Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488235
• Subject: XM_011247475.1
• Aligned Length: 1016
• Identities: 853
• Gaps: 39

Alignment

Query    1  ATGAACAACAATACAACATGTATTCAACCATCTATGATCTCTTCCATGGCTTTACCAATCATTTACATCCTCCT  74
            ||||..||.||..|.|||||.|||||||||||..||||.|||.|||..||||||||..|||.|||||||.|  |
Sbjct    1  ATGACTAATAACTCGACATGCATTCAACCATCCGTGATTTCTACCACAGCTTTACCGGTCACTTACATCTT--T  72

Query   75  TTG--TATTGTTGGTGTTTTTGGAAACACTCTCTCTCAATGGATATTTTTAACAAAAATAGGTAAAAAAACATC  146
            |||  ||||.|||||.|.|||||||||.|.||..||||.|||.||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct   73  TTGTTTATTATTGGTCTCTTTGGAAACTCACTTGCTCAGTGGGTATTTTTAACAAAAATAGGTAAGAAAACATC  146

Query  147  AACGCACATCTACCTGTCACACCTTGTGACTGCAAACTTACTTGTGTGCAGTGCCATGCCTTTCATGAGTATCT  220
            |||.||.||||||.||.||.|.||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||.||||.|
Sbjct  147  AACACATATCTACTTGGCAAATCTTGTGACTGCAAACTTACTTGTGTGCACTGCTATGCCTTTCATGGGTATAT  220

Query  221  ATTTCCTGAAAGGTTTCCAATGGGAATATCAATCTGCTCAATGCAGAGTGGTCAATTTTCTGGGAACTCTATCC  294
            |||||.|||.||||||..|.|||.||||||||||||..|||||||||.|||||||||||.||||||||||.||.
Sbjct  221  ATTTCTTGAGAGGTTTTTATTGGAAATATCAATCTGTACAATGCAGACTGGTCAATTTTTTGGGAACTCTTTCT  294

Query  295  ATGCATGCAAGTATGTTTGTCAGTCTCTTAATTTTAAGTTGGATTGCCATAAGCCGCTATGCTACCTTAATGCA  368
            |||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  295  ATGCATGTAAGTATGTTTGTCAGCCTCTTAATTTTAAGCTGGATTGCCATAAGCCGCTATGCTACCTTAATGAA  368

Query  369  AAAGGATTCCTCGCAAGAGACTACTTCATGCTATGAGAAAATATTTTATGGCCATTTACTGAAAAAATTTCGCC  442
            ||||||.|||..|||||||.|.||.||||||||.||||.|||.||||||||.||..|||||||||.||||||||
Sbjct  369  AAAGGAGTCCAAGCAAGAGGCCACCTCATGCTACGAGAGAATGTTTTATGGTCACGTACTGAAAAGATTTCGCC  442

Query  443  AGCCCAACTTTGCTAGAAAACTATGCATTTACATATGGGGAGTTGTACTGGGCATAATCATTCCAGTTACCGTA  516
            |||||||||||||.||||.|.|.||.||||||||||||||||||||.||.|.||||||.||||||||||||.||
Sbjct  443  AGCCCAACTTTGCCAGAACAATGTGTATTTACATATGGGGAGTTGTGCTTGTCATAATTATTCCAGTTACCCTA  516

Query  517  TACTACTCAGTCATAGAGGCTACAGAAGGAGAAGAGAGCCTATGCTACAATCGGCAGATGGAACTAGGAGCCAT  590
            |||||||||||..|.|||||||||||||.||.|.||||||..|||||||||||||||||||||||.||||||| 
Sbjct  517  TACTACTCAGTAGTCGAGGCTACAGAAGAAGGACAGAGCCAGTGCTACAATCGGCAGATGGAACTGGGAGCCA-  589

Query  591  GATC-TCTCAGATTGCAGGTCTCATTGGAACCACATTTATTGGATTTTCCTTTTTAGTAGTACTAACATCATAC  663
            ||.| |||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.|||||||||
Sbjct  590  GACCTTCTCAGATTGCGGGTCTCATTGGAACCACATTTATTGGATTCTCCTTTTTAGTAGTAGTGACATCATAC  663

Query  664  TACTCTTTTGTAAGCCATCTGAGAAAAATAAGAACCTGTACGTCCATTATGGAGAAAGATTTGACTTACAGTTC  737
            ||.|||.||||.|||||||||.|||.|.||||.||||||||.|||||||..||||||||||||||.|||||.||
Sbjct  664  TATTCTCTTGTCAGCCATCTGCGAAGAGTAAGGACCTGTACCTCCATTACCGAGAAAGATTTGACCTACAGATC  737

Query  738  TGTGAAAAGACATCTTTTGGTCATCCAGATTCTACTAATAGTTTGCTTCCTTCCTTATAGTATTTTTAAACCCA  811
            ||||||||||||.||||||.||||||||.|.||.|||.||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  738  TGTGAAAAGACACCTTTTGATCATCCAGGTCCTCCTAGTAGTTTGCTTTCTTCCATATAGTATTTTTAAACCCA  811

Query  812  TTTTTTATGTTCTACACCAAAGAGATA----ACTGTCAGCAATTGAATTATTTAATAGAAACAAAAAACATTCT  881
            |||||||||||||.|||||.||||| |    ||||||||||..|||||||||||||||||.||||||||||.||
Sbjct  812  TTTTTTATGTTCTGCACCAGAGAGA-AGGAGACTGTCAGCAGCTGAATTATTTAATAGAAGCAAAAAACATCCT  884

Query  882  CACCTGTCTTGCTTCGGCCAGAAGTAGCACAGACCCCATTATATTTCTTTTATTAGATAAAACATTCAAGAAGA  955
            |||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  885  CACTTGTCTTGCATCAGCCAGAAGTAGTACAGACCCCATTATATTTCTTTTATTAGATAAAACATTCAAGAAGA  958

Query  956  CACTATATAATCTCTTTACAAAGTCTAATTCAGCACATATGCAATCATATGGTG  1009
            ||||||||..||||.|||||||.|||                            
Sbjct  959  CACTATATGGTCTCCTTACAAAATCT----------------------------  984