Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488460
• Subject: XM_011522734.3
• Aligned Length: 1497
• Identities: 1491
• Gaps: 6

Alignment

Query    1  ATG------CGGCCTCCTGCACTGGCCATGCCCATGCCCACGGAGGGCACCCCGCCACCTCTGAGTGGCACCCC  68
            |||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCTAGAACGGCCTCCTGCACTGGCCATGCCCATGCCCACGGAGGGCACCCCGCCACCTCTGAGTGGCACCCC  74

Query   69  CATCCCAGTCCCAGCCTACTTCCGCCACGCAGAACCTGGATTCTCCCTCAAGAGGCCCAGGGGGCTCAGCCGGA  142
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CATCCCAGTCCCAGCCTACTTCCGCCACGCAGAACCTGGATTCTCCCTCAAGAGGCCCAGGGGGCTCAGCCGGA  148

Query  143  GCCTCCCACCTCCGCCCCCTGCCAAGGGCAGCATTCCCATCAGCCGCCTCTTCCCTCCTCGGACCCCAGGCTGG  216
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCCTCCCACCTCCGCCCCCTGCCAAGGGCAGCATTCCCATCAGCCGCCTCTTCCCTCCTCGGACCCCAGGCTGG  222

Query  217  CACCAGCTGCAGCCCCGGCGGGTGTCATTCCGGGGCGAGGCCTCAGAGACTCTGCAGAGCCCTGGGTATGACCC  290
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CACCAGCTGCAGCCCCGGCGGGTGTCATTCCGGGGCGAGGCCTCAGAGACTCTGCAGAGCCCTGGGTATGACCC  296

Query  291  AAGCCGGCCAGAGTCCTTCTTCCAGCAGAGCTTCCAGAGGCTCAGCCGCCTGGGCCATGGCTCCTACGGAGAGG  364
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AAGCCGGCCAGAGTCCTTCTTCCAGCAGAGCTTCCAGAGGCTCAGCCGCCTGGGCCATGGCTCCTACGGAGAGG  370

Query  365  TCTTCAAGGTGCGCTCCAAGGAGGACGGCCGGCTCTATGCGGTAAAGCGTTCCATGTCACCATTCCGGGGCCCC  438
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCTTCAAGGTGCGCTCCAAGGAGGACGGCCGGCTCTATGCGGTAAAGCGTTCCATGTCACCATTCCGGGGCCCC  444

Query  439  AAGGACCGGGCCCGCAAGTTGGCCGAGGTGGGCAGCCACGAGAAGGTGGGGCAGCACCCATGCTGCGTGCGGCT  512
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAGGACCGGGCCCGCAAGTTGGCCGAGGTGGGCAGCCACGAGAAGGTGGGGCAGCACCCATGCTGCGTGCGGCT  518

Query  513  GGAGCAGGCCTGGGAGGAGGGCGGCATCCTGTACCTGCAGACGGAGCTGTGCGGGCCCAGCCTGCAGCAACACT  586
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGAGCAGGCCTGGGAGGAGGGCGGCATCCTGTACCTGCAGACGGAGCTGTGCGGGCCCAGCCTGCAGCAACACT  592

Query  587  GTGAGGCCTGGGGTGCCAGCCTGCCTGAGGCCCAGGTCTGGGGCTACCTGCGGGACACGCTGCTTGCCCTGGCC  660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GTGAGGCCTGGGGTGCCAGCCTGCCTGAGGCCCAGGTCTGGGGCTACCTGCGGGACACGCTGCTTGCCCTGGCC  666

Query  661  CATCTGCACAGCCAGGGCCTGGTGCACCTTGATGTCAAGCCTGCCAACATCTTCCTGGGGCCCCGGGGCCGCTG  734
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CATCTGCACAGCCAGGGCCTGGTGCACCTTGATGTCAAGCCTGCCAACATCTTCCTGGGGCCCCGGGGCCGCTG  740

