Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488412
• Subject: NM_010717.3
• Aligned Length: 1941
• Identities: 1708
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGAGGTTGACGCTACTTTGTTGCACCTGGAGGGAAGAACGTATGGGAGAGGAAGGAAGCGAGTTGCCCGTGTG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct    1  ATGAGGTTGACGCTACTTTGTTGCACCTGGAGGGAAGAACGTATGGGAGAGGAAGGAAGCGAGTTGCCTGTGTG  74

Query   75  TGCAAGCTGCGGCCAGAGGATCTATGATGGCCAGTACCTCCAGGCCCTGAACGCGGACTGGCACGCAGACTGCT  148
            |||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||
Sbjct   75  TGCGAGCTGTGGCCAGAGGATCTATGACGGCCAGTACCTCCAGGCCCTGAATGCTGACTGGCATGCAGACTGCT  148

Query  149  TCAGGTGTTGTGACTGCAGTGCCTCCCTGTCGCACCAGTACTATGAGAAGGATGGGCAGCTCTTCTGCAAGAAG  222
            |||||||.||.||.||.||.|.||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCAGGTGCTGCGAGTGTAGCGTCTCCCTTTCACACCAGTACTACGAGAAGGATGGACAGCTCTTCTGCAAGAAG  222

Query  223  GACTACTGGGCCCGCTATGGCGAGTCCTGCCATGGGTGCTCTGAGCAAATCACCAAGGGACTGGTTATGGTGGC  296
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.||||||||
Sbjct  223  GACTACTGGGCCCGCTATGGCGAGTCTTGCCACGGGTGCTCCGAGCACATCACCAAAGGGCTGGTCATGGTGGC  296

Query  297  TGGGGAGCTGAAGTACCACCCCGAGTGTTTCATCTGCCTCACGTGTGGGACCTTTATCGGTGACGGGGACACCT  370
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|.|||||.|.|||.||.||.||.||||||||||
Sbjct  297  TGGGGAGCTGAAGTACCACCCTGAGTGTTTCATCTGCCTCGCCTGTGGAAACTTCATTGGCGATGGGGACACCT  370

Query  371  ACACGCTGGTGGAGCACTCCAAGCTGTACTGCGGGCACTGCTACTACCAGACTGTGGTGACCCCCGTCATCGAG  444
            ||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||.
Sbjct  371  ACACACTGGTGGAGCACTCCAAGCTGTACTGTGGCCAGTGCTACTACCAGACCGTGGTAACTCCAGTCATCGAA  444

Query  445  CAGATCCTGCCTGACTCCCCTGGCTCCCACCTGCCCCACACCGTCACCCTGGTGTCCATCCCAGCCTCATCTCA  518
            ||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||..|.||
Sbjct  445  CAGATCCTACCTGACTCACCCGGCTCCCACCTGCCCCACACAGTCACCCTCGTGTCTATCCCAGCCTCTGCCCA  518

Query  519  TGGCAAGCGTGGACTTTCAGTCTCCATTGACCCCCCGCACGGCCCACCGGGCTGTGGCACCGAGCACTCACACA  592
            ||||||.||.||.||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||.||.||||
Sbjct  519  TGGCAAACGAGGCCTGTCTGTCTCCATCGACCCCCCTCACGGCCCACCAGGATGTGGCACGGAGCATTCGCACA  592

Query  593  CCGTCCGCGTCCAGGGAGTGGATCCGGGCTGCATGAGCCCAGATGTGAAGAATTCCATCCACGTCGGAGACCGG  666
            |.|||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  593  CTGTCCGAGTCCAAGGAGTGGACCCAGGCTGCATGAGCCCAGATGTGAAGAATTCCATCCACGTTGGAGACCGG  666

Query  667  ATCTTGGAAATCAATGGCACGCCCATCCGAAATGTGCCCCTGGACGAGATTGACCTGCTGATTCAGGAAACCAG  740
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||.|||||||.|||||.|||||
Sbjct  667  ATCTTGGAAATCAATGGCACGCCCATCCGGAATGTGCCGCTGGACGAGATCGACTTGCTGATCCAGGAGACCAG  740

Query  741  CCGCCTGCTCCAGCTGACCCTCGAGCATGACCCTCACGATACACTGGGCCACGGGCTGGGGCCTGAGACCAGCC  814
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||..||||||||||.||||..|.|.|.||..||||||
Sbjct  741  CCGCCTGCTCCAGCTGACCCTCGAGCACGACCCCCATGACTCACTGGGCCATGGGCCCGTGTCGGATCCCAGCC  814

Query  815  CCCTGAGCTCTCCGGCTTATACTCCCAGCGGGGAGGCGGGCAGCTCTGCCCGGCAGAAACCTGTCTTGAGGAGC  888
            ||||||||||.||||...|.|||||||||||..||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCCTGAGCTCCCCGGTGCACACTCCCAGCGGACAGGCAGCCAGCTCTGCCCGGCAGAAACCTGTCTTGAGGAGC  888

Query  889  TGCAGCATCGACAGGTCTCCGGGCGCTGGCTCACTGGGCTCCCCGGCCTCCCAGCGCAAGGACCTGGGTCGCTC  962
            |||||.||.||||.|||.|||||..|..|||||||.|.|||.||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TGCAGTATTGACACGTCCCCGGGTACCAGCTCACTAGCCTCTCCAGCCTCCCAGCGCAAGGACCTGGGTCGCTC  962

