Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488280
• Subject: NM_001291986.2
• Aligned Length: 2403
• Identities: 2042
• Gaps: 360

Alignment

Query    1  ATGCTGCAAAACGTGACTCCCCACAATAAGCTCCCTGGGGAAGGGAATGCAGGGTTGCTGGGGCTGGGCCCAGA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  AGCAGCAGCACCAGGGAAGAGGATTCGAAAACCCTCTCTCTTGTATGAGGGCTTTGAGAGCCCCACAATGGCTT  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CGGTGCCTGCTTTGCAACTTACCCCTGCCAACCCACCACCCCCGGAGGTGTCCAATCCCAAAAAGCCAGGACGA  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GTTACCAACCAGCTGCAATACCTACACAAGGTAGTGATGAAGGCTCTGTGGAAACATCAGTTCGCATGGCCATT  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  CCGGCAGCCTGTGGATGCTGTCAAACTGGGTCTACCGGATTATCACAAAATTATAAAACAGCCTATGGACATGG  370
                                                                            ||||||||||
Sbjct    1  ----------------------------------------------------------------ATGGACATGG  10

Query  371  GTACTATTAAGAGGAGACTTGAAAACAATTATTATTGGGCTGCTTCAGAGTGTATGCAAGATTTTAATACCATG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   11  GTACTATTAAGAGGAGACTTGAAAACAATTATTATTGGGCTGCTTCAGAGTGTATGCAAGATTTTAATACCATG  84

Query  445  TTCACCAACTGTTACATTTACAACAAGCCCACTGATGATATTGTCCTAATGGCACAAACGCTGGAAAAGATATT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   85  TTCACCAACTGTTACATTTACAACAAGCCCACTGATGATATTGTCCTAATGGCACAAACGCTGGAAAAGATATT  158

Query  519  CCTACAGAAGGTTGCATCAATGCCACAAGAAGAACAAGAGCTGGTAGTGACCATCCCTAAGAACAGCCACAAGA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  159  CCTACAGAAGGTTGCATCAATGCCACAAGAAGAACAAGAGCTGGTAGTGACCATCCCTAAGAACAGCCACAAGA  232

Query  593  AGGGGGCCAAGTTGGCAGCGCTCCAGGGTAGTGTTACCAGTGCCCATCAGGTGCCTGCCGTCTCTTCTGTGTCA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  233  AGGGGGCCAAGTTGGCAGCGCTCCAGGGCAGTGTTACCAGTGCCCATCAGGTGCCTGCCGTCTCTTCTGTGTCA  306

Query  667  CACACAGCCCTGTATACTCCTCCACCTGAGATACCTACCACTGTCCTCAACATTCCCCACCCATCAGTCATTTC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  307  CACACAGCCCTGTATACTCCTCCACCTGAGATACCTACCACTGTCCTCAACATTCCCCACCCATCAGTCATTTC  380

Query  741  CTCTCCACTTCTCAAGTCCTTGCACTCTGCTGGACCCCCGCTCCTTGCTGTTACTGCAGCTCCTCCAGCCCAGC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  381  CTCTCCACTTCTCAAGTCCTTGCACTCTGCTGGACCCCCGCTCCTTGCTGTTACTGCAGCTCCTCCAGCCCAGC  454

Query  815  CCCTTGCCAAGAAAAAAGGCGTAAAGCGGAAAGCAGATACTACCACCCCTACACCTACAGCCATCTTGGCTCCT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  455  CCCTTGCCAAGAAAAAAGGCGTAAAGCGGAAAGCAGATACTACCACCCCTACACCTACAGCCATCTTGGCTCCT  528

Query  889  GGTTCTCCAGCTAGCCCTCCTGGGAGTCTTGAGCCTAAGGCAGCACGGCTTCCCCCTATGCGTAGAGAGAGTGG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  529  GGTTCTCCAGCTAGCCCTCCTGGGAGTCTTGAGCCTAAGGCAGCACGGCTTCCCCCTATGCGTAGAGAGAGTGG  602

Query  963  TCGCCCCATCAAGCCCCCACGCAAAGACTTGCCTGACTCTCAGCAACAACACCAGAGCTCTAAGAAAGGAAAGC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  603  TCGCCCCATCAAGCCCCCACGCAAAGACTTGCCTGACTCTCAGCAACAACACCAGAGCTCTAAGAAAGGAAAGC  676

Query 1037  TTTCAGAACAGTTAAAACATTGCAATGGCATTTTGAAGGAGTTACTCTCTAAGAAGCATGCTGCCTATGCTTGG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  677  TTTCAGAACAGTTAAAACATTGCAATGGCATTTTGAAGGAGTTACTCTCTAAGAAGCATGCTGCCTATGCTTGG  750

Query 1111  CCTTTCTATAAACCAGTGGATGCTTCTGCACTTGGCCTGCATGACTACCATGACATCATTAAGCACCCCATGGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  751  CCTTTCTATAAACCAGTGGATGCTTCTGCACTTGGCCTGCATGACTACCATGACATCATTAAGCACCCCATGGA  824

Query 1185  CCTCAGCACTGTCAAGCGGAAGATGGAGAACCGTGATTACCGGGATGCACAGGAGTTTGCTGCTGATGTACGGC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  825  CCTCAGCACTGTCAAGCGGAAGATGGAGAACCGTGATTACCGGGATGCACAGGAGTTTGCTGCTGATGTACGGC  898

Query 1259  TTATGTTCTCCAACTGCTATAAGTACAATCCCCCAGATCACGATGTTGTGGCAATGGCACGAAAGCTACAGGAT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  899  TTATGTTCTCCAACTGCTATAAGTACAATCCCCCAGATCACGATGTTGTGGCAATGGCACGAAAGCTACAGGAT  972

