Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000488346
- Subject:
- NM_013696.2
- Aligned Length:
- 1194
- Identities:
- 1066
- Gaps:
- 15
Alignment
Query 1 ATGGAAAACGAGACAGTCAGTGAACTGAACCAAACACAGCTTCAGCCACGAGCAGTGGTGGCCTTAGAATACCA 74
|||||.||.||.||.|||||||||.||||||||||..||||.|||||||.|||||..||||||.|.||.|||||
Sbjct 1 ATGGAGAATGATACTGTCAGTGAAATGAACCAAACCGAGCTCCAGCCACAAGCAGCTGTGGCCCTCGAGTACCA 74
Query 75 GGTGGTCACCATCTTACTTGTACTCATTATTTGTGGCCTGGGCATTGTAGGCAACATCATGGTAGTCCTGGTTG 148
||||||.||||||||||||||..|||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 75 GGTGGTTACCATCTTACTTGTGGTCATTATTTGTGGACTGGGCATTGTGGGCAACATCATGGTAGTCCTGGTGG 148
Query 149 TCATGAGAACCAAGCACATGAGGACCCCCACAAACTGCTACCTGGTGAGCCTGGCAGTAGCTGATCTCATGGTC 222
||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||.|||||.||.||.|||||||||||.
Sbjct 149 TCATGAGAACAAAGCACATGAGAACCCCTACAAACTGTTACCTGGTAAGTCTGGCTGTGGCAGATCTCATGGTT 222
Query 223 TTGGTGGCCGCAGGCCTCCCCAACATAACAGACAGTATCTACGGTTCCTGGGTCTATGGCTATGTTGGATGCCT 296
.|||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 223 CTGGTGGCTGCAGGCCTCCCCAACATAACCGACAGTATCTATGGTTCCTGGGTCTATGGCTATGTTGGCTGCCT 296
Query 297 CTGCATTACTTACCTCCAGTATTTGGGAATTAATGCATCCTCTTGTTCAATAACAGCCTTTACCATTGAGAGGT 370
|||||||||.||.||||||||..|.||.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 297 CTGCATTACATATCTCCAGTACCTAGGCATTAATGCATCTTCATGTTCAATAACGGCCTTTACCATTGAAAGGT 370
Query 371 ACATAGCAATCTGTCACCCCATCAAAGCCCAGTTTCTCTGCACATTTTCCAGAGCCAAAAAGATTATCATCTTT 444
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 371 ACATAGCAATCTGTCACCCCATCAAAGCCCAGTTTCTCTGCACGTTTTCCAGAGCCAAAAAAATCATCATCTTT 444
Query 445 GTCTGGGCTTTCACATCTCTTTACTGTATGCTCTGGTTCTTCTTGCTGGATCTCAATATTAGCACCTACAAAGA 518
||||||||.||||||||..|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||.||||||||||||.|
Sbjct 445 GTCTGGGCCTTCACATCCATTTACTGTATGCTCTGGTTCTTCCTGCTGGATCTCAACATCAGCACCTACAAAAA 518
Query 519 TGCTATTGTGATATCCTGTGGCTACAAGATCTCCAGGAATTACTACTCACCTATTTACCTAATGGACTTTGGTG 592
.|||.|||||.|.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CGCTGTTGTGGTTTCCTGTGGCTACAAGATCTCCAGGAACTACTACTCACCTATTTACCTAATGGACTTTGGTG 592
Query 593 TCTTTTATGTTGTGCCAATGATCCTGGCTACCGTCCTCTATGGATTCATAGCTAGAATCCTTTTCTTAAATCCC 666
||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 593 TCTTTTATGTTGTGCCAATGATCCTGGCCACTGTGCTTTATGGATTTATAGCTAGAATCCTCTTCTTAAACCCC 666
Query 667 ATTCCTTCAGATCCTAAAGAAAACTCTAAGACATGGAAAAATGATTCAACCCATCAGAACACAAATCTGAATGT 740
|||||||||||.|||||||||||||||||||..|||||||||||.||||.|||||||||||..|||.|||||.|
Sbjct 667 ATTCCTTCAGACCCTAAAGAAAACTCTAAGATGTGGAAAAATGACTCAATCCATCAGAACAAGAATTTGAATTT 740
Query 741 AAATACCTCTAATAGATGTTTCAACAGCACAGTATCTTCAAGGAAGCAGGTCACCAAGATGCTGGCAGTGGTTG 814
||||.||.|.||.|||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 741 AAATGCCACCAACAGATGCTTCAACAGCACTGTATCTTCCAGGAAGCAGGTCACCAAGATGCTCGCAGTGGTTG 814
Query 815 TAATTCTGTTTGCCCTTTTATGGATGCCCTACAGGACTCTAGTGGTTGTCAACTCATTTCTCTCCAGTCCTTTC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 815 TAATTCTGTTTGCCCTTTTATGGATGCCCTACAGGACTCTTGTGGTTGTCAACTCATTTCTCTCCAGCCCTTTC 888
Query 889 CAAGAAAATTGGTTTTTGCTCTTTTGCAGAATTTGCATTTATCTCAACAGTGCCATCAACCCGGTGATTTACAA 962
||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 889 CAGGAAAATTGGTTCTTGCTCTTTTGCAGAATTTGCATTTATCTCAACAGTGCCATCAACCCAGTGATTTACAA 962
Query 963 TCTCATGTCCCAGAAATTCCGTGCAGCCTTCAGAAAGCTCTGCAACTGCAAGCAGAAGCCAACAGAGAAACCTG 1036
.||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||.|||
Sbjct 963 CCTCATGTCTCAGAAATTTCGTGCAGCCTTCAGGAAGCTCTGCAATTGCAAGCAGAAGCCCACAGAAAAAGCTG 1036
Query 1037 CTAACTACAGTGTGGCCCTAAATTACAGCGTCATCAAGGAGTCAGACCATTTCAGCACAGAGCTTGATGATATC 1110
||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||..||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 1037 CTAACTACAGTGTGGCCCTAAATTACAGTGTCATCAAGGAGTCAGACCGCTTCAGCACAGAGCTAGAAGATATC 1110
Query 1111 ACTGTCACTGACACTTACCTGTCTGCCACAAAAGTGTCTTTTGATGACACCTGCTTGGCTTCTGAGGTATCCTT 1184
||.|||||.||.||.||..||||..|||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||| |.|
Sbjct 1111 ACCGTCACCGATACGTATGTGTCAACCACAAAAGTGTCCTTTGATGACACCTGCTTGGCCTCTGAG--AAC--- 1179
Query 1185 TAGCCAAAGT 1194
Sbjct 1180 ---------- 1179