Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000488391
- Subject:
- NM_207655.2
- Aligned Length:
- 3650
- Identities:
- 3079
- Gaps:
- 55
Alignment
Query 1 ATGCGACCCTCCGGGACGGCCGGGGCAGCGCTCCTGGCGCTGCTGGCTGCGCTCTGCCCGGCGAGTCGGGCTCT 74
|||||||||||.|||||.||..|..|..|.||.||||.|.|||||.|.|||||||||.|.||..||.||||..|
Sbjct 1 ATGCGACCCTCAGGGACCGCGAGAACCACACTGCTGGTGTTGCTGACCGCGCTCTGCGCCGCAGGTGGGGCGTT 74
Query 75 GGAGGAAAAGAAAGTTTGCCAAGGCACGAGTAACAAGCTCACGCAGTTGGGCACTTTTGAAGATCATTTTCTCA 148
|||||||||||||||.|||||||||||.|||||||.||||||.||..||||||||||||||||.||.|||||.|
Sbjct 75 GGAGGAAAAGAAAGTCTGCCAAGGCACAAGTAACAGGCTCACCCAACTGGGCACTTTTGAAGACCACTTTCTGA 148
Query 149 GCCTCCAGAGGATGTTCAATAACTGTGAGGTGGTCCTTGGGAATTTGGAAATTACCTATGTGCAGAGGAATTAT 222
||||.||||||||||.|||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 149 GCCTGCAGAGGATGTACAACAACTGTGAAGTGGTCCTTGGGAACTTGGAAATTACCTATGTGCAAAGGAATTAC 222
Query 223 GATCTTTCCTTCTTAAAGACCATCCAGGAGGTGGCTGGTTATGTCCTCATTGCCCTCAACACAGTGGAGCGAAT 296
||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||.||||
Sbjct 223 GACCTTTCCTTCTTAAAGACCATCCAGGAGGTGGCCGGCTATGTCCTCATTGCCCTCAACACCGTGGAGAGAAT 296
Query 297 TCCTTTGGAAAACCTGCAGATCATCAGAGGAAATATGTAC--TACGAAAATTCCTATGCCTTAGCAGTCTTATC 368
.||||||||.|||||||||||||||||.|||| |||..| ||.|||||..|||||||||||||..||.|.||
Sbjct 297 CCCTTTGGAGAACCTGCAGATCATCAGGGGAA--ATGCTCTTTATGAAAACACCTATGCCTTAGCCATCCTGTC 368
Query 369 TAACTATGATGCAAATAAAACCGGACTGAAGGAGCTGCCCATGAGAAATTTACAGGAAATCCTGCATGGCGCCG 442
.|||||||...||||.|.|||.||.||.|.|||.|||||||||.|.||.|||||||||||||||..|||.||.|
Sbjct 369 CAACTATGGGACAAACAGAACTGGGCTTAGGGAACTGCCCATGCGGAACTTACAGGAAATCCTGATTGGTGCTG 442
Query 443 TGCGGTTCAGCAACAACCCTGCCCTGTGCAACGTGGAGAGCATCCAGTGGCGGGACATAGTCAGCA----GTGA 512
||||.||||||||||||||...|||.|||||..||||.|..|||||||||.|||||||.||| || ||
Sbjct 443 TGCGATTCAGCAACAACCCCATCCTCTGCAATATGGATACTATCCAGTGGAGGGACATCGTC--CAAAACGT-- 512
Query 513 CTTTCTCAGCAACATGTCGATGGACTTCCAGAACCACCTGGGCAGCTGCCAAAAGTGTGATCCAAGCTGTCCCA 586
||||.|.|||||||||||.||||||||.||||.|||.|.|.||||.||||..||.|||||||||||||||||||
Sbjct 513 CTTTATGAGCAACATGTCAATGGACTTACAGAGCCATCCGAGCAGTTGCCCCAAATGTGATCCAAGCTGTCCCA 586
Query 587 ATGGGAGCTGCTGGGGTGCAGGAGAGGAGAACTGCCAGAAACTGACCAAAATCATCTGTGCCCAGCAGTGCTCC 660
||||.|||||||||||.|.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 587 ATGGAAGCTGCTGGGGAGGAGGAGAGGAGAACTGCCAGAAATTGACCAAAATCATCTGTGCCCAGCAATGTTCC 660