Query  963  TGAGTCCCTCCGCGTAGTCTGCCGGCCACACCGCATCTTCCGGCCGTCGGACCTCATCCACGGGGAGGTGCTGG  1036
            .||.||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||.|||||.|||||||
Sbjct  963  CGAATCCCTCCGAGTGGTCTGCCGACCACACCGAATCTTCCGGCCATCTGATCTCATCCATGGGGAAGTGCTGG  1036

Query 1037  GCAAGGGCTGCTTCGGCCAGGCTATCAAGGTGACACACCGTGAGACAGGTGAGGTGATGGTGATGAAGGAGCTG  1110
            ||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 1037  GCAAGGGCTGTTTTGGCCAGGCCATCAAGGTGACACACCGAGAAACAGGCGAGGTGATGGTGATGAAGGAACTT  1110

Query 1111  ATCCGGTTCGACGAGGAGACCCAGAGGACGTTCCTCAAGGAGGTGAAGGTCATGCGATGCCTGGAACACCCCAA  1184
            ||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||
Sbjct 1111  ATCCGGTTTGATGAGGAGACCCAGAGGACATTCCTCAAGGAGGTAAAGGTCATGCGCTGCCTGGAGCACCCTAA  1184

Query 1185  CGTGCTCAAGTTCATCGGGGTGCTCTACAAGGACAAGAGGCTCAACTTCATCACTGAGTACATCAAGGGCGGCA  1258
            ||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CGTGCTCAAGTTCATCGGAGTGCTCTACAAGGACAAGCGGCTAAACTTCATCACAGAGTACATCAAGGGCGGCA  1258

Query 1259  CGCTCCGGGGCATCATCAAGAGCATGGACAGCCAGTACCCATGGAGCCAGAGAGTGAGCTTTGCCAAGGACATC  1332
            |.||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||.
Sbjct 1259  CCCTGCGGGGCATCATCAAGAACATGGACAGCCAGTACCCGTGGAGTCAGAGGGTCAGCTTTGCCAAGGACATT  1332

Query 1333  GCATCAGGGATGGCCTACCTCCACTCCATGAACATCATCCACCGAGACCTCAACTCCCACAACTGCCTGGTCCG  1406
            |||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1333  GCATCAGGGATGGCCTACCTCCATTCGATGAACATCATCCACCGAGACCTCAACTCCCACAACTGTCTGGTCCG  1406

Query 1407  CGAGAACAAGAATGTGGTGGTGGCTGACTTCGGGCTGGCGCGTCTCATGGTGGACGAGAAGACTCAGCCTGAGG  1480
            .|||||.|.|||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||.|.||.||.||||.||||.||||.|
Sbjct 1407  TGAGAATAGGAACGTGGTGGTGGCCGACTTTGGGCTGGCTCGACTCATGATCGATGAAAAGAATCAGTCTGAAG  1480

Query 1481  GCCTGCGGAGCCTCAAGAAGCCAGACCGCAAGAAGCGCTACACCGTGGTGGGCAACCCCTACTGGATGGCACCT  1554
            .|.|.||.|||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 1481  ACTTACGCAGCCTTAAGAAGCCGGACCGCAAGAAGCGGTACACAGTGGTGGGCAACCCCTACTGGATGGCGCCA  1554

Query 1555  GAGATGATCAACGGCCGCAGCTATGATGAGAAGGTGGATGTGTTCTCCTTTGGGATCGTCCTGTGCGAGATCAT  1628
            |||||||||||.||.||.||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.||.|||||.||
Sbjct 1555  GAGATGATCAATGGTCGTAGTTATGATGAAAAGGTGGACGTGTTTTCCTTTGGAATTGTCCTCTGTGAGATTAT  1628

Query 1629  CGGGCGGGTGAACGCAGACCCTGACTACCTGCCCCGCACCATGGACTTTGGCCTCAACGTGCGAGGATTCCTGG  1702
            ||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||..|.||.|||||||
Sbjct 1629  CGGGCGTGTGAATGCAGACCCTGACTATCTGCCCCGCACTATGGACTTTGGCCTCAATGTAAGGGGTTTCCTGG  1702

Query 1703  ACCGCTACTGCCCCCCAAACTGCCCCCCGAGCTTCTTCCCCATCACCGTGCGCTGTTGCGATCTGGACCCCGAG  1776
            ||||||||||.||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.||.||.
Sbjct 1703  ACCGCTACTGTCCACCAAACTGTCCCCCAAGTTTCTTCCCCATCACTGTGCGCTGCTGTGACCTGGATCCTGAA  1776

Query 1777  AAGAGGCCATCCTTTGTGAAGCTGGAACACTGGCTGGAGACCCTCCGCATGCACCTGGCCGGCCACCTGCCACT  1850
            |||||.||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||.||.|||||||||.||.|.||.|||||||||||
Sbjct 1777  AAGAGACCCTCTTTTGTAAAGCTGGAACAATGGCTAGAAACACTTCGCATGCACTTGTCTGGTCACCTGCCACT  1850

Query 1851  GGGCCCACAGCTGGAGCAGCTGGACAGAGGTTTCTGGGAGACCTACCGGCGCGGCGAGAGCGGACTGCCTGCCC  1924
            |||||||||.|||||.||.|||||..|.||.||||||||||||||||||||.|||||||||..|||||||||||
Sbjct 1851  GGGCCCACAACTGGAACAACTGGAGCGGGGCTTCTGGGAGACCTACCGGCGGGGCGAGAGCTCACTGCCTGCCC  1924

Query 1925  ACCCTGAGGTCCCCGAC  1941
            ||||.||||||||.|||
Sbjct 1925  ACCCCGAGGTCCCTGAC  1941