Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488316
• Subject: NM_025860.3
• Aligned Length: 2044
• Identities: 1659
• Gaps: 98

Alignment

Query    1  ATGTCACACCTGCCGATGAAACTCCTGCGTAAGAAGATCGAGAAGCGGAACCTCAAATTGCGGCAGCGGAACCT  74
            |||||.||..|.|.|||||||||||||||.|.||||||||||||||||||...|||..||||||||||.|||||
Sbjct    1  ATGTCGCAGTTACAGATGAAACTCCTGCGCAGGAAGATCGAGAAGCGGAATGCCAAGCTGCGGCAGCGAAACCT  74

Query   75  AAAGTTTCAGGGGGCCTCAA--ATCTGAC-----CCTATCGGAAACTCAAAATGGAGATGTATCTGAAGAAACA  141
            .|||.|.||.|       ||  |||.|||     |||.||..||.||||||||||||||||..||.||||||||
Sbjct   75  GAAGCTGCAAG-------AAACATCAGACACAAGCCTGTCCCAACCTCAAAATGGAGATGTGCCTAAAGAAACA  141

Query  142  ATGGGAAGTAGAAAGGTTAAAAAATCAAAACAAAAGCCCATGAA------------TGTGGGCTTATCAGAAAC  203
               |||     ||||||..||||.|.|    |||||.||.||||            |||||.||.|.|||||.|
Sbjct  142  ---GGA-----AAAGGTGGAAAAGTGA----AAAAGGCCCTGAAACGTTCTGTGCCTGTGGACTCAGCAGAAGC  203

Query  204  TCAAAATGGAGGCATGTCTCAAGAAGCAGTGGGAAATATAAAAGTTACAAAGTCTCCCCAGAAATCCACTGTAT  277
            .||||.||||||||||.||.|.||..|..|||.||||...|||||||.||||||.|||||||||..|||....|
Sbjct  204  ACAAAGTGGAGGCATGCCTGAGGAGACCTTGGAAAATGGCAAAGTTAAAAAGTCACCCCAGAAACTCACAACTT  277

Query  278  TAAGCAATGGAGAAGCAGCAATGCAGTCTTCCA-------------ATTCAGAATCAAAAAAGAAAAAGAAGAA  338
            ||..|||.||||||||||||          |||             ||||||||..||||||||||||||||||
Sbjct  278  TAGCCAACGGAGAAGCAGCA----------CCAACACCACCTCCTGATTCAGAAGTAAAAAAGAAAAAGAAGAA  341

Query  339  AAAGAGAAAAATGGTGAATGATGCTGAGCCTGATACGAAAAAAGCAAAAACTGAAAACAAAGGGAAATCTGAAG  412
            ||||||.|||||||..||||||||.|.|||||||||.||||||||.||||||                     |
Sbjct  342  AAAGAGGAAAATGGCAAATGATGCCGGGCCTGATACAAAAAAAGCGAAAACT---------------------G  394

Query  413  AAGAAAGTGCCGAGACTACTAAAGAAACAGAAAATAATGTGGAGAAGCCAGATAATGATGAAGATGAGAGTGAG  486
            ||||||||||.|||.||..|.|.|||.|||||.||.|||||.|.|||            |.||||||.||.|||
Sbjct  395  AAGAAAGTGCTGAGGCTTGTGAGGAACCAGAAGATGATGTGAAAAAG------------GCAGATGACAGCGAG  456

Query  487  GTGCCCAGTCTGCCCCTGGGACTGACAGGAGCTTTTGAGGATACTTCGTTTGCTTCTCTATGTAATCTTGTCAA  560
            ||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||..|.|.||||||.|||||
Sbjct  457  GTGCCCAGCCTGCCCCTAGGACTGACAGGTGCTTTTGAGGACACTTCATTTGCTTCCTTGTCTAATCTCGTCAA  530

Query  561  TGAAAACACTCTGAAGGCAATAAAAGAAATGGGTTTTACAA--ACATGACTGAAATTCAGCATAAAAGTATCAG  632
            |||.|||||.||||||||.|||.||||||||||.||  |||  .||||||.||.||.|||||||||||||||||
Sbjct  531  TGAGAACACCCTGAAGGCCATAGAAGAAATGGGCTT--CAAGCGCATGACGGAGATCCAGCATAAAAGTATCAG  602

