Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000488252
- Subject:
- NM_001346492.2
- Aligned Length:
- 2695
- Identities:
- 2183
- Gaps:
- 511
Alignment
Query 1 ATGCGTAAAGGGGTGCTGAAGGACCCAGAGATTGCCGATCTATTCTACAAAGATGATCCTGAGGAACTTTTTAT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 TGGTTTGCATGAAATTGGACATGGAAGTTTTGGAGCAGTTTATTTTGCTACAAATGCTCACACCAATGAGGTGG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 TGGCAATTAAGAAGATGTCCTATAGTGGGAAGCAGACCCATGAGAAATGGCAAGATATTCTTAAGGAAGTTAAA 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 TTTTTACGACAATTGAAGCATCCTAATACTATTGAGTACAAAGGCTGTTACTTGAAAGAACACACTGCTTGGTT 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 GGTGATGGAATATTGCTTAGGCTCAGCCTCTGATTTATTAGAAGTTCATAAAAAACCACTTCAGGAAGTGGAGA 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 TCGCTGCCATTACTCATGGAGCCTTGCATGGACTAGCCTACCTACATTCTCATGCATTGATTCATAGGGATATT 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 AAAGCAGGAAATATTCTTCTAACAGAGCCAGGTCAGGTAAAACTAGCTGATTTTGGATCTGCTTCAATGGCTTC 518
||||||||
Sbjct 1 ------------------------------------------------------------------ATGGCTTC 8
Query 519 TCCTGCCAACTCCTTCGTGGGCACACCTTACTGGATGGCTCCAGAGGTGATCTTAGCTATGGATGAAGGACAGT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 9 TCCTGCCAACTCCTTCGTGGGCACACCTTACTGGATGGCTCCAGAGGTGATCTTAGCTATGGATGAAGGACAGT 82
Query 593 ATGATGGGAAAGTTGATATTTGGTCACTTGGCATCACTTGTATTGAATTGGCGGAACGGAAGCCGCCCCTTTTC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 83 ATGATGGGAAAGTTGATATTTGGTCACTTGGCATCACTTGTATTGAATTGGCGGAACGGAAGCCGCCCCTTTTC 156
Query 667 AACATGAATGCAATGAGTGCCTTATATCACATTGCCCAGAATGACTCCCCAACGTTACAGTCTAATGAATGGAC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 157 AACATGAATGCAATGAGTGCCTTATATCACATTGCCCAGAATGACTCCCCAACGTTACAGTCTAATGAATGGAC 230
Query 741 AGACTCCTTTAGGAGATTTGTTGATTACTGCTTGCAGAAAATACCTCAGGAAAGGCCAACATCAGCAGAACTAT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 231 AGACTCCTTTAGGAGATTTGTTGATTACTGCTTGCAGAAAATACCTCAGGAAAGGCCAACATCAGCAGAACTAT 304
Query 815 TAAGGCATGACTTTGTTCGACGAGACCGGCCACTACGTGTCCTCATTGACCTCATACAGAGGACAAAAGATGCA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 305 TAAGGCATGACTTTGTTCGACGAGACCGGCCACTACGTGTCCTCATTGACCTCATACAGAGGACAAAAGATGCA 378
Query 889 GTTCGTGAGCTAGATAACCTACAGTACCGAAAAATGAAAAAAATACTTTTCCAAGAGACACGGAATGGACCCTT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 379 GTTCGTGAGCTAGATAACCTACAGTACCGAAAAATGAAAAAAATACTTTTCCAAGAGACACGGAATGGACCCTT 452
Query 963 GAATGAGTCACAGGAGGATGAGGAAGACAGTGAACATGGAACCAGCCTGAACAGGGAAATGGACAGCCTGGGCA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 453 GAATGAGTCACAGGAGGATGAGGAAGACAGTGAACATGGAACCAGCCTGAACAGGGAAATGGACAGCCTGGGCA 526