Query 661 GGGCGCTGCCGTGGCAAGTCCCCCAGTGACTGCTGCCACAACCAGTGTGCTGCAGGCTGCACAGGCCCCCGGGA 734
...|||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.|||||.||
Sbjct 661 CATCGCTGTCGTGGCAGGTCCCCCAGTGACTGCTGCCACAACCAATGTGCTGCGGGGTGTACAGGGCCCCGAGA 734
Query 735 GAGCGACTGCCTGGTCTGCCGCAAATTCCGAGACGAAGCCACGTGCAAGGACACCTGCCCCCCACTCATGCTCT 808
|||.|||||.||||||||||..||.||||.|||.||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 735 GAGTGACTGTCTGGTCTGCCAAAAGTTCCAAGATGAGGCCACATGCAAAGACACCTGCCCACCACTCATGCTGT 808
Query 809 ACAACCCCACCACGTACCAGATGGATGTGAACCCCGAGGGCAAATACAGCTTTGGTGCCACCTGCGTGAAGAAG 882
|||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 809 ACAACCCCACCACCTATCAGATGGATGTCAACCCTGAAGGGAAGTACAGCTTTGGTGCCACCTGTGTGAAGAAG 882
Query 883 TGTCCCCGTAATTATGTGGTGACAGATCACGGCTCGTGCGTCCGAGCCTGTGGGGCCGACAGCTATGAGATGGA 956
||.|||||.||.||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||.|.|||..|||.||..||||
Sbjct 883 TGCCCCCGAAACTACGTGGTGACAGATCATGGCTCATGTGTCCGAGCCTGTGGGCCTGACTACTACGAAGTGGA 956
Query 957 GGAAGACGGCGTCCGCAAGTGTAAGAAGTGCGAAGGGCCTTGCCGCAAAGTGTGTAACGGAATAGGTATTGGTG 1030
.|||||.|||.|||||||||||||.||.||.||.|||||.||.||||||||.|||||.||.|||||.|||||||
Sbjct 957 AGAAGATGGCATCCGCAAGTGTAAAAAATGTGATGGGCCCTGTCGCAAAGTTTGTAATGGCATAGGCATTGGTG 1030
Query 1031 AATTTAAAGACTCACTCTCCATAAATGCTACGAATATTAAACACTTCAAAAACTGCACCTCCATCAGTGGCGAT 1104
|||||||||||.|||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||.|||||||..|||||||.||.||.
Sbjct 1031 AATTTAAAGACACACTCTCCATAAATGCTACAAACATCAAACACTTCAAATACTGCACTGCCATCAGCGGGGAC 1104
Query 1105 CTCCACATCCTGCCGGTGGCATTTAGGGGTGACTCCTTCACACATACTCCTCCTCTGGATCCACAGGAACTGGA 1178
||.|||||||||||.|||||.||||.|||.||.||.|||||.|..|||||||||||.||.||||..|||||.||
Sbjct 1105 CTTCACATCCTGCCAGTGGCCTTTAAGGGGGATTCTTTCACGCGCACTCCTCCTCTAGACCCACGAGAACTAGA 1178
Query 1179 TATTCTGAAAACCGTAAAGGAAATCACAGGGTTTTTGCTGATTCAGGCTTGGCCTGAAAACAGGACGGACCTCC 1252
.|||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||.||||.|||||||
Sbjct 1179 AATTCTAAAAACCGTAAAGGAAATAACAGGCTTTTTGCTGATTCAGGCTTGGCCTGATAACTGGACTGACCTCC 1252
Query 1253 ATGCCTTTGAGAACCTAGAAATCATACGCGGCAGGACCAAGCAACATGGTCAGTTTTCTCTTGCAGTCGTCAGC 1326
||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||.|.||.|||||..||
Sbjct 1253 ATGCTTTCGAGAACCTAGAAATAATACGTGGCAGAACAAAGCAACATGGTCAGTTTTCTTTGGCGGTCGTTGGC 1326
Query 1327 CTGAACATAACATCCTTGGGATTACGCTCCCTCAAGGAGATAAGTGATGGAGATGTGATAATTTCAGGAAACAA 1400
||||||||.|||||..||||..|.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||..
