Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000488353
- Subject:
- NM_001164172.1
- Aligned Length:
- 1326
- Identities:
- 1134
- Gaps:
- 69
Alignment
Query 1 ATGGCGGCGTCCTCCCTGGAACAGAAGCTGTCCCGCCTGGAAGCAAAGCTAAAGCAGGAGAACCGGGAGGCCCG 74
||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1 ATGGCGGCGTCCTCCCTGGAGCAGAAGCTGTCCCGCCTGGAAGCCAAGCTGAAGCAGGAGAACCGTGAGGCCCG 74
Query 75 GCGGAGGATCGACCTCAACCTGGATATCAGCCCCCAGCGGCCCAGGCCCA------------------------ 124
..|||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 75 CAGGAGGATCGACCTCAACTTGGATATCAGCCCACAGCGGCCCAGGCCCATTATTGTGATCACTCTAAGCCCTG 148
Query 125 ------------------------CCCTGCAGCTCCCGCTGGCCAACGATGGGGGCAGCCGCTCGCCATCCTCA 174
|||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 149 CTCCTGCCCCGTCCCAGCGAGCAGCCCTGCAACTCCCACTGGCCAACGATGGGGGCAGCCGCTCACCATCCTCA 222
Query 175 GAGAGCTCCCCGCAGCACCCCACGCCCCCCGCCCGGCCCCGCCACATGCTGGGGCTCCCGTCAACCCTGTTCAC 248
|||||||||||.||||||||.||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||
Sbjct 223 GAGAGCTCCCCACAGCACCCTACACCCCCCACCCGGCCCCGCCACATGCTGGGGCTCCCATCAACCTTGTTCAC 296
Query 249 ACCCCGCAGCATGGAGAGCATTGAGATTGACCAGAAGCTGCAGGAGATCATGAAGCAGACGGGCTACCTGACCA 322
|||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|
Sbjct 297 ACCGCGCAGTATGGAGAGCATCGAGATTGACCAGAAGCTGCAGGAGATCATGAAGCAGACAGGGTACCTGACTA 370
Query 323 TCGGGGGCCAGCGCTACCAGGCAGAAATCAACGACCTGGAGAACTTGGGCGAGATGGGCAGCGGCACCTGCGGC 396
|||||||||||||.||.||||||||||||||.|||.|||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.
Sbjct 371 TCGGGGGCCAGCGTTATCAGGCAGAAATCAATGACTTGGAGAACTTGGGTGAGATGGGCAGTGGTACCTGTGGT 444
Query 397 CAGGTGTGGAAGATGCGCTTCCGGAAGACCGGCCACGTCATTGCCGTTAAGCAAATGCGGCGCTCCGGGAACAA 470
|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||.|||||||.||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 445 CAGGTGTGGAAGATGCGGTTCCGGAAGACAGGCCACATCATTGCTGTTAAGCAAATGCGGCGCTCTGGGAACAA 518
Query 471 GGAGGAGAACAAGCGCATCCTCATGGACCTGGATGTGGTGCTGAAGAGCCACGACTGCCCCTACATCGTGCAGT 544
|||.|||||.||||||||..|.||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||.||||||||.||||
Sbjct 519 GGAAGAGAATAAGCGCATTTTGATGGACCTGGATGTAGTACTCAAGAGCCATGACTGCCCTTACATCGTTCAGT 592
Query 545 GCTTTGGGACGTTCATCACCAACACGGATGTCTTCATCGCCATGGAGCTCATGGGCACCTGCGCTGAGAAGCTC 618
|||||||.||.||||||||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.
Sbjct 593 GCTTTGGCACCTTCATCACCAACACAGACGTCTTTATTGCCATGGAGCTCATGGGCACATGTGCAGAGAAGCTG 666
Query 619 AAGAAGCGGATGCAGGGCCCCATCCCCGAGCGCATTCTGGGCAAGATGACAGTGGCGATTGTGAAGGCGCTGTA 692
|||||.||.||||||||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 667 AAGAAACGAATGCAGGGCCCCATTCCAGAGCGAATCCTGGGCAAGATGACTGTGGCGATTGTGAAAGCACTGTA 740
Query 693 CTACCTGAAGGAGAAGCACGGTGTCATCCACCGCGACGTCAAGCCCTCCAACATCCTGCTGGACGAGCGGGGCC 766
|||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 741 CTATCTGAAGGAGAAGCATGGCGTCATCCATCGCGATGTCAAACCCTCCAACATCCTGCTAGATGAGCGGGGCC 814
Query 767 AGATCAAGCTCTGCGACTTCGGCATCAGCGGCCGCCTGGTGGACTCCAAAGCCAAGACGCGGAGCGCCGGCTGT 840
|||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||.||.||||||
Sbjct 815 AGATCAAGCTCTGTGACTTTGGCATCAGTGGCCGCCTTGTTGACTCCAAAGCCAAAACACGGAGTGCTGGCTGT 888
Query 841 GCCGCCTACATGGCACCCGAGCGCATTGACCCCCCAGACCCCACCAAGCCGGACTATGACATCCGGGCCGACGT 914
||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||.||
Sbjct 889 GCTGCCTATATGGCTCCCGAGCGCATCGACCCTCCAGATCCCACCAAGCCTGACTATGACATCCGAGCTGATGT 962
Query 915 ATGGAGCCTGGGCATCTCGTTGCCCTGCCCGTCTCCCTCCCAGGTGGAGCTGGCAACAGGACAGTTTCCCTACA 988
.|||||||||||||| |||.|.||||||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 963 GTGGAGCCTGGGCAT---------------------CTCACTGGTGGAGCTGGCAACAGGACAGTTCCCCTATA 1015
Query 989 AGAACTGCAAGACGGACTTTGAGGTCCTCACCAAAGTCCTACAGGAAGAGCCCCCGCTTCTGCCCGGACACATG 1062
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||||||
Sbjct 1016 AGAACTGCAAGACGGACTTTGAGGTCCTCACCAAAGTCCTACAGGAAGAGCCCCCACTCCTGCCTGGTCACATG 1089
Query 1063 GGCTTCTCGGGGGACTTCCAGTCCTTCGTCAAAGACTGCCTTACTAAAGATCACAGGAAGAGACCAAAGTATAA 1136
||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1090 GGCTTCTCAGGGGACTTCCAGTCATTTGTCAAAGACTGCCTTACTAAAGATCACAGGAAGAGACCAAAGTATAA 1163
Query 1137 TAAGCTACTTGAACACAGCTTCATCAAGCGCTACGAGACGCTGGAGGTGGACGTGGCGTCCTGGTTCAAGGATG 1210
|||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||..||.||||||||.||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 1164 TAAGCTACTTGAACACAGCTTCATCAAGCACTATGAGATACTCGAGGTGGATGTCGCGTCCTGGTTTAAGGATG 1237
Query 1211 TCATGGCGAAGACTGAGTCACCGCGGACTAGCGGCGTCCTGAGCCAGCCCCACCTGCCCTTCTTCAGG 1278
|||||||||||||.|||||.||..|||||||.||.||||||||.||||.|||.|||||||||||||||
Sbjct 1238 TCATGGCGAAGACCGAGTCCCCAAGGACTAGTGGAGTCCTGAGTCAGCACCATCTGCCCTTCTTCAGG 1305