Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488291
• Subject: NM_001321853.2
• Aligned Length: 3463
• Identities: 3458
• Gaps: 1

Alignment

Query    1  ATGCAGTATCTAAATATAAAAGAGGACTGCAATGCCATGGCTTTCTGTGCTAAAATGAGGAGCTCCAAGAAGAC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCAGTATCTAAATATAAAAGAGGACTGCAATGCCATGGCTTTCTGTGCTAAAATGAGGAGCTCCAAGAAGAC  74

Query   75  TGAGGTGAACCTGGAGGCCCCTGAGCCAGGGGTGGAAGTGATCTTCTATCTGTCGGACAGGGAGCCCCTCCGGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGAGGTGAACCTGGAGGCCCCTGAGCCAGGGGTGGAAGTGATCTTCTATCTGTCGGACAGGGAGCCCCTCCGGC  148

Query  149  TGGGCAGTGGAGAGTACACAGCAGAGGAACTGTGCATCAGGGCTGCACAGGCATGCCGTATCTCTCCTCTTTGT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGGGCAGTGGAGAGTACACAGCAGAGGAACTGTGCATCAGGGCTGCACAGGCATGCCGTATCTCTCCTCTTTGT  222

Query  223  CACAACCTCTTTGCCCTGTATGACGAGAACACCAAGCTCTGGTATGCTCCAAATCGCACCATCACCGTTGATGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CACAACCTCTTTGCCCTGTATGACGAGAACACCAAGCTCTGGTATGCTCCAAATCGCACCATCACCGTTGATGA  296

Query  297  CAAGATGTCCCTCCGGCTCCACTACCGGATGAGGTTCTATTTCACCAATTGGCATGGAACCAACGACAATGAGC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CAAGATGTCCCTCCGGCTCCACTACCGGATGAGGTTCTATTTCACCAATTGGCATGGAACCAACGACAATGAGC  370

Query  371  AGTCAGTGTGGCGTCATTCTCCAAAGAAGCAGAAAAATGGCTACGAGAAAAAAAAGATTCCAGATGCAACCCCT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGTCAGTGTGGCGTCATTCTCCAAAGAAGCAGAAAAATGGCTACGAGAAAAAAAAGATTCCAGATGCAACCCCT  444

Query  445  CTCCTTGATGCCAGCTCACTGGAGTATCTGTTTGCTCAGGGACAGTATGATTTGGTGAAATGCCTGGCTCCTAT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTCCTTGATGCCAGCTCACTGGAGTATCTGTTTGCTCAGGGACAGTATGATTTGGTGAAATGCCTGGCTCCTAT  518

Query  519  TCGAGACCCCAAGACCGAGCAGGATGGGCATGATATTGAGAACGAGTGTCTAGGGATGGCTGTCCTGGCCATCT  592
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCGAGACCCCAAGACCGAGCAGGATGGACATGATATTGAGAACGAGTGTCTAGGGATGGCTGTCCTGGCCATCT  592

Query  593  CACACTATGCCATGATGAAGAAGATGCAGTTGCCAGAACTGCCCAAGGACATCAGCTACAAGCGATATATTCCA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CACACTATGCCATGATGAAGAAGATGCAGTTGCCAGAACTGCCCAAGGACATCAGCTACAAGCGATATATTCCA  666

Query  667  GAAACATTGAATAAGTCCATCAGACAGAGGAACCTTCTCACCAGGATGCGGATAAATAATGTTTTCAAGGATTT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAAACATTGAATAAGTCCATCAGACAGAGGAACCTTCTCACCAGGATGCGGATAAATAATGTTTTCAAGGATTT  740

Query  741  CCTAAAGGAATTTAACAACAAGACCATTTGTGACAGCAGCGTGTCCACGCATGACCTGAAGGTGAAATACTTGG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCTAAAGGAATTTAACAACAAGACCATTTGTGACAGCAGCGTGTCCACGCATGACCTGAAGGTGAAATACTTGG  814

Query  815  CTACCTTGGAAACTTTGACAAAACATTACGGTGCTGAAATATTTGAGACTTCCATGTTACTGATTTCATCAGAA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTACCTTGGAAACTTTGACAAAACATTACGGTGCTGAAATATTTGAGACTTCCATGTTACTGATTTCATCAGAA  888

