Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488448
• Subject: NM_011584.4
• Aligned Length: 1737
• Identities: 1540
• Gaps: 9

Alignment

Query    1  ATGGAGGTGAATGCAGGAGGTGTGATTGCCTATATCAGTTCTTCCAGCTCAGCCTCAAGCCCTGCCTCTTGTCA  74
            ||||||.||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGCTGAACGCAGGAGGTGTGATTGCCTACATCAGTTCCTCTAGCTCTGCCTCCAGCCCTGCCTCTTGTCA  74

Query   75  CAGTGAGGGTTCTGAGAATAGTTTCCAGTCCTCCTCCTCTTCTGTTCCATCTTCTCCAAATAGCTCTAATTCTG  148
            |||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|.||
Sbjct   75  CAGTGAGGGTTCTGAGAATAGCTTCCAGTCCTCGTCCTCGTCTGTTCCATCTTCTCCAAATAGCTCTAACTGTG  148

Query  149  ATACCAATGGTAATCCCAAGAATGGTGATCTCGCCAATATTGAAGGCATCTTGAAGAATGATCGAATAGATTGT  222
            ||.||||.||.|||||||||||.|.||||.||.|.|..||.||.||..|..||||||.|||.||.|.|||||||
Sbjct  149  ATGCCAACGGCAATCCCAAGAACGCTGATATCTCTAGCATCGATGGTGTTCTGAAGAGTGACCGCACAGATTGT  222

Query  223  TCTATGAAAACAAGCAAATCGAGTGCACCTGGGATGACAAAAAGTCATAGTGGTGTGACAAAATTTAGTGGCAT  296
            .||.||||||||.|||||.|.|||||.|||||.|||||.||.|||||.|||||..|||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCTGTGAAAACAGGCAAAACCAGTGCTCCTGGCATGACTAAGAGTCACAGTGGAATGACAAAATTTAGTGGCAT  296

Query  297  GGTTCTACTGTGTAAAGTCTGTGGGGATGTGGCGTCAGGATTCCACTATGGAGTTCATGCTTGCGAAGGCTGTA  370
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  297  GGTTCTACTGTGTAAAGTCTGTGGGGATGTGGCATCAGGATTCCACTATGGAGTTCATGCTTGTGAAGGCTGTA  370

Query  371  AGGGTTTCTTTCGGAGAAGTATTCAACAAAACATCCAGTACAAGAAGTGCCTGAAGAATGAAAACTGTTCTATA  444
            ||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.
Sbjct  371  AGGGTTTCTTTCGGAGGAGCATTCAGCAAAACATCCAGTATAAGAAGTGCCTGAAGAATGAGAACTGTTCCATC  444

Query  445  ATGAGAATGAATAGGAACAGATGTCAGCAATGTCGCTTCAAAAAGTGTCTGTCTGTTGGAATGTCAAGAGATGC  518
            |||||.|||||.||||||.|.||.|||||.||.|||||.||.||||||||||||||.||.||||||.|||||||
Sbjct  445  ATGAGGATGAACAGGAACCGGTGCCAGCAGTGCCGCTTTAAGAAGTGTCTGTCTGTGGGGATGTCACGAGATGC  518

Query  519  TGTTCGGTTTGGTCGTATTCCTAAGCGTGAAAAACAGAGGATGCTAATTGAAATGCAAAGTGCAATGAAGACCA  592
            ||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGTTCGATTTGGCCGAATTCCTAAGCGTGAAAAACAGAGAATGCTAATTGAAATGCAAAGTGCAATGAAGACCA  592

Query  593  TGATGAACAGCCAGTTCAGTGGTCACTTGCAAAATGACACATTAGTAGAACATCATGAACAGACAGCCTTGCCA  666
            |||||||||.||||||||||||.|||.||||.||||||||.||||.||||||.|||||.|||.||||..|.|||
Sbjct  593  TGATGAACACCCAGTTCAGTGGCCACCTGCAGAATGACACCTTAGCAGAACAGCATGATCAGTCAGCACTACCA  666

Query  667  GCCCAGGAACAGCTGCGACCCAAGCCCCAACTGGAGCAAGAAAACATCAAAAGCTCTTCTCCTCCATCTTCTGA  740
            ||.||||||||||||||.||||||.||||.||||||||||||||||||||||.|.||         .|||||||
Sbjct  667  GCTCAGGAACAGCTGCGGCCCAAGTCCCAGCTGGAGCAAGAAAACATCAAAAACACT---------CCTTCTGA  731

Query  741  TTTTGCAAAGGAAGAAGTGATTGGCATGGTGACCAGAGCTCACAAGGATACCTTTATGTATAATCAAGAGCAGC  814
            ||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||.||.||.|
Sbjct  732  TTTTGCAAAGGAGGAAGTGATTGGTATGGTGACCAGAGCCCACAAGGATACCTTTCTGTATAATCAGGAACATC  805