Sbjct 1327 CTGAACATCACATCACTGGGGCTGCGTTCCCTCAAGGAGATCAGTGATGGGGATGTGATCATTTCTGGAAACCG 1400
Query 1401 AAATTTGTGCTATGCAAATACAATAAACTGGAAAAAACTGTTTGGGACCTCCGGTCAGAAAACCAAAATTATAA 1474
||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||..||..|||||||||||||||.||.|
Sbjct 1401 AAATTTGTGCTACGCAAACACAATAAACTGGAAAAAACTCTTCGGGACACCCAATCAGAAAACCAAAATCATGA 1474
Query 1475 GCAACAGAGGTGAAAACAG-CTGCAAGGCCACAGG----CCAGGTCTGCCATGCCTTGTGCTCCCCCGAGGGCT 1543
.||||||||.|||.|| || |||||||||| | |||.||||||.||.|.||.||||||.|.||.||||
Sbjct 1475 ACAACAGAGCTGAGAA-AGACTGCAAGGCC----GTGAACCACGTCTGCAATCCTTTATGCTCCTCGGAAGGCT 1543
Query 1544 GCTGGGGCCCGGAGCCCAGGGACTGCGTCTCTTGCCGGAATGTCAGCCGAGGCAGGGAATGCGTGGACAAGTGC 1617
||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||.||||||.|||.||||||||||.||||||||.||.|||
Sbjct 1544 GCTGGGGCCCTGAGCCCAGGGACTGTGTCTCCTGCCAGAATGTGAGCAGAGGCAGGGAGTGCGTGGAGAAATGC 1617
Query 1618 AACCTTCTGGAGGGTGAGCCAAGGGAGTTTGTGGAGAACTCTGAGTGCATACAGTGCCACCCAGAGTGCCTGCC 1691
|||.|.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||.||.|||||
Sbjct 1618 AACATCCTGGAGGGGGAACCAAGGGAGTTTGTGGAAAATTCTGAATGCATCCAGTGCCATCCAGAATGTCTGCC 1691
Query 1692 TCAGGCCATGAACATCACCTGCACAGGACGGGGACCAGACAACTGTATCCAGTGTGCCCACTACATTGACGGCC 1765
.||||||||||||||||||||.|||||..||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1692 CCAGGCCATGAACATCACCTGTACAGGCAGGGGACCAGACAACTGCATCCAGTGTGCCCACTACATTGATGGCC 1765
Query 1766 CCCACTGCGTCAAGACCTGCCCGGCAGGAGTCATGGGAGAAAACAACACCCTGGTCTGGAAGTACGCAGACGCC 1839
|.|||||.||||||||||||||.||.||..||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 1766 CACACTGTGTCAAGACCTGCCCAGCTGGCATCATGGGAGAGAACAACACTCTGGTCTGGAAGTATGCAGATGCC 1839
Query 1840 GGCCATGTGTGCCACCTGTGCCATCCAAACTGCACCTACGGATGCACTGGGCCAGGTCTTGAAGGCTGT----- 1908
....||||.||||||||.|||||..|.|||||.|||||.|||||..||||||||||||||.||||.|||
Sbjct 1840 AATAATGTCTGCCACCTATGCCACGCCAACTGTACCTATGGATGTGCTGGGCCAGGTCTTCAAGGATGTGAAGT 1913
Query 1909 ----CCAACGAATGGGCCTAAGATCCCGTCCATCGCCACTGGGATGGTGGGGGCCCTCCTCTTGCTGCTGGTGG 1978
|||.| ||||||.|||||.||.||.||.|||||||||||.|||||.|.|||||||||..|..||||||
Sbjct 1914 GTGGCCATC---TGGGCCAAAGATACCATCTATTGCCACTGGGATTGTGGGTGGCCTCCTCTTCATAGTGGTGG 1984
Query 1979 TGGCCCTGGGGATCGGCCTCTTCATGCGAAGGCGCCACATCGTTCGGAAGCGCACGCTGCGGAGGCTGCTGCAG 2052
|||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||.||.||..|.|||||.||.
