Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000488354
- Subject:
- XM_006511304.2
- Aligned Length:
- 1905
- Identities:
- 1611
- Gaps:
- 27
Alignment
Query 1 ATGAATAGATACACAACAATCAGGCAGCTCGGGGATGGAACCTACGGTTCCGTCCTGCTGGGAAGAAGCATTGA 74
|||||||||||||||||.||||.||||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1 ATGAATAGATACACAACGATCAAGCAGCTTGGGGATGGGACCTACGGCTCTGTCCTGCTGGGGAGAAGCATTGA 74
Query 75 GTCTGGGGAGCTGATCGCTATTAAAAAAATGAAAAGAAAATTTTATTCCTGGGAGGAATGCATGAACCTTCGGG 148
||||||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 75 GTCTGGAGAACTGATTGCCATTAAAAAAATGAAAAGAAAGTTTTACTCCTGGGAAGAATGCATGAACCTTCGGG 148
Query 149 AGGTTAAGTCTTTAAAGAAGCTCAACCATGCCAATGTAGTCAAATTAAAAGAAGTTATCAGGGAAAATGATCAT 222
||||||||||||||||||||||.||.|||||||||.|.||.||.||||||||.||||||||||||||.||.|||
Sbjct 149 AGGTTAAGTCTTTAAAGAAGCTTAATCATGCCAATATCGTAAAGTTAAAAGAGGTTATCAGGGAAAACGACCAT 222
Query 223 CTTTATTTTATCTTCGAGTACATGAAGGAAAATCTTTACCAGCTCATTAAAGAGAGAAATAAGTTGTTTCCTGA 296
|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 223 CTTTACTTTATCTTCGAGTACATGAAGGAAAACCTTTACCAGCTCATTAAAGAAAGAAATAAGTTGTTTCCAGA 296
Query 297 GTCTGCTATAAGGAATATCATGTATCAGATATTACAAGGACTCGCATTTATTCACAAACACGGCTTCTTTCATC 370
||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||.|
Sbjct 297 GTCTGCTATAAGGAATATAATGTACCAGATATTGCAAGGACTGGCATTCATTCACAAACACGGTTTCTTCCACC 370
Query 371 GAGACTTAAAGCCTGAGAACCTCCTCTGCATGGGACCAGAACTTGTGAAAATTGCAGACTTTGGTTTGGCCCGA 444
|.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||
Sbjct 371 GGGACTTAAAACCCGAGAACCTCCTCTGCATGGGACCAGAACTTGTGAAAATCGCCGACTTTGGATTGGCTCGA 444
Query 445 GAAATACGATCAAAACCTCCATATACAGATTATGTATCTACCAGATGGTACAGGGCTCCAGAAGTACTCCTGAG 518
|||||.|||||||.||||||.||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 445 GAAATCCGATCAAGACCTCCGTACACAGACTATGTGTCTACTAGATGGTACAGGGCTCCAGAGGTACTGCTGAG 518
Query 519 GTCTACCAACTACAGCTCCCCCATTGACGTCTGGGCGGTGGGCTGCATCATGGCAGAAGTTTACACCCTCAGGC 592
.||.||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||.|||.|||