Query  633  ACCACTTCTGGAAGGCAGGGATCTTCTAGCAGCTGCAAAAACAGGCAGTGGTAAAACCCTGGCTTTTCTCATCC  706
            .||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||
Sbjct  603  GCCACTTCTGGAAGGCAGGGACCTTCTGGCGGCTGCGAAAACCGGCAGTGGCAAAACCCTCGCTTTCCTCATCC  676

Query  707  CTGCAGTTGAACTCATTGTTAAGTTAAGGTTCATGCCCAGGAATGGAACAGGAGTCCTTATTCTCTCACCTACT  780
            |||...|.||.||||||||.|||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.
Sbjct  677  CTGTGATCGAGCTCATTGTCAAGTTGAAGTTCATGCCCAGGAATGGAACAGGAGTCCTGATTCTCTCTCCTACC  750

Query  781  AGAGAACTAGCCATGCAAACCTTTGGTGTTCTTAAGGAGCTGATGACTCACCACGTGCATACCTATGGCTTGAT  854
            ||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||..||||
Sbjct  751  AGAGAACTGGCCATGCAGACCTTTGGTGTTCTCAAGGAGCTGATGACGCACCACGTTCACACGTATGGGCTGAT  824

Query  855  AATGGGTGGCAGTAACAGATCTGCTGAAGCACAGAAACTTGGTAATGGGATCAACATCATTGTGGCCACACCAG  928
            .|||||.|||||.|||||.||||||||||..|||||.||....|||||||||||||||||.||||||||.||.|
Sbjct  825  CATGGGCGGCAGCAACAGGTCTGCTGAAGTGCAGAAGCTCCTCAATGGGATCAACATCATCGTGGCCACGCCCG  898

Query  929  GCCGTCTGCTGGACCATATGCAGAATACCCCAGGATTTATGTATAAAAACCTGCAGTGTCTGGTTATTGATGAA  1002
            ||||.||.||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  899  GCCGGCTCCTGGACCACATGCAGAACACGCCAGGGTTTATGTACAAGAACCTGCAGTGTCTGGTTATTGATGAG  972

Query 1003  GCTGATCGTATCTTGGATGTGGGGTTTGAAGAGGAATTAAAGCAAATTATTAAACTTTTGCCAACACGTAGACA  1076
            |||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||.||
Sbjct  973  GCTGACCGTATCTTGGATGTTGGGTTTGAAGAAGAATTAAAGCAAATTATTAAACTTTTGCCAGCCCGTAGGCA  1046

Query 1077  GACTATGCTCTTTTCTGCCACCCAAACTCGAAAAGTTGAAGACCTGGCAAGGATTTCTCTGAAAAAGGAGCCAT  1150
            .||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1047  AACCATGCTCTTTTCTGCCACACAAACTCGAAAAGTTGAAGACTTGGCAAGAATTTCTCTGAAAAAGGAGCCTT  1120

Query 1151  TGTATGTTGGCGTTGATGATGATAAAGCGAATGCAACAGTGGATGGTCTTGAACAGGGATATGTTGTTTGTCCT  1224
            ||||.||.||.||||||||.||.||||.|..|||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.
Sbjct 1121  TGTACGTGGGTGTTGATGACGACAAAGAGGTTGCCACAGTGGATGGCCTTGAGCAGGGCTATGTTGTTTGTCCC  1194

Query 1225  TCTGAAAAGAGATTCCTTCTGCTCTTTACATTCCTTAAGAAGAACCGAAAGAAGAAGCTTATGGTCTTCTTTTC  1298
            |||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||..|.||||||||||||||
Sbjct 1195  TCTGAGAAGAGGTTCCTTCTGCTTTTCACATTCCTTAAGAAGAACCGGAAGAAGAAAGTGATGGTCTTCTTTTC  1268