Sbjct 1985 TGGCCCTTGGGATTGGCCTATTCATGCGAAGACGTCACATTGTTCGAAAGCGTACACTACGCCGCCTGCTTCAA 2058
Query 2053 GAGAGGGAGCTTGTGGAGCCTCTTACACCCAGTGGAGAAGCTCCCAACCAAGCTCTCTTGAGGATCTTGAAGGA 2126
|||||.|||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|.|||||||||.||.|||||
Sbjct 2059 GAGAGAGAGCTCGTGGAACCTCTCACACCCAGCGGAGAAGCTCCAAACCAAGCCCACTTGAGGATATTAAAGGA 2132
Query 2127 AACTGAATTCAAAAAGATCAAAGTGCTGGGCTCCGGTGCGTTCGGCACGGTGTATAAGGGACTCTGGATCCCAG 2200
|||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 2133 AACAGAATTCAAAAAGATCAAAGTTCTGGGTTCGGGAGCATTTGGCACAGTGTATAAGGGTCTCTGGATCCCAG 2206
Query 2201 AAGGTGAGAAAGTTAAAATTCCCGTCGCTATCAAG---------------ACATCTCCGAAAGCCAACAAGGAA 2259
|||||||||||||.|||||.||.||.||.|||||| ||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct 2207 AAGGTGAGAAAGTAAAAATCCCGGTGGCCATCAAGGAGTTAAGAGAAGCCACATCTCCAAAAGCCAACAAAGAA 2280
Query 2260 ATCCTCGATGAAGCCTACGTGATGGCCAGCGTGGACAACCCCCACGTGTGCCGCCTGCTGGGCATCTGCCTCAC 2333
|||||.||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||.||.||
Sbjct 2281 ATCCTTGACGAAGCCTATGTGATGGCTAGTGTGGACAACCCTCATGTATGCCGCCTCCTGGGCATCTGTCTGAC 2354
Query 2334 CTCCACCGTGCAACTCATCACGCAGCTCATGCCCTTCGGCTGCCTCCTGGACTATGTCCGGGAACACAAAGACA 2407
||||||.||.||.|||||.||.|||||||||||||.|||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||||
Sbjct 2355 CTCCACTGTCCAGCTCATTACACAGCTCATGCCCTACGGTTGCCTCCTGGACTACGTCCGAGAACACAAGGACA 2428
Query 2408 ATATTGGCTCCCAGTACCTGCTCAACTGGTGTGTGCAGATCGCAAAGGGCATGAACTACTTGGAGGACCGTCGC 2481
|.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||.||.||.||.
Sbjct 2429 ACATTGGCTCCCAGTACCTCCTCAACTGGTGTGTGCAGATTGCAAAGGGCATGAACTACCTGGAAGATCGGCGT 2502
Query 2482 TTGGTGCACCGCGACCTGGCAGCCAGGAACGTACTGGTGAAAACACCGCAGCATGTCAAGATCACAGATTTTGG 2555
|||||||||||.|||.|||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2503 TTGGTGCACCGTGACTTGGCAGCCAGGAATGTACTGGTGAAGACACCACAGCATGTCAAGATCACAGATTTTGG 2576
Query 2556 GCTGGCCAAACTGCTGGGTGCGGAAGAGAAAGAATACCATGCAGAAGGAGGCAAAGTGCCTATCAAGTGGATGG 2629
|||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2577 GCTGGCCAAACTGCTTGGTGCTGAAGAGAAAGAATATCATGCCGAGGGGGGCAAAGTGCCTATCAAGTGGATGG 2650
Query 2630 CATTGGAATCAATTTTACACAGAATCTATACCCACCAGAGTGATGTCTGGAGCTACGGGGTGACCGTTTGGGAG 2703
|.||||||||||||||||||.||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||.