Query 1037 GCAACCATTCCATTCCAAGCATGTCCGTGAGCACAGGCAGCCAGAGCAGCAGTGTGAACAGCATGCAGGAAGTC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 527 GCAACCATTCCATTCCAAGCATGTCCGTGAGCACAGGCAGCCAGAGCAGCAGTGTGAACAGCATGCAGGAAGTC 600
Query 1111 ATGGACGAGAGCAGTTCCGAACTTGTCATGATGCACGATGACGAAAGCACAATCAATTCCAGCTCCTCCGTCGT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 ATGGACGAGAGCAGTTCCGAACTTGTCATGATGCACGATGACGAAAGCACAATCAATTCCAGCTCCTCCGTCGT 674
Query 1185 GCATAAGAAAGATCATGTATTCATAAGGGATGAGGCGGGCCACGGCAATCCCAGGCCTGAGCCGCGGCCTACCC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 675 GCATAAGAAAGATCATGTATTCATAAGGGATGAGGCGGGCCACGGCGATCCCAGGCCTGAGCCGCGGCCTACCC 748
Query 1259 AGTCAGTTCAGAGCCAGGCCCTCCACTACCGGAACAGAGAGCGCTTTGCCACGATCAAATCAGCATCTTTGGTT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 749 AGTCAGTTCAGAGCCAGGCCCTCCACTACCGGAACAGAGAGCGCTTTGCCACGATCAAATCAGCATCTTTGGTT 822
Query 1333 ACACGACAGATCCATGAGCATGAGCAGGAGAACGAGTTGCGGGAACAGATGTCAGGTTATAAGCGGATGCGGCG 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 823 ACACGACAGATCCATGAGCATGAGCAGGAGAACGAGTTGCGGGAACAGATGTCAGGTTATAAGCGGATGCGGCG 896
Query 1407 CCAGCACCAGAAGCAGCTGATCGCCCTGGAGAACAAGCTGAAGGCTGAGATGGACGAGCACCGCCTCAAGCTAC 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 897 CCAGCACCAGAAGCAGCTGATCGCCCTGGAGAACAAGCTGAAGGCTGAGATGGACGAGCACCGCCTCAAGCTAC 970
Query 1481 AGAAGGAGGTGGAGACGCATGCCAACAACTCGTCCATCGAGCTGGAGAAGCTGGCCAAGAAGCAAGTGGCTATC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 971 AGAAGGAGGTGGAGACGCATGCCAACAACTCGTCCATCGAGCTGGAGAAGCTGGCCAAGAAGCAAGTGGCTATC 1044
Query 1555 ATAGAAAAGGAGGCAAAGGTAGCTGCAGCAGATGAGAAGAAGTTCCAGCAACAGATCTTGGCCCAGCAGAAGAA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1045 ATAGAAAAGGAGGCAAAGGTAGCTGCAGCAGATGAGAAGAAGTTCCAGCAACAGATCTTGGCCCAGCAGAAGAA 1118
Query 1629 AGATTTGACAACTTTCTTAGAAAGTCAGAAGAAGCAGTATAAGATTTGTAAGGAAAAAATAAAAGAGGAAATGA 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1119 AGATTTGACAACTTTCTTAGAAAGTCAGAAGAAGCAGTATAAGATTTGTAAGGAAAAAATAAAAGAGGAAATGA 1192
Query 1703 ATGAGGACCATAGCACACCCAAGAAAGAGAAGCAAGAGCGGATCTCCAAACATAAAGAGAACTTGCAGCACACA 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1193 ATGAGGACCATAGCACACCCAAGAAAGAGAAGCAAGAGCGGATCTCCAAACATAAAGAGAACTTGCAGCACACA 1266
Query 1777 CAGGCTGAAGAGGAAGCCCACCTTCTCACTCAACAGAGACTGTACTACGACAAAAATTGTCGTTTCTTCAAGCG 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1267 CAGGCTGAAGAGGAAGCCCACCTTCTCACTCAACAGAGACTGTACTACGACAAAAATTGTCGTTTCTTCAAGCG 1340