Sbjct 519 ATCCACCAACTACAGCTCCCCCATTGACATCTGGGCGGTAGGCTGCATCATGGCGGAGGTGTACACGCTCCGGC 592
Query 593 CACTCTTCCCTGGAGCCAGTGAAATTGACACAATATTCAAAATTTGCCAAGTGCTGGGGACACCAAAAAAGACT 666
|.||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||.||||||||.||||||
Sbjct 593 CCCTTTTCCCTGGGGCCAGTGAAATTGACACAATTTTCAAAATTTGCCAAGTGTTGGGAACACCAAAGAAGACT 666
Query 667 GACTGGCCTGAAGGCTATCAACTTTCAAGTGCAATGAACTTCCGTTGGCCACAGTGTGTACCCAATAACTTAAA 740
|||||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||.||||..|||||.|||||..||||||||||||||||
Sbjct 667 GACTGGCCTGAAGGCTACCAGCTGTCAAGTGCTATGAATTTCCTCTGGCCCCAGTGCATACCCAATAACTTAAA 740
Query 741 GACCTTGATTCCCAATGCTAGCAGTGAAGCAGTCCAGCTCCTGAGAGACATGCTTCAGTGGGATCCCAAGAAAC 814
|||..|.||.||.|||||||||||.|||||..|.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GACTCTAATCCCAAATGCTAGCAGCGAAGCCATTCAGCTCCTGAGAGACTTGCTTCAGTGGGATCCCAAGAAAC 814
Query 815 GACCAACAGCTAGTCAGGCACTTCGATATCCTTACTTCCAAGTTGGACACCCACTAGGCAGCACCA-CACAAAA 887
|||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||..|.|||||||||||.||||.||.|| ||
Sbjct 815 GACCAACCGCTAGTCAGGCTCTTCGATATCCTTACTTCCAGATCGGACACCCACTGGGCATCATCAGCA----- 883
Query 888 CCTTCAGGATTCAGAAAAACCACAGAAAGGCATCCTGGAAAAGGCAGGCCCACCTCCTTATATTAAGCCAGTCC 961
||||.||||.|||||||||||.||...|||.|||.|||.|||||||.||||||||.||.|||||||.||
Sbjct 884 -----AGGACTCAGGAAAACCACAGAGAGAGGTCCAGGACAAGACAGGCCCTCCTCCTTACATCAAGCCAGCCC 952
Query 962 CACCTGCCCAGCCACCAGCCAAGCCACACACACGAATTTCTTCACGAC--AGCATCAAGCCAGCCAGCCCCCTC 1033
|.|||||||||.|.||.||||||.||.|.||.|..||||||||||||| ||| ||||||||.||||||||||
Sbjct 953 CTCCTGCCCAGGCCCCGGCCAAGGCATATACGCTGATTTCTTCACGACCAAGC--CAAGCCAGTCAGCCCCCTC 1024
Query 1034 TGCA-TCTCACGT--ACCCCTACAAAGCAGAGGTCTCCAGGACAGATCACCCAAGCCATCTCCAGGAGGACAAG 1104
.||| ||| || ||||||||||||..||.|||||.|||||.||.||.|..||||||.|.|||||||.||||
Sbjct 1025 AGCATTCT---GTGCACCCCTACAAAGGCGATGTCTCTAGGACTGAGCAGCTGAGCCATGTTCAGGAGGGCAAG 1095
Query 1105 CCAAGCCCGTTGC--TTTTCCCATCCCTCCACAACAAGCATCCACAGTCGAAAATCACAGCTGGCCTGGAGCAC 1176
|||||||| |.| |.|||||||||||||||||.|||.|||..|||.|.||||||..|||..|||||||.||.