Query  889  AATGAGATGAATTGGTTTCATTCGAATGACGGTGGAAACGTTCTCTACTACGAAGTGATGGTGACTGGGAATCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AATGAGATGAATTGGTTTCATTCGAATGACGGTGGAAACGTTCTCTACTACGAAGTGATGGTGACTGGGAATCT  962

Query  963  TGGAATCCAGTGGAGGCATAAACCAAATGTTGTTTCTGTTGAAAAGGAAAAAAATAAACTGAAGCGGAAAAAAC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGGAATCCAGTGGAGGCATAAACCAAATGTTGTTTCTGTTGAAAAGGAAAAAAATAAACTGAAGCGGAAAAAAC  1036

Query 1037  TGGAAAATAAACACAAGAAGGATGAGGAGAAAAACAAGATCCGGGAAGAGTGGAACAATTTTTCTTACTTCCCT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGGAAAATAAACACAAGAAGGATGAGGAGAAAAACAAGATCCGGGAAGAGTGGAACAATTTTTCTTACTTCCCT  1110

Query 1111  GAAATCACTCACATTGTAATAAAGGAGTCTGTGGTCAGCATTAACAAGCAGGACAACAAGAAAATGGAACTGAA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GAAATCACTCACATTGTAATAAAGGAGTCTGTGGTCAGCATTAACAAGCAGGACAACAAGAAAATGGAACTGAA  1184

Query 1185  GCTCTCTTCCCACGAGGAGGCCTTGTCCTTTGTGTCCCTGGTAGATGGCTACTTCCGGCTCACAGCAGATGCCC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GCTCTCTTCCCACGAGGAGGCCTTGTCCTTTGTGTCCCTGGTAGATGGCTACTTCCGGCTCACAGCAGATGCCC  1258

Query 1259  ATCATTACCTCTGCACCGACGTGGCCCCCCCGTTGATCGTCCACAACATACAGAATGGCTGTCATGGTCCAATC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ATCATTACCTCTGCACCGACGTGGCCCCCCCGTTGATCGTCCACAACATACAGAATGGCTGTCATGGTCCAATC  1332

Query 1333  TGTACAGAATACGCCATCAATAAATTGCGGCAAGAAGGAAGCGAGGAGGGGATGTACGTGCTGAGGTGGAGCTG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TGTACAGAATACGCCATCAATAAATTGCGGCAAGAAGGAAGCGAGGAGGGGATGTACGTGCTGAGGTGGAGCTG  1406

Query 1407  CACCGACTTTGACAACATCCTCATGACCGTCACCTGCTTTGAGAAGTCTGAGCAGGTGCAGGGTGCCCAGAAGC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CACCGACTTTGACAACATCCTCATGACCGTCACCTGCTTTGAGAAGTCTGAGCAGGTGCAGGGTGCCCAGAAGC  1480

Query 1481  AGTTCAAGAACTTTCAGATCGAGGTGCAGAAGGGCCGCTACAGTCTGCACGGTTCGGACCGCAGCTTCCCCAGC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AGTTCAAGAACTTTCAGATCGAGGTGCAGAAGGGCCGCTACAGTCTGCACGGTTCGGACCGCAGCTTCCCCAGC  1554

Query 1555  TTGGGAGACCTCATGAGCCACCTCAAGAAGCAGATTCTGCGCACGGATAACATCAGCTTCATGCTAAAACGCTG  1628
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TTGGGAGACCTCATGAGCCACCTCAAGAAGCAGATCCTGCGCACGGATAACATCAGCTTCATGCTAAAACGCTG  1628

Query 1629  CTGCCAGCCCAAGCCCCGAGAAATCTCCAACCTGCTGGTGGCTACTAAGAAAGCCCAGGAGTGGCAGCCCGTCT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CTGCCAGCCCAAGCCCCGAGAAATCTCCAACCTGCTGGTGGCTACTAAGAAAGCCCAGGAGTGGCAGCCCGTCT  1702

Query 1703  ACCCCATGAGCCAGCTGAGTTTCGATCGGATCCTCAAGAAGGATCTGGTGCAGGGCGAGCACCTTGGGAGAGGC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  ACCCCATGAGCCAGCTGAGTTTCGATCGGATCCTCAAGAAGGATCTGGTGCAGGGCGAGCACCTTGGGAGAGGC  1776