Query 1333  GTATTTGAGTTCCGTTATGCCAAGATGCCAGATGAACCACTAGAACCAGGGCCTTTACCAGTCTCTACTGCCAT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  973  GTATTTGAGTTCCGTTATGCCAAGATGCCAGATGAACCACTAGAACCAGGGCCTTTACCAGTCTCTACTGCCAT  1046

Query 1407  GCCCCCTGGCTTGGCCAAATCGTCTTCAGAGTCCTCCAGTGAGGAAAGTAGCAGTGAGAGCTCCTCTGAGGAAG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1047  GCCCCCTGGCTTGGCCAAATCGTCTTCAGAGTCCTCCAGTGAGGAAAGTAGCAGTGAGAGCTCCTCTGAGGAAG  1120

Query 1481  AGGAGGAGGAAGATGAGGAGGACGAGGAGGAAGAAGAGAGTGAAAGCTCAGACTCAGAGGAAGAAAGGGCTCAT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1121  AGGAGGAGGAAGATGAGGAGGACGAGGAGGAAGAAGAGAGTGAAAGCTCAGACTCAGAGGAAGAAAGGGCTCAT  1194

Query 1555  CGCTTAGCAGAACTACAGGAACAGCTTCGGGCAGTACATGAACAACTGGCTGCTCTGTCCCAGGGTCCAATATC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1195  CGCTTAGCAGAACTACAGGAACAGCTTCGGGCAGTACATGAACAACTGGCTGCTCTGTCCCAGGGTCCAATATC  1268

Query 1629  CAAGCCCAAGAGGAAAAGAGAGAAAAAAGAGAAAAAGAAGAAACGGAAGGCAGAGAAGCATCGAGGCCGAGCTG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1269  CAAGCCCAAGAGGAAAAGAGAGAAAAAAGAGAAAAAGAAGAAACGGAAGGCAGAGAAGCATCGAGGCCGAGCTG  1342

Query 1703  GGGCCGATGAAGATGACAAGGGGCCTAGGGCACCCCGCCCACCTCAACCTAAGAAGTCCAAGAAAGCAAGTGGC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1343  GGGCCGATGAAGATGACAAGGGGCCTAGGGCACCCCGCCCACCTCAACCTAAGAAGTCCAAGAAAGCAAGTGGC  1416

Query 1777  AGTGGGGGTGGCAGTGCTGCTTTAGGCCCTTCTGGCTTTGGACCTTCTGGAGGAAGTGGCACCAAGCTCCCCAA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1417  AGTGGGGGTGGCAGTGCTGCTTTAGGCCCTTCTGGCTTTGGACCTTCTGGAGGAAGTGGCACCAAGCTCCCCAA  1490

Query 1851  AAAGGCCACAAAGACAGCCCCACCTGCCCTGCCTACAGGTTATGATTCAGAGGAGGAGGAAGAGAGCAGGCCCA  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1491  AAAGGCCACAAAGACAGCCCCACCTGCCCTGCCTACAGGTTATGATTCAGAGGAGGAGGAAGAGAGCAGGCCCA  1564

Query 1925  TGAGTTACGATGAGAAGCGGCAGCTGAGCCTGGACATCAACAAATTACCTGGGGAGAAGCTGGGCCGAGTTGTG  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1565  TGAGTTACGATGAGAAGCGGCAGCTGAGCCTGGACATCAACAAATTACCTGGGGAGAAGCTGGGCCGAGTTGTG  1638

Query 1999  CATATAATCCAAGCCAGGGAGCCCTCTTTACGTGATTCAAACCCAGAAGAGATTGAGATTGATTTTGAAACACT  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1639  CATATAATCCAAGCCAGGGAGCCCTCTTTACGTGATTCAAACCCAGAAGAGATTGAGATTGATTTTGAAACACT  1712

Query 2073  CAAGCCATCCACACTTAGAGAGCTTGAGCGCTATGTCCTTTCCTGCCTACGTAAGAAACCCCGGAAGCCCTACA  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1713  CAAGCCATCCACACTTAGAGAGCTTGAGCGCTATGTCCTTTCCTGCCTACGTAAGAAACCCCGGAAGCCCTACA  1786

Query 2147  CCATTAAGAAGCCTGTGGGAAAGACAAAGGAGGAACTGGCTTTGGAGAAAAAGCGGGAATTAGAAAAGCGGTTA  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1787  CCATTAAGAAGCCTGTGGGAAAGACAAAGGAGGAACTGGCTTTGGAGAAAAAGCGGGAATTAGAAAAGCGGTTA  1860

Query 2221  CAAGATGTCAGCGGACAGCTCAATTCTACTAAAAAGCCCCCCAAGAAAGCGAATGAGAAAACAGAGTCATCCTC  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1861  CAAGATGTCAGCGGACAGCTCAATTCTACTAAAAAGCCCCCCAAGAAAGCGAATGAGAAAACAGAGTCATCCTC  1934

Query 2295  TGCACAGCAAGTAGCAGTGTCACGCCTTAGCGCTTCCAGCTCCAGCTCAGATTCCAGCTCCTCCTCTTCCTCGT  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1935  TGCACAGCAAGTAGCAGTGTCACGCCTTAGCGCTTCCAGCTCCAGCTCAGATTCCAGCTCCTCCTCTTCCTCGT  2008

Query 2369  CGTCGTCTTCAGACACCAGTGATTCAGACTCAGGC  2403
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2009  CGTCGTCTTCAGACACCAGTGATTCAGACTCAGGC  2043