Sbjct 2651 CTTTGGAATCAATTTTACACCGAATTTATACACACCAAAGTGATGTCTGGAGCTATGGTGTCACTGTGTGGGAA 2724
Query 2704 TTGATGACCTTTGGATCCAAGCCATATGACGGAATCCCTGCCAGCGAGATCTCCTCCATCCTGGAGAAAGGAGA 2777
.|||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||.||.||.|||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 2725 CTGATGACCTTTGGGTCCAAGCCTTATGATGGAATCCCAGCAAGTGACATCTCATCCATCCTAGAGAAAGGAGA 2798
Query 2778 ACGCCTCCCTCAGCCACCCATATGTACCATCGATGTCTACATGATCATGGTCAAGTGCTGGATGATAGACGCAG 2851
.|||||.||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 2799 GCGCCTTCCACAGCCACCTATCTGCACCATCGATGTCTACATGATCATGGTCAAGTGCTGGATGATAGATGCTG 2872
Query 2852 ATAGTCGCCCAAAGTTCCGTGAGTTGATCATCGAATTCTCCAAAATGGCCCGAGACCCCCAGCGCTACCTTGTC 2925
||||.||||||||||||||.||||||||..|.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 2873 ATAGCCGCCCAAAGTTCCGAGAGTTGATTCTTGAATTCTCCAAAATGGCCCGAGACCCACAGCGCTACCTTGTT 2946
Query 2926 ATTCAGGGGGATGAAAGAATGCATTTGCCAAGTCCTACAGACTCCAACTTCTACCGTGCCCTGATGGATGAAGA 2999
||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct 2947 ATCCAGGGGGATGAAAGAATGCATTTGCCAAGCCCTACAGACTCCAACTTTTACCGAGCCCTGATGGATGAAGA 3020
Query 3000 AGACATGGACGACGTGGTGGATGCCGACGAGTACCTCATCCCACAGCAGGGCTTCTTCAGCAGCCCCTCCACGT 3073
.||||||||.||.||.||.|||||.||.|||||.||.|||||||||||.||||||||||.||||||.|||||||
Sbjct 3021 GGACATGGAGGATGTAGTTGATGCTGATGAGTATCTTATCCCACAGCAAGGCTTCTTCAACAGCCCGTCCACGT 3094
Query 3074 CACGGACTCCCCTCCTGAGCTCTCTGAGTGCAACCAGCAACAATTCCACCGTGGCTTGCATTGATAGAAATGGG 3147
|..|||||||||||.||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 3095 CGAGGACTCCCCTCTTGAGTTCTCTGAGTGCAACTAGCAACAATTCCACTGTGGCTTGCATTAATAGAAATGGG 3168
Query 3148 CTGCAAAGCTGTCCCATCAAGGAAGACAGCTTCTTGCAGCGATACAGCTCAGACCCCACAGGCGCCTTGACTGA 3221
|||||.|...||||.||||||..||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||..|.||.||
Sbjct 3169 ------AGCTGCCGTGTCAAAGAAGACGCCTTCTTGCAGCGGTACAGCTCCGACCCCACAGGTGCTGTAACAGA 3236
Query 3222 GGACAGCATAGACGACACCTTCCTCCCAGTGCCTGAATACATAAACCAGTCCGTTCCCAAAAGGCCCGCTGGAT 3295
|||||.||||||.|||.|.||||||||.||.||||||||..|||||||.||.||||||||.|||||.||.||.|
Sbjct 3237 GGACAACATAGATGACGCATTCCTCCCTGTACCTGAATATGTAAACCAATCTGTTCCCAAGAGGCCAGCAGGCT 3310
Query 3296 CTGTGCAGAATCCTGTCTATCACAATCAGCCTCTGAACCCCGCGCCCAGCAGAGACCCACACTACCAGGACCCC 3369
||||||||||.||||||||||||||||||||.|||.|.||.||.||..|.|||||||..||.||.||..|.|||
Sbjct 3311 CTGTGCAGAACCCTGTCTATCACAATCAGCCCCTGCATCCAGCTCCTGGAAGAGACCTGCATTATCAAAATCCC 3384
Query 3370 CACAGCACTGCAGTGGGCAACCCCGAGTATCTCAACACTGTCCAGCCCACCTGTGTCAACAGCACATTCGACAG 3443
|||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||.||||||.|||..||....||..||||
Sbjct 3385 CACAGCAATGCAGTGGGCAACCCTGAGTATCTCAACACTGCCCAGCCTACCTGTCTCAGTAGTGGGTTTAACAG 3458
Query 3444 CCCTGCCCACTGGGCCCAGAAAGGCAGCCACCAAATTAGCCTGGACAACCCTGACTACCAGCAGGACTTCTTTC 3517
||||||.|.||||..||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 3459 CCCTGCACTCTGGATCCAGAAAGGCAGTCACCAAATGAGCCTAGACAACCCTGACTACCAGCAGGACTTCTTCC 3532
Query 3518 CCAAGGAAGCCAAGCCAAATGGCATCTTTAAGGGCTCCACAGCTGAAAATGCAGAATACCTAAGGGTCGCGCCA 3591
||||||||.||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||.||||||.||||.||.||.
Sbjct 3533 CCAAGGAAACCAAGCCAAATGGCATATTTAAGGGCCCCACAGCTGAAAATGCAGAGTACCTACGGGTGGCACCT 3606
Query 3592 CAAAGCAGTGAATTTATTGGAGCA 3615
|.|||||||||.||||||||||||
Sbjct 3607 CCAAGCAGTGAGTTTATTGGAGCA 3630