGGC  222

Query  154  GCTGTGGGCAATGGGCTGACCTGTCTGGTCATCCTGCGCCACAAGGCCATGCGCACGCCTACCAACTACTACCT  227
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCTGTGGGCAATGGGCTGACCTGTCTGGTCATCCTGCGCCACAAGGCCATGCGCACGCCTACCAACTACTACCT  296

Query  228  CTTCAGCCTGGCCGTGTCGGACCTGCTGGTGCTGCTGGTGGGCCTGCCCCTGGAGCTCTATGAGATGTGGCACA  301
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTTCAGCCTGGCCGTGTCGGACCTGCTGGTGCTGCTGGTGGGCCTGCCCCTGGAGCTCTATGAGATGTGGCACA  370

Query  302  ACTACCCCTTCCTGCTGGGCGTTGGTGGCTGCTATTTCCGCACGCTACTGTTTGAGATGGTCTGCCTGGCCTCA  375
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACTACCCCTTCCTGCTGGGCGTTGGTGGCTGCTATTTCCGCACGCTACTGTTTGAGATGGTCTGCCTGGCCTCA  444

Query  376  GTGCTCAACGTCACTGCCCTGAGCGTGGAACGCTATGTGGCCGTGGTGCACCCACTCCAGGCCAGGTCCATGGT  449
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTGCTCAACGTCACTGCCCTGAGCGTGGAACGCTATGTGGCCGTGGTGCACCCACTCCAGGCCAGGTCCATGGT  518

Query  450  GACGCGGGCCCATGTGCGCCGAGTGCTTGGGGCCGTCTGGGGTCTTGCCATGCTCTGCTCCCTGCCCAACACCA  523
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GACGCGGGCCCATGTGCGCCGAGTGCTTGGGGCCGTCTGGGGTCTTGCCATGCTCTGCTCCCTGCCCAACACCA  592

Query  524  GCCTGCACGGCATCCAGCAGCTGCACGTGCCCTGCCGGGGCCCAGTGCCAGACTCAGCTGTTTGCATGCTGGTC  597
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCCTGCACGGCATCCGGCAGCTGCACGTGCCCTGCCGGGGCCCAGTGCCAGACTCAGCTGTTTGCATGCTGGTC  666

Query  598  CGCCCACGGGCCCTCTACAACATGGTAGTGCAGACCACCGCGCTGCTCTTCTTCTGCCTGCCCATGGCCATCAT  671
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CGCCCACGGGCCCTCTACAACATGGTAGTGCAGACCACCGCGCTGCTCTTCTTCTGCCTGCCCATGGCCATCAT  740

Query  672  GAGCGTGCTCTACCTGCTCATTGGGCTGCGACTGCGGCGGGAGAGGCTGCTGCTCATGCAGGAGGCCAAGGGCA  745
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GAGCGTGCTCTACCTGCTCATTGGGCTGCGACTGCGGCGGGAGAGGCTGCTGCTCATGCAGGAGGCCAAGGGCA  814

Query  746  GGGGCTCTGCAGCAGCCAGGTCCAGATACACCTGCAGGCTCCAGCAGCACGATCGGGGCCGGAGACAAGTGACC  819
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGGGCTCTGCAGCAGCCAGGTCCAGATACACCTGCAGGCTCCAGCAGCACGATCGGGGCCGGAGACAAGTGACC  888

Query  820  AAGATGCTGTTTGTCCTGGT------CGTGGTGTTTGGCATCTGCTGGGCCCCGTTCCACGCCGACCGCGTCAT  887
            ||||||||||...|||.|||      ||    |.||    |||       |||..||||           ||| 
Sbjct  889  AAGATGCTGTACTTCCAGGTTCTAGACG----GCTT----TCT-------CCCAATCCA-----------TCA-  935

Query  888  GTGGAGCGTCGTGTCACAGTGGACAGATGGCCTGCACCTGGCCTTCCAGCACGTGCACGTC-------ATCTCC  954
                                         ||||        |||...|||   |.|||.||       ||| ||
Sbjct  936  -----------------------------GCCT--------CCTCTGAGC---TTCACTTCTTTTCTGATC-CC  968

Query  955  GGCATC--TTCTTCTACCTGGGCTCGGCGGCCAACCCCGTGCTCTATAGCCTCATGTCCAGCCGCTTCC-GAGA  1025
            ..||||  |||.||||||                         |||    ||| || |||||  .|||| ||| 
Sbjct  969  ACCATCAGTTCATCTACC-------------------------CTA----CTC-TG-CCAGC--GTTCCTGAG-  1008

Query 1026  GACCTTCCAGGAGGCCCTGTGCCTCGGGGCCTG--------CTGCCATCGCCTCAGAC-CCCGCCACAGCTCCC  1090
                                     ||||  ||        |||           ||| |.|.||||.|||..|
Sbjct 1009  -------------------------GGGG--TGAAAGAGTTCTG-----------GACACTCTCCACTGCTGAC  1044

Query 1091  ACAGCCTC-------AGCAGGAT-GACCACAGGCAGCACCCTGTGTGATGTGGGCTCCCTGGGCAGCTGGGTCC  1156
            |     ||       | ||.||| |||||     |||                          ||||||||| .
Sbjct 1045  A-----TCTATTGGTA-CATGATGGACCA-----AGC--------------------------CAGCTGGGT-G  1080

Query 1157  ACCCCCTGGCTGGGAACGATGGCCCAG-AGGCGCAGCAAGAGACCGATCCATCCG  1210
            ||||          ||||..||.||.| |...|.||||||               
Sbjct 1081  ACCC----------AACGTGGGACCTGTATCTGGAGCAAG---------------  1110