Query  735  CAAGCTGGGTGACTTCGGACTGCTGGTGGAGCTGGGTACAGCAGGAGCTGGTGAGGTCCAGGAGGGAGACCCCC  808
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAAGCTGGGTGACTTCGGACTGCTGGTGGAGCTGGGTACAGCAGGAGCTGGTGAGGTCCAGGAGGGAGACCCCC  814

Query  809  GCTACATGGCCCCCGAGCTGCTGCAGGGCTCCTATGGGACAGCAGCGGATGTGTTCAGTCTGGGCCTCACCATC  882
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCTACATGGCCCCCGAGCTGCTGCAGGGCTCCTATGGGACAGCAGCGGATGTGTTCAGTCTGGGCCTCACCATC  888

Query  883  CTGGAAGTGGCATGCAACATGGAGCTGCCCCACGGTGGGGAGGGCTGGCAGCAGCTGCGCCAGGGCTACCTGCC  956
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTGGAAGTGGCATGCAACATGGAGCTGCCCCACGGTGGGGAGGGCTGGCAGCAGCTGCGCCAGGGCTACCTGCC  962

Query  957  CCCTGAGTTCACTGCCGGTCTGTCTTCCGAGCTGCGTTCTGTCCTTGTCATGATGCTGGAGCCAGACCCCAAGC  1030
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCCTGAGTTCACTGCCGGTCTGTCTTCCGAGCTGCGTTCTGTCCTTGTCATGATGCTGGAGCCAGACCCCAAGC  1036

Query 1031  TGCGGGCCACGGCCGAGGCCCTGCTGGCACTGCCTGTGTTGAGGCAGCCGCGGGCCTGGGGTGTGCTGTGGTGC  1104
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGCGGGCCACGGCCGAGGCCCTGCTGGCACTGCCTGTGTTGAGGCAGCCGCGGGCCTGGGGTGTGCTGTGGTGC  1110

Query 1105  ATGGCAGCGGAGGCCCTGAGCCGAGGGTGGGCCCTGTGGCAGGCCCTGCTTGCCCTGCTCTGCTGGCTCTGGCA  1178
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ATGGCAGCGGAGGCCCTGAGCCGAGGGTGGGCCCTGTGGCAGGCCCTGCTTGCCCTGCTCTGCTGGCTCTGGCA  1184

Query 1179  TGGGCTGGCTCACCCTGCCAGCTGGCTACAGCCCCTGGGCCCGCCAGCCACCCCGCCTGGCTCACCACCCTGCA  1252
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGGGCTGGCTCACCCTGCCAGCTGGCTACAGCCCCTGGGCCCGCCAGCCACCCCGCCTGGCTCACCACCCTGCA  1258

Query 1253  GTTTGCTCCTGGACAGCAGCCTCTCCAGCAACTGGGATGACGACAGCCTAGGGCCTTCACTCTCCCCTGAGGCT  1326
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GTTTGCTCCTGGACAGCAGCCTCTCCAGCAACTGGGATGACGACAGCCTAGGGCCTTCACTCTCCCCTGAGGCT  1332

Query 1327  GTCCTGGCCCGGACTGTGGGGAGCACCTCCACCCCCCGGAGCAGGTGCACACCCAGGGATGCCCTGGACCTAAG  1400
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GTCCTGGCCCGGACTGTGGGGAGCACCTCCACCCCCCGGAGCAGGTGCACACCCAGGGATGCCCTGGACCTAAG  1406

Query 1401  TGACATCAACTCAGAGCCTCCTCGGGGCTCCTTCCCCTCCTTTGAGCCTCGGAACCTCCTCAGCCTGTTTGAGG  1474
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGACATCAACTCAGAGCCTCCTCGGGGCTCCTTCCCCTCCTTTGAGCCTCGGAACCTCCTCAGCCTGTTTGAGG  1480

Query 1475  ACACCCTAGACCCAACC  1491
            |||||||||||||||||
Sbjct 1481  ACACCCTAGACCCAACC  1497