Sbjct 1096 CCAAGCCC--TCCATTCTTCCCATCCCTCCACAATAAGAATCTTCAGCCAAAAATCCTAGCCAGCCTGGAACAG 1167
Query 1177 AAAAATGGTGAGATAAAGCCAAAGAGTAGGAGAAGGTGGGGTCTTATTTCCAGGTCAACAAAGGATTCAGATGA 1250
|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||||.|||.||.||
Sbjct 1168 AAAAATGGTGAAATCAAGCCAAAGAGCAGGAGAAGATGGGGTCTCATCTCCAGGTCGACAAAGGGTTCTGACGA 1241
Query 1251 TTGGGCTGACTTGGATGACTTGGATTTCAGTCCATCCCTCAGCAGGATTGACCTGAAAAACAAGAAAAGACAGA 1324
.|||||.||||||||||||||.||.||||||||.||.||||.||||||.||..|.|||||||||||.|||||||
Sbjct 1242 CTGGGCCGACTTGGATGACTTAGACTTCAGTCCCTCTCTCACCAGGATAGATGTAAAAAACAAGAAGAGACAGA 1315
Query 1325 GTGATGACACTCTCTGCAGGTTTGAGAGTGTTTTGGACCTGAAGCCCTCTGAGCCTGTGGGCACAGGAAACAGT 1398
||||||||||.||||||||||||||.||||||.|||||||||||||.||||||.|.|||||.|||||||.||.|
Sbjct 1316 GTGATGACACCCTCTGCAGGTTTGAAAGTGTTCTGGACCTGAAGCCATCTGAGTCAGTGGGTACAGGAACCACT 1389
Query 1399 GCCCCCACCCAGACGTCATATCAGCGGCGAGACACGCCCACCCTG-AGATCTGCAGCCAAGCAGCACTATTTGA 1471
|.|.||||.|||.|.||.|..|||.||.||||||||||.|||||| || ||..||||.|||||||||||.||||
Sbjct 1390 GTCTCCACGCAGGCTTCCTCGCAGAGGAGAGACACGCCGACCCTGCAG-TCCTCAGCAAAGCAGCACTACTTGA 1462
Query 1472 AGCACTCTCGATACTTGCCTGGGATCAGTATAAGAAATGGCATACTCTCGAATCCAGGCAAGGAATTTATTCCA 1545
||||||||||.|||||||||||.||.|.|||||||||||||.|.|||.|.||||||||||||||.|||.|||||
Sbjct 1463 AGCACTCTCGCTACTTGCCTGGAATAAATATAAGAAATGGCGTGCTCCCAAATCCAGGCAAGGACTTTCTTCCA 1536
Query 1546 CCTAATCCATGGTCTAGTTCTGGCTTGTCTGGAAAATCTTCAGGGACAATGTCAGTAATCAGCAAAGTAAATTC 1619
.|.|||.|||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||.|.||||||.|.||||||.|||.|||
Sbjct 1537 TCAAATTCATGGTCCAGTTCCGGCTTGTCTGGAAAATCTTCAGGAACAGTATCAGTAGTGAGCAAAATAACTTC 1610
Query 1620 AGTTGGTTCCAGCTCTACAAGTTCTAGTGGACTGACTGGAAACTATGTCCCTTCCTTTCTGAAAAAAGAAATCG 1693
||||||.||..|||||.|.||.|||||||||||||||||||.|||..|.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1611 AGTTGGCTCAGGCTCTGCGAGCTCTAGTGGACTGACTGGAAGCTACATTCCTTCCTTTCTGAAAAAGGAAATCG 1684
Query 1694 GTTCTGCTATGCAGAGGGTACACCTAGCACCTATTCCAGACCCTTCCCCTGGTTATTCCTCCCTGAAGGCCATG 1767
||||||..|||||||||||.||.||.||.||..|..|||.||||.||||.||.||.||.|||||.||||||.||
Sbjct 1685 GTTCTGTCATGCAGAGGGTTCAGCTGGCGCCCCTCGCAGCCCCTCCCCCCGGCTACTCTTCCCTCAAGGCCGTG 1758
Query 1768 AGACCTCATCCTGGGCGACCATTCTTCCACACCCAGCCTAGAAGCACTCCTGGGTTGATACCACGGCCTCCAGC 1841
||||||||.||.|||.|.||.|||||.|||||||||||.||.|||||.||.||.|||||.||.||.||||||||
Sbjct 1759 AGACCTCACCCGGGGAGGCCTTTCTTTCACACCCAGCCCAGGAGCACGCCCGGCTTGATCCCCCGACCTCCAGC 1832
Query 1842 CGCCCAGCCAGTGCATGGCCGGACAGACTGGGCTTCCAAGTACGCATCTCGGCGA 1896
.||.|||||.|||||.|||.|||.|||||||.|||||||||||.||||.|||||.
Sbjct 1833 TGCTCAGCCTGTGCACGGCAGGATAGACTGGTCTTCCAAGTACCCATCCCGGCGG 1887