Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000488354
- Subject:
- XM_011514421.1
- Aligned Length:
- 1917
- Identities:
- 1896
- Gaps:
- 21
Alignment
Query 1 ATGAATAGATACACAACAATCAGGCAGCTCGGGGATGGAACCTACGGTTCCGTCCTGCTGGGAAGAAGCATTGA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAATAGATACACAACAATCAGGCAGCTCGGGGATGGAACCTACGGTTCCGTCCTGCTGGGAAGAAGCATTGA 74
Query 75 GTCTGGGGAGCTGATCGCTATTAAAAAAATGAAAAGAAAATTTTATTCCTGGGAGGAATGCATGAACCTTCGGG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GTCTGGGGAGCTGATCGCTATTAAAAAAATGAAAAGAAAATTTTATTCCTGGGAGGAATGCATGAACCTTCGGG 148
Query 149 AGGTTAAGTCTTTAAAGAAGCTCAACCATGCCAATGTAGTCAAATTAAAAGAAGTTATCAGGGAAAATGATCAT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AGGTTAAGTCTTTAAAGAAGCTCAACCATGCCAATGTAGTCAAATTAAAAGAAGTTATCAGGGAAAATGATCAT 222
Query 223 CTTTATTTTATCTTCGAGTACATGAAGGAAAATCTTTACCAGCTCATTAAAGAGAGAAATAAGTTGTTTCCTGA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CTTTATTTTATCTTCGAGTACATGAAGGAAAATCTTTACCAGCTCATTAAAGAGAGAAATAAGTTGTTTCCTGA 296
Query 297 GTCTGCTATAAGGAATATCATGTATCAGATATTACAAGGACTCGCATTTATTCACAAACACGGCTTCTTTCATC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GTCTGCTATAAGGAATATCATGTATCAGATATTACAAGGACTCGCATTTATTCACAAACACGGCTTCTTTCATC 370
Query 371 GAGACTTAAAGCCTGAGAACCTCCTCTGCATGGGACCAGAACTTGTGAAAATTGCAGACTTTGGTTTGGCCCGA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GAGACTTAAAGCCTGAGAACCTCCTCTGCATGGGACCAGAACTTGTGAAAATTGCAGACTTTGGTTTGGCCCGA 444
Query 445 GAAATACGATCAAAACCTCCATATACAGATTATGTATCTACCAGATGGTACAGGGCTCCAGAAGTACTCCTGAG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GAAATACGATCAAAACCTCCATATACAGATTATGTATCTACCAGATGGTACAGGGCTCCAGAAGTACTCCTGAG 518
Query 519 GTCTACCAACTACAGCTCCCCCATTGACGTCTGGGCGGTGGGCTGCATCATGGCAGAAGTTTACACCCTCAGGC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GTCTACCAACTACAGCTCCCCCATTGACGTCTGGGCGGTGGGCTGCATCATGGCAGAAGTTTACACCCTCAGGC 592
Query 593 CACTCTTCCCTGGAGCCAGTGAAATTGACACAATATTCAAAATTTGCCAAGTGCTGGGGACACCAAAAAAGACT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CACTCTTCCCTGGAGCCAGTGAAATTGACACAATATTCAAAATTTGCCAAGTGCTGGGGACACCAAAAAAGACT 666
Query 667 GACTGGCCTGAAGGCTATCAACTTTCAAGTGCAATGAACTTCCGTTGGCCACAGTGTGTACCCAATAACTTAAA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GACTGGCCTGAAGGCTATCAACTTTCAAGTGCAATGAACTTCCGTTGGCCACAGTGTGTACCCAATAACTTAAA 740
Query 741 GACCTTGATTCCCAATGCTAGCAGTGAAGCAGTCCAGCTCCTGAGAGACATGCTTCAGTGGGATCCCAAGAAAC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GACCTTGATTCCCAATGCTAGCAGTGAAGCAGTCCAGCTCCTGAGAGACATGCTTCAGTGGGATCCCAAGAAAC 814
Query 815 GACCAACAGCTAGTCAGGCACTTCGATATCCTTACTTCCAAGTTGGACACCCACTAGGCAGCACCACACAAAAC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GACCAACAGCTAGTCAGGCACTTCGATATCCTTACTTCCAAGTTGGACACCCACTAGGCAGCACCACACAAAAC 888
Query 889 CTTCAGGATTCAGAAAAACCACAGAAAGGCATCCTGGAAAAGGCAGGCCCACCTCCTTATATTAAGCCAGTCCC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CTTCAGGATTCAGAAAAACCACAGAAAGGCATCCTGGAAAAGGCAGGCCCACCTCCTTATATTAAGCCAGTCCC 962
