Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488239
• Subject: NM_015529.4
• Aligned Length: 1847
• Identities: 1632
• Gaps: 215

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGTGCTGCTGGCCGCTGCTCCTGCTGTGGGGGCTGCTCCCCGGGACGGCGGCGGGGGGCTCGGGCCGAACCTA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  TCCGCACCGGACCCTCCTGGACTCGGAGGGCAAGTACTGGCTGGGCTGGAGCCAGCGGGGCAGCCAGATCGCCT  148

Query    1  -----------------------------------------------------------ATGGCGTCCGCCGAC  15
                                                                       |||||||||||||||
Sbjct  149  TCCGCCTCCAGGTGCGCACTGCAGGCTACGTGGGCTTCGGCTTCTCGCCCACCGGGGCCATGGCGTCCGCCGAC  222

Query   16  ATCGTCGTGGGCGGGGTGGCCCACGGGCGGCCCTACCTCCAGGATTATTTTACAAATGCAAATAGAGAGTTGAA  89
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATCGTCGTGGGCGGGGTGGCCCACGGGCGGCCCTACCTCCAGGATTATTTTACAAATGCAAATAGAGAGTTGAA  296

Query   90  AAAAGATGCTCAGCAAGATTACCATCTAGAATATGCCATGGAAAATAGCACACACACAATAATTGAATTTACCA  163
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AAAAGATGCTCAGCAAGATTACCATCTAGAATATGCCATGGAAAATAGCACACACACAATAATTGAATTTACCA  370

Query  164  GAGAGCTGCATACATGTGACATAAATGACAAGAGTATAACGGATAGCACTGTGAGAGTGATCTGGGCCTACCAC  237
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GAGAGCTGCATACATGTGACATAAATGACAAGAGTATAACGGATAGCACTGTGAGAGTGATCTGGGCCTACCAC  444

Query  238  CATGAAGATGCAGGAGAAGCTGGTCCCAAGTACCATGACTCCAATAGGGGCACCAAGAGTTTGCGGTTATTGAA  311
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CATGAAGATGCAGGAGAAGCTGGTCCCAAGTACCATGACTCCAATAGGGGCACCAAGAGTTTGCGGTTATTGAA  518

Query  312  TCCTGAGAAAACTAGTGTGCTATCTACAGCCTTACCATACTTTGATCTGGTAAATCAGGACGTCCCCATCCCAA  385
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCCTGAGAAAACTAGTGTGCTATCTACAGCCTTACCATACTTTGATCTGGTAAATCAGGACGTCCCCATCCCAA  592

Query  386  ACAAAGATACAACATATTGGTGCCAAATGTTTAAGATTCCTGTGTTCCAAGAAAAGCATCATGTAATAAAGGTT  459
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACAAAGATACAACATATTGGTGCCAAATGTTTAAGATTCCTGTGTTCCAAGAAAAGCATCATGTAATAAAGGTT  666

Query  460  GAGCCAGTGATACAGAGAGGCCATGAGAGTCTGGTGCACCACATCCTGCTCTATCAGTGCAGCAACAACTTTAA  533
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAGCCAGTGATACAGAGAGGCCATGAGAGTCTGGTGCACCACATCCTGCTCTATCAGTGCAGCAACAACTTTAA  740

Query  534  CGACAGCGTTCTGGAGTCCGGCCACGAGTGCTATCACCCCAACATGCCCGATGCATTCCTCACCTGTGAAACTG  607
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CGACAGCGTTCTGGAGTCCGGCCACGAGTGCTATCACCCCAACATGCCCGATGCATTCCTCACCTGTGAAACTG  814

Query  608  TGATTTTTGCCTGGGCTATTGGTGGAGAGGGCTTTTCTTATCCACCTCATGTTGGATTATCCCTTGGCACTCCA  681
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGATTTTTGCCTGGGCTATTGGTGGAGAGGGCTTTTCTTATCCACCTCATGTTGGATTATCCCTTGGCACTCCA  888

Query  682  TTAGATCCGCATTATGTGCTCCTAGAAGTCCATTATGATAATCCCACTTATGAGGAAGGCTTAATAGATAATTC  755
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TTAGATCCGCATTATGTGCTCCTAGAAGTCCATTATGATAATCCCACTTATGAGGAAGGCTTAATAGATAATTC  962