Query  815  AAGAAAACTCAGCTGAGAGCATGCAGCCCCAGAGAGGAGAACGGATTCCCAAGAACATGGAGCAATATAATTTA  888
            .||||||||||.||||||||||||..||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  806  GAGAAAACTCATCTGAGAGCATGCCACCTCAGAGAGGAGAACGGATTCCCAGGAACATGGAGCAATATAATTTA  879

Query  889  AATCATGATCATTGCGGCAATGGGCTTAGCAGCCATTTTCCCTGTAGTGAGAGCCAGCAGCATCTCAATGGACA  962
            |||||.||.|||.|.||||.||||.||..||.|||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||.||||||
Sbjct  880  AATCAAGACCATCGTGGCAGTGGGATTCACAACCACTTCCCCTGTAGTGAGAGGCAGCAACATCTCAGTGGACA  953

Query  963  GTTCAAAGGGAGGAATATAATGCATTACCCAAATGGTCATGCCATTTGTATTGCAAATGGACATTGTATGAACT  1036
            ||.||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  954  GTACAAAGGGAGGAACATAATGCATTACCCAAACGGCCATGCCGTTTGTATTGCAAATGGACACTGTATGAACT  1027

Query 1037  TCTCCAATGCTTATACTCAAAGAGTATGTGATAGAGTTCCGATAGATGGATTTTCTCAGAATGAGAACAAGAAT  1110
            ||||||.||||||||||||||||||.|||||||||.||||..|||.|||||.||||||||.||||||||..|||
Sbjct 1028  TCTCCAGTGCTTATACTCAAAGAGTCTGTGATAGAATTCCAGTAGGTGGATGTTCTCAGACTGAGAACAGAAAT  1101

Query 1111  AGTTACCTGTGCAACACTGGAGGAAGAATGCATCTGGTTTGTCCAATGAGTAAGTCTCCATATGTGGACCCTCA  1184
            |||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1102  AGTTACCTGTGCAACACTGGAGGGAGGATGCATCTGGTGTGTCCTATGAGCAAGTCTCCATATGTGGACCCTCA  1175

Query 1185  TAAATCAGGACATGAAATCTGGGAAGAATTTTCGATGAGCTTCACTCCAGCAGTGAAAGAAGTGGTGGAATTTG  1258
            .||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 1176  GAAGTCTGGACATGAAATCTGGGAAGAATTTTCAATGAGTTTTACCCCAGCAGTAAAAGAGGTGGTGGAATTTG  1249

Query 1259  CAAAGCGTATTCCTGGGTTCAGAGATCTCTCTCAGCATGACCAGGTCAACCTTTTAAAGGCTGGGACTTTTGAG  1332
            |||||.|.||||||||.|||.|||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 1250  CAAAGAGGATTCCTGGCTTCCGAGATCTGTCTCAGCATGATCAGGTCAATCTGTTAAAAGCTGGGACTTTTGAG  1323

Query 1333  GTTTTAATGGTACGGTTCGCATCATTATTTGATGCAAAGGAACGTACTGTCACCTTTTTAAGTGGAAAGAAATA  1406
            ||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||.|||||.||
Sbjct 1324  GTTTTAATGGTACGATTTGCTTCATTATTTGATGCAAAGGAACGGACTGTCACCTTTCTAAGTGGTAAGAAGTA  1397

Query 1407  TAGTGTGGATGATTTACACTCAATGGGAGCAGGGGATCTGCTAAACTCTATGTTTGAATTTAGTGAGAAGCTAA  1480
            .|||||||||||..|.||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||.||.|||||||||||.|
Sbjct 1398  CAGTGTGGATGACCTGCACTCAATGGGAGCAGGGGATCTGCTCAGCTCTATGTTTGAGTTCAGTGAGAAGCTGA  1471

Query 1481  ATGCCCTCCAACTTAGTGATGAAGAGATGAGTTTGTTTACAGCTGTTGTCCTGGTATCTGCAGATCGATCTGGA  1554
            ||||||||||.||.||||||||.||.|||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1472  ATGCCCTCCAGCTCAGTGATGAGGAAATGAGCTTGTTCACAGCAGTTGTTCTGGTATCTGCAGATCGATCTGGA  1545

Query 1555  ATAGAAAACGTCAACTCTGTGGAGGCTTTGCAGGAAACTCTCATTCGTGCACTAAGGACCTTAATAATGAAAAA  1628
            ||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1546  ATTGAAAATGTCAACTCAGTGGAGGCTTTGCAGGAAACACTCATCCGTGCACTAAGGACCTTAATAATGAAAAA  1619

Query 1629  CCATCCAAATGAGGCCTCTATTTTTACAAAACTGCTTCTAAAGTTGCCAGATCTTCGATCTTTAAACAACATGC  1702
            ||||||||||||||||||.||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1620  CCATCCAAATGAGGCCTCCATTTTTACAAAATTACTTCTAAAGTTGCCAGATCTTCGATCTTTAAACAACATGC  1693

Query 1703  ACTCTGAGGAGCTCTTGGCCTTTAAAGTTCACCCT  1737
            ||||||||||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1694  ACTCTGAGGAACTCTTGGCCTTTAAAGTTCATCCT  1728