Query 1777  ACGAGAACACACATCTATTCTGGGACCCTGATGGATTACAAGGATGACGAAGGAACTTCTGAAGAGAAGAAGAT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  ACGAGAACACACATCTATTCTGGGACCCTGATGGATTACAAGGATGACGAAGGAACTTCTGAAGAGAAGAAGAT  1850

Query 1851  AAAAGTGATCCTCAAAGTCTTAGACCCCAGCCACAGGGATATTTCCCTGGCCTTCTTCGAGGCAGCCAGCATGA  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  AAAAGTGATCCTCAAAGTCTTAGACCCCAGCCACAGGGATATTTCCCTGGCCTTCTTCGAGGCAGCCAGCATGA  1924

Query 1925  TGAGACAGGTCTCCCACAAACACATCGTGTACCTCTATGGCGTCTGTGTCCGCGACGTGGAGAATATCATGGTG  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  TGAGACAGGTCTCCCACAAACACATCGTGTACCTCTATGGCGTCTGTGTCCGCGACGTGGAGAATATCATGGTG  1998

Query 1999  GAAGAGTTTGTGGAAGGGGGTCCTCTGGATCTCTTCATGCACCGGAAAAGCGATGTCCTTACCACACCATGGAA  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GAAGAGTTTGTGGAAGGGGGTCCTCTGGATCTCTTCATGCACCGGAAAAGCGATGTCCTTACCACACCATGGAA  2072

Query 2073  ATTCAAAGTTGCCAAACAGCTGGCGAGTGCCCTGAGCTACTTGGAGGATAAAGACCTGGTCCATGGAAATGTGT  2146
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  ATTCAAAGTTGCCAAACAGCTGGCCAGTGCCCTGAGCTACTTGGAGGATAAAGACCTGGTCCATGGAAATGTGT  2146

Query 2147  GTACTAAAAACCTCCTCCTGGCCCGTGAGGGCATCGACAGTGAGTGTGGCCCATTCATCAAGCTCAGTGACCCC  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  GTACTAAAAACCTCCTCCTGGCCCGTGAGGGCATCGACAGTGAGTGTGGCCCATTCATCAAGCTCAGTGACCCC  2220

Query 2221  GGCATCCCCATTACGGTGCTGTCTAGGCAAGAATGCATTGAACGAATCCCATGGATTGCTCCTGAGTGTGTTGA  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  GGCATCCCCATTACGGTGCTGTCTAGGCAAGAATGCATTGAACGAATCCCATGGATTGCTCCTGAGTGTGTTGA  2294

Query 2295  GGACTCCAAGAACCTGAGTGTGGCTGCTGACAAGTGGAGCTTTGGAACCACGCTCTGGGAAATCTGCTACAATG  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  GGACTCCAAGAACCTGAGTGTGGCTGCTGACAAGTGGAGCTTTGGAACCACGCTCTGGGAAATCTGCTACAATG  2368

Query 2369  GCGAGATCCCCTTGAAAGACAAGACGCTGATTGAGAAAGAGAGATTCTATGAAAGCCGGTGCAGGCCAGTGACA  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  GCGAGATCCCCTTGAAAGACAAGACGCTGATTGAGAAAGAGAGATTCTATGAAAGCCGGTGCAGGCCAGTGACA  2442

Query 2443  CCATCATGTAAGGAGCTGGCTGACCTCATGACCCGCTGCATGAACTATGACCCCAATCAGAGGCCTTTCTTCCG  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  CCATCATGTAAGGAGCTGGCTGACCTCATGACCCGCTGCATGAACTATGACCCCAATCAGAGGCCTTTCTTCCG  2516

Query 2517  AGCCATCATGAGAGACATTAATAAGCTTGAAGAGCAGAATCCAGATATTGTTTCAGAAAAAAAACCAGCAACTG  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  AGCCATCATGAGAGACATTAATAAGCTTGAAGAGCAGAATCCAGATATTGTTTCAGAAAAAAAACCAGCAACTG  2590

