Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488343
• Subject: XM_006506919.3
• Aligned Length: 681
• Identities: 528
• Gaps: 117

Alignment

Query   1  ATGACTGAATATAAACTTGTGGTAGTTGGAGCTGGTGGCGTAGGCAAGAGTGCCTTGACGATACAGCTAATTCA  74
           ||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGACTGAGTATAAACTTGTGGTGGTTGGAGCTGGTGGCGTAGGCAAGAGCGCCTTGACGATACAGCTAATTCA  74

Query  75  GAATCATTTTGTGGACGAATATGATCCAACAATAGAGGATTCCTACAGGAAGCAAGTAGTAATTGATGGAGAAA  148
           ||||||.||||||||.||.|||||.||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  GAATCACTTTGTGGATGAGTATGACCCTACGATAGAGGACTCCTACAGGAAACAAGTAGTAATTGATGGAGAAA  148

Query 149  CCTGTCTCTTGGATATTCTCGACACAGCAGGTCAAGAGGAGTACAGTGCAATGAGGGACCAGTACATGAGGACT  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 149  CCTGTCTCTTGGATATTCTCGACACAGCAGGTCAAGAGGAGTACAGTGCAATGAGGGACCAGTACATGAGAACT  222

Query 223  GGGGAGGGCTTTCTTTGTGTATTTGCCATAAATAATACTAAATCATTTGAAGATATTCACCATTATAGAGAACA  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  GGGGAGGGCTTTCTTTGTGTATTTGCCATAAATAATACTAAATCATTTGAAGATATTCACCATTATAGAGAACA  296

Query 297  AATTAAAAGAGTTAAGGACTCTGAAGATGTACCTATGGTCCTAGTAGGAAATAAATGTGATTTGCCTTCTAGAA  370
           ||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 297  AATTAAAAGAGTAAAGGACTCTGAAGATGTGCCTATGGTCCTGGTAGGGAATAAGTGTGATTTGCCTTCTAGAA  370

Query 371  CAGTAGACACAAAACAGGCTCAGGACTTAGCAAGAAGTTATGGAATTCCTTTTATTGAAACATCAGCAAAGACA  444
           ||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||.||.||||||||||||
Sbjct 371  CAGTAGACACGAAACAGGCTCAGGAGTTAGCAAGGAGTTACGGGATTCCGTTCATTGAGACCTCAGCAAAGACA  444

Query 445  AGACA---------------------------------------------------------------------  449
           |||||                                                                     
Sbjct 445  AGACAGAGAGTGGAGGATGCTTTTTATACATTGGTGAGAGAGATCCGACAGTACAGATTGAAAAAAATCAGCAA  518

Query 450  ------------------------------------------------GGGTGTTGATGATGCCTTCTATACAT  475
                                                           |||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 519  AGAAGAAAAGACTCCTGGCTGTGTGAAAATTAAAAAATGCGTTATAATGGGTGTTGACGATGCCTTCTATACAT  592

Query 476  TAGTTCGAGAAATTCGAAAACATAAAGAAAAGATGAGCAAAGATGGTAAAAAGAAGAAAAAGAAGTCAAAGACA  549
           ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||.||||
Sbjct 593  TAGTCCGAGAAATTCGAAAACATAAAGAAAAGATGAGCAAAGATGGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGTCAAGGACA  666

Query 550  AAGTGTGTAATTATG  564
           |.||||..|.|||||
Sbjct 667  AGGTGTACAGTTATG  681