Query 1299  ATCTTGTATGTCTGTGAAATACCACTATGAGTTGCTGAACTACATTGATTTGCCCGTCTTGGCCATTCATGGAA  1372
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||..|.||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1269  ATCTTGTATGTCTGTGAAATACCACTATGAGCTGTTGAACTACATTGACCTTCCCGTCTTGGCCATCCATGGAA  1342

Query 1373  AGCAAAAGCAAAATAAGCGTACAACCACATTCTTCCAGTTCTGCAATGCAGATTCGGGAACACTATTGTGTACG  1446
            |||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||.||||.|||..|||||||.
Sbjct 1343  AGCAAAAGCAAAATAAGCGAACAACCACGTTTTTCCAGTTCTGCAACGCGGATTCAGGAATACTGCTGTGTACT  1416

Query 1447  GATGTGGCAGCGAGAGGACTAGACATTCCTGAAGTCGACTGGATTGTTCAGTATGACCCTCCGGATGACCCTAA  1520
            |||||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||
Sbjct 1417  GATGTGGCAGCCAGAGGGCTGGACATCCCCGAAGTGGACTGGATTGTTCAGTACGACCCTCCCGATGACCCCAA  1490

Query 1521  GGAATATATTCATCGTGTGGGTAGAACAGCCAGAGGCCTAAATGGGAGAGGGCATGCCTTGCTCATTTTGCGCC  1594
            ||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||.|||||||..||||||
Sbjct 1491  GGAATACATTCATCGTGTTGGTAGAACAGCCAGGGGCCTGAATGGAAGAGGGCACGCCCTGCTCATCCTGCGCC  1564

Query 1595  CAGAAGAATTGGGTTTTCTTCGCTACTTGAAACAATCCAAGGTTCCATTAAGTGAATTTGACTTTTCCTGGTCT  1668
            |.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.|.|.|.||||||||.|||||||||
Sbjct 1565  CTGAAGAGTTGGGTTTCCTTCGTTACTTGAAACAGTCCAAGGTTCCATTGAATCAGTTTGACTTCTCCTGGTCT  1638

Query 1669  AAAATTTCTGACATTCAGTCTCAGCTTGAGAAATTGATTGAAAAGAATTACTTTCTTCATAAGTCAGCCCAGGA  1742
            |||.|||||||.||.|||||||||||.||.|||.||||.||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||
Sbjct 1639  AAAGTTTCTGATATCCAGTCTCAGCTGGAAAAACTGATCGAAAAGAACTACTTTCTCCACAAGTCTGCCCAGGA  1712

Query 1743  AGCATATAAGTCATACATACGAGCCTATGATTCCCATTCTCTGAAACAGATCTTTAATGTTAATAACCTAAATT  1816
            ||||||.||.||.||||||.||||.|||||.||.||.|||||.||.||||||||.||.||.||.|||.|||||.
Sbjct 1713  AGCATACAAATCCTACATAAGAGCATATGACTCTCACTCTCTCAAGCAGATCTTCAACGTGAACAACTTAAATC  1786

Query 1817  TGCCTCAGGTTGCTCTGTCATTTGGTTTCAAGGTGCCTCCCTTCGTTGATCTGAACGTCAACAGTAATGAAGGC  1890
            |||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||.||.|.|||..||||.|||
Sbjct 1787  TGCCTCAGGTTGCTCTGTCTTTTGGTTTTAAGGTCCCTCCTTTTGTTGATCTGAATGTGAGCAGCCATGATGGC  1860

Query 1891  AAGCAGAAAAAGCGAGGAGGTGGTGGTGGATTTGGCTACCAGAAAACCAAGAAAGTTGAGAAATCCAAAATCTT  1964
            ||||..||.|||.||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||
Sbjct 1861  AAGCTTAAGAAGAGAGGCGGTGGTGGCGGATTCGGCTACCAGAAAACAAAGAAAGTGGAGAAGTCCAAGATCTT  1934

Query 1965  TAAACACATTAGCAAGAAATCATCTGACAGCAGGCAGTTCTCTCAC  2010
            |||||||||.||.|||||..||.|.|||.|||||||||||||.|||
Sbjct 1935  TAAACACATCAGTAAGAAGCCAGCAGACCGCAGGCAGTTCTCACAC  1980