Query 2591  AAGTGGACCCCACACATTTTGAAAAGCGCTTCCTAAAGAGGATCCGTGACTTGGGAGAGGGCCACTTTGGGAAG  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  AAGTGGACCCCACACATTTTGAAAAGCGCTTCCTAAAGAGGATCCGTGACTTGGGAGAGGGCCACTTTGGGAAG  2664

Query 2665  GTTGAGCTCTGCAGGTATGACCCCGAAGGGGACAATACAGGGGAGCAGGTGGCTGTTAAATCTCTGAAGCCTGA  2738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  GTTGAGCTCTGCAGGTATGACCCCGAAGGGGACAATACAGGGGAGCAGGTGGCTGTTAAATCTCTGAAGCCTGA  2738

Query 2739  GAGTGGAGGTAACCACATAGCTGATCTGAAAAAGGAAATCGAGATCTTAAGGAACCTCTATCATGAGAACATTG  2812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  GAGTGGAGGTAACCACATAGCTGATCTGAAAAAGGAAATCGAGATCTTAAGGAACCTCTATCATGAGAACATTG  2812

Query 2813  TGAAGTACAAAGGAATCTGCACAGAAGACGGAGGAAATGGTATTAAGCTCATCATGGAATTTCTGCCTTCGGGA  2886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  TGAAGTACAAAGGAATCTGCACAGAAGACGGAGGAAATGGTATTAAGCTCATCATGGAATTTCTGCCTTCGGGA  2886

Query 2887  AGCCTTAAGGAATATCTTCCAAAGAATAAGAACAAAATAAACCTCAAACAGCAGCTAAAATATGCCGTTCAGAT  2960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  AGCCTTAAGGAATATCTTCCAAAGAATAAGAACAAAATAAACCTCAAACAGCAGCTAAAATATGCCGTTCAGAT  2960

Query 2961  TTGTAAGGGGATGGACTATTTGGGTTCTCGGCAATACGTTCACCGGGACTTGGCAGCAAGAAATGTCCTTGTTG  3034
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961  TTGTAAGGGGATGGACTATTTGGGTTCTCGGCAATACGTTCACCGGGACTTGGCAGCAAGAAATGTCCTTGTTG  3034

Query 3035  AGAGTGAACACCAAGTGAAAATTGGAGACTTCGGTTTAACCAAAGCAATTGAAACCGATAAGGAGTATTACACC  3108
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035  AGAGTGAACACCAAGTGAAAATTGGAGACTTCGGTTTAACCAAAGCAATTGAAACCGATAAGGAGTATTACACC  3108

Query 3109  GTCAAGGATGATCGGGACAGCCCTGTGTTTTGGTATGCTCCAGAATGTTTAATGCAATCTAAATTTTATATTGC  3182
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109  GTCAAGGATGACCGGGACAGCCCTGTGTTTTGGTATGCTCCAGAATGTTTAATGCAATCTAAATTTTATATTGC  3182

Query 3183  CTCTGACGTCTGGTCTTTTGGAGTCACTCTGCATGAGCTGCTGACTTACTGTGATTCAGATTCTAGTCCCATGG  3256
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183  CTCTGACGTCTGGTCTTTTGGAGTCACTCTGCATGAGCTGCTGACTTACTGTGATTCAGATTCTAGTCCCATGG  3256

Query 3257  CTTTGTTCCTGAAAATGATAGGCCCAACCCATGGCCAGATGACAGTCACAAGACTTGTGAATACGTTAAAAGAA  3330
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257  CTTTGTTCCTGAAAATGATAGGCCCAACCCATGGCCAGATGACAGTCACAAGACTTGTGAATACGTTAAAAGAA  3330

Query 3331  GGAAAACGCCTGCCGTGCCCACCTAACTGTCCAGATGAGGTTTATCAACTTATGAGGAAATGCTGGGAATTCCA  3404
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3331  GGAAAACGCCTGCCGTGCCCACCTAACTGTCCAGATGAGGTTTATCAACTTATGAGGAAATGCTGGGAATTCCA  3404

Query 3405  ACCATCCAATCGGACAAGCTTTCAGAACCTTATTGAAGGATTTGAAGCACTTTTAAAAG  3463
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct 3405  ACCATCCAATCGGACAAGCTTTCAGAACCTTATTGAAGGATTTGAAGCACTTTTAAAA-  3462