Query 963 ACCTGCCCAGCCACCAGCCAAGCCACACACACGAATTTCTTCACGACAGCATCAAGCCAGCCAGCCCCCTCTGC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 ACCTGCCCAGCCACCAGCCAAGCCACACACACGAATTTCTTCACGACAGCATCAAGCCAGCCAGCCCCCTCTGC 1036
Query 1037 ATCTCACGTACCCCTACAAAGCAGAGGTCTCCAGGACAGATCACCCAAGCCATCTCCAGGAGGACAAGCCAAGC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 ATCTCACGTACCCCTACAAAGCAGAGGTCTCCAGGACAGATCACCCAAGCCATCTCCAGGAGGACAAGCCAAGC 1110
Query 1111 CCGTTGCTTTTCCCATCCCTCCACAACAAGCATCCACAGTCG---------------------AAAATCACAGC 1163
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1111 CCGTTGCTTTTCCCATCCCTCCACAACAAGCATCCACAGTCGGTGAGCAGCCCAGATTCACCAAAAATCACAGC 1184
Query 1164 TGGCCTGGAGCACAAAAATGGTGAGATAAAGCCAAAGAGTAGGAGAAGGTGGGGTCTTATTTCCAGGTCAACAA 1237
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TGGCCTGGAGCACAAAAATGGTGAGATAAAGCCAAAGAGTAGGAGAAGGTGGGGTCTTATTTCCAGGTCAACAA 1258
Query 1238 AGGATTCAGATGATTGGGCTGACTTGGATGACTTGGATTTCAGTCCATCCCTCAGCAGGATTGACCTGAAAAAC 1311
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AGGATTCAGATGATTGGGCTGACTTGGATGACTTGGATTTCAGTCCATCCCTCAGCAGGATTGACCTGAAAAAC 1332
Query 1312 AAGAAAAGACAGAGTGATGACACTCTCTGCAGGTTTGAGAGTGTTTTGGACCTGAAGCCCTCTGAGCCTGTGGG 1385
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 AAGAAAAGACAGAGTGATGACACTCTCTGCAGGTTTGAGAGTGTTTTGGACCTGAAGCCCTCTGAGCCTGTGGG 1406
Query 1386 CACAGGAAACAGTGCCCCCACCCAGACGTCATATCAGCGGCGAGACACGCCCACCCTGAGATCTGCAGCCAAGC 1459
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CACAGGAAACAGTGCCCCCACCCAGACGTCATATCAGCGGCGAGACACGCCCACCCTGAGATCTGCAGCCAAGC 1480
Query 1460 AGCACTATTTGAAGCACTCTCGATACTTGCCTGGGATCAGTATAAGAAATGGCATACTCTCGAATCCAGGCAAG 1533
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 AGCACTATTTGAAGCACTCTCGATACTTGCCTGGGATCAGTATAAGAAATGGCATACTCTCGAATCCAGGCAAG 1554
Query 1534 GAATTTATTCCACCTAATCCATGGTCTAGTTCTGGCTTGTCTGGAAAATCTTCAGGGACAATGTCAGTAATCAG 1607
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GAATTTATTCCACCTAATCCATGGTCTAGTTCTGGCTTGTCTGGAAAATCTTCAGGGACAATGTCAGTAATCAG 1628
Query 1608 CAAAGTAAATTCAGTTGGTTCCAGCTCTACAAGTTCTAGTGGACTGACTGGAAACTATGTCCCTTCCTTTCTGA 1681
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 CAAAGTAAATTCAGTTGGTTCCAGCTCTACAAGTTCTAGTGGACTGACTGGAAACTATGTCCCTTCCTTTCTGA 1702
Query 1682 AAAAAGAAATCGGTTCTGCTATGCAGAGGGTACACCTAGCACCTATTCCAGACCCTTCCCCTGGTTATTCCTCC 1755
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 AAAAAGAAATCGGTTCTGCTATGCAGAGGGTACACCTAGCACCTATTCCAGACCCTTCCCCTGGTTATTCCTCC 1776
Query 1756 CTGAAGGCCATGAGACCTCATCCTGGGCGACCATTCTTCCACACCCAGCCTAGAAGCACTCCTGGGTTGATACC 1829
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 CTGAAGGCCATGAGACCTCATCCTGGGCGACCATTCTTCCACACCCAGCCTAGAAGCACTCCTGGGTTGATACC 1850
Query 1830 ACGGCCTCCAGCCGCCCAGCCAGTGCATGGCCGGACAGACTGGGCTTCCAAGTACGCATCTCGGCGA 1896
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 ACGGCCTCCAGCCGCCCAGCCAGTGCATGGCCGGACAGACTGGGCTTCCAAGTACGCATCTCGGCGA 1917