Query 1851 GAAAATAATGATCAAGCGGCACGAGGTGGAGCAGCAGAACATTCGGGAGGAACTAAATAAAAAGAGGACCCAGA 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1341 GAAAATAATGATCAAGCGGCACGAGGTGGAGCAGCAGAACATTCGGGAGGAACTAAATAAAAAGAGGACCCAGA 1414
Query 1925 AGGAGATGGAGCATGCCATGCTAATCCGGCACGACGAGTCCACCCGAGAGCTAGAGTACAGGCAGCTGCACACG 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1415 AGGAGATGGAGCATGCCATGCTAATCCGGCACGACGAGTCCACCCGAGAGCTAGAGTACAGGCAGCTGCACACG 1488
Query 1999 TTACAGAAGCTACGCATGGATCTGATCCGTTTACAGCACCAGACGGAACTGGAAAACCAGCTGGAGTACAATAA 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1489 TTACAGAAGCTACGCATGGATCTGATCCGTTTACAGCACCAGACGGAACTGGAAAACCAGCTGGAGTACAATAA 1562
Query 2073 GAGGCGAGAAAGAGAACTGCACAGAAAGCATGTCATGGAACTTCGGCAACAGCCAAAAAACTTAAAGGCCATGG 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1563 GAGGCGAGAAAGAGAACTGCACAGAAAGCATGTCATGGAACTTCGGCAACAGCCAAAAAACTTAAAGGCCATGG 1636
Query 2147 AAATGCAAATTAAAAAACAGTTTCAGGACACTTGCAAAGTACAGACCAAACAGTATAAAGCACTCAAGAATCAC 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1637 AAATGCAAATTAAAAAACAGTTTCAGGACACTTGCAAAGTACAGACCAAACAGTATAAAGCACTCAAGAATCAC 1710
Query 2221 CAGTTGGAAGTTACTCCAAAGAATGAGCACAAAACAATCTTAAAGACACTGAAAGATGAGCAGACAAGAAAACT 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1711 CAGTTGGAAGTTACTCCAAAGAATGAGCACAAAACAATCTTAAAGACACTGAAAGATGAGCAGACAAGAAAACT 1784
Query 2295 TGCCATTTTGGCAGAGCAGTATGAACAGAGTATAAATGAAATGATGGCCTCTCAAGCGTTACGGCTAGATGAGG 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1785 TGCCATTTTGGCAGAGCAGTATGAACAGAGTATAAATGAAATGATGGCCTCTCAAGCGTTACGGCTAGATGAGG 1858
Query 2369 CTCAAGAAGCAGAATGCCAGGCCTTGAGGCTACAGCTCCAGCAGGAAATGGAGCTGCTCAACGCCTACCAGAGC 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1859 CTCAAGAAGCAGAATGCCAGGCCTTGAGGCTACAGCTCCAGCAGGAAATGGAGCTGCTCAACGCCTACCAGAGC 1932
Query 2443 AAAATCAAGATGCAAACAGAGGCACAACATGAACGTGAGCTCCAGAAGCTAGAGCAGAGAGTGTCTCTGCGCAG 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1933 AAAATCAAGATGCAAACAGAGGCACAACATGAACGTGAGCTCCAGAAGCTAGAGCAGAGAGTGTCTCTGCGCAG 2006
Query 2517 AGCACACCTTGAGCAGAAGATTGAAGAGGAGCTGGCTGCCCTTCAGAAGGAACGCAGCGAGAGAATAAAGAACC 2590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2007 AGCACACCTTGAGCAGAAGATTGAAGAGGAGCTGGCTGCCCTTCAGAAGGAACGCAGCGAGAGAATAAAGAACC 2080
Query 2591 TATTGGAAAGGCAAGAGCGAGAGATTGAAACTTTTGACATGGAGAGCCTCAGAATGGGATTTGGGAATTTGGTT 2664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2081 TATTGGAAAGGCAAGAGCGAGAGATTGAAACTTTTGACATGGAGAGCCTCAGAATGGGATTTGGGAATTTGGTT 2154
Query 2665 ACATTAGATTTTCCTAAGGAGGACTACAGAG 2695
||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2155 ACATTAGATTTTCCTAAGGAGGACTACAGA- 2184