Query  756  TGGACTGAGGTTATTTTACACAATGGATATAAGGAAATATGATGCTGGGGTGATTGAGGCTGGCCTCTGGGTGA  829
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGGACTGAGGTTATTTTACACAATGGATATAAGGAAATATGATGCTGGGGTGATTGAGGCTGGCCTCTGGGTGA  1036

Query  830  GCCTCTTCCATACCATCCCTCCAGGGATGCCTGAGTTCCAGTCTGAGGGTCACTGCACTTTGGAGTGCCTGGAA  903
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCCTCTTCCATACCATCCCTCCAGGGATGCCTGAGTTCCAGTCTGAGGGTCACTGCACTTTGGAGTGCCTGGAA  1110

Query  904  GAGGCTCTGGAAGCCGAAAAGCCAAGTGGAATTCATGTGTTTGCTGTTCTTCTCCATGCTCACCTGGCTGGCAG  977
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GAGGCTCTGGAAGCCGAAAAGCCAAGTGGAATTCATGTGTTTGCTGTTCTTCTCCATGCTCACCTGGCTGGCAG  1184

Query  978  AGGCATCAGGCTGCGTCATTTTCGAAAAGGGAAGGAAATGAAATTACTTGCCTATGATGATGATTTTGACTTCA  1051
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AGGCATCAGGCTGCGTCATTTTCGAAAAGGGAAGGAAATGAAATTACTTGCCTATGATGATGATTTTGACTTCA  1258

Query 1052  ATTTCCAGGAGTTTCAGTATCTAAAGGAAGAACAAACAATCTTACCAGGAGATAACCTAATTACTGAGTGTCGC  1125
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ATTTCCAGGAGTTTCAGTATCTAAAGGAAGAACAAACAATCTTACCAGGAGATAACCTAATTACTGAGTGTCGC  1332

Query 1126  TACAACACGAAAGATAGAGCTGAGATGACTTGGGGAGGACTAAGCACCAGGAGTGAAATGTGTCTCTCATACCT  1199
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TACAACACGAAAGATAGAGCTGAGATGACTTGGGGAGGACTAAGCACCAGGAGTGAAATGTGTCTCTCATACCT  1406

Query 1200  TCTTTATTACCCAAGAATTAATCTTACTCGATGTGCAAGTATTCCAGACATTATGGAACAACTTCAGTTCATTG  1273
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TCTTTATTACCCAAGAATTAATCTTACTCGATGTGCAAGTATTCCAGACATTATGGAACAACTTCAGTTCATTG  1480

Query 1274  GGGTTAAGGAGATCTACAGACCAGTCACGACCTGGCCTTTCATTATCAAAAGTCCCAAGCAATATAAAAACCTT  1347
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GGGTTAAGGAGATCTACAGACCAGTCACGACCTGGCCTTTCATTATCAAAAGTCCCAAGCAATATAAAAACCTT  1554

Query 1348  TCTTTCATGGATGCTATGAATAAGTTTAAATGGACTAAAAAGGAAGGTCTCTCCTTCAACAAGCTGGTCCTCAG  1421
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TCTTTCATGGATGCTATGAATAAGTTTAAATGGACTAAAAAGGAAGGTCTCTCCTTCAACAAGCTGGTCCTCAG  1628

Query 1422  CCTGCCAGTGAATGTGAGATGTTCCAAGACAGACAATGCTGAGTGGTCGATTCAAGGAATGACAGCATTACCTC  1495
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CCTGCCAGTGAATGTGAGATGTTCCAAGACAGACAATGCTGAGTGGTCGATTCAAGGAATGACAGCATTACCTC  1702

Query 1496  CAGATATAGAAAGACCCTATAAAGCAGAACCTTTGGTGTGTGGCACGTCTTCTTCCTCTTCCCTGCACAGAGAT  1569
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CAGATATAGAAAGACCCTATAAAGCAGAACCTTTGGTGTGTGGCACGTCTTCTTCCTCTTCCCTGCACAGAGAT  1776

Query 1570  TTCTCCATCAACTTGCTTGTTTGCCTTCTGCTACTCAGCTGCACGCTGAGCACCAAGAGCTTGTGAAAGCT  1640
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
Sbjct 1777  TTCTCCATCAACTTGCTTGTTTGCCTTCTGCTACTCAGCTGCACGCTGAGCACCAAGAGCTTG--------  1839